MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187106	GGATAA	2	12	241	252	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	409250881
2	NT_187106	CGCCTG	2	12	1346	1357	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	409250881
3	NT_187106	GCCAGC	2	12	5131	5142	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409250883
4	NT_187106	GGAAGT	2	12	11216	11227	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	409250887
5	NT_187106	GCGCCT	2	12	13206	13217	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	409250890
6	NT_187106	ATTACC	2	12	17646	17657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250893
7	NT_187106	TTGCCG	2	12	23168	23179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250897
8	NT_187106	TGCCGT	2	12	25882	25893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250901
9	NT_187106	GTCGAT	2	12	26030	26041	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	409250901
10	NT_187106	GCGAAA	2	12	28225	28236	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	409250903
11	NT_187106	GCAGAT	2	12	35287	35298	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	409250910
12	NT_187106	TGGCGC	2	12	37759	37770	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409250913
13	NT_187106	CATTCT	2	12	40843	40854	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	409250915
14	NT_187106	CGGTTT	2	12	40890	40901	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NT_187106	TGCGCC	2	12	41006	41017	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	409250916
16	NT_187106	CATCCA	2	12	41241	41252	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	409250916
17	NT_187106	CGGCAG	2	12	44746	44757	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	409250919
18	NT_187106	TCAGGT	2	12	48897	48908	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	409250923
19	NT_187106	CAGCCA	2	12	49874	49885	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	409250924
20	NT_187106	GCATGA	2	12	50073	50084	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	409250924
21	NT_187106	ACGCGG	2	12	52929	52940	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	409250928
22	NT_187106	GGTGAC	2	12	53177	53188	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	409250928
23	NT_187106	ACCGAT	2	12	55583	55594	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	409250929
24	NT_187106	CATAGC	2	12	55714	55725	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	409250929
25	NT_187106	TCAAAG	2	12	58843	58854	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	409250932
26	NT_187106	AAAAAT	2	12	61085	61096	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	409250934
27	NT_187106	CATTAA	2	12	61616	61627	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NT_187106	ATCGAG	2	12	62933	62944	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	409250936
29	NT_187106	TGGCCG	2	12	65016	65027	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409250938
30	NT_187106	TGCATA	2	12	67357	67368	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	409250940
31	NT_187106	AACACC	2	12	72136	72147	50 %	0 %	0 %	50 %	409250945
32	NT_187106	GTTTAC	2	12	72784	72795	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	409250945
33	NT_187106	TATGTT	2	12	73843	73854	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	409250946
34	NT_187106	CGCTGG	2	12	78348	78359	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409250950
35	NT_187106	CAGCGC	2	12	80396	80407	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409250953
36	NT_187106	TCAGCG	2	12	82856	82867	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409250956
37	NT_187106	TCAGCG	2	12	85217	85228	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409250959
38	NT_187106	ATCAAA	2	12	86431	86442	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	409250961
39	NT_187106	CCAGCG	2	12	88938	88949	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409250963
40	NT_187106	ATTCGC	2	12	90029	90040	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	409250964
41	NT_187106	GCAAAC	2	12	92471	92482	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	409250966
42	NT_187106	GCCAAA	2	12	95284	95295	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	409250968
43	NT_187106	AGAAAA	2	12	98356	98367	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NT_187106	CGGCTT	2	12	98945	98956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250971
45	NT_187106	GCACGC	2	12	100262	100273	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409250972
46	NT_187106	CCGCAG	2	12	105967	105978	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409250978
47	NT_187106	CCAGAC	2	12	107021	107032	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	409250979

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.