MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 7360

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3006	NT_187127	GCT	2	6	143075	143080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247985
3007	NT_187127	CGAT	2	8	143138	143145	25 %	25 %	25 %	25 %	409247985
3008	NT_187127	CGG	2	6	143155	143160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247985
3009	NT_187127	AAT	2	6	143220	143225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247985
3010	NT_187127	TTA	2	6	143330	143335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NT_187127	TTG	2	6	143373	143378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3012	NT_187127	TTAC	2	8	143393	143400	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3013	NT_187127	TCC	2	6	143443	143448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3014	NT_187127	T	8	8	143477	143484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NT_187127	CT	4	8	143494	143501	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3017	NT_187127	AATA	2	8	143518	143525	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NT_187127	T	7	7	143534	143540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NT_187127	AGG	2	6	143542	143547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3020	NT_187127	TCA	2	6	143599	143604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247986
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3024	NT_187127	TTG	2	6	143862	143867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409247987
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3030	NT_187127	CTG	2	6	144060	144065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247987
3031	NT_187127	TAT	2	6	144085	144090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NT_187127	TCAGGT	2	12	144098	144109	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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3034	NT_187127	TTAAA	2	10	144165	144174	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NT_187127	GAT	2	6	144203	144208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3036	NT_187127	TTGCC	2	10	144217	144226	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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3064	NT_187127	TA	3	6	145495	145500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NT_187127	ATT	2	6	145501	145506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3072	NT_187127	GAGGG	2	10	145877	145886	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
3073	NT_187127	TA	3	6	145982	145987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3093	NT_187127	TCT	2	6	147265	147270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247992
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3122	NT_187127	ATG	2	6	148313	148318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3123	NT_187127	TTATGA	2	12	148333	148344	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3124	NT_187127	AAG	2	6	148374	148379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3125	NT_187127	A	6	6	148389	148394	100 %	0 %	0 %	0 %	409247994
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3242	NT_187127	AAT	2	6	153672	153677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247998
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3246	NT_187127	GTA	2	6	153779	153784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3247	NT_187127	TAT	2	6	153817	153822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247999
3248	NT_187127	TAC	2	6	153845	153850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247999
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3374	NT_187127	CAC	2	6	161346	161351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248000
3375	NT_187127	TGGA	2	8	161620	161627	25 %	25 %	50 %	0 %	409248000
3376	NT_187127	ATT	2	6	161635	161640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248000
3377	NT_187127	GACC	2	8	161643	161650	25 %	0 %	25 %	50 %	409248000
3378	NT_187127	GTTA	2	8	161652	161659	25 %	50 %	25 %	0 %	409248000
3379	NT_187127	GAG	2	6	161678	161683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409248000
3380	NT_187127	GCT	2	6	161803	161808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248000
3381	NT_187127	GAA	2	6	161872	161877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248000
3382	NT_187127	CAG	2	6	161986	161991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248000
3383	NT_187127	TC	3	6	162007	162012	0 %	50 %	0 %	50 %	409248000
3384	NT_187127	ATC	2	6	162013	162018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248000
3385	NT_187127	GAA	2	6	162030	162035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248000
3386	NT_187127	ATA	2	6	162044	162049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248000
3387	NT_187127	ATC	2	6	162086	162091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248000
3388	NT_187127	CTGC	2	8	162120	162127	0 %	25 %	25 %	50 %	409248000
3389	NT_187127	CTT	2	6	162193	162198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248000
3390	NT_187127	TGC	2	6	162315	162320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248000
3391	NT_187127	ATG	2	6	162325	162330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248000
3392	NT_187127	TAC	2	6	162377	162382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248000
3393	NT_187127	TGC	2	6	162402	162407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248000
3394	NT_187127	TGC	2	6	162411	162416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248000
3395	NT_187127	CGA	2	6	162461	162466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248000
3396	NT_187127	CGC	2	6	162484	162489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248000
3397	NT_187127	AATG	2	8	162550	162557	50 %	25 %	25 %	0 %	409248001
3398	NT_187127	TCCCT	2	10	162588	162597	0 %	40 %	0 %	60 %	409248001
3399	NT_187127	CTG	2	6	162632	162637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248001
3400	NT_187127	ACGC	2	8	162657	162664	25 %	0 %	25 %	50 %	409248001
3401	NT_187127	GCT	2	6	162737	162742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248002
3402	NT_187127	GCCGG	2	10	162809	162818	0 %	0 %	60 %	40 %	409248002
3403	NT_187127	AT	3	6	162830	162835	50 %	50 %	0 %	0 %	409248002
3404	NT_187127	GCC	2	6	162910	162915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248002
3405	NT_187127	G	6	6	162929	162934	0 %	0 %	100 %	0 %	409248002
3406	NT_187127	A	6	6	162945	162950	100 %	0 %	0 %	0 %	409248002
3407	NT_187127	AGT	2	6	162983	162988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248002
3408	NT_187127	GGGC	2	8	163004	163011	0 %	0 %	75 %	25 %	409248002
3409	NT_187127	AT	3	6	163019	163024	50 %	50 %	0 %	0 %	409248002
3410	NT_187127	AAG	2	6	163098	163103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248002
3411	NT_187127	ATC	2	6	163401	163406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248002
3412	NT_187127	ATC	2	6	163458	163463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248002
3413	NT_187127	GTT	2	6	163499	163504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248002
3414	NT_187127	A	8	8	163558	163565	100 %	0 %	0 %	0 %	409248002
3415	NT_187127	TCA	2	6	163632	163637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248002
3416	NT_187127	AAG	2	6	163651	163656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248002
3417	NT_187127	GTTTCA	2	12	163663	163674	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	409248002
3418	NT_187127	GA	3	6	163689	163694	50 %	0 %	50 %	0 %	409248002
3419	NT_187127	AAC	2	6	163723	163728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3420	NT_187127	GAC	2	6	163816	163821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248003
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3422	NT_187127	C	6	6	163855	163860	0 %	0 %	0 %	100 %	409248003
3423	NT_187127	AAT	2	6	163897	163902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248003
3424	NT_187127	GATCTT	2	12	163936	163947	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	409248003
3425	NT_187127	AT	3	6	163965	163970	50 %	50 %	0 %	0 %	409248003
3426	NT_187127	CAT	2	6	164023	164028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248003
3427	NT_187127	ATAAC	2	10	164033	164042	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3428	NT_187127	TGA	2	6	164043	164048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3429	NT_187127	CAA	2	6	164132	164137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248005
3430	NT_187127	A	6	6	164153	164158	100 %	0 %	0 %	0 %	409248005
3431	NT_187127	GTT	2	6	164176	164181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248005
3432	NT_187127	CCT	2	6	164199	164204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409248005
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3434	NT_187127	CTG	2	6	164348	164353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248006
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3436	NT_187127	CTG	2	6	164396	164401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248006
3437	NT_187127	TGC	3	9	164431	164439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248006
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3439	NT_187127	GCGG	2	8	164677	164684	0 %	0 %	75 %	25 %	409248008
3440	NT_187127	AG	3	6	164691	164696	50 %	0 %	50 %	0 %	409248008
3441	NT_187127	ATCA	2	8	164767	164774	50 %	25 %	0 %	25 %	409248008
3442	NT_187127	GAT	2	6	164843	164848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248008
3443	NT_187127	GCA	2	6	164899	164904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248008
3444	NT_187127	CTGGCG	2	12	164925	164936	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409248008
3445	NT_187127	TGG	3	9	164956	164964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248008
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3447	NT_187127	GGC	2	6	165077	165082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248008
3448	NT_187127	CTG	2	6	165093	165098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248008
3449	NT_187127	GCTG	2	8	165158	165165	0 %	25 %	50 %	25 %	409248008
3450	NT_187127	AC	3	6	165183	165188	50 %	0 %	0 %	50 %	409248008
3451	NT_187127	GGC	2	6	165254	165259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248008
3452	NT_187127	GGC	2	6	165334	165339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248008
3453	NT_187127	GGT	2	6	165371	165376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248008
3454	NT_187127	GAC	2	6	165394	165399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248008
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3458	NT_187127	GCG	2	6	165740	165745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3459	NT_187127	TAT	2	6	165771	165776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3460	NT_187127	TGA	2	6	165803	165808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3461	NT_187127	CGATA	2	10	165809	165818	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3462	NT_187127	TAT	2	6	165839	165844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3463	NT_187127	TGG	2	6	165883	165888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3464	NT_187127	TA	3	6	165922	165927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3465	NT_187127	TAT	2	6	165942	165947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3466	NT_187127	CAT	2	6	166048	166053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3467	NT_187127	AAT	2	6	166068	166073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3468	NT_187127	AAT	2	6	166077	166082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3469	NT_187127	ATG	2	6	166195	166200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3470	NT_187127	CGA	2	6	166218	166223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248009
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3472	NT_187127	CAT	2	6	166264	166269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248009
3473	NT_187127	A	6	6	166331	166336	100 %	0 %	0 %	0 %	409248009
3474	NT_187127	CGC	2	6	166347	166352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248009
3475	NT_187127	CCTGCG	2	12	166412	166423	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	409248009
3476	NT_187127	CGATA	2	10	166449	166458	40 %	20 %	20 %	20 %	409248009
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3479	NT_187127	CTG	2	6	166699	166704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248009
3480	NT_187127	CAT	2	6	166729	166734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248009
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3482	NT_187127	GCA	2	6	166818	166823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248009
3483	NT_187127	GCA	2	6	166833	166838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248009
3484	NT_187127	GCT	2	6	166857	166862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248009
3485	NT_187127	AGC	2	6	166892	166897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248009
3486	NT_187127	CAG	2	6	166909	166914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248009
3487	NT_187127	CAG	2	6	166969	166974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248009
3488	NT_187127	GCG	2	6	167056	167061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248009
3489	NT_187127	AGC	2	6	167069	167074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248009
3490	NT_187127	A	6	6	167101	167106	100 %	0 %	0 %	0 %	409248009
3491	NT_187127	GCCA	2	8	167115	167122	25 %	0 %	25 %	50 %	409248009
3492	NT_187127	CCAG	2	8	167145	167152	25 %	0 %	25 %	50 %	409248009
3493	NT_187127	GAT	2	6	167170	167175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248009
3494	NT_187127	CCA	2	6	167186	167191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248009
3495	NT_187127	GCC	2	6	167194	167199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248009
3496	NT_187127	GC	3	6	167213	167218	0 %	0 %	50 %	50 %	409248009
3497	NT_187127	AAT	2	6	167269	167274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248009
3498	NT_187127	GCC	2	6	167356	167361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248009
3499	NT_187127	CGA	3	9	167390	167398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248009
3500	NT_187127	GCT	2	6	167419	167424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248009

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