MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NT_187121	AGTAA	2	10	23597	23606	60 %	20 %	20 %	0 %	409247523
502	NT_187121	GAA	2	6	23760	23765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247523
503	NT_187121	AAC	2	6	24186	24191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247524
504	NT_187121	CGC	2	6	24210	24215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247524
505	NT_187121	CCG	2	6	24334	24339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247524
506	NT_187121	CTT	2	6	24365	24370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247524
507	NT_187121	CGC	2	6	24428	24433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247524
508	NT_187121	CG	3	6	24459	24464	0 %	0 %	50 %	50 %	409247524
509	NT_187121	TTC	2	6	24517	24522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247524
510	NT_187121	CCA	2	6	24557	24562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247524
511	NT_187121	GC	3	6	24593	24598	0 %	0 %	50 %	50 %	409247524
512	NT_187121	ATT	2	6	24603	24608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247524
513	NT_187121	CGC	2	6	24638	24643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247524
514	NT_187121	GTCG	2	8	24750	24757	0 %	25 %	50 %	25 %	409247524
515	NT_187121	AGT	2	6	24806	24811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247524
516	NT_187121	GTC	2	6	24906	24911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247524
517	NT_187121	CGG	2	6	24926	24931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247524
518	NT_187121	AGT	2	6	25062	25067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247524
519	NT_187121	CG	4	8	25100	25107	0 %	0 %	50 %	50 %	409247524
520	NT_187121	GGA	2	6	25163	25168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409247524
521	NT_187121	GAC	2	6	25196	25201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247524
522	NT_187121	CTG	2	6	25221	25226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247524
523	NT_187121	TAA	2	6	25236	25241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247524
524	NT_187121	ACG	2	6	25275	25280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247525
525	NT_187121	TCT	2	6	25307	25312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247525
526	NT_187121	TTC	2	6	25327	25332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247525
527	NT_187121	CGCC	2	8	25382	25389	0 %	0 %	25 %	75 %	409247525
528	NT_187121	TGGT	2	8	25418	25425	0 %	50 %	50 %	0 %	409247525
529	NT_187121	CGAG	2	8	25471	25478	25 %	0 %	50 %	25 %	409247525
530	NT_187121	ATTTTG	2	12	25505	25516	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	409247525
531	NT_187121	TCT	2	6	25533	25538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247525
532	NT_187121	CCGG	2	8	25621	25628	0 %	0 %	50 %	50 %	409247525
533	NT_187121	GC	3	6	25659	25664	0 %	0 %	50 %	50 %	409247525
534	NT_187121	ACGT	2	8	25675	25682	25 %	25 %	25 %	25 %	409247525
535	NT_187121	T	6	6	25750	25755	0 %	100 %	0 %	0 %	409247525
536	NT_187121	CCAA	2	8	25813	25820	50 %	0 %	0 %	50 %	409247525
537	NT_187121	CTG	2	6	25888	25893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247525
538	NT_187121	CAG	2	6	25903	25908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247525
539	NT_187121	GAA	2	6	25957	25962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247525
540	NT_187121	TCG	2	6	25970	25975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247525
541	NT_187121	GTA	2	6	25999	26004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247525
542	NT_187121	GCA	2	6	26130	26135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247525
543	NT_187121	GCC	2	6	26158	26163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247525
544	NT_187121	GCC	2	6	26188	26193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247525
545	NT_187121	GCC	2	6	26216	26221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247525
546	NT_187121	GC	4	8	26222	26229	0 %	0 %	50 %	50 %	409247525
547	NT_187121	GTTG	2	8	26232	26239	0 %	50 %	50 %	0 %	409247525
548	NT_187121	CGA	2	6	26250	26255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247525
549	NT_187121	CCG	2	6	26304	26309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247525
550	NT_187121	GCTGCG	2	12	26355	26366	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409247525
551	NT_187121	GTT	2	6	26369	26374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409247525
552	NT_187121	CGC	2	6	26469	26474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247525
553	NT_187121	TTG	2	6	26501	26506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409247525
554	NT_187121	CTG	2	6	26650	26655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247525
555	NT_187121	CGG	2	6	26673	26678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247525
556	NT_187121	TTG	2	6	26729	26734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NT_187121	TCT	2	6	26910	26915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NT_187121	TTC	2	6	26928	26933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
559	NT_187121	CG	3	6	27003	27008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
560	NT_187121	A	6	6	27016	27021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NT_187121	GCT	2	6	27146	27151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NT_187121	ATT	2	6	27222	27227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NT_187121	CTA	2	6	27401	27406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247526
564	NT_187121	GTC	2	6	27413	27418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247526
565	NT_187121	CGT	3	9	27430	27438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247526
566	NT_187121	TAA	2	6	27472	27477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247526
567	NT_187121	CGC	2	6	27579	27584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247527
568	NT_187121	GCC	2	6	27600	27605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247527
569	NT_187121	GTG	3	9	27746	27754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247527
570	NT_187121	A	6	6	27758	27763	100 %	0 %	0 %	0 %	409247527
571	NT_187121	CT	3	6	27789	27794	0 %	50 %	0 %	50 %	409247527
572	NT_187121	GCC	2	6	27819	27824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247527
573	NT_187121	GCT	2	6	27888	27893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247528
574	NT_187121	GTTG	2	8	27974	27981	0 %	50 %	50 %	0 %	409247528
575	NT_187121	TGG	2	6	28020	28025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247528
576	NT_187121	TCCCG	2	10	28032	28041	0 %	20 %	20 %	60 %	409247528
577	NT_187121	CGCAA	2	10	28081	28090	40 %	0 %	20 %	40 %	409247529
578	NT_187121	ACC	2	6	28194	28199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247529
579	NT_187121	GCC	2	6	28212	28217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247529
580	NT_187121	CCAG	2	8	28230	28237	25 %	0 %	25 %	50 %	409247529
581	NT_187121	GTG	3	9	28297	28305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247529
582	NT_187121	GCT	2	6	28367	28372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247529
583	NT_187121	ACC	2	6	28377	28382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247529
584	NT_187121	TATC	2	8	28391	28398	25 %	50 %	0 %	25 %	409247529
585	NT_187121	GAAC	2	8	28505	28512	50 %	0 %	25 %	25 %	409247529
586	NT_187121	CGC	2	6	28538	28543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247529
587	NT_187121	CCT	2	6	28680	28685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409247529
588	NT_187121	GCA	2	6	28841	28846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247529
589	NT_187121	ACG	2	6	28876	28881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247529
590	NT_187121	CAA	2	6	28886	28891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247529
591	NT_187121	GGC	2	6	29024	29029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247529
592	NT_187121	GCACC	2	10	29034	29043	20 %	0 %	20 %	60 %	409247529
593	NT_187121	TC	3	6	29080	29085	0 %	50 %	0 %	50 %	409247529
594	NT_187121	ATC	2	6	29148	29153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247529
595	NT_187121	TGC	2	6	29227	29232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247529
596	NT_187121	GAT	2	6	29268	29273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247529
597	NT_187121	GAT	2	6	29294	29299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247529
598	NT_187121	GCT	2	6	29338	29343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247529
599	NT_187121	ATC	2	6	29352	29357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247529
600	NT_187121	TAC	2	6	29382	29387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247529
601	NT_187121	TAC	2	6	29463	29468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247529
602	NT_187121	TTC	2	6	29499	29504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247529
603	NT_187121	AGA	2	6	29509	29514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247529
604	NT_187121	ACC	2	6	29523	29528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247529
605	NT_187121	GACC	2	8	29531	29538	25 %	0 %	25 %	50 %	409247529
606	NT_187121	GCA	2	6	29543	29548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247529
607	NT_187121	TTC	2	6	29586	29591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247529
608	NT_187121	CAT	2	6	29645	29650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247529
609	NT_187121	CAG	3	9	29652	29660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247529
610	NT_187121	GAA	2	6	29705	29710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247529
611	NT_187121	A	6	6	29709	29714	100 %	0 %	0 %	0 %	409247529
612	NT_187121	GC	3	6	29762	29767	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
613	NT_187121	T	6	6	29831	29836	0 %	100 %	0 %	0 %	409247530
614	NT_187121	CAA	2	6	29841	29846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247530
615	NT_187121	TCG	2	6	29880	29885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247530
616	NT_187121	GC	3	6	29945	29950	0 %	0 %	50 %	50 %	409247530
617	NT_187121	GC	3	6	30030	30035	0 %	0 %	50 %	50 %	409247530
618	NT_187121	CGG	2	6	30112	30117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247530
619	NT_187121	CTG	2	6	30134	30139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247530
620	NT_187121	CG	3	6	30200	30205	0 %	0 %	50 %	50 %	409247530
621	NT_187121	GGC	2	6	30277	30282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247530
622	NT_187121	CCGC	2	8	30318	30325	0 %	0 %	25 %	75 %	409247530
623	NT_187121	ACC	2	6	30330	30335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247530
624	NT_187121	GAG	2	6	30395	30400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409247530
625	NT_187121	TC	3	6	30409	30414	0 %	50 %	0 %	50 %	409247530
626	NT_187121	GC	3	6	30479	30484	0 %	0 %	50 %	50 %	409247530
627	NT_187121	CTG	2	6	30494	30499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247530
628	NT_187121	CTG	2	6	30554	30559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247530
629	NT_187121	CG	3	6	30612	30617	0 %	0 %	50 %	50 %	409247530
630	NT_187121	ATC	2	6	30662	30667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247530
631	NT_187121	CCG	2	6	30672	30677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247530
632	NT_187121	CGA	2	6	30694	30699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247530
633	NT_187121	TGG	2	6	30765	30770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247530
634	NT_187121	CAC	2	6	30775	30780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247530
635	NT_187121	GACG	2	8	30781	30788	25 %	0 %	50 %	25 %	409247530
636	NT_187121	TCAC	2	8	30913	30920	25 %	25 %	0 %	50 %	409247530
637	NT_187121	ACC	2	6	30969	30974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247530
638	NT_187121	AAGCA	2	10	30977	30986	60 %	0 %	20 %	20 %	409247530
639	NT_187121	GGC	2	6	31010	31015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247530
640	NT_187121	CTG	2	6	31112	31117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247530
641	NT_187121	GCA	2	6	31138	31143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247530
642	NT_187121	CGA	2	6	31177	31182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247530
643	NT_187121	CTG	2	6	31184	31189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247530
644	NT_187121	GTAA	2	8	31218	31225	50 %	25 %	25 %	0 %	409247530
645	NT_187121	A	6	6	31420	31425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
646	NT_187121	A	6	6	31432	31437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
647	NT_187121	AC	3	6	31461	31466	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
648	NT_187121	TTC	2	6	31569	31574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247531
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650	NT_187121	GAA	2	6	31739	31744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247531
651	NT_187121	GCTG	2	8	31791	31798	0 %	25 %	50 %	25 %	409247531
652	NT_187121	A	6	6	31812	31817	100 %	0 %	0 %	0 %	409247531
653	NT_187121	CAT	2	6	31861	31866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247531
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659	NT_187121	AGA	2	6	32096	32101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247532
660	NT_187121	CTG	2	6	32169	32174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247532
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663	NT_187121	AAC	2	6	32402	32407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247532
664	NT_187121	CGG	2	6	32546	32551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247532
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668	NT_187121	AAT	2	6	32719	32724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
669	NT_187121	ATA	2	6	32780	32785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
670	NT_187121	A	6	6	32885	32890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
671	NT_187121	A	6	6	32896	32901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
672	NT_187121	T	7	7	32911	32917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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