MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 225

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187109	CGCA	2	8	414	421	25 %	0 %	25 %	50 %	409251068
2	NT_187109	ATGG	2	8	627	634	25 %	25 %	50 %	0 %	409251068
3	NT_187109	CGAT	2	8	1260	1267	25 %	25 %	25 %	25 %	409251068
4	NT_187109	ACTT	2	8	1452	1459	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NT_187109	CAAA	2	8	1483	1490	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NT_187109	AAAT	2	8	1757	1764	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187109	AATA	2	8	3567	3574	75 %	25 %	0 %	0 %	409251070
8	NT_187109	TCAC	2	8	3781	3788	25 %	25 %	0 %	50 %	409251070
9	NT_187109	GGCT	2	8	4291	4298	0 %	25 %	50 %	25 %	409251070
10	NT_187109	GCGT	2	8	5188	5195	0 %	25 %	50 %	25 %	409251071
11	NT_187109	TGCG	2	8	5620	5627	0 %	25 %	50 %	25 %	409251071
12	NT_187109	CCCA	2	8	5958	5965	25 %	0 %	0 %	75 %	409251071
13	NT_187109	TATT	2	8	6251	6258	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NT_187109	GGCG	2	8	6951	6958	0 %	0 %	75 %	25 %	409251072
15	NT_187109	TGAA	2	8	7076	7083	50 %	25 %	25 %	0 %	409251072
16	NT_187109	GTCA	2	8	9012	9019	25 %	25 %	25 %	25 %	409251074
17	NT_187109	GGTT	2	8	10188	10195	0 %	50 %	50 %	0 %	409251075
18	NT_187109	GCCA	2	8	11423	11430	25 %	0 %	25 %	50 %	409251076
19	NT_187109	TTGG	2	8	12451	12458	0 %	50 %	50 %	0 %	409251076
20	NT_187109	CATT	2	8	12578	12585	25 %	50 %	0 %	25 %	409251076
21	NT_187109	CAAA	2	8	12909	12916	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NT_187109	CGTG	2	8	13718	13725	0 %	25 %	50 %	25 %	409251077
23	NT_187109	GCTG	2	8	13812	13819	0 %	25 %	50 %	25 %	409251078
24	NT_187109	CTGC	2	8	13978	13985	0 %	25 %	25 %	50 %	409251078
25	NT_187109	CCAT	2	8	15460	15467	25 %	25 %	0 %	50 %	409251079
26	NT_187109	AACA	2	8	15826	15833	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NT_187109	ACGG	2	8	16628	16635	25 %	0 %	50 %	25 %	409251080
28	NT_187109	ACCA	2	8	17103	17110	50 %	0 %	0 %	50 %	409251080
29	NT_187109	TTTC	2	8	17617	17624	0 %	75 %	0 %	25 %	409251082
30	NT_187109	CCAG	2	8	17786	17793	25 %	0 %	25 %	50 %	409251083
31	NT_187109	GGAT	2	8	18030	18037	25 %	25 %	50 %	0 %	409251083
32	NT_187109	CAAA	2	8	18293	18300	75 %	0 %	0 %	25 %	409251083
33	NT_187109	GCTC	2	8	18730	18737	0 %	25 %	25 %	50 %	409251083
34	NT_187109	CCAG	2	8	18875	18882	25 %	0 %	25 %	50 %	409251083
35	NT_187109	TTGC	2	8	19987	19994	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NT_187109	TTAA	2	8	20043	20050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NT_187109	TCCT	2	8	20799	20806	0 %	50 %	0 %	50 %	409251085
38	NT_187109	AGAT	2	8	20898	20905	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NT_187109	ATCA	2	8	21214	21221	50 %	25 %	0 %	25 %	409251086
40	NT_187109	CTGC	2	8	21578	21585	0 %	25 %	25 %	50 %	409251086
41	NT_187109	TGAC	2	8	21728	21735	25 %	25 %	25 %	25 %	409251086
42	NT_187109	GGTC	2	8	22364	22371	0 %	25 %	50 %	25 %	409251087
43	NT_187109	CTGC	2	8	23263	23270	0 %	25 %	25 %	50 %	409251089
44	NT_187109	CATC	2	8	23804	23811	25 %	25 %	0 %	50 %	409251089
45	NT_187109	CATC	2	8	25076	25083	25 %	25 %	0 %	50 %	409251089
46	NT_187109	CTGG	2	8	27313	27320	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NT_187109	GCTG	2	8	28010	28017	0 %	25 %	50 %	25 %	409251092
48	NT_187109	TGAT	2	8	28096	28103	25 %	50 %	25 %	0 %	409251092
49	NT_187109	ACGT	2	8	29415	29422	25 %	25 %	25 %	25 %	409251094
50	NT_187109	ACGT	2	8	29584	29591	25 %	25 %	25 %	25 %	409251094
51	NT_187109	TGGA	2	8	29820	29827	25 %	25 %	50 %	0 %	409251094
52	NT_187109	CCGT	2	8	30464	30471	0 %	25 %	25 %	50 %	409251094
53	NT_187109	CAAG	2	8	30484	30491	50 %	0 %	25 %	25 %	409251094
54	NT_187109	AAGA	2	8	30840	30847	75 %	0 %	25 %	0 %	409251095
55	NT_187109	AACC	2	8	30958	30965	50 %	0 %	0 %	50 %	409251095
56	NT_187109	ACCA	2	8	31017	31024	50 %	0 %	0 %	50 %	409251095
57	NT_187109	GTTC	2	8	31061	31068	0 %	50 %	25 %	25 %	409251095
58	NT_187109	ACTG	2	8	32531	32538	25 %	25 %	25 %	25 %	409251097
59	NT_187109	GCCT	2	8	33611	33618	0 %	25 %	25 %	50 %	409251098
60	NT_187109	GACC	2	8	33619	33626	25 %	0 %	25 %	50 %	409251098
61	NT_187109	GGCT	2	8	33800	33807	0 %	25 %	50 %	25 %	409251098
62	NT_187109	TTAA	2	8	34174	34181	50 %	50 %	0 %	0 %	409251099
63	NT_187109	GCTG	2	8	34539	34546	0 %	25 %	50 %	25 %	409251099
64	NT_187109	ATGA	2	8	34609	34616	50 %	25 %	25 %	0 %	409251099
65	NT_187109	TTCG	2	8	34874	34881	0 %	50 %	25 %	25 %	409251100
66	NT_187109	AGCG	2	8	35665	35672	25 %	0 %	50 %	25 %	409251101
67	NT_187109	AGCA	2	8	36187	36194	50 %	0 %	25 %	25 %	409251103
68	NT_187109	ACAA	2	8	36251	36258	75 %	0 %	0 %	25 %	409251103
69	NT_187109	GGAA	2	8	37183	37190	50 %	0 %	50 %	0 %	409251103
70	NT_187109	CTGA	2	8	37613	37620	25 %	25 %	25 %	25 %	409251104
71	NT_187109	CCAG	2	8	37723	37730	25 %	0 %	25 %	50 %	409251104
72	NT_187109	TTAC	2	8	38961	38968	25 %	50 %	0 %	25 %	409251105
73	NT_187109	TGCT	2	8	39087	39094	0 %	50 %	25 %	25 %	409251106
74	NT_187109	TCCC	2	8	40097	40104	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
75	NT_187109	ATCA	2	8	40130	40137	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NT_187109	CAGG	2	8	40158	40165	25 %	0 %	50 %	25 %	409251107
77	NT_187109	CGCC	2	8	40772	40779	0 %	0 %	25 %	75 %	409251107
78	NT_187109	CTTT	2	8	42742	42749	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NT_187109	ATTA	2	8	42751	42758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NT_187109	GTTG	2	8	42761	42768	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NT_187109	TTCT	2	8	42798	42805	0 %	75 %	0 %	25 %	409251110
82	NT_187109	CAGC	2	8	42927	42934	25 %	0 %	25 %	50 %	409251110
83	NT_187109	CAGC	2	8	42972	42979	25 %	0 %	25 %	50 %	409251110
84	NT_187109	CGCA	2	8	43957	43964	25 %	0 %	25 %	50 %	409251112
85	NT_187109	TTTG	2	8	44432	44439	0 %	75 %	25 %	0 %	409251112
86	NT_187109	GCGG	2	8	44858	44865	0 %	0 %	75 %	25 %	409251113
87	NT_187109	GGCG	2	8	44911	44918	0 %	0 %	75 %	25 %	409251113
88	NT_187109	TTAT	2	8	45642	45649	25 %	75 %	0 %	0 %	409251113
89	NT_187109	CAAA	2	8	45664	45671	75 %	0 %	0 %	25 %	409251114
90	NT_187109	CTGC	2	8	45735	45742	0 %	25 %	25 %	50 %	409251114
91	NT_187109	GTTT	2	8	45959	45966	0 %	75 %	25 %	0 %	409251114
92	NT_187109	CCGC	2	8	46047	46054	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
93	NT_187109	CCGA	2	8	46371	46378	25 %	0 %	25 %	50 %	409251115
94	NT_187109	AATC	2	8	46922	46929	50 %	25 %	0 %	25 %	409251115
95	NT_187109	GGAA	2	8	47327	47334	50 %	0 %	50 %	0 %	409251115
96	NT_187109	ACCA	2	8	47487	47494	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NT_187109	CGCC	2	8	48665	48672	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
98	NT_187109	GCCA	2	8	48785	48792	25 %	0 %	25 %	50 %	409251117
99	NT_187109	ACGC	2	8	49205	49212	25 %	0 %	25 %	50 %	409251118
100	NT_187109	GCAA	2	8	50200	50207	50 %	0 %	25 %	25 %	409251119
101	NT_187109	TACA	2	8	50522	50529	50 %	25 %	0 %	25 %	409251119
102	NT_187109	CGCC	2	8	50807	50814	0 %	0 %	25 %	75 %	409251120
103	NT_187109	CCAG	2	8	50855	50862	25 %	0 %	25 %	50 %	409251120
104	NT_187109	GACG	2	8	50900	50907	25 %	0 %	50 %	25 %	409251120
105	NT_187109	TGGT	2	8	51046	51053	0 %	50 %	50 %	0 %	409251120
106	NT_187109	GAAA	2	8	51600	51607	75 %	0 %	25 %	0 %	409251120
107	NT_187109	AGGA	2	8	52162	52169	50 %	0 %	50 %	0 %	409251121
108	NT_187109	CCCG	2	8	52242	52249	0 %	0 %	25 %	75 %	409251121
109	NT_187109	GGTT	2	8	52746	52753	0 %	50 %	50 %	0 %	409251121
110	NT_187109	AGGC	2	8	53043	53050	25 %	0 %	50 %	25 %	409251121
111	NT_187109	TGCC	2	8	53832	53839	0 %	25 %	25 %	50 %	409251122
112	NT_187109	ATGG	2	8	54509	54516	25 %	25 %	50 %	0 %	409251122
113	NT_187109	CAGC	2	8	55034	55041	25 %	0 %	25 %	50 %	409251123
114	NT_187109	GCTC	2	8	55070	55077	0 %	25 %	25 %	50 %	409251123
115	NT_187109	CTGG	2	8	55232	55239	0 %	25 %	50 %	25 %	409251123
116	NT_187109	CAAA	2	8	55934	55941	75 %	0 %	0 %	25 %	409251123
117	NT_187109	CCGC	2	8	56231	56238	0 %	0 %	25 %	75 %	409251124
118	NT_187109	GGCG	2	8	57275	57282	0 %	0 %	75 %	25 %	409251125
119	NT_187109	CGAC	2	8	57354	57361	25 %	0 %	25 %	50 %	409251125
120	NT_187109	CGCC	2	8	58135	58142	0 %	0 %	25 %	75 %	409251125
121	NT_187109	GGCT	2	8	58269	58276	0 %	25 %	50 %	25 %	409251125
122	NT_187109	GCCA	2	8	58372	58379	25 %	0 %	25 %	50 %	409251126
123	NT_187109	TTCA	2	8	59078	59085	25 %	50 %	0 %	25 %	409251128
124	NT_187109	CCAT	2	8	59905	59912	25 %	25 %	0 %	50 %	409251128
125	NT_187109	TGGC	2	8	60318	60325	0 %	25 %	50 %	25 %	409251129
126	NT_187109	CTTT	2	8	61803	61810	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NT_187109	AGAA	2	8	62490	62497	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NT_187109	AATA	2	8	62588	62595	75 %	25 %	0 %	0 %	409251132
129	NT_187109	GCGG	2	8	62971	62978	0 %	0 %	75 %	25 %	409251134
130	NT_187109	CAGG	2	8	64939	64946	25 %	0 %	50 %	25 %	409251134
131	NT_187109	CATC	2	8	65076	65083	25 %	25 %	0 %	50 %	409251134
132	NT_187109	TTGA	2	8	65501	65508	25 %	50 %	25 %	0 %	409251135
133	NT_187109	GACT	2	8	66072	66079	25 %	25 %	25 %	25 %	409251135
134	NT_187109	GAAA	2	8	66106	66113	75 %	0 %	25 %	0 %	409251135
135	NT_187109	CCGG	2	8	66734	66741	0 %	0 %	50 %	50 %	409251136
136	NT_187109	GCTG	2	8	66824	66831	0 %	25 %	50 %	25 %	409251136
137	NT_187109	ACGC	2	8	67902	67909	25 %	0 %	25 %	50 %	409251137
138	NT_187109	CCGC	2	8	68138	68145	0 %	0 %	25 %	75 %	409251137
139	NT_187109	CAAT	2	8	69075	69082	50 %	25 %	0 %	25 %	409251139
140	NT_187109	CTCA	2	8	69199	69206	25 %	25 %	0 %	50 %	409251139
141	NT_187109	CGCT	2	8	70068	70075	0 %	25 %	25 %	50 %	409251140
142	NT_187109	AGAA	2	8	70448	70455	75 %	0 %	25 %	0 %	409251140
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.