MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 247

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187127	AGCGC	2	10	198	207	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NT_187127	TAAAT	2	10	291	300	60 %	40 %	0 %	0 %	409247874
3	NT_187127	TTCTA	2	10	743	752	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NT_187127	TCAGG	2	10	962	971	20 %	20 %	40 %	20 %	409247875
5	NT_187127	ACATC	2	10	1384	1393	40 %	20 %	0 %	40 %	409247875
6	NT_187127	ATTTA	2	10	1906	1915	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187127	AATTA	2	10	1941	1950	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NT_187127	TTATT	2	10	2267	2276	20 %	80 %	0 %	0 %	409247876
9	NT_187127	TGCGT	2	10	2864	2873	0 %	40 %	40 %	20 %	409247876
10	NT_187127	GCGCG	2	10	3038	3047	0 %	0 %	60 %	40 %	409247876
11	NT_187127	GCAGT	2	10	3348	3357	20 %	20 %	40 %	20 %	409247876
12	NT_187127	GGATC	2	10	4071	4080	20 %	20 %	40 %	20 %	409247877
13	NT_187127	CAGAT	2	10	4100	4109	40 %	20 %	20 %	20 %	409247877
14	NT_187127	TGATG	2	10	4368	4377	20 %	40 %	40 %	0 %	409247877
15	NT_187127	GCGCT	2	10	5027	5036	0 %	20 %	40 %	40 %	409247878
16	NT_187127	GCGAT	2	10	6418	6427	20 %	20 %	40 %	20 %	409247879
17	NT_187127	CGCAG	2	10	7406	7415	20 %	0 %	40 %	40 %	409247881
18	NT_187127	GCGCT	2	10	8178	8187	0 %	20 %	40 %	40 %	409247882
19	NT_187127	TGCAA	2	10	10684	10693	40 %	20 %	20 %	20 %	409247883
20	NT_187127	GTGAA	2	10	10756	10765	40 %	20 %	40 %	0 %	409247883
21	NT_187127	CGTGG	2	10	11361	11370	0 %	20 %	60 %	20 %	409247883
22	NT_187127	GCGAT	2	10	13353	13362	20 %	20 %	40 %	20 %	409247884
23	NT_187127	CTGTT	2	10	13889	13898	0 %	60 %	20 %	20 %	409247884
24	NT_187127	TCGCG	2	10	15573	15582	0 %	20 %	40 %	40 %	409247887
25	NT_187127	CCAAA	2	10	16243	16252	60 %	0 %	0 %	40 %	409247887
26	NT_187127	GCAAC	2	10	17673	17682	40 %	0 %	20 %	40 %	409247890
27	NT_187127	TTCGC	2	10	18762	18771	0 %	40 %	20 %	40 %	409247891
28	NT_187127	ACCAG	2	10	19852	19861	40 %	0 %	20 %	40 %	409247892
29	NT_187127	CAGAA	2	10	22716	22725	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NT_187127	ATGAA	2	10	23116	23125	60 %	20 %	20 %	0 %	409247894
31	NT_187127	GCGCT	2	10	24710	24719	0 %	20 %	40 %	40 %	409247895
32	NT_187127	CCGTT	2	10	25879	25888	0 %	40 %	20 %	40 %	409247897
33	NT_187127	CGGCC	2	10	27422	27431	0 %	0 %	40 %	60 %	409247899
34	NT_187127	TATGA	2	10	28887	28896	40 %	40 %	20 %	0 %	409247899
35	NT_187127	ACTTT	2	10	31507	31516	20 %	60 %	0 %	20 %	409247902
36	NT_187127	GCGCT	2	10	32146	32155	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NT_187127	GTCGC	2	10	34405	34414	0 %	20 %	40 %	40 %	409247904
38	NT_187127	GCGCC	2	10	36603	36612	0 %	0 %	40 %	60 %	409247906
39	NT_187127	TTACT	2	10	36877	36886	20 %	60 %	0 %	20 %	409247906
40	NT_187127	TGGAG	2	10	38108	38117	20 %	20 %	60 %	0 %	409247908
41	NT_187127	TGAAC	2	10	39225	39234	40 %	20 %	20 %	20 %	409247909
42	NT_187127	GACGC	2	10	39890	39899	20 %	0 %	40 %	40 %	409247909
43	NT_187127	CGCGC	2	10	40173	40182	0 %	0 %	40 %	60 %	409247909
44	NT_187127	GTTCC	2	10	42253	42262	0 %	40 %	20 %	40 %	409247911
45	NT_187127	GCGCT	2	10	42806	42815	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NT_187127	TCGTT	2	10	42898	42907	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NT_187127	TATCT	2	10	43988	43997	20 %	60 %	0 %	20 %	409247912
48	NT_187127	CGATT	2	10	44850	44859	20 %	40 %	20 %	20 %	409247914
49	NT_187127	TGCGC	2	10	46456	46465	0 %	20 %	40 %	40 %	409247915
50	NT_187127	GCGTC	2	10	46881	46890	0 %	20 %	40 %	40 %	409247916
51	NT_187127	TGTGG	2	10	49494	49503	0 %	40 %	60 %	0 %	409247918
52	NT_187127	TGGCG	2	10	52403	52412	0 %	20 %	60 %	20 %	409247921
53	NT_187127	GCAGA	2	10	56190	56199	40 %	0 %	40 %	20 %	409247925
54	NT_187127	GCACG	2	10	57951	57960	20 %	0 %	40 %	40 %	409247928
55	NT_187127	ATATG	2	10	61400	61409	40 %	40 %	20 %	0 %	409247930
56	NT_187127	ATAAA	2	10	62446	62455	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NT_187127	TACAA	2	10	63715	63724	60 %	20 %	0 %	20 %	409247931
58	NT_187127	GAAAA	2	10	64209	64218	80 %	0 %	20 %	0 %	409247932
59	NT_187127	CAGAT	2	10	64705	64714	40 %	20 %	20 %	20 %	409247932
60	NT_187127	AATGA	2	10	65375	65384	60 %	20 %	20 %	0 %	409247932
61	NT_187127	AATAT	2	10	66664	66673	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NT_187127	AGAAA	2	10	66974	66983	80 %	0 %	20 %	0 %	409247934
63	NT_187127	AAACG	2	10	67928	67937	60 %	0 %	20 %	20 %	409247934
64	NT_187127	AACGC	2	10	72288	72297	40 %	0 %	20 %	40 %	409247934
65	NT_187127	TGGGA	2	10	79125	79134	20 %	20 %	60 %	0 %	409247934
66	NT_187127	GGCGA	2	10	79440	79449	20 %	0 %	60 %	20 %	409247934
67	NT_187127	GACAC	2	10	81393	81402	40 %	0 %	20 %	40 %	409247934
68	NT_187127	GGAAG	2	10	82079	82088	40 %	0 %	60 %	0 %	409247934
69	NT_187127	GTTAC	2	10	83316	83325	20 %	40 %	20 %	20 %	409247934
70	NT_187127	TCTAT	2	10	83921	83930	20 %	60 %	0 %	20 %	409247935
71	NT_187127	ACATC	2	10	86103	86112	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
72	NT_187127	TTATT	2	10	86926	86935	20 %	80 %	0 %	0 %	409247937
73	NT_187127	CTTAT	2	10	87058	87067	20 %	60 %	0 %	20 %	409247937
74	NT_187127	ATTCG	2	10	88515	88524	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NT_187127	ACGGG	2	10	89005	89014	20 %	0 %	60 %	20 %	409247939
76	NT_187127	GCAGG	2	10	91184	91193	20 %	0 %	60 %	20 %	409247943
77	NT_187127	GTTTG	2	10	91980	91989	0 %	60 %	40 %	0 %	409247944
78	NT_187127	CAGCG	2	10	93711	93720	20 %	0 %	40 %	40 %	409247945
79	NT_187127	ATGAG	2	10	94960	94969	40 %	20 %	40 %	0 %	409247946
80	NT_187127	CGGCG	2	10	95529	95538	0 %	0 %	60 %	40 %	409247947
81	NT_187127	ACCCA	2	10	98938	98947	40 %	0 %	0 %	60 %	409247950
82	NT_187127	TCCGT	2	10	102383	102392	0 %	40 %	20 %	40 %	409247952
83	NT_187127	CATTT	2	10	103093	103102	20 %	60 %	0 %	20 %	409247954
84	NT_187127	CTGGG	2	10	104740	104749	0 %	20 %	60 %	20 %	409247955
85	NT_187127	TTTCG	2	10	105433	105442	0 %	60 %	20 %	20 %	409247955
86	NT_187127	GCGCT	2	10	105773	105782	0 %	20 %	40 %	40 %	409247955
87	NT_187127	AAGCG	2	10	106068	106077	40 %	0 %	40 %	20 %	409247955
88	NT_187127	GCCTG	2	10	107229	107238	0 %	20 %	40 %	40 %	409247958
89	NT_187127	GCTTG	2	10	110714	110723	0 %	40 %	40 %	20 %	409247960
90	NT_187127	TCTGC	2	10	111928	111937	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NT_187127	CGCTT	2	10	116983	116992	0 %	40 %	20 %	40 %	409247967
92	NT_187127	AAAAT	2	10	119941	119950	80 %	20 %	0 %	0 %	409247969
93	NT_187127	GACCA	2	10	120634	120643	40 %	0 %	20 %	40 %	409247970
94	NT_187127	GCGTT	2	10	122343	122352	0 %	40 %	40 %	20 %	409247971
95	NT_187127	CGAGC	2	10	127605	127614	20 %	0 %	40 %	40 %	409247974
96	NT_187127	GCGGA	2	10	128542	128551	20 %	0 %	60 %	20 %	409247975
97	NT_187127	CGGCG	2	10	128855	128864	0 %	0 %	60 %	40 %	409247975
98	NT_187127	GATGG	2	10	129949	129958	20 %	20 %	60 %	0 %	409247976
99	NT_187127	GACCA	2	10	132540	132549	40 %	0 %	20 %	40 %	409247977
100	NT_187127	CATCG	2	10	134055	134064	20 %	20 %	20 %	40 %	409247978
101	NT_187127	CGCGG	2	10	134848	134857	0 %	0 %	60 %	40 %	409247979
102	NT_187127	TTTCC	2	10	135319	135328	0 %	60 %	0 %	40 %	409247979
103	NT_187127	AAAAC	2	10	135628	135637	80 %	0 %	0 %	20 %	409247979
104	NT_187127	CTTGC	2	10	135815	135824	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NT_187127	ATTTT	2	10	135968	135977	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NT_187127	TGGTC	2	10	138802	138811	0 %	40 %	40 %	20 %	409247981
107	NT_187127	TGGGC	2	10	139298	139307	0 %	20 %	60 %	20 %	409247982
108	NT_187127	AGCGT	2	10	139962	139971	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NT_187127	CAGAT	2	10	142121	142130	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NT_187127	CTGGT	2	10	142677	142686	0 %	40 %	40 %	20 %	409247985
111	NT_187127	TTAAA	2	10	144165	144174	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NT_187127	TTGCC	2	10	144217	144226	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NT_187127	ATATT	2	10	144673	144682	40 %	60 %	0 %	0 %	409247989
114	NT_187127	GAGGG	2	10	145877	145886	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
115	NT_187127	TTGTA	2	10	148878	148887	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NT_187127	TGTGG	2	10	149294	149303	0 %	40 %	60 %	0 %	409247996
117	NT_187127	CGATC	2	10	149473	149482	20 %	20 %	20 %	40 %	409247996
118	NT_187127	AAAAC	2	10	151439	151448	80 %	0 %	0 %	20 %	409247998
119	NT_187127	GTATT	2	10	151781	151790	20 %	60 %	20 %	0 %	409247998
120	NT_187127	ATCTT	2	10	155206	155215	20 %	60 %	0 %	20 %	409247999
121	NT_187127	GAAAA	2	10	155393	155402	80 %	0 %	20 %	0 %	409247999
122	NT_187127	GGCTG	2	10	155995	156004	0 %	20 %	60 %	20 %	409247999
123	NT_187127	TTATC	2	10	157668	157677	20 %	60 %	0 %	20 %	409248000
124	NT_187127	TTACG	2	10	158449	158458	20 %	40 %	20 %	20 %	409248000
125	NT_187127	GGAAC	2	10	159228	159237	40 %	0 %	40 %	20 %	409248000
126	NT_187127	GCTTG	2	10	159402	159411	0 %	40 %	40 %	20 %	409248000
127	NT_187127	TCCCT	2	10	162588	162597	0 %	40 %	0 %	60 %	409248001
128	NT_187127	GCCGG	2	10	162809	162818	0 %	0 %	60 %	40 %	409248002
129	NT_187127	ATAAC	2	10	164033	164042	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NT_187127	TCAAC	2	10	164553	164562	40 %	20 %	0 %	40 %	409248007
131	NT_187127	CGATA	2	10	165809	165818	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NT_187127	CGATA	2	10	166449	166458	40 %	20 %	20 %	20 %	409248009
133	NT_187127	CCGGG	2	10	168309	168318	0 %	0 %	60 %	40 %	409248010
134	NT_187127	AAATG	2	10	170372	170381	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NT_187127	TTCTG	2	10	171984	171993	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NT_187127	TGGGT	2	10	174109	174118	0 %	40 %	60 %	0 %	409248016
137	NT_187127	GGCGT	2	10	175738	175747	0 %	20 %	60 %	20 %	409248017
138	NT_187127	GCCAC	2	10	177013	177022	20 %	0 %	20 %	60 %	409248019
139	NT_187127	ATCGA	2	10	179749	179758	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NT_187127	CAGCA	2	10	181411	181420	40 %	0 %	20 %	40 %	409248023
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142	NT_187127	TGCGC	2	10	183534	183543	0 %	20 %	40 %	40 %	409248025
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150	NT_187127	GGCGT	2	10	203416	203425	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
151	NT_187127	GACGC	2	10	206020	206029	20 %	0 %	40 %	40 %	409248049
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177	NT_187127	GGGGT	2	10	253485	253494	0 %	20 %	80 %	0 %	409248102
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231	NT_187127	CGGCG	2	10	329088	329097	0 %	0 %	60 %	40 %	409248176
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244	NT_187127	CACGA	2	10	350886	350895	40 %	0 %	20 %	40 %	409248200
245	NT_187127	AGTTG	2	10	351167	351176	20 %	40 %	40 %	0 %	409248201
246	NT_187127	GTCAT	2	10	352207	352216	20 %	40 %	20 %	20 %	409248204
247	NT_187127	TCTGC	2	10	352886	352895	0 %	40 %	20 %	40 %	409248205

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.