MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d partial sequence

Total Repeats: 5679

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NT_187147	GAG	2	6	266947	266952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5502	NT_187147	GGC	2	6	267031	267036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NT_187147	GCC	2	6	267110	267115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5504	NT_187147	GCT	2	6	267186	267191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995301
5505	NT_187147	GAC	2	6	267194	267199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995301
5506	NT_187147	CGG	3	9	267219	267227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995301
5507	NT_187147	G	7	7	267231	267237	0 %	0 %	100 %	0 %	399995301
5508	NT_187147	TTG	2	6	267239	267244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995301
5509	NT_187147	TTG	2	6	267290	267295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995301
5510	NT_187147	TTC	2	6	267306	267311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995301
5511	NT_187147	GAT	2	6	267348	267353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995301
5512	NT_187147	CAG	2	6	267395	267400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995301
5513	NT_187147	AC	3	6	267454	267459	50 %	0 %	0 %	50 %	399995301
5514	NT_187147	TCA	2	6	267581	267586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995301
5515	NT_187147	GGC	2	6	267737	267742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995301
5516	NT_187147	CG	3	6	267763	267768	0 %	0 %	50 %	50 %	399995301
5517	NT_187147	GCAC	2	8	267788	267795	25 %	0 %	25 %	50 %	399995301
5518	NT_187147	ATC	2	6	267800	267805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995301
5519	NT_187147	CA	3	6	267811	267816	50 %	0 %	0 %	50 %	399995301
5520	NT_187147	GGACA	2	10	267823	267832	40 %	0 %	40 %	20 %	399995301
5521	NT_187147	GCT	2	6	267949	267954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995301
5522	NT_187147	TGC	2	6	268034	268039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995301
5523	NT_187147	GAGCAG	2	12	268057	268068	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	399995301
5524	NT_187147	TGGCG	2	10	268185	268194	0 %	20 %	60 %	20 %	399995301
5525	NT_187147	CGC	2	6	268204	268209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995301
5526	NT_187147	TGT	2	6	268274	268279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995301
5527	NT_187147	GCTGA	2	10	268358	268367	20 %	20 %	40 %	20 %	399995301
5528	NT_187147	GC	3	6	268468	268473	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5529	NT_187147	TCCTGC	2	12	268544	268555	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5530	NT_187147	GAT	2	6	268592	268597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5531	NT_187147	GGA	2	6	268658	268663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5532	NT_187147	ATGG	2	8	268680	268687	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5533	NT_187147	GAA	2	6	268782	268787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5534	NT_187147	CG	3	6	268792	268797	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5535	NT_187147	GTC	2	6	268962	268967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995302
5536	NT_187147	CGC	2	6	269036	269041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995302
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5539	NT_187147	TTG	2	6	269164	269169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995302
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5541	NT_187147	CTT	2	6	269383	269388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995302
5542	NT_187147	GTT	2	6	269418	269423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995302
5543	NT_187147	GAA	2	6	269425	269430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995302
5544	NT_187147	CTTT	2	8	269460	269467	0 %	75 %	0 %	25 %	399995302
5545	NT_187147	CGA	2	6	269484	269489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995302
5546	NT_187147	GCC	2	6	269493	269498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995302
5547	NT_187147	TCA	2	6	269565	269570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5548	NT_187147	GTC	2	6	269659	269664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5549	NT_187147	CTG	2	6	269748	269753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995303
5550	NT_187147	GAT	2	6	269761	269766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995303
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5552	NT_187147	AGC	2	6	269803	269808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995303
5553	NT_187147	GCA	2	6	269820	269825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995303
5554	NT_187147	CGG	2	6	269836	269841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995303
5555	NT_187147	TGC	2	6	269960	269965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995303
5556	NT_187147	ATG	2	6	269974	269979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995303
5557	NT_187147	GCG	2	6	269998	270003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995303
5558	NT_187147	TCA	2	6	270135	270140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995303
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5560	NT_187147	CAC	2	6	270205	270210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995303
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5562	NT_187147	CCGG	2	8	270227	270234	0 %	0 %	50 %	50 %	399995303
5563	NT_187147	CACCAT	2	12	270265	270276	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	399995303
5564	NT_187147	TCT	2	6	270285	270290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995303
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5592	NT_187147	GCG	2	6	271713	271718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995304
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5602	NT_187147	GAT	2	6	272206	272211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995306
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5604	NT_187147	CGG	2	6	272320	272325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995306
5605	NT_187147	GGCA	2	8	272344	272351	25 %	0 %	50 %	25 %	399995306
5606	NT_187147	GCT	2	6	272368	272373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995306
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5612	NT_187147	CGT	2	6	272567	272572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995306
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5620	NT_187147	CGATG	2	10	272936	272945	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5621	NT_187147	CAGC	2	8	272955	272962	25 %	0 %	25 %	50 %	399995308
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