MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 142

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187135	TC	3	6	1287	1292	0 %	50 %	0 %	50 %	409248367
2	NT_187135	TC	3	6	1491	1496	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NT_187135	CT	3	6	3945	3950	0 %	50 %	0 %	50 %	409248372
4	NT_187135	GA	3	6	4246	4251	50 %	0 %	50 %	0 %	409248373
5	NT_187135	AT	3	6	4636	4641	50 %	50 %	0 %	0 %	409248375
6	NT_187135	TC	3	6	4695	4700	0 %	50 %	0 %	50 %	409248375
7	NT_187135	TA	3	6	6723	6728	50 %	50 %	0 %	0 %	409248378
8	NT_187135	AC	3	6	7295	7300	50 %	0 %	0 %	50 %	409248379
9	NT_187135	TA	3	6	7769	7774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187135	TA	3	6	8115	8120	50 %	50 %	0 %	0 %	409248380
11	NT_187135	GC	3	6	8300	8305	0 %	0 %	50 %	50 %	409248381
12	NT_187135	CT	3	6	8434	8439	0 %	50 %	0 %	50 %	409248381
13	NT_187135	AT	3	6	9589	9594	50 %	50 %	0 %	0 %	409248381
14	NT_187135	AT	3	6	9760	9765	50 %	50 %	0 %	0 %	409248381
15	NT_187135	TA	3	6	9990	9995	50 %	50 %	0 %	0 %	409248381
16	NT_187135	TA	4	8	10514	10521	50 %	50 %	0 %	0 %	409248382
17	NT_187135	AG	3	6	10784	10789	50 %	0 %	50 %	0 %	409248382
18	NT_187135	TA	4	8	11968	11975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187135	TA	3	6	11987	11992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187135	TC	3	6	12489	12494	0 %	50 %	0 %	50 %	409248386
21	NT_187135	CG	3	6	13103	13108	0 %	0 %	50 %	50 %	409248386
22	NT_187135	GA	3	6	16008	16013	50 %	0 %	50 %	0 %	409248391
23	NT_187135	CG	3	6	16526	16531	0 %	0 %	50 %	50 %	409248392
24	NT_187135	TG	3	6	16674	16679	0 %	50 %	50 %	0 %	409248392
25	NT_187135	GA	3	6	16964	16969	50 %	0 %	50 %	0 %	409248393
26	NT_187135	GA	3	6	19345	19350	50 %	0 %	50 %	0 %	409248397
27	NT_187135	AG	3	6	19413	19418	50 %	0 %	50 %	0 %	409248397
28	NT_187135	TA	4	8	19884	19891	50 %	50 %	0 %	0 %	409248397
29	NT_187135	GC	3	6	20116	20121	0 %	0 %	50 %	50 %	409248397
30	NT_187135	TG	3	6	20505	20510	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NT_187135	CA	3	6	20571	20576	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NT_187135	GA	3	6	20613	20618	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NT_187135	GT	3	6	21515	21520	0 %	50 %	50 %	0 %	409248398
34	NT_187135	GA	3	6	22539	22544	50 %	0 %	50 %	0 %	409248398
35	NT_187135	GA	3	6	23181	23186	50 %	0 %	50 %	0 %	409248398
36	NT_187135	AG	3	6	24164	24169	50 %	0 %	50 %	0 %	409248398
37	NT_187135	AT	3	6	24502	24507	50 %	50 %	0 %	0 %	409248398
38	NT_187135	AT	3	6	24768	24773	50 %	50 %	0 %	0 %	409248398
39	NT_187135	AT	3	6	24816	24821	50 %	50 %	0 %	0 %	409248398
40	NT_187135	AT	3	6	25636	25641	50 %	50 %	0 %	0 %	409248398
41	NT_187135	CA	3	6	25795	25800	50 %	0 %	0 %	50 %	409248398
42	NT_187135	TA	3	6	27527	27532	50 %	50 %	0 %	0 %	409248398
43	NT_187135	GT	3	6	29561	29566	0 %	50 %	50 %	0 %	409248398
44	NT_187135	CG	3	6	29842	29847	0 %	0 %	50 %	50 %	409248398
45	NT_187135	AG	3	6	30605	30610	50 %	0 %	50 %	0 %	409248398
46	NT_187135	AT	3	6	30737	30742	50 %	50 %	0 %	0 %	409248398
47	NT_187135	TA	3	6	31121	31126	50 %	50 %	0 %	0 %	409248398
48	NT_187135	TA	3	6	31477	31482	50 %	50 %	0 %	0 %	409248398
49	NT_187135	TA	3	6	31936	31941	50 %	50 %	0 %	0 %	409248398
50	NT_187135	AT	3	6	32614	32619	50 %	50 %	0 %	0 %	409248398
51	NT_187135	CA	3	6	33243	33248	50 %	0 %	0 %	50 %	409248398
52	NT_187135	GC	3	6	34307	34312	0 %	0 %	50 %	50 %	409248399
53	NT_187135	TA	3	6	34765	34770	50 %	50 %	0 %	0 %	409248399
54	NT_187135	GA	4	8	35220	35227	50 %	0 %	50 %	0 %	409248399
55	NT_187135	AC	3	6	36611	36616	50 %	0 %	0 %	50 %	409248399
56	NT_187135	AT	5	10	36914	36923	50 %	50 %	0 %	0 %	409248399
57	NT_187135	GC	3	6	37034	37039	0 %	0 %	50 %	50 %	409248399
58	NT_187135	AT	4	8	37153	37160	50 %	50 %	0 %	0 %	409248399
59	NT_187135	TC	3	6	37704	37709	0 %	50 %	0 %	50 %	409248399
60	NT_187135	CA	3	6	37723	37728	50 %	0 %	0 %	50 %	409248399
61	NT_187135	TG	3	6	38777	38782	0 %	50 %	50 %	0 %	409248399
62	NT_187135	AT	3	6	38950	38955	50 %	50 %	0 %	0 %	409248399
63	NT_187135	CT	3	6	39470	39475	0 %	50 %	0 %	50 %	409248399
64	NT_187135	AT	3	6	39965	39970	50 %	50 %	0 %	0 %	409248399
65	NT_187135	TA	3	6	40726	40731	50 %	50 %	0 %	0 %	409248399
66	NT_187135	TA	3	6	41077	41082	50 %	50 %	0 %	0 %	409248399
67	NT_187135	GT	3	6	42120	42125	0 %	50 %	50 %	0 %	409248399
68	NT_187135	AC	3	6	43184	43189	50 %	0 %	0 %	50 %	409248402
69	NT_187135	TG	3	6	43337	43342	0 %	50 %	50 %	0 %	409248402
70	NT_187135	CT	3	6	43868	43873	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NT_187135	CG	3	6	44033	44038	0 %	0 %	50 %	50 %	409248403
72	NT_187135	GT	3	6	44316	44321	0 %	50 %	50 %	0 %	409248404
73	NT_187135	GT	3	6	44460	44465	0 %	50 %	50 %	0 %	409248404
74	NT_187135	AT	3	6	45100	45105	50 %	50 %	0 %	0 %	409248404
75	NT_187135	AG	3	6	45130	45135	50 %	0 %	50 %	0 %	409248404
76	NT_187135	AT	3	6	45149	45154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NT_187135	GC	3	6	45328	45333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NT_187135	GT	3	6	45680	45685	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NT_187135	GC	3	6	45932	45937	0 %	0 %	50 %	50 %	409248405
80	NT_187135	TA	3	6	46675	46680	50 %	50 %	0 %	0 %	409248408
81	NT_187135	CT	3	6	46849	46854	0 %	50 %	0 %	50 %	409248408
82	NT_187135	TA	3	6	47874	47879	50 %	50 %	0 %	0 %	409248409
83	NT_187135	AT	3	6	48292	48297	50 %	50 %	0 %	0 %	409248409
84	NT_187135	TA	3	6	49086	49091	50 %	50 %	0 %	0 %	409248410
85	NT_187135	TG	3	6	49605	49610	0 %	50 %	50 %	0 %	409248410
86	NT_187135	AC	3	6	49855	49860	50 %	0 %	0 %	50 %	409248410
87	NT_187135	GA	3	6	50164	50169	50 %	0 %	50 %	0 %	409248411
88	NT_187135	CG	3	6	51009	51014	0 %	0 %	50 %	50 %	409248411
89	NT_187135	TC	3	6	51811	51816	0 %	50 %	0 %	50 %	409248412
90	NT_187135	GC	3	6	52038	52043	0 %	0 %	50 %	50 %	409248412
91	NT_187135	CG	3	6	52203	52208	0 %	0 %	50 %	50 %	409248412
92	NT_187135	GA	3	6	52394	52399	50 %	0 %	50 %	0 %	409248412
93	NT_187135	AG	3	6	52553	52558	50 %	0 %	50 %	0 %	409248413
94	NT_187135	TA	3	6	52933	52938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NT_187135	CA	3	6	54597	54602	50 %	0 %	0 %	50 %	409248420
96	NT_187135	TG	3	6	54853	54858	0 %	50 %	50 %	0 %	409248421
97	NT_187135	GT	3	6	55226	55231	0 %	50 %	50 %	0 %	409248422
98	NT_187135	GC	3	6	55543	55548	0 %	0 %	50 %	50 %	409248423
99	NT_187135	GC	3	6	55915	55920	0 %	0 %	50 %	50 %	409248423
100	NT_187135	CG	3	6	55943	55948	0 %	0 %	50 %	50 %	409248423
101	NT_187135	CG	3	6	57468	57473	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NT_187135	GA	4	8	57500	57507	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NT_187135	CG	3	6	57820	57825	0 %	0 %	50 %	50 %	409248429
104	NT_187135	GA	3	6	59056	59061	50 %	0 %	50 %	0 %	409248434
105	NT_187135	GA	4	8	59515	59522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NT_187135	GC	3	6	60981	60986	0 %	0 %	50 %	50 %	409248436
107	NT_187135	GC	3	6	61758	61763	0 %	0 %	50 %	50 %	409248436
108	NT_187135	TC	3	6	62525	62530	0 %	50 %	0 %	50 %	409248438
109	NT_187135	GT	4	8	63210	63217	0 %	50 %	50 %	0 %	409248439
110	NT_187135	AT	3	6	64580	64585	50 %	50 %	0 %	0 %	409248440
111	NT_187135	AC	3	6	65415	65420	50 %	0 %	0 %	50 %	409248443
112	NT_187135	CG	3	6	65749	65754	0 %	0 %	50 %	50 %	409248443
113	NT_187135	AC	3	6	66258	66263	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NT_187135	AG	4	8	66546	66553	50 %	0 %	50 %	0 %	409248446
115	NT_187135	GT	3	6	66846	66851	0 %	50 %	50 %	0 %	409248446
116	NT_187135	GC	3	6	66963	66968	0 %	0 %	50 %	50 %	409248446
117	NT_187135	AC	3	6	67204	67209	50 %	0 %	0 %	50 %	409248446
118	NT_187135	CG	3	6	67387	67392	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NT_187135	TG	3	6	67790	67795	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NT_187135	TA	3	6	67809	67814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NT_187135	GC	3	6	67890	67895	0 %	0 %	50 %	50 %	409248449
122	NT_187135	AT	3	6	68182	68187	50 %	50 %	0 %	0 %	409248449
123	NT_187135	GA	3	6	68708	68713	50 %	0 %	50 %	0 %	409248450
124	NT_187135	TG	3	6	68747	68752	0 %	50 %	50 %	0 %	409248450
125	NT_187135	GT	3	6	68834	68839	0 %	50 %	50 %	0 %	409248450
126	NT_187135	AG	3	6	69129	69134	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NT_187135	CA	4	8	69683	69690	50 %	0 %	0 %	50 %	409248451
128	NT_187135	GA	3	6	70695	70700	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NT_187135	AT	3	6	70856	70861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NT_187135	AC	3	6	71013	71018	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NT_187135	TG	3	6	71025	71030	0 %	50 %	50 %	0 %	409248452
132	NT_187135	CT	3	6	71158	71163	0 %	50 %	0 %	50 %	409248452
133	NT_187135	AC	3	6	73919	73924	50 %	0 %	0 %	50 %	409248453
134	NT_187135	GT	3	6	74479	74484	0 %	50 %	50 %	0 %	409248454
135	NT_187135	GC	3	6	75580	75585	0 %	0 %	50 %	50 %	409248454
136	NT_187135	GA	3	6	75786	75791	50 %	0 %	50 %	0 %	409248454
137	NT_187135	GT	3	6	76723	76728	0 %	50 %	50 %	0 %	409248454
138	NT_187135	CG	3	6	76857	76862	0 %	0 %	50 %	50 %	409248454
139	NT_187135	CA	3	6	77225	77230	50 %	0 %	0 %	50 %	409248454
140	NT_187135	TC	3	6	78196	78201	0 %	50 %	0 %	50 %	409248454
141	NT_187135	GC	3	6	78777	78782	0 %	0 %	50 %	50 %	409248454
142	NT_187135	GC	3	6	81121	81126	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.