MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 6230

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NT_187115	GCG	2	6	189629	189634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246685
4002	NT_187115	TCA	2	6	189635	189640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246685
4003	NT_187115	CGC	2	6	189690	189695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246685
4004	NT_187115	GCCA	2	8	189736	189743	25 %	0 %	25 %	50 %	409246685
4005	NT_187115	ACGTA	2	10	189843	189852	40 %	20 %	20 %	20 %	409246685
4006	NT_187115	TCA	2	6	189883	189888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246685
4007	NT_187115	TCAG	2	8	189907	189914	25 %	25 %	25 %	25 %	409246685
4008	NT_187115	CGC	2	6	189935	189940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246685
4009	NT_187115	ATCGG	2	10	189955	189964	20 %	20 %	40 %	20 %	409246685
4010	NT_187115	AG	3	6	190011	190016	50 %	0 %	50 %	0 %	409246685
4011	NT_187115	TGC	2	6	190067	190072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246685
4012	NT_187115	GC	3	6	190079	190084	0 %	0 %	50 %	50 %	409246685
4013	NT_187115	GCA	2	6	190112	190117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246685
4014	NT_187115	AAT	2	6	190146	190151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246685
4015	NT_187115	TGA	2	6	190172	190177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246685
4016	NT_187115	T	6	6	190197	190202	0 %	100 %	0 %	0 %	409246685
4017	NT_187115	GCG	2	6	190234	190239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246685
4018	NT_187115	TTA	2	6	190267	190272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409246685
4019	NT_187115	TCA	2	6	190289	190294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246685
4020	NT_187115	GCC	2	6	190380	190385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246685
4021	NT_187115	GC	3	6	190461	190466	0 %	0 %	50 %	50 %	409246685
4022	NT_187115	CGTTCG	2	12	190495	190506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246685
4023	NT_187115	T	6	6	190512	190517	0 %	100 %	0 %	0 %	409246685
4024	NT_187115	CGT	2	6	190574	190579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246685
4025	NT_187115	T	7	7	190684	190690	0 %	100 %	0 %	0 %	409246686
4026	NT_187115	TGA	2	6	190733	190738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246686
4027	NT_187115	CAC	2	6	190768	190773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246686
4028	NT_187115	CGGAT	2	10	190801	190810	20 %	20 %	40 %	20 %	409246686
4029	NT_187115	ACC	2	6	190820	190825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246686
4030	NT_187115	CAATAA	2	12	190945	190956	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	409246686
4031	NT_187115	TGC	2	6	190971	190976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246686
4032	NT_187115	TCA	2	6	190993	190998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246686
4033	NT_187115	ATT	2	6	191061	191066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NT_187115	GCA	2	6	191079	191084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NT_187115	CAT	2	6	191120	191125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NT_187115	CTTCGC	2	12	191274	191285	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	409246687
4037	NT_187115	CAT	2	6	191293	191298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246687
4038	NT_187115	ATC	2	6	191347	191352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246687
4039	NT_187115	GTC	2	6	191353	191358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246687
4040	NT_187115	CAT	2	6	191367	191372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246687
4041	NT_187115	GCC	2	6	191404	191409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246687
4042	NT_187115	CGC	2	6	191559	191564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246687
4043	NT_187115	AAT	2	6	191639	191644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246687
4044	NT_187115	TCC	2	6	191648	191653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409246687
4045	NT_187115	AGCC	2	8	191666	191673	25 %	0 %	25 %	50 %	409246687
4046	NT_187115	TGC	2	6	191756	191761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246687
4047	NT_187115	CGG	2	6	191834	191839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246687
4048	NT_187115	CGT	2	6	191853	191858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246687
4049	NT_187115	CT	3	6	191948	191953	0 %	50 %	0 %	50 %	409246687
4050	NT_187115	A	6	6	191986	191991	100 %	0 %	0 %	0 %	409246687
4051	NT_187115	GACT	2	8	192095	192102	25 %	25 %	25 %	25 %	409246687
4052	NT_187115	CGC	2	6	192103	192108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246687
4053	NT_187115	CT	3	6	192118	192123	0 %	50 %	0 %	50 %	409246687
4054	NT_187115	TCA	2	6	192221	192226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246687
4055	NT_187115	TCG	2	6	192239	192244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246687
4056	NT_187115	CCA	2	6	192276	192281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246687
4057	NT_187115	TAT	2	6	192315	192320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409246687
4058	NT_187115	TGGA	2	8	192323	192330	25 %	25 %	50 %	0 %	409246687
4059	NT_187115	CTG	2	6	192358	192363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246687
4060	NT_187115	TCG	2	6	192401	192406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246687
4061	NT_187115	TCA	2	6	192441	192446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246687
4062	NT_187115	CGT	2	6	192486	192491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246687
4063	NT_187115	CAG	2	6	192499	192504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246687
4064	NT_187115	CCG	2	6	192654	192659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246687
4065	NT_187115	CTG	2	6	192688	192693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246687
4066	NT_187115	TCAA	2	8	192695	192702	50 %	25 %	0 %	25 %	409246687
4067	NT_187115	GAA	2	6	192736	192741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246687
4068	NT_187115	CGC	2	6	192806	192811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246687
4069	NT_187115	CAG	2	6	192829	192834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246687
4070	NT_187115	CAG	2	6	192934	192939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246687
4071	NT_187115	TGC	2	6	192968	192973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246687
4072	NT_187115	CTT	2	6	193068	193073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246687
4073	NT_187115	AAC	2	6	193112	193117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409246687
4074	NT_187115	TGAC	2	8	193192	193199	25 %	25 %	25 %	25 %	409246687
4075	NT_187115	CCG	2	6	193204	193209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246687
4076	NT_187115	GC	3	6	193245	193250	0 %	0 %	50 %	50 %	409246687
4077	NT_187115	CCA	2	6	193296	193301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246687
4078	NT_187115	CG	3	6	193314	193319	0 %	0 %	50 %	50 %	409246687
4079	NT_187115	CAG	2	6	193351	193356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246687
4080	NT_187115	AG	3	6	193408	193413	50 %	0 %	50 %	0 %	409246687
4081	NT_187115	CTC	2	6	193462	193467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409246687
4082	NT_187115	CGCC	2	8	193476	193483	0 %	0 %	25 %	75 %	409246687
4083	NT_187115	CAA	2	6	193551	193556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409246687
4084	NT_187115	AAC	2	6	193703	193708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409246687
4085	NT_187115	GAC	2	6	193734	193739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246687
4086	NT_187115	GCCA	2	8	193760	193767	25 %	0 %	25 %	50 %	409246687
4087	NT_187115	C	6	6	193785	193790	0 %	0 %	0 %	100 %	409246687
4088	NT_187115	GGT	2	6	193927	193932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409246687
4089	NT_187115	GCG	2	6	194000	194005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246687
4090	NT_187115	CCA	2	6	194013	194018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246687
4091	NT_187115	GCG	2	6	194031	194036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246687
4092	NT_187115	CGG	2	6	194136	194141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246687
4093	NT_187115	CG	4	8	194142	194149	0 %	0 %	50 %	50 %	409246687
4094	NT_187115	GTC	2	6	194179	194184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246687
4095	NT_187115	GCA	2	6	194199	194204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246687
4096	NT_187115	GCA	2	6	194235	194240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246687
4097	NT_187115	TCA	2	6	194244	194249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246687
4098	NT_187115	TTTG	2	8	194265	194272	0 %	75 %	25 %	0 %	409246687
4099	NT_187115	CTTT	2	8	194282	194289	0 %	75 %	0 %	25 %	409246687
4100	NT_187115	AACA	2	8	194311	194318	75 %	0 %	0 %	25 %	409246687
4101	NT_187115	CGC	2	6	194359	194364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246687
4102	NT_187115	ATC	2	6	194449	194454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246687
4103	NT_187115	CGA	2	6	194469	194474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246687
4104	NT_187115	CTGC	2	8	194584	194591	0 %	25 %	25 %	50 %	409246688
4105	NT_187115	CAG	2	6	194670	194675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246688
4106	NT_187115	TGC	2	6	194699	194704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246688
4107	NT_187115	GCC	2	6	194712	194717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246688
4108	NT_187115	GCC	2	6	194977	194982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246689
4109	NT_187115	CAC	2	6	194985	194990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246689
4110	NT_187115	GCCCCC	2	12	195080	195091	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	409246689
4111	NT_187115	CGT	2	6	195141	195146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246689
4112	NT_187115	GGC	2	6	195153	195158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246689
4113	NT_187115	CTG	3	9	195168	195176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246689
4114	NT_187115	GAA	2	6	195235	195240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246689
4115	NT_187115	GCA	2	6	195334	195339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246690
4116	NT_187115	TGA	2	6	195391	195396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246690
4117	NT_187115	T	6	6	195418	195423	0 %	100 %	0 %	0 %	409246690
4118	NT_187115	GGTAT	2	10	195516	195525	20 %	40 %	40 %	0 %	409246690
4119	NT_187115	TTA	2	6	195537	195542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409246690
4120	NT_187115	TGT	2	6	195697	195702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409246690
4121	NT_187115	ATCGCC	2	12	195765	195776	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	409246690
4122	NT_187115	GGC	2	6	195823	195828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246690
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4142	NT_187115	CGC	2	6	196648	196653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246693
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4233	NT_187115	TCGGCG	2	12	200819	200830	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409246696
4234	NT_187115	ATAC	2	8	200870	200877	50 %	25 %	0 %	25 %	409246696
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4237	NT_187115	TA	3	6	201170	201175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4238	NT_187115	TAA	2	6	201235	201240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4239	NT_187115	GAT	2	6	201280	201285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4240	NT_187115	GAA	2	6	201332	201337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4241	NT_187115	TGA	2	6	201488	201493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4242	NT_187115	TCG	2	6	201568	201573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4243	NT_187115	AGT	2	6	201598	201603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4244	NT_187115	GGT	2	6	201604	201609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4245	NT_187115	GAA	2	6	201710	201715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246697
4246	NT_187115	ACA	2	6	201716	201721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409246697
4247	NT_187115	A	6	6	201723	201728	100 %	0 %	0 %	0 %	409246697
4248	NT_187115	GGC	2	6	201925	201930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246698
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4260	NT_187115	GCT	2	6	202489	202494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246698
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4263	NT_187115	CTT	2	6	202680	202685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4264	NT_187115	T	7	7	202684	202690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4265	NT_187115	CTGG	2	8	202739	202746	0 %	25 %	50 %	25 %	409246699
4266	NT_187115	ACGCTG	2	12	202755	202766	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409246699
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4333	NT_187115	CGT	2	6	205942	205947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246702
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4365	NT_187115	GCT	2	6	207508	207513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246703
4366	NT_187115	CCG	2	6	207577	207582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246703
4367	NT_187115	CCG	2	6	207613	207618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246703
4368	NT_187115	TCA	2	6	207625	207630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246703
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4372	NT_187115	GCA	2	6	207694	207699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246703
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4392	NT_187115	A	8	8	208772	208779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4393	NT_187115	CAA	2	6	208819	208824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4397	NT_187115	TAT	2	6	209065	209070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4413	NT_187115	CTG	2	6	210258	210263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246705
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4458	NT_187115	A	6	6	212458	212463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4464	NT_187115	GCCT	2	8	212817	212824	0 %	25 %	25 %	50 %	409246707
4465	NT_187115	TAC	2	6	212857	212862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246707
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4468	NT_187115	GCC	2	6	213057	213062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246707
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4472	NT_187115	GGGC	2	8	213232	213239	0 %	0 %	75 %	25 %	409246707
4473	NT_187115	GCC	2	6	213276	213281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246707
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4477	NT_187115	GC	3	6	213507	213512	0 %	0 %	50 %	50 %	409246708
4478	NT_187115	GC	3	6	213567	213572	0 %	0 %	50 %	50 %	409246708
4479	NT_187115	GTT	2	6	213585	213590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409246708
4480	NT_187115	ATA	2	6	213604	213609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246708
4481	NT_187115	TGAT	2	8	213662	213669	25 %	50 %	25 %	0 %	409246708
4482	NT_187115	GCC	2	6	213726	213731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246708
4483	NT_187115	AAC	2	6	213846	213851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409246708
4484	NT_187115	CTG	2	6	213919	213924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246708
4485	NT_187115	CGC	2	6	213972	213977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246708
4486	NT_187115	GCA	2	6	214017	214022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246708
4487	NT_187115	GCT	2	6	214050	214055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246708
4488	NT_187115	TAA	2	6	214082	214087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246708
4489	NT_187115	ACC	2	6	214111	214116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246708
4490	NT_187115	TCA	2	6	214206	214211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4491	NT_187115	CGCC	2	8	214276	214283	0 %	0 %	25 %	75 %	409246709
4492	NT_187115	GAT	2	6	214436	214441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246709
4493	NT_187115	CAC	2	6	214529	214534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246709
4494	NT_187115	GCG	2	6	214539	214544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246709
4495	NT_187115	CAT	2	6	214568	214573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246709
4496	NT_187115	GA	3	6	214596	214601	50 %	0 %	50 %	0 %	409246709
4497	NT_187115	AGTC	2	8	214751	214758	25 %	25 %	25 %	25 %	409246709
4498	NT_187115	ACC	2	6	214761	214766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246709
4499	NT_187115	GTG	2	6	214791	214796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409246709
4500	NT_187115	GCG	2	6	214822	214827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246709

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