MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 972

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187126	ATC	2	6	31	36	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NT_187126	CGC	2	6	57	62	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NT_187126	TCG	2	6	65	70	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NT_187126	CAT	3	9	81	89	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NT_187126	CGC	2	6	90	95	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NT_187126	ATC	2	6	97	102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NT_187126	CGC	2	6	123	128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NT_187126	GCC	2	6	151	156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NT_187126	TCG	2	6	158	163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NT_187126	CGC	2	6	177	182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NT_187126	GCA	2	6	269	274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NT_187126	CGC	2	6	276	281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NT_187126	GAG	2	6	365	370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409247807
14	NT_187126	TCA	2	6	392	397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247807
15	NT_187126	GCG	2	6	410	415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247807
16	NT_187126	TAA	2	6	428	433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247807
17	NT_187126	ATG	2	6	546	551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247808
18	NT_187126	GAA	2	6	561	566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247808
19	NT_187126	TAT	2	6	632	637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187126	ATT	2	6	694	699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NT_187126	AAT	2	6	758	763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187126	GAC	2	6	936	941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247809
23	NT_187126	CGC	2	6	1100	1105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247809
24	NT_187126	AGC	2	6	1184	1189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247809
25	NT_187126	CGC	3	9	1259	1267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247809
26	NT_187126	CGC	2	6	1286	1291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247809
27	NT_187126	GCA	2	6	1331	1336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247809
28	NT_187126	TCC	2	6	1351	1356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409247809
29	NT_187126	GTC	2	6	1431	1436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247809
30	NT_187126	TGT	2	6	1480	1485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409247809
31	NT_187126	CAG	2	6	1500	1505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247809
32	NT_187126	CGA	2	6	1663	1668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247809
33	NT_187126	TGC	2	6	1744	1749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247809
34	NT_187126	GCA	2	6	1751	1756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247809
35	NT_187126	GCA	2	6	1775	1780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247809
36	NT_187126	GCC	2	6	1803	1808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247809
37	NT_187126	GAG	2	6	1810	1815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409247809
38	NT_187126	GCG	2	6	1829	1834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247809
39	NT_187126	AAT	2	6	1842	1847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247809
40	NT_187126	GGC	2	6	1866	1871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247809
41	NT_187126	CCA	2	6	1883	1888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247809
42	NT_187126	CCG	2	6	1913	1918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247809
43	NT_187126	TCG	2	6	1945	1950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247809
44	NT_187126	TCG	2	6	1993	1998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247809
45	NT_187126	CAG	2	6	2097	2102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247809
46	NT_187126	CCG	2	6	2134	2139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247809
47	NT_187126	ACG	2	6	2298	2303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247810
48	NT_187126	TGA	2	6	2376	2381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247810
49	NT_187126	CAG	2	6	2450	2455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247810
50	NT_187126	ACC	2	6	2458	2463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247810
51	NT_187126	GAA	2	6	2549	2554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247810
52	NT_187126	GGT	2	6	2573	2578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247810
53	NT_187126	CAA	2	6	2621	2626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247810
54	NT_187126	GCC	3	9	2630	2638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247810
55	NT_187126	GAT	2	6	2792	2797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247810
56	NT_187126	AAT	2	6	2885	2890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247810
57	NT_187126	ATT	2	6	2945	2950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247810
58	NT_187126	TTA	2	6	2991	2996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247810
59	NT_187126	GCC	2	6	3077	3082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NT_187126	AAT	2	6	3190	3195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247811
61	NT_187126	CAC	2	6	3210	3215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247811
62	NT_187126	CGC	2	6	3446	3451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247811
63	NT_187126	TCC	2	6	3528	3533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409247812
64	NT_187126	TGT	2	6	3576	3581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409247812
65	NT_187126	TCT	2	6	3717	3722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247812
66	NT_187126	GTC	2	6	3749	3754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247812
67	NT_187126	GAT	2	6	3755	3760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247812
68	NT_187126	GCC	2	6	3782	3787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247812
69	NT_187126	CAT	2	6	3848	3853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247812
70	NT_187126	AGC	2	6	3873	3878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247812
71	NT_187126	CAG	2	6	3902	3907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247812
72	NT_187126	GCC	2	6	3929	3934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247812
73	NT_187126	GAT	2	6	3974	3979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247812
74	NT_187126	TGC	2	6	4129	4134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247812
75	NT_187126	CCA	2	6	4315	4320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247812
76	NT_187126	GCG	2	6	4420	4425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247812
77	NT_187126	TGC	2	6	4428	4433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247812
78	NT_187126	ACG	2	6	4459	4464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247812
79	NT_187126	CAG	2	6	4466	4471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247812
80	NT_187126	CAG	2	6	4526	4531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247812
81	NT_187126	TTC	2	6	4532	4537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247812
82	NT_187126	GTT	3	9	4610	4618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409247812
83	NT_187126	GCC	2	6	4679	4684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247812
84	NT_187126	GCC	2	6	4719	4724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247812
85	NT_187126	GCG	2	6	4749	4754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247812
86	NT_187126	GCA	2	6	4909	4914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247812
87	NT_187126	AGC	2	6	4956	4961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247812
88	NT_187126	CTT	2	6	4999	5004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247812
89	NT_187126	GCC	2	6	5066	5071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247812
90	NT_187126	CAG	2	6	5084	5089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247812
91	NT_187126	CGC	2	6	5278	5283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247812
92	NT_187126	AGA	2	6	5344	5349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247812
93	NT_187126	CTG	2	6	5414	5419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247812
94	NT_187126	GCT	2	6	5485	5490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247812
95	NT_187126	CGC	2	6	5491	5496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247812
96	NT_187126	CAG	2	6	5594	5599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247812
97	NT_187126	CCG	3	9	5601	5609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247812
98	NT_187126	ACC	2	6	5610	5615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247812
99	NT_187126	TGC	2	6	5626	5631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247812
100	NT_187126	CGG	2	6	5711	5716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247812
101	NT_187126	ATA	2	6	5756	5761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247812
102	NT_187126	GTG	2	6	5894	5899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247812
103	NT_187126	TTC	2	6	5945	5950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247812
104	NT_187126	ATA	2	6	6036	6041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247812
105	NT_187126	AGG	2	6	6273	6278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NT_187126	ACC	2	6	6449	6454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247814
107	NT_187126	CGC	2	6	6481	6486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247814
108	NT_187126	GAC	2	6	6520	6525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247814
109	NT_187126	TGC	2	6	6599	6604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247814
110	NT_187126	ATG	2	6	6617	6622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247814
111	NT_187126	GAA	2	6	6643	6648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247814
112	NT_187126	TAA	2	6	6693	6698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247814
113	NT_187126	CCG	2	6	6714	6719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247814
114	NT_187126	GCG	2	6	6917	6922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247814
115	NT_187126	GAC	2	6	6961	6966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247814
116	NT_187126	TGC	2	6	6980	6985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247814
117	NT_187126	TAC	2	6	7083	7088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247814
118	NT_187126	CAG	2	6	7093	7098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247814
119	NT_187126	GGC	2	6	7102	7107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247814
120	NT_187126	ATC	2	6	7121	7126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247814
121	NT_187126	GAA	2	6	7138	7143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247814
122	NT_187126	CAG	2	6	7156	7161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247814
123	NT_187126	CGC	2	6	7255	7260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247814
124	NT_187126	AAC	2	6	7265	7270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247814
125	NT_187126	GAT	2	6	7351	7356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247814
126	NT_187126	ATT	2	6	7643	7648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NT_187126	CAT	2	6	7693	7698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NT_187126	CGT	2	6	7719	7724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NT_187126	GGC	2	6	7854	7859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247815
130	NT_187126	GCA	2	6	7906	7911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247815
131	NT_187126	ACC	2	6	7936	7941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247815
132	NT_187126	CCG	2	6	7943	7948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247815
133	NT_187126	AAC	2	6	8032	8037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247815
134	NT_187126	GGT	2	6	8080	8085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247815
135	NT_187126	GCA	2	6	8100	8105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247815
136	NT_187126	GAA	2	6	8106	8111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247815
137	NT_187126	CCG	2	6	8119	8124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247815
138	NT_187126	CCA	2	6	8204	8209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247815
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142	NT_187126	GAA	2	6	8520	8525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247816
143	NT_187126	GCG	2	6	8562	8567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247816
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146	NT_187126	TCA	2	6	8752	8757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247817
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148	NT_187126	GAA	2	6	8993	8998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247817
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150	NT_187126	TCT	2	6	9114	9119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247817
151	NT_187126	GCG	2	6	9201	9206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247817
152	NT_187126	GCC	2	6	9303	9308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
153	NT_187126	ATG	2	6	9400	9405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247818
154	NT_187126	TCA	2	6	9551	9556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247818
155	NT_187126	GGT	2	6	9584	9589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247818
156	NT_187126	CTG	2	6	9846	9851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247818
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158	NT_187126	GGT	2	6	9946	9951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
159	NT_187126	TGA	2	6	9996	10001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247819
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162	NT_187126	CGG	2	6	10101	10106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247819
163	NT_187126	ATT	2	6	10459	10464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247819
164	NT_187126	GGT	3	9	10524	10532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247819
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232	NT_187126	TAA	2	6	15688	15693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
233	NT_187126	ATA	2	6	15740	15745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247824
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238	NT_187126	AAT	2	6	16125	16130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247825
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240	NT_187126	GTC	2	6	16230	16235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247825
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253	NT_187126	GCG	2	6	16833	16838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247825
254	NT_187126	GCA	2	6	16850	16855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247825
255	NT_187126	GTC	2	6	17040	17045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247826
256	NT_187126	GAG	2	6	17246	17251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409247827
257	NT_187126	GAG	2	6	17291	17296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409247827
258	NT_187126	GGC	2	6	17348	17353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247827
259	NT_187126	GAA	2	6	17372	17377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247827
260	NT_187126	TGA	2	6	17431	17436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247827
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263	NT_187126	TGC	2	6	17534	17539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247828
264	NT_187126	CGG	2	6	17639	17644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247828
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267	NT_187126	CAT	2	6	17904	17909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247829
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300	NT_187126	ACA	2	6	19892	19897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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302	NT_187126	GCG	2	6	19962	19967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
303	NT_187126	GAA	2	6	20021	20026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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363	NT_187126	TAT	2	6	23441	23446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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366	NT_187126	GCG	4	12	23515	23526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247834
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370	NT_187126	ATG	2	6	23724	23729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247834
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372	NT_187126	CGG	2	6	23752	23757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
373	NT_187126	ATA	2	6	23843	23848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
374	NT_187126	CTT	2	6	23894	23899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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384	NT_187126	GCT	2	6	24676	24681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247835
385	NT_187126	TGC	2	6	24748	24753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247835
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387	NT_187126	GCG	2	6	24789	24794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
388	NT_187126	AAT	2	6	24981	24986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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415	NT_187126	TTA	2	6	26880	26885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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499	NT_187126	GGC	2	6	32106	32111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247845
500	NT_187126	TTC	2	6	32136	32141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247845

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