MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 2338

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NT_187109	GCGCG	2	10	24231	24240	0 %	0 %	60 %	40 %	409251089
502	NT_187109	CAC	2	6	24291	24296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251089
503	NT_187109	GCA	2	6	24422	24427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251089
504	NT_187109	CGC	2	6	24455	24460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251089
505	NT_187109	CGC	3	9	24543	24551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251089
506	NT_187109	GCC	2	6	24576	24581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251089
507	NT_187109	GCG	2	6	24585	24590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251089
508	NT_187109	CG	3	6	24589	24594	0 %	0 %	50 %	50 %	409251089
509	NT_187109	GGT	2	6	24732	24737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251089
510	NT_187109	GCA	2	6	24819	24824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251089
511	NT_187109	TCA	2	6	24892	24897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251089
512	NT_187109	GCG	2	6	24956	24961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251089
513	NT_187109	CATC	2	8	25076	25083	25 %	25 %	0 %	50 %	409251089
514	NT_187109	ATG	2	6	25101	25106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251089
515	NT_187109	GTT	3	9	25133	25141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409251089
516	NT_187109	A	6	6	25172	25177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NT_187109	GCG	2	6	25282	25287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251090
518	NT_187109	TCA	2	6	25288	25293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251090
519	NT_187109	ACG	2	6	25314	25319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251090
520	NT_187109	CCG	2	6	25320	25325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251090
521	NT_187109	TCA	2	6	25329	25334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251090
522	NT_187109	TGC	2	6	25341	25346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251090
523	NT_187109	GCA	2	6	25354	25359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251090
524	NT_187109	GGCCG	2	10	25490	25499	0 %	0 %	60 %	40 %	409251090
525	NT_187109	CTG	2	6	25559	25564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251090
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530	NT_187109	GCG	2	6	25759	25764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251090
531	NT_187109	CGG	2	6	25772	25777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251090
532	NT_187109	CTG	2	6	25784	25789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251090
533	NT_187109	GCG	2	6	25792	25797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251090
534	NT_187109	CGG	2	6	25805	25810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251090
535	NT_187109	CTG	2	6	25826	25831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251090
536	NT_187109	GCG	2	6	25837	25842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251090
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539	NT_187109	GCG	2	6	25948	25953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251090
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545	NT_187109	CAA	2	6	26176	26181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409251090
546	NT_187109	CAT	2	6	26207	26212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251090
547	NT_187109	TGT	2	6	26222	26227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NT_187109	CCA	2	6	26240	26245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
549	NT_187109	CAAGTG	2	12	26286	26297	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
550	NT_187109	GCA	2	6	26312	26317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NT_187109	T	6	6	26348	26353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NT_187109	TCA	2	6	26450	26455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251091
553	NT_187109	GCG	2	6	26475	26480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251091
554	NT_187109	TAT	2	6	26483	26488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409251091
555	NT_187109	CCG	2	6	26527	26532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251091
556	NT_187109	GCG	2	6	26574	26579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251091
557	NT_187109	TGG	2	6	26585	26590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251091
558	NT_187109	TGA	2	6	26625	26630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251091
559	NT_187109	CTG	2	6	26666	26671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251091
560	NT_187109	CTG	2	6	26696	26701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251091
561	NT_187109	T	6	6	26713	26718	0 %	100 %	0 %	0 %	409251091
562	NT_187109	CGC	2	6	26740	26745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251091
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568	NT_187109	GC	3	6	27081	27086	0 %	0 %	50 %	50 %	409251091
569	NT_187109	GAT	2	6	27103	27108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251091
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582	NT_187109	TGAT	2	8	28096	28103	25 %	50 %	25 %	0 %	409251092
583	NT_187109	GAA	2	6	28125	28130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251092
584	NT_187109	CG	3	6	28142	28147	0 %	0 %	50 %	50 %	409251092
585	NT_187109	TTC	2	6	28184	28189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409251092
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589	NT_187109	A	6	6	28363	28368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NT_187109	T	6	6	28385	28390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NT_187109	TCACC	2	10	28409	28418	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
592	NT_187109	ATT	2	6	28462	28467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NT_187109	GCC	2	6	28668	28673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
594	NT_187109	AAG	2	6	28734	28739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251093
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596	NT_187109	AAG	2	6	28794	28799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251093
597	NT_187109	CGT	2	6	28900	28905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251093
598	NT_187109	T	7	7	28983	28989	0 %	100 %	0 %	0 %	409251093
599	NT_187109	CTG	3	9	29078	29086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251094
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601	NT_187109	A	7	7	29114	29120	100 %	0 %	0 %	0 %	409251094
602	NT_187109	GAA	2	6	29228	29233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251094
603	NT_187109	AAG	2	6	29235	29240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251094
604	NT_187109	TGC	2	6	29262	29267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251094
605	NT_187109	GAG	2	6	29276	29281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409251094
606	NT_187109	GAA	2	6	29375	29380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251094
607	NT_187109	ACGT	2	8	29415	29422	25 %	25 %	25 %	25 %	409251094
608	NT_187109	CTG	2	6	29438	29443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251094
609	NT_187109	GAA	2	6	29489	29494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251094
610	NT_187109	CTGAC	2	10	29511	29520	20 %	20 %	20 %	40 %	409251094
611	NT_187109	TCA	2	6	29565	29570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251094
612	NT_187109	ACGT	2	8	29584	29591	25 %	25 %	25 %	25 %	409251094
613	NT_187109	CAT	2	6	29602	29607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251094
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615	NT_187109	GC	3	6	29746	29751	0 %	0 %	50 %	50 %	409251094
616	NT_187109	TGGA	2	8	29820	29827	25 %	25 %	50 %	0 %	409251094
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621	NT_187109	GC	3	6	30100	30105	0 %	0 %	50 %	50 %	409251094
622	NT_187109	CG	3	6	30152	30157	0 %	0 %	50 %	50 %	409251094
623	NT_187109	GAT	2	6	30202	30207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251094
624	NT_187109	GAA	2	6	30218	30223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251094
625	NT_187109	CG	3	6	30227	30232	0 %	0 %	50 %	50 %	409251094
626	NT_187109	TGG	2	6	30315	30320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251094
627	NT_187109	GCG	2	6	30332	30337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251094
628	NT_187109	AAG	2	6	30360	30365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251094
629	NT_187109	ATGAT	2	10	30429	30438	40 %	40 %	20 %	0 %	409251094
630	NT_187109	CCGT	2	8	30464	30471	0 %	25 %	25 %	50 %	409251094
631	NT_187109	CAAG	2	8	30484	30491	50 %	0 %	25 %	25 %	409251094
632	NT_187109	TG	3	6	30531	30536	0 %	50 %	50 %	0 %	409251094
633	NT_187109	CGA	2	6	30550	30555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251094
634	NT_187109	AAG	2	6	30629	30634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251094
635	NT_187109	AGCAG	2	10	30673	30682	40 %	0 %	40 %	20 %	409251094
636	NT_187109	GAA	2	6	30737	30742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251094
637	NT_187109	A	6	6	30741	30746	100 %	0 %	0 %	0 %	409251094
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642	NT_187109	A	6	6	30928	30933	100 %	0 %	0 %	0 %	409251095
643	NT_187109	AACC	2	8	30958	30965	50 %	0 %	0 %	50 %	409251095
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648	NT_187109	GTT	2	6	31212	31217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409251095
649	NT_187109	AAG	2	6	31299	31304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251095
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651	NT_187109	T	8	8	31345	31352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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653	NT_187109	GCG	2	6	31384	31389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
654	NT_187109	GCC	2	6	31574	31579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251096
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660	NT_187109	TCA	2	6	31755	31760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251097
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682	NT_187109	AAT	2	6	32638	32643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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720	NT_187109	TTA	2	6	34687	34692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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731	NT_187109	ACG	2	6	35119	35124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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751	NT_187109	CG	3	6	35917	35922	0 %	0 %	50 %	50 %	409251101
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753	NT_187109	GCG	2	6	36012	36017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251101
754	NT_187109	AAGCG	2	10	36128	36137	40 %	0 %	40 %	20 %	409251102
755	NT_187109	AGCA	2	8	36187	36194	50 %	0 %	25 %	25 %	409251103
756	NT_187109	ACAA	2	8	36251	36258	75 %	0 %	0 %	25 %	409251103
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758	NT_187109	CGT	2	6	36279	36284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251103
759	NT_187109	CAC	2	6	36295	36300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251103
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763	NT_187109	CGC	2	6	36516	36521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251103
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790	NT_187109	CGC	2	6	37589	37594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251104
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840	NT_187109	TGC	2	6	39933	39938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251106
841	NT_187109	TCA	2	6	40013	40018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
842	NT_187109	TA	3	6	40052	40057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
843	NT_187109	TGA	2	6	40063	40068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
844	NT_187109	TCCC	2	8	40097	40104	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
845	NT_187109	GAG	3	9	40115	40123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
846	NT_187109	ATCA	2	8	40130	40137	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
847	NT_187109	TACGCT	2	12	40144	40155	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	409251107
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852	NT_187109	CCA	2	6	40485	40490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251107
853	NT_187109	CAT	2	6	40510	40515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251107
854	NT_187109	ATC	2	6	40541	40546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251107
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860	NT_187109	TAA	2	6	40984	40989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
861	NT_187109	A	7	7	41037	41043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
862	NT_187109	GCGCT	2	10	41091	41100	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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873	NT_187109	CGC	2	6	41725	41730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251108
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875	NT_187109	CGC	3	9	41853	41861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251108
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879	NT_187109	CG	3	6	41968	41973	0 %	0 %	50 %	50 %	409251108
880	NT_187109	TCC	2	6	42067	42072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409251108
881	NT_187109	AAGCG	2	10	42131	42140	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
882	NT_187109	ACG	2	6	42161	42166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251109
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884	NT_187109	TCA	2	6	42204	42209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251109
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