MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187121	CGCC	2	8	508	515	0 %	0 %	25 %	75 %	409247506
2	NT_187121	ATTT	2	8	545	552	25 %	75 %	0 %	0 %	409247506
3	NT_187121	TGCT	2	8	813	820	0 %	50 %	25 %	25 %	409247506
4	NT_187121	CCGC	2	8	946	953	0 %	0 %	25 %	75 %	409247506
5	NT_187121	CATA	2	8	1516	1523	50 %	25 %	0 %	25 %	409247506
6	NT_187121	ATTA	2	8	1626	1633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187121	ATTG	2	8	1691	1698	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NT_187121	ATTT	2	8	1757	1764	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NT_187121	ACGA	2	8	1830	1837	50 %	0 %	25 %	25 %	409247507
10	NT_187121	ATTC	2	8	1956	1963	25 %	50 %	0 %	25 %	409247507
11	NT_187121	GCTG	2	8	2263	2270	0 %	25 %	50 %	25 %	409247507
12	NT_187121	GCCA	2	8	2284	2291	25 %	0 %	25 %	50 %	409247507
13	NT_187121	GCCA	2	8	2359	2366	25 %	0 %	25 %	50 %	409247507
14	NT_187121	GCTG	2	8	2401	2408	0 %	25 %	50 %	25 %	409247507
15	NT_187121	CAGC	2	8	3193	3200	25 %	0 %	25 %	50 %	409247508
16	NT_187121	GCCA	2	8	3735	3742	25 %	0 %	25 %	50 %	409247508
17	NT_187121	CCAT	2	8	3801	3808	25 %	25 %	0 %	50 %	409247508
18	NT_187121	CCAG	2	8	3844	3851	25 %	0 %	25 %	50 %	409247508
19	NT_187121	CGCC	2	8	3870	3877	0 %	0 %	25 %	75 %	409247508
20	NT_187121	CGTG	2	8	4134	4141	0 %	25 %	50 %	25 %	409247508
21	NT_187121	CCGT	2	8	5367	5374	0 %	25 %	25 %	50 %	409247509
22	NT_187121	TTTC	2	8	5638	5645	0 %	75 %	0 %	25 %	409247509
23	NT_187121	GCCC	2	8	6632	6639	0 %	0 %	25 %	75 %	409247510
24	NT_187121	CCGC	2	8	6825	6832	0 %	0 %	25 %	75 %	409247510
25	NT_187121	TGAC	2	8	7842	7849	25 %	25 %	25 %	25 %	409247511
26	NT_187121	TGGC	2	8	8081	8088	0 %	25 %	50 %	25 %	409247512
27	NT_187121	TGGC	2	8	8285	8292	0 %	25 %	50 %	25 %	409247512
28	NT_187121	GATT	2	8	8625	8632	25 %	50 %	25 %	0 %	409247512
29	NT_187121	ATGA	2	8	8660	8667	50 %	25 %	25 %	0 %	409247512
30	NT_187121	CCCG	2	8	9123	9130	0 %	0 %	25 %	75 %	409247512
31	NT_187121	GGCT	2	8	9930	9937	0 %	25 %	50 %	25 %	409247512
32	NT_187121	GCAA	2	8	10046	10053	50 %	0 %	25 %	25 %	409247512
33	NT_187121	TGAA	2	8	10470	10477	50 %	25 %	25 %	0 %	409247512
34	NT_187121	ATGA	2	8	10592	10599	50 %	25 %	25 %	0 %	409247512
35	NT_187121	GCCA	2	8	11206	11213	25 %	0 %	25 %	50 %	409247513
36	NT_187121	AGAA	2	8	11326	11333	75 %	0 %	25 %	0 %	409247513
37	NT_187121	GCAG	3	12	12491	12502	25 %	0 %	50 %	25 %	409247514
38	NT_187121	GCCC	2	8	12629	12636	0 %	0 %	25 %	75 %	409247514
39	NT_187121	ATCA	2	8	12918	12925	50 %	25 %	0 %	25 %	409247514
40	NT_187121	CGCT	2	8	15020	15027	0 %	25 %	25 %	50 %	409247517
41	NT_187121	AGCG	2	8	15390	15397	25 %	0 %	50 %	25 %	409247517
42	NT_187121	CGGG	2	8	15809	15816	0 %	0 %	75 %	25 %	409247518
43	NT_187121	ACGG	2	8	16512	16519	25 %	0 %	50 %	25 %	409247518
44	NT_187121	CCAT	2	8	16616	16623	25 %	25 %	0 %	50 %	409247518
45	NT_187121	CTGT	2	8	17008	17015	0 %	50 %	25 %	25 %	409247519
46	NT_187121	TATT	2	8	17343	17350	25 %	75 %	0 %	0 %	409247519
47	NT_187121	CAGT	2	8	17408	17415	25 %	25 %	25 %	25 %	409247519
48	NT_187121	TGGC	2	8	17786	17793	0 %	25 %	50 %	25 %	409247519
49	NT_187121	TTAT	2	8	18110	18117	25 %	75 %	0 %	0 %	409247519
50	NT_187121	ATTA	2	8	18213	18220	50 %	50 %	0 %	0 %	409247519
51	NT_187121	GGCT	2	8	18358	18365	0 %	25 %	50 %	25 %	409247520
52	NT_187121	CTGC	2	8	19434	19441	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NT_187121	GCAG	2	8	19445	19452	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NT_187121	ACAA	2	8	20011	20018	75 %	0 %	0 %	25 %	409247521
55	NT_187121	CGCC	2	8	20356	20363	0 %	0 %	25 %	75 %	409247521
56	NT_187121	ACCA	2	8	20689	20696	50 %	0 %	0 %	50 %	409247522
57	NT_187121	ACGC	2	8	20868	20875	25 %	0 %	25 %	50 %	409247522
58	NT_187121	ACTG	2	8	20930	20937	25 %	25 %	25 %	25 %	409247522
59	NT_187121	CCGC	2	8	22564	22571	0 %	0 %	25 %	75 %	409247522
60	NT_187121	ATAC	2	8	22791	22798	50 %	25 %	0 %	25 %	409247522
61	NT_187121	GTCT	2	8	23284	23291	0 %	50 %	25 %	25 %	409247523
62	NT_187121	CCGC	2	8	23391	23398	0 %	0 %	25 %	75 %	409247523
63	NT_187121	GTCG	2	8	24750	24757	0 %	25 %	50 %	25 %	409247524
64	NT_187121	CGCC	2	8	25382	25389	0 %	0 %	25 %	75 %	409247525
65	NT_187121	TGGT	2	8	25418	25425	0 %	50 %	50 %	0 %	409247525
66	NT_187121	CGAG	2	8	25471	25478	25 %	0 %	50 %	25 %	409247525
67	NT_187121	CCGG	2	8	25621	25628	0 %	0 %	50 %	50 %	409247525
68	NT_187121	ACGT	2	8	25675	25682	25 %	25 %	25 %	25 %	409247525
69	NT_187121	CCAA	2	8	25813	25820	50 %	0 %	0 %	50 %	409247525
70	NT_187121	GTTG	2	8	26232	26239	0 %	50 %	50 %	0 %	409247525
71	NT_187121	GTTG	2	8	27974	27981	0 %	50 %	50 %	0 %	409247528
72	NT_187121	CCAG	2	8	28230	28237	25 %	0 %	25 %	50 %	409247529
73	NT_187121	TATC	2	8	28391	28398	25 %	50 %	0 %	25 %	409247529
74	NT_187121	GAAC	2	8	28505	28512	50 %	0 %	25 %	25 %	409247529
75	NT_187121	GACC	2	8	29531	29538	25 %	0 %	25 %	50 %	409247529
76	NT_187121	CCGC	2	8	30318	30325	0 %	0 %	25 %	75 %	409247530
77	NT_187121	GACG	2	8	30781	30788	25 %	0 %	50 %	25 %	409247530
78	NT_187121	TCAC	2	8	30913	30920	25 %	25 %	0 %	50 %	409247530
79	NT_187121	GTAA	2	8	31218	31225	50 %	25 %	25 %	0 %	409247530
80	NT_187121	GCTG	2	8	31791	31798	0 %	25 %	50 %	25 %	409247531
81	NT_187121	ATTG	2	8	32201	32208	25 %	50 %	25 %	0 %	409247532
82	NT_187121	GGAA	2	8	32646	32653	50 %	0 %	50 %	0 %	409247532

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.