MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d partial sequence

Total Repeats: 5679

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NT_187147	ATCCA	2	10	218549	218558	40 %	20 %	0 %	40 %	399995247
4502	NT_187147	CTC	2	6	218584	218589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4503	NT_187147	TGC	2	6	218593	218598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NT_187147	CAT	2	6	218613	218618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995248
4505	NT_187147	CCG	2	6	218627	218632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995248
4506	NT_187147	CAT	2	6	218648	218653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995248
4507	NT_187147	CGA	2	6	218836	218841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4508	NT_187147	ACG	2	6	218846	218851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NT_187147	CCG	2	6	218852	218857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4510	NT_187147	TCCG	2	8	218886	218893	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4511	NT_187147	CT	4	8	218901	218908	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4512	NT_187147	CGG	2	6	218973	218978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4513	NT_187147	GCG	2	6	219120	219125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4514	NT_187147	TCC	2	6	219150	219155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4515	NT_187147	AGAC	2	8	219228	219235	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4516	NT_187147	GCT	2	6	219304	219309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4517	NT_187147	AAG	2	6	219329	219334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4518	NT_187147	TTC	2	6	219337	219342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4519	NT_187147	ATC	2	6	219454	219459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4520	NT_187147	GC	3	6	219497	219502	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4521	NT_187147	GCA	2	6	219519	219524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4522	NT_187147	CGG	2	6	219555	219560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NT_187147	ACG	2	6	219562	219567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4524	NT_187147	CCG	2	6	219584	219589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4525	NT_187147	GCTT	2	8	219642	219649	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4526	NT_187147	TCT	2	6	219656	219661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4527	NT_187147	AT	3	6	219728	219733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4528	NT_187147	AGG	2	6	219739	219744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4529	NT_187147	TTC	2	6	219886	219891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995249
4530	NT_187147	GCA	2	6	219962	219967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995249
4531	NT_187147	CAT	2	6	219976	219981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995249
4532	NT_187147	GCG	2	6	219993	219998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995249
4533	NT_187147	GAA	2	6	220025	220030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995249
4534	NT_187147	ATG	2	6	220091	220096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995249
4535	NT_187147	TCA	3	9	220167	220175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995249
4536	NT_187147	GGGC	2	8	220176	220183	0 %	0 %	75 %	25 %	399995249
4537	NT_187147	CGG	2	6	220261	220266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995249
4538	NT_187147	GCAC	2	8	220273	220280	25 %	0 %	25 %	50 %	399995249
4539	NT_187147	TTC	2	6	220358	220363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995249
4540	NT_187147	CGA	2	6	220381	220386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995249
4541	NT_187147	AG	3	6	220471	220476	50 %	0 %	50 %	0 %	399995249
4542	NT_187147	GAA	2	6	220517	220522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995249
4543	NT_187147	CGG	2	6	220548	220553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995249
4544	NT_187147	G	6	6	220555	220560	0 %	0 %	100 %	0 %	399995249
4545	NT_187147	CAC	2	6	220564	220569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995249
4546	NT_187147	GGT	2	6	220615	220620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995249
4547	NT_187147	GTT	2	6	220703	220708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995249
4548	NT_187147	GGGT	2	8	220725	220732	0 %	25 %	75 %	0 %	399995249
4549	NT_187147	CGACCG	2	12	220951	220962	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	399995249
4550	NT_187147	AC	3	6	220971	220976	50 %	0 %	0 %	50 %	399995249
4551	NT_187147	CGT	2	6	221031	221036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995249
4552	NT_187147	CTA	2	6	221087	221092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995249
4553	NT_187147	GCT	2	6	221120	221125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995249
4554	NT_187147	TGA	3	9	221158	221166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995249
4555	NT_187147	TTA	2	6	221184	221189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	399995249
4556	NT_187147	TCG	2	6	221190	221195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995249
4557	NT_187147	TACGA	2	10	221204	221213	40 %	20 %	20 %	20 %	399995249
4558	NT_187147	GAT	2	6	221279	221284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995249
4559	NT_187147	TTC	2	6	221330	221335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995249
4560	NT_187147	AT	4	8	221472	221479	50 %	50 %	0 %	0 %	399995249
4561	NT_187147	CAA	2	6	221501	221506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995249
4562	NT_187147	CAG	2	6	221513	221518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995249
4563	NT_187147	ATT	2	6	221604	221609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	399995249
4564	NT_187147	AGG	2	6	221622	221627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995249
4565	NT_187147	CTT	2	6	221736	221741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995249
4566	NT_187147	CGG	2	6	221746	221751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995250
4567	NT_187147	CCG	2	6	221776	221781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995250
4568	NT_187147	CGG	2	6	221796	221801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995250
4569	NT_187147	CCT	2	6	221844	221849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995250
4570	NT_187147	GCCA	2	8	221850	221857	25 %	0 %	25 %	50 %	399995250
4571	NT_187147	CCGG	2	8	221951	221958	0 %	0 %	50 %	50 %	399995250
4572	NT_187147	GTCC	2	8	222035	222042	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4573	NT_187147	CCG	2	6	222090	222095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4574	NT_187147	CGA	2	6	222247	222252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4575	NT_187147	CGGC	2	8	222318	222325	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4576	NT_187147	GAC	2	6	222391	222396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4577	NT_187147	GCC	2	6	222456	222461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4578	NT_187147	TGC	2	6	222477	222482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4579	NT_187147	CAG	2	6	222490	222495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4580	NT_187147	GCC	2	6	222545	222550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4581	NT_187147	GCC	2	6	222580	222585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4582	NT_187147	CAG	2	6	222589	222594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995251
4583	NT_187147	AGC	2	6	222695	222700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995251
4584	NT_187147	GTC	2	6	222765	222770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995251
4585	NT_187147	ACG	3	9	222784	222792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995251
4586	NT_187147	CG	3	6	222797	222802	0 %	0 %	50 %	50 %	399995251
4587	NT_187147	TCG	2	6	222805	222810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995251
4588	NT_187147	ACG	2	6	222832	222837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995251
4589	NT_187147	CGG	2	6	222962	222967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4590	NT_187147	GCT	2	6	223096	223101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995252
4591	NT_187147	TGC	2	6	223103	223108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995252
4592	NT_187147	GCA	2	6	223119	223124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995252
4593	NT_187147	TCG	2	6	223210	223215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995252
4594	NT_187147	AGC	2	6	223236	223241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995252
4595	NT_187147	GGC	2	6	223251	223256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995252
4596	NT_187147	TCCT	2	8	223356	223363	0 %	50 %	0 %	50 %	399995252
4597	NT_187147	GCAT	2	8	223371	223378	25 %	25 %	25 %	25 %	399995252
4598	NT_187147	CGA	2	6	223450	223455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995252
4599	NT_187147	CGG	2	6	223500	223505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995252
4600	NT_187147	GTT	2	6	223514	223519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995252
4601	NT_187147	CAG	2	6	223549	223554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995252
4602	NT_187147	TTC	2	6	223562	223567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995252
4603	NT_187147	GGT	2	6	223624	223629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995252
4604	NT_187147	CGTT	2	8	223642	223649	0 %	50 %	25 %	25 %	399995252
4605	NT_187147	GCG	2	6	223686	223691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995252
4606	NT_187147	CGC	2	6	223838	223843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995252
4607	NT_187147	GCG	2	6	223866	223871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995252
4608	NT_187147	GCG	2	6	223909	223914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995252
4609	NT_187147	CGT	2	6	223927	223932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995252
4610	NT_187147	TGA	2	6	223962	223967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995252
4611	NT_187147	GGC	2	6	224001	224006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995252
4612	NT_187147	TCA	2	6	224073	224078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995253
4613	NT_187147	CAA	2	6	224125	224130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995253
4614	NT_187147	TCC	2	6	224146	224151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995253
4615	NT_187147	CGCC	2	8	224164	224171	0 %	0 %	25 %	75 %	399995253
4616	NT_187147	CGC	2	6	224251	224256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4617	NT_187147	ATC	2	6	224268	224273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995254
4618	NT_187147	CCCG	2	8	224307	224314	0 %	0 %	25 %	75 %	399995254
4619	NT_187147	CTG	2	6	224319	224324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995254
4620	NT_187147	TGC	2	6	224336	224341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995254
4621	NT_187147	ACC	2	6	224352	224357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995254
4622	NT_187147	CAT	3	9	224366	224374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995254
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4624	NT_187147	CAG	2	6	224479	224484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995254
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4995	NT_187147	AGCA	2	8	242368	242375	50 %	0 %	25 %	25 %	399995274
4996	NT_187147	GCA	3	9	242373	242381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995274
4997	NT_187147	TCG	2	6	242420	242425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995274
4998	NT_187147	GC	3	6	242467	242472	0 %	0 %	50 %	50 %	399995274
4999	NT_187147	GC	5	10	242478	242487	0 %	0 %	50 %	50 %	399995274
5000	NT_187147	GCG	2	6	242531	242536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995274

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