MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d partial sequence

Total Repeats: 5679

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NT_187147	GCCGC	2	10	242539	242548	0 %	0 %	40 %	60 %	399995274
5002	NT_187147	CGA	2	6	242580	242585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995274
5003	NT_187147	GCA	2	6	242592	242597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995274
5004	NT_187147	CGC	2	6	242706	242711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995274
5005	NT_187147	GCC	2	6	242798	242803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995274
5006	NT_187147	CG	3	6	242814	242819	0 %	0 %	50 %	50 %	399995274
5007	NT_187147	GC	3	6	242829	242834	0 %	0 %	50 %	50 %	399995274
5008	NT_187147	AGT	2	6	242918	242923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995274
5009	NT_187147	TCA	2	6	242949	242954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995274
5010	NT_187147	CCAG	2	8	242976	242983	25 %	0 %	25 %	50 %	399995274
5011	NT_187147	CG	3	6	243007	243012	0 %	0 %	50 %	50 %	399995274
5012	NT_187147	GCA	2	6	243015	243020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995274
5013	NT_187147	AGC	2	6	243128	243133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995274
5014	NT_187147	CAG	2	6	243142	243147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995274
5015	NT_187147	CGG	2	6	243158	243163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995274
5016	NT_187147	CG	3	6	243178	243183	0 %	0 %	50 %	50 %	399995274
5017	NT_187147	GCC	2	6	243231	243236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995274
5018	NT_187147	TGA	2	6	243260	243265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995274
5019	NT_187147	GCA	2	6	243268	243273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995274
5020	NT_187147	TCG	2	6	243274	243279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995274
5021	NT_187147	CCA	2	6	243293	243298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995274
5022	NT_187147	CAC	2	6	243334	243339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995274
5023	NT_187147	TCC	2	6	243371	243376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995274
5024	NT_187147	CCG	2	6	243415	243420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5025	NT_187147	GC	3	6	243444	243449	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5026	NT_187147	TCGCCA	2	12	243450	243461	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5027	NT_187147	GGC	2	6	243485	243490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NT_187147	CTGG	2	8	243500	243507	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5029	NT_187147	AGC	2	6	243513	243518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NT_187147	CGG	2	6	243520	243525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NT_187147	GCAC	2	8	243610	243617	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5032	NT_187147	GGT	2	6	243623	243628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5033	NT_187147	ACG	2	6	243651	243656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NT_187147	C	8	8	243667	243674	0 %	0 %	0 %	100 %	399995275
5035	NT_187147	GC	3	6	243698	243703	0 %	0 %	50 %	50 %	399995275
5036	NT_187147	GCT	2	6	243740	243745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995275
5037	NT_187147	GC	3	6	243768	243773	0 %	0 %	50 %	50 %	399995275
5038	NT_187147	GTCG	2	8	243870	243877	0 %	25 %	50 %	25 %	399995275
5039	NT_187147	GCC	2	6	243894	243899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995275
5040	NT_187147	CG	3	6	243919	243924	0 %	0 %	50 %	50 %	399995275
5041	NT_187147	GCCG	2	8	243969	243976	0 %	0 %	50 %	50 %	399995275
5042	NT_187147	TTC	2	6	244000	244005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995275
5043	NT_187147	CAC	2	6	244011	244016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995275
5044	NT_187147	GCC	2	6	244017	244022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995275
5045	NT_187147	CGCAG	2	10	244079	244088	20 %	0 %	40 %	40 %	399995275
5046	NT_187147	CTT	2	6	244091	244096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995275
5047	NT_187147	CGA	2	6	244097	244102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995275
5048	NT_187147	GCA	2	6	244189	244194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995275
5049	NT_187147	GTG	2	6	244195	244200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995275
5050	NT_187147	GCC	2	6	244206	244211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995275
5051	NT_187147	CAG	2	6	244212	244217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995275
5052	NT_187147	TCG	3	9	244267	244275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995275
5053	NT_187147	TGCGCT	2	12	244319	244330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995275
5054	NT_187147	CCG	2	6	244376	244381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995275
5055	NT_187147	CGG	2	6	244439	244444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995275
5056	NT_187147	GTC	2	6	244458	244463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995275
5057	NT_187147	GC	3	6	244575	244580	0 %	0 %	50 %	50 %	399995275
5058	NT_187147	CGA	2	6	244583	244588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995275
5059	NT_187147	GC	3	6	244590	244595	0 %	0 %	50 %	50 %	399995275
5060	NT_187147	CG	3	6	244637	244642	0 %	0 %	50 %	50 %	399995275
5061	NT_187147	TCG	2	6	244721	244726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995275
5062	NT_187147	GC	3	6	244743	244748	0 %	0 %	50 %	50 %	399995275
5063	NT_187147	GGC	2	6	244817	244822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995275
5064	NT_187147	CGC	2	6	244842	244847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995275
5065	NT_187147	ACC	2	6	244874	244879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995275
5066	NT_187147	TGC	2	6	244944	244949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995275
5067	NT_187147	TGGC	2	8	244984	244991	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5068	NT_187147	GCC	2	6	245027	245032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5069	NT_187147	GCA	2	6	245044	245049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NT_187147	AG	3	6	245069	245074	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5071	NT_187147	GCT	2	6	245087	245092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NT_187147	CAT	2	6	245098	245103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5073	NT_187147	CG	3	6	245128	245133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5074	NT_187147	GTCG	2	8	245193	245200	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5075	NT_187147	GGA	2	6	245283	245288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5076	NT_187147	GC	3	6	245534	245539	0 %	0 %	50 %	50 %	399995276
5077	NT_187147	AC	3	6	245557	245562	50 %	0 %	0 %	50 %	399995276
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5080	NT_187147	CTG	2	6	245904	245909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995276
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5082	NT_187147	CTGG	2	8	245960	245967	0 %	25 %	50 %	25 %	399995276
5083	NT_187147	CAC	2	6	245994	245999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995276
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5086	NT_187147	GCA	2	6	246150	246155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995276
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5091	NT_187147	GGC	2	6	246317	246322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995276
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5094	NT_187147	ACG	2	6	246471	246476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995276
5095	NT_187147	CG	4	8	246491	246498	0 %	0 %	50 %	50 %	399995276
5096	NT_187147	AGG	2	6	246576	246581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5097	NT_187147	CGG	2	6	246721	246726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NT_187147	CGT	2	6	246758	246763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5099	NT_187147	CCT	2	6	246776	246781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5100	NT_187147	ACG	2	6	246811	246816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NT_187147	CGGG	2	8	246828	246835	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5102	NT_187147	CTG	2	6	246849	246854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995277
5103	NT_187147	TGGA	2	8	246877	246884	25 %	25 %	50 %	0 %	399995277
5104	NT_187147	GAT	2	6	246918	246923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995277
5105	NT_187147	CGG	2	6	246935	246940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995277
5106	NT_187147	GTT	2	6	246959	246964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995277
5107	NT_187147	GGC	2	6	246993	246998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995277
5108	NT_187147	CGC	2	6	247025	247030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995277
5109	NT_187147	GAA	2	6	247059	247064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995277
5110	NT_187147	GC	3	6	247141	247146	0 %	0 %	50 %	50 %	399995277
5111	NT_187147	GGC	2	6	247164	247169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995277
5112	NT_187147	CGGC	2	8	247202	247209	0 %	0 %	50 %	50 %	399995277
5113	NT_187147	GGC	2	6	247305	247310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995277
5114	NT_187147	AAC	2	6	247312	247317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995277
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5119	NT_187147	GCG	2	6	247566	247571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995277
5120	NT_187147	GCC	2	6	247600	247605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995277
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5251	NT_187147	CCTG	2	8	254052	254059	0 %	25 %	25 %	50 %	399995285
5252	NT_187147	TCC	3	9	254090	254098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995285
5253	NT_187147	CTT	2	6	254134	254139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995285
5254	NT_187147	GATCC	2	10	254152	254161	20 %	20 %	20 %	40 %	399995285
5255	NT_187147	TTGT	2	8	254162	254169	0 %	75 %	25 %	0 %	399995285
5256	NT_187147	GGCC	2	8	254170	254177	0 %	0 %	50 %	50 %	399995285
5257	NT_187147	GCT	2	6	254276	254281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995285
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5261	NT_187147	AATT	2	8	254332	254339	50 %	50 %	0 %	0 %	399995285
5262	NT_187147	CCT	2	6	254385	254390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995285
5263	NT_187147	CAT	2	6	254431	254436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995285
5264	NT_187147	CAGC	2	8	254456	254463	25 %	0 %	25 %	50 %	399995285
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5271	NT_187147	TCA	2	6	254834	254839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995285
5272	NT_187147	CA	3	6	255108	255113	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5273	NT_187147	ACA	3	9	255111	255119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5274	NT_187147	AGCAT	2	10	255173	255182	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5275	NT_187147	ATA	2	6	255202	255207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5276	NT_187147	GCTGA	2	10	255225	255234	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5277	NT_187147	TTG	2	6	255280	255285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5278	NT_187147	CTC	2	6	255309	255314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5279	NT_187147	CAG	2	6	255320	255325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5280	NT_187147	CGT	2	6	255362	255367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5282	NT_187147	CGC	2	6	255556	255561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995286
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5284	NT_187147	AAG	2	6	255580	255585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995286
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5286	NT_187147	GCA	2	6	255692	255697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995286
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5289	NT_187147	ACGG	2	8	255892	255899	25 %	0 %	50 %	25 %	399995286
5290	NT_187147	CAT	2	6	255933	255938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995286
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5302	NT_187147	AC	3	6	256627	256632	50 %	0 %	0 %	50 %	399995287
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5312	NT_187147	TCA	2	6	257074	257079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995287
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5314	NT_187147	TGAC	2	8	257427	257434	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5315	NT_187147	CAG	2	6	257441	257446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5341	NT_187147	AGCG	2	8	258790	258797	25 %	0 %	50 %	25 %	399995289
5342	NT_187147	GAGAC	2	10	258831	258840	40 %	0 %	40 %	20 %	399995289
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5350	NT_187147	CGT	2	6	259343	259348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995289
5351	NT_187147	TTCG	2	8	259435	259442	0 %	50 %	25 %	25 %	399995289
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5354	NT_187147	GAACG	2	10	259649	259658	40 %	0 %	40 %	20 %	399995290
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5362	NT_187147	CGGT	2	8	259906	259913	0 %	25 %	50 %	25 %	399995290
5363	NT_187147	GAA	2	6	259928	259933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995290
5364	NT_187147	TGC	2	6	260029	260034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5365	NT_187147	GTC	2	6	260092	260097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5366	NT_187147	GTTG	2	8	260118	260125	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5367	NT_187147	AGTG	2	8	260139	260146	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5368	NT_187147	AC	3	6	260195	260200	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5369	NT_187147	TTC	2	6	260206	260211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5370	NT_187147	TCT	2	6	260223	260228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5371	NT_187147	ATTG	2	8	260254	260261	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5372	NT_187147	TGA	2	6	260324	260329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5373	NT_187147	CGG	2	6	260345	260350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5374	NT_187147	GCCA	2	8	260365	260372	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5375	NT_187147	GCC	2	6	260438	260443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995291
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