MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d partial sequence

Total Repeats: 5679

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NT_187147	TCT	3	9	23991	23999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995044
502	NT_187147	ACG	2	6	24029	24034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995045
503	NT_187147	AGG	2	6	24039	24044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995045
504	NT_187147	CCG	2	6	24117	24122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
505	NT_187147	CGC	2	6	24154	24159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
506	NT_187147	GCTG	2	8	24171	24178	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
507	NT_187147	GAA	2	6	24197	24202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NT_187147	CGA	2	6	24242	24247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NT_187147	A	6	6	24325	24330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NT_187147	GTTT	2	8	24355	24362	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
511	NT_187147	TCGG	2	8	24366	24373	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
512	NT_187147	GGA	2	6	24394	24399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
513	NT_187147	CG	3	6	24497	24502	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
514	NT_187147	TCT	2	6	24541	24546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995046
515	NT_187147	AGC	2	6	24582	24587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995046
516	NT_187147	CGG	2	6	24896	24901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995046
517	NT_187147	TTCG	2	8	25014	25021	0 %	50 %	25 %	25 %	399995046
518	NT_187147	CGC	2	6	25032	25037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995046
519	NT_187147	CTTG	2	8	25042	25049	0 %	50 %	25 %	25 %	399995046
520	NT_187147	GTG	3	9	25069	25077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995046
521	NT_187147	GCAA	2	8	25094	25101	50 %	0 %	25 %	25 %	399995046
522	NT_187147	TCA	2	6	25110	25115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995046
523	NT_187147	CGCA	2	8	25302	25309	25 %	0 %	25 %	50 %	399995047
524	NT_187147	CCA	2	6	25385	25390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995047
525	NT_187147	TTC	2	6	25429	25434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995047
526	NT_187147	GTA	2	6	25440	25445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995047
527	NT_187147	GTC	2	6	25573	25578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995047
528	NT_187147	CGC	2	6	25615	25620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995047
529	NT_187147	TTTCG	2	10	25650	25659	0 %	60 %	20 %	20 %	399995047
530	NT_187147	TCC	2	6	25717	25722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
531	NT_187147	GA	3	6	25873	25878	50 %	0 %	50 %	0 %	399995048
532	NT_187147	AGC	2	6	25883	25888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995048
533	NT_187147	TCG	2	6	25955	25960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995048
534	NT_187147	CGGG	2	8	25983	25990	0 %	0 %	75 %	25 %	399995048
535	NT_187147	GCCCT	2	10	26011	26020	0 %	20 %	20 %	60 %	399995048
536	NT_187147	GTC	2	6	26032	26037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995048
537	NT_187147	A	7	7	26050	26056	100 %	0 %	0 %	0 %	399995048
538	NT_187147	AAG	2	6	26058	26063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995048
539	NT_187147	CTG	2	6	26089	26094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995048
540	NT_187147	CTG	2	6	26143	26148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995048
541	NT_187147	TCG	2	6	26200	26205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995048
542	NT_187147	TCT	2	6	26262	26267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995048
543	NT_187147	AC	3	6	26283	26288	50 %	0 %	0 %	50 %	399995048
544	NT_187147	TTCTT	2	10	26435	26444	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
545	NT_187147	AGG	2	6	26451	26456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
546	NT_187147	CGG	2	6	26522	26527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
547	NT_187147	GCT	2	6	26530	26535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NT_187147	GCT	2	6	26706	26711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
549	NT_187147	TGC	2	6	26728	26733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NT_187147	GAT	3	9	26908	26916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995049
551	NT_187147	CCT	2	6	26960	26965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995049
552	NT_187147	CTG	2	6	27004	27009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995049
553	NT_187147	A	6	6	27148	27153	100 %	0 %	0 %	0 %	399995049
554	NT_187147	TCC	2	6	27226	27231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995049
555	NT_187147	GCT	2	6	27242	27247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995049
556	NT_187147	GCG	2	6	27302	27307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995049
557	NT_187147	TC	3	6	27345	27350	0 %	50 %	0 %	50 %	399995049
558	NT_187147	CAC	2	6	27419	27424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995049
559	NT_187147	GCA	2	6	27458	27463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995049
560	NT_187147	CGG	2	6	27476	27481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995049
561	NT_187147	CAC	2	6	27501	27506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995049
562	NT_187147	ATG	2	6	27598	27603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995049
563	NT_187147	GA	3	6	27604	27609	50 %	0 %	50 %	0 %	399995049
564	NT_187147	GCA	2	6	27617	27622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995049
565	NT_187147	TCG	2	6	27700	27705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995049
566	NT_187147	GGCT	2	8	27748	27755	0 %	25 %	50 %	25 %	399995049
567	NT_187147	TGC	2	6	27764	27769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995049
568	NT_187147	TCA	2	6	27797	27802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995049
569	NT_187147	GAG	2	6	27819	27824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995049
570	NT_187147	TTAA	2	8	27921	27928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NT_187147	CGCC	2	8	27962	27969	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
572	NT_187147	CCT	2	6	27982	27987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
573	NT_187147	GCC	2	6	28120	28125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995050
574	NT_187147	CGC	2	6	28148	28153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995050
575	NT_187147	GACGG	2	10	28156	28165	20 %	0 %	60 %	20 %	399995050
576	NT_187147	AGC	2	6	28168	28173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995050
577	NT_187147	A	6	6	28202	28207	100 %	0 %	0 %	0 %	399995050
578	NT_187147	AAAGAA	2	12	28256	28267	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	399995050
579	NT_187147	GTC	2	6	28312	28317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995050
580	NT_187147	GC	4	8	28325	28332	0 %	0 %	50 %	50 %	399995050
581	NT_187147	GAA	2	6	28333	28338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995050
582	NT_187147	TCG	2	6	28360	28365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995050
583	NT_187147	GGA	2	6	28408	28413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995050
584	NT_187147	GTC	2	6	28463	28468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995050
585	NT_187147	GCC	2	6	28482	28487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995050
586	NT_187147	CCA	2	6	28510	28515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995050
587	NT_187147	CT	3	6	28520	28525	0 %	50 %	0 %	50 %	399995050
588	NT_187147	TGCG	2	8	28539	28546	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
589	NT_187147	CATTT	2	10	28607	28616	20 %	60 %	0 %	20 %	399995051
590	NT_187147	GAT	2	6	28637	28642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995051
591	NT_187147	GA	3	6	28844	28849	50 %	0 %	50 %	0 %	399995051
592	NT_187147	AAC	2	6	28872	28877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995051
593	NT_187147	GTG	2	6	28911	28916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995051
594	NT_187147	GCC	2	6	28919	28924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995051
595	NT_187147	CCT	2	6	29017	29022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995051
596	NT_187147	CGA	2	6	29032	29037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995051
597	NT_187147	TCCA	2	8	29069	29076	25 %	25 %	0 %	50 %	399995051
598	NT_187147	ACA	2	6	29107	29112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995051
599	NT_187147	TTC	2	6	29121	29126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995051
600	NT_187147	CTC	2	6	29177	29182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995051
601	NT_187147	TTC	2	6	29184	29189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995051
602	NT_187147	CA	3	6	29190	29195	50 %	0 %	0 %	50 %	399995051
603	NT_187147	CGG	2	6	29242	29247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995051
604	NT_187147	TCGA	2	8	29277	29284	25 %	25 %	25 %	25 %	399995051
605	NT_187147	GATG	2	8	29285	29292	25 %	25 %	50 %	0 %	399995051
606	NT_187147	CCG	2	6	29368	29373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995051
607	NT_187147	ACA	2	6	29374	29379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995051
608	NT_187147	CTC	2	6	29393	29398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995051
609	NT_187147	GCC	2	6	29418	29423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995051
610	NT_187147	GCC	3	9	29475	29483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995051
611	NT_187147	GTATCC	2	12	29558	29569	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	399995051
612	NT_187147	GCG	2	6	29622	29627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995051
613	NT_187147	GCA	2	6	29689	29694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995051
614	NT_187147	GCG	2	6	29739	29744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995051
615	NT_187147	CG	3	6	29815	29820	0 %	0 %	50 %	50 %	399995051
616	NT_187147	TGA	2	6	29857	29862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995051
617	NT_187147	GTG	2	6	29866	29871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995051
618	NT_187147	ATTC	2	8	30113	30120	25 %	50 %	0 %	25 %	399995051
619	NT_187147	CTG	2	6	30146	30151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NT_187147	A	7	7	30165	30171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NT_187147	GT	3	6	30239	30244	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
622	NT_187147	CG	3	6	30297	30302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
623	NT_187147	GGTC	2	8	30318	30325	0 %	25 %	50 %	25 %	399995052
624	NT_187147	CGC	2	6	30354	30359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995052
625	NT_187147	CGGG	2	8	30382	30389	0 %	0 %	75 %	25 %	399995052
626	NT_187147	GCA	2	6	30457	30462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995052
627	NT_187147	CCGA	2	8	30494	30501	25 %	0 %	25 %	50 %	399995052
628	NT_187147	CAA	2	6	30537	30542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995052
629	NT_187147	CGA	2	6	30546	30551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995052
630	NT_187147	AGC	2	6	30575	30580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995052
631	NT_187147	GATGCA	2	12	30589	30600	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	399995052
632	NT_187147	GCT	2	6	30675	30680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995052
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634	NT_187147	ACC	2	6	30751	30756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995052
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652	NT_187147	GCA	2	6	31905	31910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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