MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 1616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187109	GCA	2	6	103	108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251068
2	NT_187109	CAG	2	6	251	256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251068
3	NT_187109	CTT	2	6	257	262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409251068
4	NT_187109	CGC	2	6	284	289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251068
5	NT_187109	CGA	2	6	384	389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251068
6	NT_187109	CTG	2	6	422	427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251068
7	NT_187109	GCG	2	6	441	446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251068
8	NT_187109	GCC	2	6	450	455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251068
9	NT_187109	CCA	2	6	532	537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251068
10	NT_187109	CGT	2	6	646	651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251068
11	NT_187109	CAC	2	6	680	685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251068
12	NT_187109	CAT	2	6	691	696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251068
13	NT_187109	ATC	2	6	777	782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251068
14	NT_187109	GAA	2	6	830	835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251068
15	NT_187109	AAT	2	6	1187	1192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409251068
16	NT_187109	ATA	2	6	1302	1307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409251068
17	NT_187109	TGG	2	6	1357	1362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187109	TTC	2	6	1389	1394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NT_187109	ATT	2	6	1495	1500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187109	CGA	2	6	1541	1546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NT_187109	AAT	2	6	1575	1580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187109	ATG	2	6	1795	1800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187109	AAT	2	6	1848	1853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187109	CCA	2	6	2012	2017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NT_187109	CCA	2	6	2151	2156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251069
26	NT_187109	CGC	2	6	2218	2223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251069
27	NT_187109	CGC	2	6	2251	2256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251069
28	NT_187109	ATG	2	6	2268	2273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251069
29	NT_187109	CGG	2	6	2431	2436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251069
30	NT_187109	CTT	3	9	2479	2487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409251069
31	NT_187109	CGC	3	9	2623	2631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251069
32	NT_187109	CGG	2	6	2680	2685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251069
33	NT_187109	TGA	2	6	2695	2700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251069
34	NT_187109	CAC	2	6	2855	2860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251069
35	NT_187109	GCC	2	6	2954	2959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251069
36	NT_187109	CTA	2	6	2968	2973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251069
37	NT_187109	TTC	2	6	2989	2994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409251069
38	NT_187109	AAC	3	9	3052	3060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NT_187109	TCA	2	6	3095	3100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NT_187109	GCA	2	6	3131	3136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NT_187109	TGC	3	9	3218	3226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251070
42	NT_187109	ATT	2	6	3244	3249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409251070
43	NT_187109	GTG	2	6	3397	3402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251070
44	NT_187109	GCT	2	6	3498	3503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251070
45	NT_187109	ATC	2	6	3514	3519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251070
46	NT_187109	TGG	2	6	3528	3533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251070
47	NT_187109	GGC	3	9	3582	3590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251070
48	NT_187109	CGC	2	6	3684	3689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251070
49	NT_187109	GGC	2	6	3765	3770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251070
50	NT_187109	GCG	2	6	3772	3777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251070
51	NT_187109	TGG	2	6	3851	3856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251070
52	NT_187109	TCG	2	6	3875	3880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251070
53	NT_187109	TGC	2	6	3941	3946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251070
54	NT_187109	CAA	2	6	4054	4059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409251070
55	NT_187109	ATT	2	6	4091	4096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409251070
56	NT_187109	CGT	2	6	4107	4112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251070
57	NT_187109	CGC	2	6	4119	4124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251070
58	NT_187109	CGG	2	6	4136	4141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251070
59	NT_187109	CGG	2	6	4155	4160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251070
60	NT_187109	GGC	2	6	4311	4316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251070
61	NT_187109	GTC	2	6	4318	4323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251070
62	NT_187109	CTG	2	6	4339	4344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251070
63	NT_187109	GCT	2	6	4347	4352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251070
64	NT_187109	GCC	2	6	4405	4410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251070
65	NT_187109	GGT	2	6	4635	4640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251071
66	NT_187109	TTG	2	6	4722	4727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409251071
67	NT_187109	AGC	2	6	4728	4733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251071
68	NT_187109	AAT	2	6	4808	4813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409251071
69	NT_187109	CCG	2	6	4823	4828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251071
70	NT_187109	CGG	2	6	4858	4863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251071
71	NT_187109	ATA	2	6	4971	4976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409251071
72	NT_187109	CTG	2	6	4994	4999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251071
73	NT_187109	CGG	2	6	5059	5064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251071
74	NT_187109	CGG	3	9	5072	5080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251071
75	NT_187109	CCG	2	6	5197	5202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251071
76	NT_187109	TTG	2	6	5207	5212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409251071
77	NT_187109	CTT	2	6	5293	5298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409251071
78	NT_187109	TGC	2	6	5299	5304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251071
79	NT_187109	TCA	2	6	5346	5351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251071
80	NT_187109	AGT	2	6	5370	5375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251071
81	NT_187109	TCA	2	6	5479	5484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251071
82	NT_187109	CGC	2	6	5521	5526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251071
83	NT_187109	CGG	2	6	5593	5598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251071
84	NT_187109	GCA	2	6	5599	5604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251071
85	NT_187109	GCT	2	6	5773	5778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251071
86	NT_187109	CGA	2	6	5800	5805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251071
87	NT_187109	GGT	2	6	5879	5884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251071
88	NT_187109	GCG	2	6	5934	5939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251071
89	NT_187109	GGT	2	6	5977	5982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251071
90	NT_187109	TCG	2	6	6324	6329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251072
91	NT_187109	GCG	2	6	6341	6346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251072
92	NT_187109	GCT	2	6	6420	6425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251072
93	NT_187109	AAT	2	6	6469	6474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409251072
94	NT_187109	GCC	3	9	6480	6488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251072
95	NT_187109	TGA	2	6	6546	6551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251072
96	NT_187109	ATC	2	6	6556	6561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251072
97	NT_187109	CCA	2	6	6563	6568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251072
98	NT_187109	CGC	2	6	6710	6715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251072
99	NT_187109	GGA	2	6	6825	6830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409251072
100	NT_187109	TCA	2	6	6852	6857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251072
101	NT_187109	GCT	2	6	6897	6902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251072
102	NT_187109	CGC	2	6	6944	6949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251072
103	NT_187109	CCG	2	6	7046	7051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251072
104	NT_187109	ACG	2	6	7092	7097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251072
105	NT_187109	TGC	2	6	7133	7138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251072
106	NT_187109	CGC	2	6	7197	7202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251072
107	NT_187109	CGG	3	9	7229	7237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251072
108	NT_187109	GGC	2	6	7412	7417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251073
109	NT_187109	GAT	2	6	7503	7508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251073
110	NT_187109	ACT	2	6	7516	7521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251073
111	NT_187109	GGT	2	6	7527	7532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251073
112	NT_187109	TGG	2	6	7587	7592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251073
113	NT_187109	ATC	2	6	7609	7614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251073
114	NT_187109	CGA	2	6	7673	7678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251073
115	NT_187109	CAT	2	6	7707	7712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251073
116	NT_187109	CCT	2	6	7720	7725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409251073
117	NT_187109	CGA	2	6	7826	7831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251074
118	NT_187109	CGC	2	6	7867	7872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251074
119	NT_187109	CAG	2	6	7953	7958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251074
120	NT_187109	TCA	2	6	7967	7972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251074
121	NT_187109	GCA	2	6	8021	8026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251074
122	NT_187109	CAC	2	6	8082	8087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251074
123	NT_187109	GGA	2	6	8115	8120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409251074
124	NT_187109	GCC	2	6	8158	8163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251074
125	NT_187109	CGC	3	9	8241	8249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251074
126	NT_187109	CAT	2	6	8259	8264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251074
127	NT_187109	GTT	2	6	8330	8335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409251074
128	NT_187109	CCG	2	6	8344	8349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251074
129	NT_187109	TCG	2	6	8399	8404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251074
130	NT_187109	CGG	2	6	8417	8422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251074
131	NT_187109	GCG	3	9	8521	8529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251074
132	NT_187109	CCG	2	6	8545	8550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251074
133	NT_187109	TAA	2	6	8634	8639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409251074
134	NT_187109	TGC	2	6	8670	8675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251074
135	NT_187109	GAT	2	6	8709	8714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251074
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137	NT_187109	GCT	2	6	8991	8996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251074
138	NT_187109	GAC	2	6	9145	9150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NT_187109	TTA	2	6	9273	9278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NT_187109	GTT	2	6	9399	9404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409251075
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180	NT_187109	AAT	2	6	12843	12848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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182	NT_187109	AGC	2	6	12928	12933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
183	NT_187109	TGG	2	6	12998	13003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
184	NT_187109	TGG	2	6	13116	13121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
185	NT_187109	CAT	2	6	13223	13228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
186	NT_187109	AGT	2	6	13328	13333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
187	NT_187109	AGA	2	6	13436	13441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251077
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232	NT_187109	CAC	2	6	16206	16211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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236	NT_187109	GAC	2	6	16478	16483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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251	NT_187109	GGA	2	6	17603	17608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409251082
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253	NT_187109	AAT	2	6	17828	17833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409251083
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255	NT_187109	CCT	2	6	17933	17938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409251083
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257	NT_187109	ATC	2	6	17995	18000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251083
258	NT_187109	CAG	3	9	18003	18011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251083
259	NT_187109	AAG	2	6	18049	18054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251083
260	NT_187109	TCA	2	6	18083	18088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251083
261	NT_187109	GAA	2	6	18120	18125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251083
262	NT_187109	CAC	2	6	18192	18197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251083
263	NT_187109	GCA	2	6	18269	18274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251083
264	NT_187109	CAT	2	6	18285	18290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251083
265	NT_187109	AAG	2	6	18301	18306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251083
266	NT_187109	GTG	2	6	18367	18372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251083
267	NT_187109	CTT	2	6	18378	18383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409251083
268	NT_187109	CAA	2	6	18506	18511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409251083
269	NT_187109	CAT	2	6	18657	18662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251083
270	NT_187109	GGT	2	6	18678	18683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251083
271	NT_187109	GCC	3	9	19057	19065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251084
272	NT_187109	CAA	2	6	19133	19138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409251084
273	NT_187109	CGC	2	6	19199	19204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251084
274	NT_187109	AAT	2	6	19206	19211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409251084
275	NT_187109	CAT	2	6	19215	19220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251084
276	NT_187109	GCC	2	6	19231	19236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251084
277	NT_187109	CTC	2	6	19293	19298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409251084
278	NT_187109	GAA	2	6	19356	19361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251084
279	NT_187109	ATC	2	6	19377	19382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251084
280	NT_187109	CCA	2	6	19391	19396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251084
281	NT_187109	AAC	2	6	19492	19497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409251084
282	NT_187109	TCA	2	6	19538	19543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251084
283	NT_187109	AAT	2	6	19779	19784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409251084
284	NT_187109	TCA	2	6	19913	19918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
285	NT_187109	TAA	2	6	20056	20061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NT_187109	TCT	2	6	20112	20117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409251085
287	NT_187109	ATT	2	6	20124	20129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409251085
288	NT_187109	GAT	2	6	20238	20243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251085
289	NT_187109	TTC	2	6	20301	20306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409251085
290	NT_187109	GCC	2	6	20329	20334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251085
291	NT_187109	ATG	2	6	20464	20469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251085
292	NT_187109	CTT	2	6	20528	20533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409251085
293	NT_187109	CTA	2	6	20558	20563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251085
294	NT_187109	TGG	2	6	20730	20735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251085
295	NT_187109	CTC	2	6	20743	20748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409251085
296	NT_187109	ATA	2	6	20782	20787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409251085
297	NT_187109	ATT	2	6	20817	20822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409251085
298	NT_187109	CGG	2	6	20940	20945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251086
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301	NT_187109	CGC	2	6	21017	21022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251086
302	NT_187109	GCA	2	6	21108	21113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251086
303	NT_187109	CCA	2	6	21135	21140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251086
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309	NT_187109	TAA	2	6	21798	21803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409251086
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313	NT_187109	CTG	2	6	22053	22058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251087
314	NT_187109	ATC	2	6	22095	22100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251087
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320	NT_187109	CGC	2	6	22354	22359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251087
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322	NT_187109	CTG	3	9	22434	22442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251087
323	NT_187109	CAA	2	6	22496	22501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409251087
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328	NT_187109	CGA	2	6	22700	22705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251087
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332	NT_187109	GCA	2	6	22892	22897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251087
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382	NT_187109	GCG	2	6	25948	25953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251090
383	NT_187109	CAT	2	6	25966	25971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251090
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