MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 2338

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NT_187109	CG	3	6	92606	92611	0 %	0 %	50 %	50 %	409251158
2002	NT_187109	AC	3	6	92640	92645	50 %	0 %	0 %	50 %	409251158
2003	NT_187109	A	7	7	92676	92682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2004	NT_187109	ATG	2	6	92696	92701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2005	NT_187109	TTA	2	6	92706	92711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2006	NT_187109	AGA	2	6	92723	92728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2007	NT_187109	GGC	2	6	92755	92760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2008	NT_187109	A	7	7	92820	92826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2009	NT_187109	TCA	2	6	92852	92857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2010	NT_187109	GGC	2	6	92872	92877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2011	NT_187109	ATG	2	6	92886	92891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2012	NT_187109	AATGG	2	10	92992	93001	40 %	20 %	40 %	0 %	409251159
2013	NT_187109	CCG	2	6	93031	93036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251159
2014	NT_187109	CAC	2	6	93042	93047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251159
2015	NT_187109	AAT	2	6	93054	93059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409251159
2016	NT_187109	CAG	2	6	93105	93110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251159
2017	NT_187109	AAT	2	6	93129	93134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409251159
2018	NT_187109	CAC	2	6	93198	93203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251159
2019	NT_187109	CAC	2	6	93213	93218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251159
2020	NT_187109	CCA	2	6	93254	93259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251159
2021	NT_187109	CCAG	2	8	93305	93312	25 %	0 %	25 %	50 %	409251159
2022	NT_187109	CAC	3	9	93324	93332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251159
2023	NT_187109	CTG	2	6	93369	93374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251159
2024	NT_187109	GCA	2	6	93419	93424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251159
2025	NT_187109	GCACCA	2	12	93485	93496	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	409251159
2026	NT_187109	CAC	2	6	93546	93551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251159
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2028	NT_187109	CATC	2	8	93614	93621	25 %	25 %	0 %	50 %	409251159
2029	NT_187109	CTG	2	6	93708	93713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251159
2030	NT_187109	CAC	2	6	93729	93734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251159
2031	NT_187109	TAA	2	6	93744	93749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409251159
2032	NT_187109	GC	3	6	93819	93824	0 %	0 %	50 %	50 %	409251159
2033	NT_187109	CAG	2	6	93837	93842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251159
2034	NT_187109	CAG	2	6	93864	93869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251159
2035	NT_187109	CCA	2	6	93914	93919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251159
2036	NT_187109	A	6	6	94052	94057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2037	NT_187109	TCA	2	6	94108	94113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2038	NT_187109	ACG	2	6	94155	94160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2039	NT_187109	ACA	2	6	94183	94188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2040	NT_187109	A	8	8	94215	94222	100 %	0 %	0 %	0 %	409251160
2041	NT_187109	TGG	2	6	94225	94230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251160
2042	NT_187109	GCA	2	6	94242	94247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251160
2043	NT_187109	GC	3	6	94387	94392	0 %	0 %	50 %	50 %	409251160
2044	NT_187109	GCT	2	6	94409	94414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251160
2045	NT_187109	T	6	6	94484	94489	0 %	100 %	0 %	0 %	409251160
2046	NT_187109	AAT	2	6	94497	94502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409251160
2047	NT_187109	CGCGTT	2	12	94514	94525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251160
2048	NT_187109	GGC	2	6	94530	94535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251160
2049	NT_187109	TGC	2	6	94543	94548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251160
2050	NT_187109	AGCT	2	8	94585	94592	25 %	25 %	25 %	25 %	409251160
2051	NT_187109	GC	4	8	94638	94645	0 %	0 %	50 %	50 %	409251160
2052	NT_187109	AGCGC	2	10	94660	94669	20 %	0 %	40 %	40 %	409251160
2053	NT_187109	TGGG	2	8	94680	94687	0 %	25 %	75 %	0 %	409251160
2054	NT_187109	TGGCCA	2	12	94708	94719	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409251160
2055	NT_187109	GGC	2	6	94736	94741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251160
2056	NT_187109	AAG	2	6	94804	94809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251160
2057	NT_187109	CTCA	2	8	94929	94936	25 %	25 %	0 %	50 %	409251160
2058	NT_187109	GCC	2	6	94951	94956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251160
2059	NT_187109	GTG	2	6	94998	95003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251160
2060	NT_187109	CCG	2	6	95011	95016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251160
2061	NT_187109	GC	4	8	95034	95041	0 %	0 %	50 %	50 %	409251160
2062	NT_187109	CTG	2	6	95085	95090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251160
2063	NT_187109	GCG	2	6	95127	95132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251160
2064	NT_187109	GC	3	6	95181	95186	0 %	0 %	50 %	50 %	409251160
2065	NT_187109	ACG	2	6	95278	95283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251160
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2069	NT_187109	AAC	2	6	95469	95474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409251160
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2072	NT_187109	GAC	2	6	95521	95526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251160
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2074	NT_187109	TTA	2	6	95671	95676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2078	NT_187109	CGCC	2	8	95815	95822	0 %	0 %	25 %	75 %	409251161
2079	NT_187109	GCC	2	6	95826	95831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251161
2080	NT_187109	CTG	2	6	95844	95849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251161
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2083	NT_187109	TGG	2	6	95998	96003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251161
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2085	NT_187109	CGC	2	6	96071	96076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2086	NT_187109	GC	3	6	96258	96263	0 %	0 %	50 %	50 %	409251162
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2088	NT_187109	AC	3	6	96491	96496	50 %	0 %	0 %	50 %	409251162
2089	NT_187109	GGC	2	6	96602	96607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251162
2090	NT_187109	GCA	2	6	96610	96615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251162
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2092	NT_187109	AG	3	6	96702	96707	50 %	0 %	50 %	0 %	409251162
2093	NT_187109	TCG	2	6	96741	96746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251162
2094	NT_187109	AG	3	6	96767	96772	50 %	0 %	50 %	0 %	409251162
2095	NT_187109	GT	3	6	96781	96786	0 %	50 %	50 %	0 %	409251162
2096	NT_187109	GCA	2	6	96861	96866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2097	NT_187109	CAT	2	6	96905	96910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251163
2098	NT_187109	CTT	2	6	96926	96931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409251163
2099	NT_187109	TCAGGC	2	12	96962	96973	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409251163
2100	NT_187109	CGA	2	6	96980	96985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251163
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2102	NT_187109	GAT	2	6	97050	97055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251163
2103	NT_187109	TGT	2	6	97091	97096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409251163
2104	NT_187109	ACA	2	6	97151	97156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409251163
2105	NT_187109	CGC	2	6	97166	97171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251163
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2107	NT_187109	CGC	2	6	97245	97250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251163
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2109	NT_187109	GGT	2	6	97314	97319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251163
2110	NT_187109	GAA	2	6	97335	97340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251163
2111	NT_187109	TCG	2	6	97352	97357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251163
2112	NT_187109	T	6	6	97410	97415	0 %	100 %	0 %	0 %	409251163
2113	NT_187109	CAC	2	6	97431	97436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251163
2114	NT_187109	CGC	2	6	97470	97475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251163
2115	NT_187109	GAT	2	6	97692	97697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251163
2116	NT_187109	GCAG	2	8	97729	97736	25 %	0 %	50 %	25 %	409251163
2117	NT_187109	CGC	2	6	97752	97757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251163
2118	NT_187109	GCCA	2	8	97761	97768	25 %	0 %	25 %	50 %	409251163
2119	NT_187109	ACATC	2	10	97817	97826	40 %	20 %	0 %	40 %	409251163
2120	NT_187109	CAGC	2	8	97827	97834	25 %	0 %	25 %	50 %	409251163
2121	NT_187109	T	6	6	97845	97850	0 %	100 %	0 %	0 %	409251163
2122	NT_187109	CAGA	2	8	97866	97873	50 %	0 %	25 %	25 %	409251163
2123	NT_187109	CGC	2	6	97880	97885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251163
2124	NT_187109	ATA	2	6	97888	97893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409251163
2125	NT_187109	CAA	2	6	97926	97931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409251163
2126	NT_187109	CAG	2	6	98007	98012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251163
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2128	NT_187109	GCG	2	6	98135	98140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251163
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.