MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 143

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187126	TTAA	2	8	495	502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NT_187126	TGAA	2	8	646	653	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187126	TTTA	2	8	719	726	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187126	TAAT	2	8	816	823	50 %	50 %	0 %	0 %	409247809
5	NT_187126	GCCA	2	8	1966	1973	25 %	0 %	25 %	50 %	409247809
6	NT_187126	TGGT	2	8	2229	2236	0 %	50 %	50 %	0 %	409247810
7	NT_187126	CCAG	2	8	2524	2531	25 %	0 %	25 %	50 %	409247810
8	NT_187126	GGCG	2	8	2564	2571	0 %	0 %	75 %	25 %	409247810
9	NT_187126	AACC	2	8	2668	2675	50 %	0 %	0 %	50 %	409247810
10	NT_187126	GTTC	2	8	3730	3737	0 %	50 %	25 %	25 %	409247812
11	NT_187126	CCGC	2	8	4341	4348	0 %	0 %	25 %	75 %	409247812
12	NT_187126	ACGC	2	8	5453	5460	25 %	0 %	25 %	50 %	409247812
13	NT_187126	TCAC	2	8	6815	6822	25 %	25 %	0 %	50 %	409247814
14	NT_187126	GAAA	2	8	7514	7521	75 %	0 %	25 %	0 %	409247814
15	NT_187126	GGTC	2	8	9010	9017	0 %	25 %	50 %	25 %	409247817
16	NT_187126	CGAA	2	8	10289	10296	50 %	0 %	25 %	25 %	409247819
17	NT_187126	TGCG	2	8	10327	10334	0 %	25 %	50 %	25 %	409247819
18	NT_187126	GATG	2	8	10503	10510	25 %	25 %	50 %	0 %	409247819
19	NT_187126	TGGC	2	8	10838	10845	0 %	25 %	50 %	25 %	409247819
20	NT_187126	AGCG	2	8	11680	11687	25 %	0 %	50 %	25 %	409247820
21	NT_187126	CCGA	2	8	12056	12063	25 %	0 %	25 %	50 %	409247820
22	NT_187126	TACG	2	8	12075	12082	25 %	25 %	25 %	25 %	409247820
23	NT_187126	GGAT	2	8	13050	13057	25 %	25 %	50 %	0 %	409247820
24	NT_187126	AAGC	2	8	13189	13196	50 %	0 %	25 %	25 %	409247820
25	NT_187126	CAGG	2	8	13233	13240	25 %	0 %	50 %	25 %	409247820
26	NT_187126	TAAT	2	8	13268	13275	50 %	50 %	0 %	0 %	409247820
27	NT_187126	CAAA	2	8	13311	13318	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NT_187126	AAGG	2	8	13573	13580	50 %	0 %	50 %	0 %	409247821
29	NT_187126	TTTC	2	8	13809	13816	0 %	75 %	0 %	25 %	409247821
30	NT_187126	ATGG	2	8	14366	14373	25 %	25 %	50 %	0 %	409247822
31	NT_187126	CGGT	2	8	15033	15040	0 %	25 %	50 %	25 %	409247823
32	NT_187126	CGCT	2	8	15149	15156	0 %	25 %	25 %	50 %	409247823
33	NT_187126	CCAA	2	8	15209	15216	50 %	0 %	0 %	50 %	409247823
34	NT_187126	TCGG	2	8	15290	15297	0 %	25 %	50 %	25 %	409247823
35	NT_187126	CGGG	2	8	15514	15521	0 %	0 %	75 %	25 %	409247823
36	NT_187126	CAGC	2	8	16641	16648	25 %	0 %	25 %	50 %	409247825
37	NT_187126	AAAT	2	8	17478	17485	75 %	25 %	0 %	0 %	409247827
38	NT_187126	ATCA	2	8	18375	18382	50 %	25 %	0 %	25 %	409247829
39	NT_187126	CGCC	2	8	18719	18726	0 %	0 %	25 %	75 %	409247829
40	NT_187126	CCAG	2	8	19235	19242	25 %	0 %	25 %	50 %	409247829
41	NT_187126	CGTT	2	8	19489	19496	0 %	50 %	25 %	25 %	409247829
42	NT_187126	GCTG	2	8	19561	19568	0 %	25 %	50 %	25 %	409247829
43	NT_187126	CAGC	2	8	20071	20078	25 %	0 %	25 %	50 %	409247830
44	NT_187126	TGGC	2	8	20581	20588	0 %	25 %	50 %	25 %	409247830
45	NT_187126	TGCT	2	8	20935	20942	0 %	50 %	25 %	25 %	409247831
46	NT_187126	TTAT	2	8	21304	21311	25 %	75 %	0 %	0 %	409247831
47	NT_187126	TCGC	2	8	21860	21867	0 %	25 %	25 %	50 %	409247831
48	NT_187126	GTAC	2	8	22770	22777	25 %	25 %	25 %	25 %	409247833
49	NT_187126	GCAC	2	8	23998	24005	25 %	0 %	25 %	50 %	409247835
50	NT_187126	AGAA	2	8	24402	24409	75 %	0 %	25 %	0 %	409247835
51	NT_187126	CTGG	2	8	24543	24550	0 %	25 %	50 %	25 %	409247835
52	NT_187126	ATAA	2	8	25755	25762	75 %	25 %	0 %	0 %	409247836
53	NT_187126	GCGA	2	8	25921	25928	25 %	0 %	50 %	25 %	409247837
54	NT_187126	AAGC	2	8	27255	27262	50 %	0 %	25 %	25 %	409247840
55	NT_187126	TAAG	2	8	27311	27318	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NT_187126	AATC	2	8	27513	27520	50 %	25 %	0 %	25 %	409247841
57	NT_187126	GTCC	2	8	27665	27672	0 %	25 %	25 %	50 %	409247841
58	NT_187126	CGAA	2	8	27756	27763	50 %	0 %	25 %	25 %	409247841
59	NT_187126	GGCG	2	8	27889	27896	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
60	NT_187126	TGGA	2	8	28115	28122	25 %	25 %	50 %	0 %	409247842
61	NT_187126	CAAA	2	8	28350	28357	75 %	0 %	0 %	25 %	409247842
62	NT_187126	CGTT	2	8	28377	28384	0 %	50 %	25 %	25 %	409247842
63	NT_187126	TGGT	2	8	28422	28429	0 %	50 %	50 %	0 %	409247842
64	NT_187126	ACTG	2	8	28687	28694	25 %	25 %	25 %	25 %	409247842
65	NT_187126	TCGT	2	8	30656	30663	0 %	50 %	25 %	25 %	409247843
66	NT_187126	CTGG	2	8	30721	30728	0 %	25 %	50 %	25 %	409247843
67	NT_187126	GGTT	2	8	31553	31560	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NT_187126	TGCG	2	8	31689	31696	0 %	25 %	50 %	25 %	409247844
69	NT_187126	GGTA	2	8	33363	33370	25 %	25 %	50 %	0 %	409247847
70	NT_187126	GAAA	2	8	33636	33643	75 %	0 %	25 %	0 %	409247847
71	NT_187126	AGTG	2	8	33894	33901	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NT_187126	AGAA	2	8	33983	33990	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NT_187126	ACAA	2	8	34225	34232	75 %	0 %	0 %	25 %	409247848
74	NT_187126	CTGG	2	8	35999	36006	0 %	25 %	50 %	25 %	409247850
75	NT_187126	CTGC	2	8	36063	36070	0 %	25 %	25 %	50 %	409247850
76	NT_187126	TGCG	2	8	36082	36089	0 %	25 %	50 %	25 %	409247850
77	NT_187126	GTCT	2	8	36886	36893	0 %	50 %	25 %	25 %	409247850
78	NT_187126	CCAG	2	8	36976	36983	25 %	0 %	25 %	50 %	409247850
79	NT_187126	GTCC	2	8	37810	37817	0 %	25 %	25 %	50 %	409247850
80	NT_187126	GCGT	2	8	37962	37969	0 %	25 %	50 %	25 %	409247850
81	NT_187126	GCTG	2	8	38440	38447	0 %	25 %	50 %	25 %	409247850
82	NT_187126	ATGC	2	8	39180	39187	25 %	25 %	25 %	25 %	409247850
83	NT_187126	GAAA	2	8	39434	39441	75 %	0 %	25 %	0 %	409247850
84	NT_187126	CGCT	2	8	39444	39451	0 %	25 %	25 %	50 %	409247850
85	NT_187126	CTGA	2	8	40036	40043	25 %	25 %	25 %	25 %	409247851
86	NT_187126	TATC	2	8	41163	41170	25 %	50 %	0 %	25 %	409247851
87	NT_187126	ACCG	2	8	41403	41410	25 %	0 %	25 %	50 %	409247851
88	NT_187126	CACG	2	8	41883	41890	25 %	0 %	25 %	50 %	409247851
89	NT_187126	AGTG	2	8	42648	42655	25 %	25 %	50 %	0 %	409247851
90	NT_187126	GTCT	2	8	42722	42729	0 %	50 %	25 %	25 %	409247851
91	NT_187126	TCGT	2	8	43325	43332	0 %	50 %	25 %	25 %	409247851
92	NT_187126	CCGG	2	8	43630	43637	0 %	0 %	50 %	50 %	409247851
93	NT_187126	GAAA	2	8	43861	43868	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NT_187126	TATT	3	12	44005	44016	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NT_187126	TGTT	2	8	44372	44379	0 %	75 %	25 %	0 %	409247852
96	NT_187126	TTTG	2	8	44668	44675	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NT_187126	AAGT	2	8	44869	44876	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NT_187126	ATTA	2	8	45413	45420	50 %	50 %	0 %	0 %	409247854
99	NT_187126	CTTA	2	8	45424	45431	25 %	50 %	0 %	25 %	409247854
100	NT_187126	CAGT	2	8	45863	45870	25 %	25 %	25 %	25 %	409247854
101	NT_187126	TCGT	2	8	46092	46099	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NT_187126	CATC	2	8	46432	46439	25 %	25 %	0 %	50 %	409247855
103	NT_187126	GGAA	2	8	46483	46490	50 %	0 %	50 %	0 %	409247855
104	NT_187126	TTTC	2	8	46664	46671	0 %	75 %	0 %	25 %	409247855
105	NT_187126	GGAT	2	8	47729	47736	25 %	25 %	50 %	0 %	409247856
106	NT_187126	GCTG	2	8	47919	47926	0 %	25 %	50 %	25 %	409247856
107	NT_187126	CTGG	2	8	48285	48292	0 %	25 %	50 %	25 %	409247858
108	NT_187126	TCAT	2	8	48961	48968	25 %	50 %	0 %	25 %	409247858
109	NT_187126	GGCG	2	8	49401	49408	0 %	0 %	75 %	25 %	409247859
110	NT_187126	CGCC	2	8	49500	49507	0 %	0 %	25 %	75 %	409247859
111	NT_187126	GCGG	2	8	49803	49810	0 %	0 %	75 %	25 %	409247860
112	NT_187126	TGGC	2	8	51195	51202	0 %	25 %	50 %	25 %	409247860
113	NT_187126	ACTT	2	8	51711	51718	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NT_187126	TTCC	2	8	52097	52104	0 %	50 %	0 %	50 %	409247861
115	NT_187126	TTCA	2	8	52191	52198	25 %	50 %	0 %	25 %	409247861
116	NT_187126	CCAG	2	8	52274	52281	25 %	0 %	25 %	50 %	409247861
117	NT_187126	CTGG	2	8	52597	52604	0 %	25 %	50 %	25 %	409247862
118	NT_187126	GGCG	2	8	53375	53382	0 %	0 %	75 %	25 %	409247863
119	NT_187126	CATC	2	8	54233	54240	25 %	25 %	0 %	50 %	409247863
120	NT_187126	TGAT	2	8	55830	55837	25 %	50 %	25 %	0 %	409247866
121	NT_187126	TGGT	2	8	55944	55951	0 %	50 %	50 %	0 %	409247866
122	NT_187126	GTTT	2	8	56048	56055	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NT_187126	TAAG	2	8	56081	56088	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NT_187126	TGTC	2	8	56136	56143	0 %	50 %	25 %	25 %	409247867
125	NT_187126	CTGC	2	8	56184	56191	0 %	25 %	25 %	50 %	409247867
126	NT_187126	ACGA	2	8	56273	56280	50 %	0 %	25 %	25 %	409247867
127	NT_187126	TAAG	2	8	57507	57514	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NT_187126	AAAC	2	8	58079	58086	75 %	0 %	0 %	25 %	409247869
129	NT_187126	ACTC	2	8	58511	58518	25 %	25 %	0 %	50 %	409247869
130	NT_187126	GTCA	2	8	58529	58536	25 %	25 %	25 %	25 %	409247869
131	NT_187126	GACC	2	8	58705	58712	25 %	0 %	25 %	50 %	409247869
132	NT_187126	TTAA	2	8	59254	59261	50 %	50 %	0 %	0 %	409247870
133	NT_187126	TGAA	2	8	59399	59406	50 %	25 %	25 %	0 %	409247870
134	NT_187126	GCGG	2	8	60042	60049	0 %	0 %	75 %	25 %	409247870
135	NT_187126	CTGG	2	8	60918	60925	0 %	25 %	50 %	25 %	409247871
136	NT_187126	GCTT	2	8	60969	60976	0 %	50 %	25 %	25 %	409247871
137	NT_187126	GGCT	2	8	61164	61171	0 %	25 %	50 %	25 %	409247871
138	NT_187126	CGAG	2	8	61216	61223	25 %	0 %	50 %	25 %	409247871
139	NT_187126	GATC	2	8	61358	61365	25 %	25 %	25 %	25 %	409247871
140	NT_187126	CGCC	2	8	61525	61532	0 %	0 %	25 %	75 %	409247871
141	NT_187126	GGCT	2	8	62316	62323	0 %	25 %	50 %	25 %	409247872
142	NT_187126	TCCA	2	8	62964	62971	25 %	25 %	0 %	50 %	409247872
143	NT_187126	GGCG	2	8	63035	63042	0 %	0 %	75 %	25 %	409247872

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.