MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 110

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187122	TCAT	2	8	554	561	25 %	50 %	0 %	25 %	409247534
2	NT_187122	ATTT	2	8	863	870	25 %	75 %	0 %	0 %	409247534
3	NT_187122	CAAA	2	8	912	919	75 %	0 %	0 %	25 %	409247534
4	NT_187122	ATTA	2	8	1106	1113	50 %	50 %	0 %	0 %	409247534
5	NT_187122	TAGG	2	8	1751	1758	25 %	25 %	50 %	0 %	409247535
6	NT_187122	AATC	2	8	1764	1771	50 %	25 %	0 %	25 %	409247535
7	NT_187122	AAAT	2	8	2172	2179	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NT_187122	CAGA	2	8	2320	2327	50 %	0 %	25 %	25 %	409247536
9	NT_187122	TCCG	2	8	2365	2372	0 %	25 %	25 %	50 %	409247536
10	NT_187122	CTGC	2	8	2467	2474	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NT_187122	GGTT	2	8	3774	3781	0 %	50 %	50 %	0 %	409247537
12	NT_187122	TGGC	2	8	3886	3893	0 %	25 %	50 %	25 %	409247537
13	NT_187122	GATT	2	8	4513	4520	25 %	50 %	25 %	0 %	409247538
14	NT_187122	CCTG	2	8	5213	5220	0 %	25 %	25 %	50 %	409247540
15	NT_187122	ATGA	2	8	5598	5605	50 %	25 %	25 %	0 %	409247540
16	NT_187122	CCAG	2	8	6074	6081	25 %	0 %	25 %	50 %	409247541
17	NT_187122	ACGC	2	8	7447	7454	25 %	0 %	25 %	50 %	409247542
18	NT_187122	CGAT	2	8	8591	8598	25 %	25 %	25 %	25 %	409247543
19	NT_187122	TCGC	2	8	9246	9253	0 %	25 %	25 %	50 %	409247544
20	NT_187122	GTTT	2	8	9545	9552	0 %	75 %	25 %	0 %	409247545
21	NT_187122	TCAA	2	8	9593	9600	50 %	25 %	0 %	25 %	409247545
22	NT_187122	ACGC	2	8	9940	9947	25 %	0 %	25 %	50 %	409247545
23	NT_187122	CGCC	2	8	10451	10458	0 %	0 %	25 %	75 %	409247546
24	NT_187122	TTGG	2	8	10557	10564	0 %	50 %	50 %	0 %	409247546
25	NT_187122	AAAC	2	8	10844	10851	75 %	0 %	0 %	25 %	409247546
26	NT_187122	GCCA	2	8	10912	10919	25 %	0 %	25 %	50 %	409247546
27	NT_187122	AGAT	2	8	10942	10949	50 %	25 %	25 %	0 %	409247546
28	NT_187122	CGCC	2	8	11701	11708	0 %	0 %	25 %	75 %	409247547
29	NT_187122	AGCC	2	8	11901	11908	25 %	0 %	25 %	50 %	409247547
30	NT_187122	TTAA	2	8	12355	12362	50 %	50 %	0 %	0 %	409247548
31	NT_187122	TGGT	2	8	12594	12601	0 %	50 %	50 %	0 %	409247548
32	NT_187122	TTTC	2	8	13246	13253	0 %	75 %	0 %	25 %	409247548
33	NT_187122	GGTA	2	8	13255	13262	25 %	25 %	50 %	0 %	409247548
34	NT_187122	CCAC	2	8	14140	14147	25 %	0 %	0 %	75 %	409247549
35	NT_187122	TCCC	2	8	14291	14298	0 %	25 %	0 %	75 %	409247549
36	NT_187122	CCAG	2	8	14389	14396	25 %	0 %	25 %	50 %	409247549
37	NT_187122	GCCA	2	8	15231	15238	25 %	0 %	25 %	50 %	409247550
38	NT_187122	TCGG	2	8	15667	15674	0 %	25 %	50 %	25 %	409247550
39	NT_187122	GACA	2	8	16830	16837	50 %	0 %	25 %	25 %	409247551
40	NT_187122	TGAG	2	8	17084	17091	25 %	25 %	50 %	0 %	409247551
41	NT_187122	CTGG	2	8	17349	17356	0 %	25 %	50 %	25 %	409247551
42	NT_187122	GGCT	2	8	17533	17540	0 %	25 %	50 %	25 %	409247551
43	NT_187122	GCAG	2	8	17688	17695	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NT_187122	AGAA	2	8	17732	17739	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NT_187122	GCCA	2	8	18561	18568	25 %	0 %	25 %	50 %	409247552
46	NT_187122	CAGC	2	8	19121	19128	25 %	0 %	25 %	50 %	409247552
47	NT_187122	CGCA	2	8	19191	19198	25 %	0 %	25 %	50 %	409247552
48	NT_187122	AGGT	2	8	20097	20104	25 %	25 %	50 %	0 %	409247553
49	NT_187122	CCGT	2	8	20523	20530	0 %	25 %	25 %	50 %	409247553
50	NT_187122	TCCT	2	8	20570	20577	0 %	50 %	0 %	50 %	409247553
51	NT_187122	ATAA	2	8	21420	21427	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NT_187122	TTCC	2	8	22254	22261	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NT_187122	AGAA	2	8	22292	22299	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NT_187122	AGAT	2	8	22670	22677	50 %	25 %	25 %	0 %	409247555
55	NT_187122	GTCA	2	8	23349	23356	25 %	25 %	25 %	25 %	409247556
56	NT_187122	GATA	2	8	23528	23535	50 %	25 %	25 %	0 %	409247556
57	NT_187122	TACC	2	8	24023	24030	25 %	25 %	0 %	50 %	409247556
58	NT_187122	CGGT	2	8	24903	24910	0 %	25 %	50 %	25 %	409247557
59	NT_187122	GAAC	2	8	25725	25732	50 %	0 %	25 %	25 %	409247558
60	NT_187122	CCTG	2	8	25745	25752	0 %	25 %	25 %	50 %	409247558
61	NT_187122	CAGT	2	8	25773	25780	25 %	25 %	25 %	25 %	409247558
62	NT_187122	CGAT	2	8	26333	26340	25 %	25 %	25 %	25 %	409247558
63	NT_187122	CCCG	2	8	26828	26835	0 %	0 %	25 %	75 %	409247559
64	NT_187122	AGCG	2	8	27121	27128	25 %	0 %	50 %	25 %	409247559
65	NT_187122	GTTC	2	8	27168	27175	0 %	50 %	25 %	25 %	409247559
66	NT_187122	CTCC	2	8	27301	27308	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
67	NT_187122	TTTG	2	8	27537	27544	0 %	75 %	25 %	0 %	409247560
68	NT_187122	GGTC	2	8	27590	27597	0 %	25 %	50 %	25 %	409247560
69	NT_187122	TTTC	2	8	27662	27669	0 %	75 %	0 %	25 %	409247560
70	NT_187122	GTTT	2	8	28090	28097	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NT_187122	GCTT	2	8	28643	28650	0 %	50 %	25 %	25 %	409247562
72	NT_187122	TGAA	2	8	29277	29284	50 %	25 %	25 %	0 %	409247563
73	NT_187122	TTTG	2	8	29951	29958	0 %	75 %	25 %	0 %	409247564
74	NT_187122	CAGC	2	8	30538	30545	25 %	0 %	25 %	50 %	409247564
75	NT_187122	GGGC	2	8	30633	30640	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
76	NT_187122	TTCG	2	8	30806	30813	0 %	50 %	25 %	25 %	409247565
77	NT_187122	GCGA	2	8	30899	30906	25 %	0 %	50 %	25 %	409247565
78	NT_187122	TCGA	2	8	31719	31726	25 %	25 %	25 %	25 %	409247565
79	NT_187122	GATG	2	8	32018	32025	25 %	25 %	50 %	0 %	409247565
80	NT_187122	CCTG	2	8	32328	32335	0 %	25 %	25 %	50 %	409247565
81	NT_187122	ATCG	2	8	32336	32343	25 %	25 %	25 %	25 %	409247565
82	NT_187122	TTTA	2	8	32677	32684	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NT_187122	TCGC	2	8	33386	33393	0 %	25 %	25 %	50 %	409247566
84	NT_187122	GATT	2	8	33583	33590	25 %	50 %	25 %	0 %	409247567
85	NT_187122	GCGG	2	8	36972	36979	0 %	0 %	75 %	25 %	409247570
86	NT_187122	CGTT	2	8	37619	37626	0 %	50 %	25 %	25 %	409247570
87	NT_187122	CGGG	2	8	37875	37882	0 %	0 %	75 %	25 %	409247570
88	NT_187122	TCAT	2	8	38231	38238	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NT_187122	GTTA	2	8	38669	38676	25 %	50 %	25 %	0 %	409247571
90	NT_187122	TTCT	2	8	39505	39512	0 %	75 %	0 %	25 %	409247571
91	NT_187122	AGCG	2	8	39690	39697	25 %	0 %	50 %	25 %	409247571
92	NT_187122	CTCA	2	8	40684	40691	25 %	25 %	0 %	50 %	409247572
93	NT_187122	ACCG	2	8	41359	41366	25 %	0 %	25 %	50 %	409247573
94	NT_187122	GGAC	2	8	41824	41831	25 %	0 %	50 %	25 %	409247573
95	NT_187122	AAGA	2	8	42149	42156	75 %	0 %	25 %	0 %	409247573
96	NT_187122	CATG	2	8	42259	42266	25 %	25 %	25 %	25 %	409247573
97	NT_187122	GATC	2	8	42582	42589	25 %	25 %	25 %	25 %	409247574
98	NT_187122	GACT	2	8	43629	43636	25 %	25 %	25 %	25 %	409247575
99	NT_187122	GCCA	2	8	43906	43913	25 %	0 %	25 %	50 %	409247575
100	NT_187122	GTTG	2	8	44751	44758	0 %	50 %	50 %	0 %	409247576
101	NT_187122	GCGT	2	8	44969	44976	0 %	25 %	50 %	25 %	409247576
102	NT_187122	ATTA	2	8	45042	45049	50 %	50 %	0 %	0 %	409247576
103	NT_187122	TGAG	2	8	45398	45405	25 %	25 %	50 %	0 %	409247577
104	NT_187122	GGCT	2	8	45941	45948	0 %	25 %	50 %	25 %	409247577
105	NT_187122	GAAT	2	8	46618	46625	50 %	25 %	25 %	0 %	409247578
106	NT_187122	AACC	2	8	46831	46838	50 %	0 %	0 %	50 %	409247578
107	NT_187122	AGAA	2	8	47100	47107	75 %	0 %	25 %	0 %	409247578
108	NT_187122	CAGC	3	12	47497	47508	25 %	0 %	25 %	50 %	409247578
109	NT_187122	GCCA	2	8	47675	47682	25 %	0 %	25 %	50 %	409247578
110	NT_187122	AAGT	2	8	47861	47868	50 %	25 %	25 %	0 %	409247579

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.