MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 6230

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NT_187115	GCC	2	6	166304	166309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246666
3502	NT_187115	GCG	2	6	166353	166358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246666
3503	NT_187115	CTG	2	6	166370	166375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246666
3504	NT_187115	TCT	2	6	166422	166427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246666
3505	NT_187115	GGACA	2	10	166448	166457	40 %	0 %	40 %	20 %	409246666
3506	NT_187115	CAT	2	6	166489	166494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246666
3507	NT_187115	GGC	2	6	166496	166501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246666
3508	NT_187115	CGC	2	6	166537	166542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246666
3509	NT_187115	CCG	2	6	166557	166562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246666
3510	NT_187115	GCG	2	6	166622	166627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246666
3511	NT_187115	A	7	7	166671	166677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NT_187115	TGAT	2	8	166708	166715	25 %	50 %	25 %	0 %	409246667
3513	NT_187115	CGT	2	6	166719	166724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246667
3514	NT_187115	GAA	2	6	166746	166751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246667
3515	NT_187115	CGG	2	6	166777	166782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246667
3516	NT_187115	TCA	2	6	166786	166791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246667
3517	NT_187115	CCG	2	6	166870	166875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246667
3518	NT_187115	GAA	2	6	166881	166886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246667
3519	NT_187115	CAG	2	6	166892	166897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246667
3520	NT_187115	GGC	2	6	167042	167047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246667
3521	NT_187115	ATG	2	6	167089	167094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246667
3522	NT_187115	CGA	2	6	167105	167110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246667
3523	NT_187115	CCG	2	6	167122	167127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246667
3524	NT_187115	GAA	2	6	167133	167138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246667
3525	NT_187115	CTG	2	6	167142	167147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246667
3526	NT_187115	CGG	2	6	167207	167212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246667
3527	NT_187115	CTT	2	6	167252	167257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246667
3528	NT_187115	CTGG	2	8	167264	167271	0 %	25 %	50 %	25 %	409246667
3529	NT_187115	GCC	2	6	167308	167313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246667
3530	NT_187115	A	6	6	167323	167328	100 %	0 %	0 %	0 %	409246667
3531	NT_187115	ATG	2	6	167332	167337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246667
3532	NT_187115	CG	3	6	167436	167441	0 %	0 %	50 %	50 %	409246667
3533	NT_187115	AG	3	6	167450	167455	50 %	0 %	50 %	0 %	409246667
3534	NT_187115	CTG	2	6	167457	167462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246667
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3539	NT_187115	CCG	2	6	167608	167613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246667
3540	NT_187115	GCT	2	6	167618	167623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246667
3541	NT_187115	GTC	2	6	167664	167669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246667
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3544	NT_187115	GGC	2	6	167951	167956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246667
3545	NT_187115	CGG	3	9	167993	168001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246667
3546	NT_187115	GGC	2	6	168027	168032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246667
3547	NT_187115	ATC	2	6	168060	168065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246667
3548	NT_187115	TGC	2	6	168082	168087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246667
3549	NT_187115	ACC	2	6	168168	168173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246667
3550	NT_187115	GCGCC	2	10	168180	168189	0 %	0 %	40 %	60 %	409246667
3551	NT_187115	TTA	2	6	168286	168291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409246667
3552	NT_187115	CGC	2	6	168296	168301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246667
3553	NT_187115	TGC	2	6	168304	168309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246667
3554	NT_187115	GTAT	2	8	168318	168325	25 %	50 %	25 %	0 %	409246667
3555	NT_187115	GGA	2	6	168335	168340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409246667
3556	NT_187115	GCG	2	6	168523	168528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NT_187115	TTG	2	6	168723	168728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409246668
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3559	NT_187115	GC	3	6	168800	168805	0 %	0 %	50 %	50 %	409246668
3560	NT_187115	GCT	2	6	168825	168830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246668
3561	NT_187115	TCA	2	6	168839	168844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246668
3562	NT_187115	CTGGT	2	10	168961	168970	0 %	40 %	40 %	20 %	409246668
3563	NT_187115	ATC	2	6	168980	168985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246668
3564	NT_187115	CTG	2	6	168991	168996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246668
3565	NT_187115	CTG	2	6	169008	169013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246668
3566	NT_187115	TCG	2	6	169024	169029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246668
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3569	NT_187115	CCAG	2	8	169085	169092	25 %	0 %	25 %	50 %	409246668
3570	NT_187115	GC	3	6	169150	169155	0 %	0 %	50 %	50 %	409246668
3571	NT_187115	ACAG	2	8	169203	169210	50 %	0 %	25 %	25 %	409246668
3572	NT_187115	CGG	2	6	169235	169240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246668
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3574	NT_187115	CTC	2	6	169320	169325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409246668
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3577	NT_187115	CAGT	2	8	169413	169420	25 %	25 %	25 %	25 %	409246668
3578	NT_187115	TGGC	2	8	169447	169454	0 %	25 %	50 %	25 %	409246668
3579	NT_187115	CTG	2	6	169483	169488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246668
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3582	NT_187115	CGCGC	2	10	169642	169651	0 %	0 %	40 %	60 %	409246668
3583	NT_187115	GGC	3	9	169738	169746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246668
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3590	NT_187115	ATT	2	6	170132	170137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409246669
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3592	NT_187115	TGA	2	6	170175	170180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246669
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3594	NT_187115	GC	3	6	170222	170227	0 %	0 %	50 %	50 %	409246669
3595	NT_187115	TCGT	2	8	170268	170275	0 %	50 %	25 %	25 %	409246669
3596	NT_187115	A	7	7	170365	170371	100 %	0 %	0 %	0 %	409246669
3597	NT_187115	ATG	2	6	170427	170432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3599	NT_187115	CTG	2	6	170477	170482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246670
3600	NT_187115	ATCA	2	8	170483	170490	50 %	25 %	0 %	25 %	409246670
3601	NT_187115	ACC	2	6	170501	170506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246670
3602	NT_187115	CCG	2	6	170548	170553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246670
3603	NT_187115	TGC	2	6	170586	170591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246670
3604	NT_187115	AT	3	6	170611	170616	50 %	50 %	0 %	0 %	409246670
3605	NT_187115	GCG	2	6	170637	170642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246670
3606	NT_187115	TCCAT	2	10	170644	170653	20 %	40 %	0 %	40 %	409246670
3607	NT_187115	AGA	2	6	170716	170721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246670
3608	NT_187115	CTG	2	6	170755	170760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246670
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3611	NT_187115	GC	3	6	171037	171042	0 %	0 %	50 %	50 %	409246670
3612	NT_187115	TAT	2	6	171054	171059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409246670
3613	NT_187115	TGAT	2	8	171060	171067	25 %	50 %	25 %	0 %	409246670
3614	NT_187115	GC	3	6	171095	171100	0 %	0 %	50 %	50 %	409246670
3615	NT_187115	GAT	2	6	171113	171118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246670
3616	NT_187115	TGA	2	6	171182	171187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3617	NT_187115	TCG	2	6	171220	171225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3618	NT_187115	CGCC	2	8	171229	171236	0 %	0 %	25 %	75 %	409246671
3619	NT_187115	GCC	2	6	171241	171246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246671
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3622	NT_187115	CCA	2	6	171476	171481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246671
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3871	NT_187115	CCG	2	6	183590	183595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246683
3872	NT_187115	GATCGC	2	12	183662	183673	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409246683
3873	NT_187115	CCCG	2	8	183686	183693	0 %	0 %	25 %	75 %	409246683
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3990	NT_187115	TCC	2	6	189088	189093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409246685
3991	NT_187115	CGT	2	6	189098	189103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246685
3992	NT_187115	CAG	2	6	189120	189125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246685
3993	NT_187115	TTG	2	6	189184	189189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409246685
3994	NT_187115	GCC	2	6	189210	189215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246685
3995	NT_187115	GCC	2	6	189220	189225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246685
3996	NT_187115	GCTGA	2	10	189231	189240	20 %	20 %	40 %	20 %	409246685
3997	NT_187115	ATC	2	6	189453	189458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246685
3998	NT_187115	TGC	2	6	189511	189516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246685
3999	NT_187115	TTA	2	6	189583	189588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409246685
4000	NT_187115	GC	3	6	189618	189623	0 %	0 %	50 %	50 %	409246685

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