MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 121

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187118	CAGG	2	8	92	99	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NT_187118	TTTA	2	8	236	243	25 %	75 %	0 %	0 %	409247065
3	NT_187118	AATT	2	8	546	553	50 %	50 %	0 %	0 %	409247065
4	NT_187118	ATAA	2	8	780	787	75 %	25 %	0 %	0 %	409247065
5	NT_187118	TCTT	2	8	1635	1642	0 %	75 %	0 %	25 %	409247066
6	NT_187118	GGCA	2	8	1915	1922	25 %	0 %	50 %	25 %	409247067
7	NT_187118	TGCC	2	8	2160	2167	0 %	25 %	25 %	50 %	409247067
8	NT_187118	TTTG	2	8	2824	2831	0 %	75 %	25 %	0 %	409247067
9	NT_187118	CAAT	2	8	3068	3075	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NT_187118	CAGC	2	8	4207	4214	25 %	0 %	25 %	50 %	409247069
11	NT_187118	TTAT	2	8	4666	4673	25 %	75 %	0 %	0 %	409247070
12	NT_187118	GTTT	2	8	5178	5185	0 %	75 %	25 %	0 %	409247070
13	NT_187118	CACG	2	8	5263	5270	25 %	0 %	25 %	50 %	409247070
14	NT_187118	CTCA	2	8	5688	5695	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NT_187118	AATT	2	8	5837	5844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187118	ATCA	2	8	6139	6146	50 %	25 %	0 %	25 %	409247071
17	NT_187118	ATGA	2	8	6598	6605	50 %	25 %	25 %	0 %	409247072
18	NT_187118	GATT	2	8	6645	6652	25 %	50 %	25 %	0 %	409247072
19	NT_187118	ATTA	2	8	6762	6769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187118	TCAG	2	8	6974	6981	25 %	25 %	25 %	25 %	409247073
21	NT_187118	CAGG	2	8	7642	7649	25 %	0 %	50 %	25 %	409247075
22	NT_187118	GAAC	2	8	7651	7658	50 %	0 %	25 %	25 %	409247075
23	NT_187118	AGCC	2	8	7820	7827	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NT_187118	GACA	2	8	7837	7844	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NT_187118	GATA	2	8	8095	8102	50 %	25 %	25 %	0 %	409247077
26	NT_187118	GCAG	2	8	8337	8344	25 %	0 %	50 %	25 %	409247077
27	NT_187118	AAAC	2	8	8398	8405	75 %	0 %	0 %	25 %	409247077
28	NT_187118	ATAA	2	8	8732	8739	75 %	25 %	0 %	0 %	409247077
29	NT_187118	ATCG	2	8	9444	9451	25 %	25 %	25 %	25 %	409247077
30	NT_187118	ATAA	2	8	9879	9886	75 %	25 %	0 %	0 %	409247077
31	NT_187118	ACGC	2	8	10279	10286	25 %	0 %	25 %	50 %	409247078
32	NT_187118	GATC	2	8	10521	10528	25 %	25 %	25 %	25 %	409247078
33	NT_187118	TAAA	2	8	10925	10932	75 %	25 %	0 %	0 %	409247079
34	NT_187118	GGAA	2	8	11065	11072	50 %	0 %	50 %	0 %	409247079
35	NT_187118	CTGG	2	8	11852	11859	0 %	25 %	50 %	25 %	409247080
36	NT_187118	GGAA	2	8	11903	11910	50 %	0 %	50 %	0 %	409247080
37	NT_187118	GCTG	2	8	11971	11978	0 %	25 %	50 %	25 %	409247080
38	NT_187118	GAAA	2	8	12206	12213	75 %	0 %	25 %	0 %	409247080
39	NT_187118	TCAA	2	8	12813	12820	50 %	25 %	0 %	25 %	409247081
40	NT_187118	GACC	2	8	12988	12995	25 %	0 %	25 %	50 %	409247081
41	NT_187118	GGAC	2	8	13245	13252	25 %	0 %	50 %	25 %	409247081
42	NT_187118	GTCG	2	8	13271	13278	0 %	25 %	50 %	25 %	409247081
43	NT_187118	CTGC	2	8	13501	13508	0 %	25 %	25 %	50 %	409247081
44	NT_187118	CTTT	2	8	13941	13948	0 %	75 %	0 %	25 %	409247082
45	NT_187118	GTTC	2	8	14577	14584	0 %	50 %	25 %	25 %	409247082
46	NT_187118	CAGC	2	8	14720	14727	25 %	0 %	25 %	50 %	409247082
47	NT_187118	GCGT	2	8	14817	14824	0 %	25 %	50 %	25 %	409247082
48	NT_187118	GCCA	2	8	14865	14872	25 %	0 %	25 %	50 %	409247082
49	NT_187118	GCCA	2	8	15078	15085	25 %	0 %	25 %	50 %	409247082
50	NT_187118	TTTA	2	8	15311	15318	25 %	75 %	0 %	0 %	409247082
51	NT_187118	GACA	2	8	16892	16899	50 %	0 %	25 %	25 %	409247082
52	NT_187118	CAGC	2	8	16922	16929	25 %	0 %	25 %	50 %	409247082
53	NT_187118	ATCC	2	8	17129	17136	25 %	25 %	0 %	50 %	409247082
54	NT_187118	CTTA	2	8	18202	18209	25 %	50 %	0 %	25 %	409247083
55	NT_187118	CGCC	2	8	20764	20771	0 %	0 %	25 %	75 %	409247086
56	NT_187118	TAAT	2	8	21953	21960	50 %	50 %	0 %	0 %	409247087
57	NT_187118	CGGA	2	8	22330	22337	25 %	0 %	50 %	25 %	409247087
58	NT_187118	ACCA	2	8	22606	22613	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NT_187118	GCCA	2	8	22940	22947	25 %	0 %	25 %	50 %	409247088
60	NT_187118	TCAA	2	8	23592	23599	50 %	25 %	0 %	25 %	409247088
61	NT_187118	CAGC	2	8	24329	24336	25 %	0 %	25 %	50 %	409247088
62	NT_187118	AGTG	2	8	24402	24409	25 %	25 %	50 %	0 %	409247088
63	NT_187118	ATCT	2	8	24902	24909	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NT_187118	CTGG	2	8	25262	25269	0 %	25 %	50 %	25 %	409247089
65	NT_187118	CTGG	2	8	25326	25333	0 %	25 %	50 %	25 %	409247089
66	NT_187118	CTGC	2	8	25339	25346	0 %	25 %	25 %	50 %	409247089
67	NT_187118	GGCG	2	8	25731	25738	0 %	0 %	75 %	25 %	409247089
68	NT_187118	CATT	2	8	25766	25773	25 %	50 %	0 %	25 %	409247089
69	NT_187118	TTAA	2	8	26005	26012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NT_187118	TATT	2	8	26014	26021	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NT_187118	TATC	2	8	26512	26519	25 %	50 %	0 %	25 %	409247090
72	NT_187118	GCTG	2	8	27468	27475	0 %	25 %	50 %	25 %	409247091
73	NT_187118	TTCG	2	8	27851	27858	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NT_187118	TGGT	2	8	28349	28356	0 %	50 %	50 %	0 %	409247093
75	NT_187118	CCGT	2	8	28733	28740	0 %	25 %	25 %	50 %	409247094
76	NT_187118	CTAT	2	8	29235	29242	25 %	50 %	0 %	25 %	409247094
77	NT_187118	GCGT	2	8	29357	29364	0 %	25 %	50 %	25 %	409247094
78	NT_187118	ATAA	2	8	31705	31712	75 %	25 %	0 %	0 %	409247096
79	NT_187118	ATGG	2	8	32017	32024	25 %	25 %	50 %	0 %	409247097
80	NT_187118	CCAG	2	8	32374	32381	25 %	0 %	25 %	50 %	409247097
81	NT_187118	GCCA	2	8	32501	32508	25 %	0 %	25 %	50 %	409247097
82	NT_187118	AATG	2	8	32694	32701	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NT_187118	CATT	2	8	32983	32990	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NT_187118	AATA	2	8	33099	33106	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NT_187118	ATTT	2	8	33132	33139	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NT_187118	TGGC	2	8	33314	33321	0 %	25 %	50 %	25 %	409247098
87	NT_187118	CCAT	2	8	33764	33771	25 %	25 %	0 %	50 %	409247098
88	NT_187118	TGTT	2	8	33787	33794	0 %	75 %	25 %	0 %	409247098
89	NT_187118	GCTT	2	8	34034	34041	0 %	50 %	25 %	25 %	409247098
90	NT_187118	TATG	2	8	35012	35019	25 %	50 %	25 %	0 %	409247100
91	NT_187118	GATG	2	8	35201	35208	25 %	25 %	50 %	0 %	409247100
92	NT_187118	GCAT	2	8	36479	36486	25 %	25 %	25 %	25 %	409247102
93	NT_187118	CTGG	2	8	36555	36562	0 %	25 %	50 %	25 %	409247102
94	NT_187118	AACC	2	8	36898	36905	50 %	0 %	0 %	50 %	409247102
95	NT_187118	TTTC	2	8	37176	37183	0 %	75 %	0 %	25 %	409247102
96	NT_187118	AATG	2	8	37224	37231	50 %	25 %	25 %	0 %	409247102
97	NT_187118	TGGC	2	8	37237	37244	0 %	25 %	50 %	25 %	409247102
98	NT_187118	AGGC	2	8	37778	37785	25 %	0 %	50 %	25 %	409247102
99	NT_187118	TCAA	2	8	38632	38639	50 %	25 %	0 %	25 %	409247103
100	NT_187118	AAAT	2	8	38828	38835	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NT_187118	TCAT	2	8	39131	39138	25 %	50 %	0 %	25 %	409247104
102	NT_187118	ACGT	2	8	39268	39275	25 %	25 %	25 %	25 %	409247105
103	NT_187118	GATC	2	8	39379	39386	25 %	25 %	25 %	25 %	409247105
104	NT_187118	CGCC	2	8	39541	39548	0 %	0 %	25 %	75 %	409247105
105	NT_187118	GTCA	2	8	39687	39694	25 %	25 %	25 %	25 %	409247105
106	NT_187118	TGTT	2	8	39966	39973	0 %	75 %	25 %	0 %	409247105
107	NT_187118	TGGC	2	8	40328	40335	0 %	25 %	50 %	25 %	409247106
108	NT_187118	AAAT	2	8	40590	40597	75 %	25 %	0 %	0 %	409247106
109	NT_187118	CTGG	2	8	40824	40831	0 %	25 %	50 %	25 %	409247106
110	NT_187118	TAAA	2	8	40844	40851	75 %	25 %	0 %	0 %	409247106
111	NT_187118	GTTG	2	8	41478	41485	0 %	50 %	50 %	0 %	409247106
112	NT_187118	TGGT	2	8	41591	41598	0 %	50 %	50 %	0 %	409247106
113	NT_187118	TATC	2	8	41892	41899	25 %	50 %	0 %	25 %	409247106
114	NT_187118	TGAT	2	8	42314	42321	25 %	50 %	25 %	0 %	409247106
115	NT_187118	ATCG	2	8	42550	42557	25 %	25 %	25 %	25 %	409247106
116	NT_187118	GATT	2	8	43139	43146	25 %	50 %	25 %	0 %	409247106
117	NT_187118	GTTA	2	8	43227	43234	25 %	50 %	25 %	0 %	409247106
118	NT_187118	TATT	2	8	43979	43986	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NT_187118	ACAG	2	8	44097	44104	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NT_187118	GTAA	2	8	44240	44247	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NT_187118	GGCG	2	8	44468	44475	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.