MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 3110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NT_187124	GGATG	2	10	140231	140240	20 %	20 %	60 %	0 %	409247796
3002	NT_187124	CCG	2	6	140259	140264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247796
3003	NT_187124	CCG	2	6	140337	140342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247796
3004	NT_187124	GAC	2	6	140357	140362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247796
3005	NT_187124	CAT	2	6	140365	140370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247796
3006	NT_187124	ATAAA	2	10	140414	140423	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NT_187124	GAT	2	6	140427	140432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3008	NT_187124	T	6	6	140469	140474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NT_187124	CTGT	2	8	140493	140500	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3010	NT_187124	CAA	2	6	140606	140611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247797
3011	NT_187124	A	6	6	140616	140621	100 %	0 %	0 %	0 %	409247797
3012	NT_187124	TGG	2	6	140634	140639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247797
3013	NT_187124	CGT	2	6	140727	140732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247797
3014	NT_187124	TGG	2	6	140775	140780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247797
3015	NT_187124	TGC	2	6	140796	140801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247797
3016	NT_187124	GGC	2	6	140840	140845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247797
3017	NT_187124	CAA	2	6	140890	140895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247797
3018	NT_187124	TGT	2	6	140913	140918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409247797
3019	NT_187124	GCG	2	6	140942	140947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247797
3020	NT_187124	GCC	2	6	140954	140959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247797
3021	NT_187124	CG	4	8	141027	141034	0 %	0 %	50 %	50 %	409247797
3022	NT_187124	AGA	2	6	141127	141132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247797
3023	NT_187124	CAT	2	6	141209	141214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247797
3024	NT_187124	GCC	3	9	141437	141445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247798
3025	NT_187124	CGT	2	6	141478	141483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247798
3026	NT_187124	CGG	2	6	141522	141527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247798
3027	NT_187124	AGT	2	6	141594	141599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247798
3028	NT_187124	ATG	2	6	141678	141683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247799
3029	NT_187124	T	6	6	141812	141817	0 %	100 %	0 %	0 %	409247799
3030	NT_187124	GCG	2	6	141842	141847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247799
3031	NT_187124	CCG	2	6	141944	141949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247799
3032	NT_187124	AAT	2	6	141957	141962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247799
3033	NT_187124	GACG	2	8	142011	142018	25 %	0 %	50 %	25 %	409247799
3034	NT_187124	GC	3	6	142056	142061	0 %	0 %	50 %	50 %	409247799
3035	NT_187124	TTGCCG	2	12	142078	142089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247799
3036	NT_187124	GGC	2	6	142164	142169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247799
3037	NT_187124	ATC	2	6	142207	142212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247799
3038	NT_187124	TCA	2	6	142237	142242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247799
3039	NT_187124	TTTTAG	2	12	142265	142276	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	409247799
3040	NT_187124	GC	3	6	142310	142315	0 %	0 %	50 %	50 %	409247799
3041	NT_187124	GGC	2	6	142338	142343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247799
3042	NT_187124	CTT	2	6	142365	142370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247799
3043	NT_187124	ATC	2	6	142471	142476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247799
3044	NT_187124	TGGC	2	8	142501	142508	0 %	25 %	50 %	25 %	409247799
3045	NT_187124	CTG	2	6	142545	142550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247799
3046	NT_187124	CGCA	2	8	142602	142609	25 %	0 %	25 %	50 %	409247799
3047	NT_187124	TGAC	2	8	142618	142625	25 %	25 %	25 %	25 %	409247799
3048	NT_187124	GCGA	2	8	142628	142635	25 %	0 %	50 %	25 %	409247799
3049	NT_187124	CAT	2	6	142668	142673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247799
3050	NT_187124	GC	3	6	142683	142688	0 %	0 %	50 %	50 %	409247799
3051	NT_187124	AAT	2	6	142757	142762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NT_187124	TGA	2	6	142810	142815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3053	NT_187124	TGAGA	2	10	142942	142951	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3054	NT_187124	CGG	2	6	142972	142977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NT_187124	TCA	2	6	142982	142987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NT_187124	TCA	2	6	143058	143063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NT_187124	CTT	2	6	143094	143099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247800
3058	NT_187124	A	6	6	143125	143130	100 %	0 %	0 %	0 %	409247800
3059	NT_187124	GCT	2	6	143136	143141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247800
3060	NT_187124	CAG	2	6	143224	143229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247800
3061	NT_187124	ATG	2	6	143306	143311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247800
3062	NT_187124	GCG	3	9	143348	143356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247800
3063	NT_187124	CTC	2	6	143367	143372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409247800
3064	NT_187124	ATTG	2	8	143412	143419	25 %	50 %	25 %	0 %	409247800
3065	NT_187124	GCGT	2	8	143423	143430	0 %	25 %	50 %	25 %	409247800
3066	NT_187124	CCG	2	6	143456	143461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247800
3067	NT_187124	AT	3	6	143502	143507	50 %	50 %	0 %	0 %	409247800
3068	NT_187124	CGG	2	6	143547	143552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247800
3069	NT_187124	ACG	2	6	143569	143574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247800
3070	NT_187124	CG	3	6	143573	143578	0 %	0 %	50 %	50 %	409247800
3071	NT_187124	CGTG	2	8	143829	143836	0 %	25 %	50 %	25 %	409247800
3072	NT_187124	ACG	2	6	143864	143869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247800
3073	NT_187124	CGC	2	6	143888	143893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247800
3074	NT_187124	TGAT	2	8	143894	143901	25 %	50 %	25 %	0 %	409247800
3075	NT_187124	GATGA	2	10	144049	144058	40 %	20 %	40 %	0 %	409247800
3076	NT_187124	GGGC	2	8	144113	144120	0 %	0 %	75 %	25 %	409247800
3077	NT_187124	ACA	2	6	144213	144218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247800
3078	NT_187124	GCG	3	9	144241	144249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247800
3079	NT_187124	TGA	2	6	144255	144260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247800
3080	NT_187124	GTC	2	6	144275	144280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247800
3081	NT_187124	CCT	2	6	144338	144343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409247800
3082	NT_187124	CCT	2	6	144350	144355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409247800
3083	NT_187124	TTA	2	6	144387	144392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247800
3084	NT_187124	ATC	2	6	144521	144526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247800
3085	NT_187124	GC	3	6	144553	144558	0 %	0 %	50 %	50 %	409247800
3086	NT_187124	G	6	6	144725	144730	0 %	0 %	100 %	0 %	409247800
3087	NT_187124	GCG	2	6	144803	144808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247800
3088	NT_187124	ATG	2	6	145017	145022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247801
3089	NT_187124	CGG	2	6	145028	145033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247801
3090	NT_187124	TA	4	8	145052	145059	50 %	50 %	0 %	0 %	409247801
3091	NT_187124	TCG	2	6	145110	145115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247801
3092	NT_187124	CAG	2	6	145145	145150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247801
3093	NT_187124	GGT	2	6	145237	145242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247801
3094	NT_187124	GCG	2	6	145268	145273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247801
3095	NT_187124	CGT	2	6	145291	145296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247801
3096	NT_187124	CGA	2	6	145308	145313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247801
3097	NT_187124	GC	3	6	145352	145357	0 %	0 %	50 %	50 %	409247801
3098	NT_187124	AATG	2	8	145364	145371	50 %	25 %	25 %	0 %	409247801
3099	NT_187124	TGG	2	6	145401	145406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247801
3100	NT_187124	GAA	2	6	145448	145453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247801
3101	NT_187124	GCC	2	6	145492	145497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247801
3102	NT_187124	CGGCG	2	10	145588	145597	0 %	0 %	60 %	40 %	409247801
3103	NT_187124	CGT	2	6	145604	145609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247801
3104	NT_187124	ATT	2	6	145702	145707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247801
3105	NT_187124	ATT	2	6	145793	145798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NT_187124	CCA	2	6	145842	145847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3107	NT_187124	AAC	2	6	145857	145862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NT_187124	CA	3	6	145865	145870	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3109	NT_187124	GCC	2	6	145872	145877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3110	NT_187124	CAG	2	6	145882	145887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.