MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 2304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NT_187106	AG	3	6	93523	93528	50 %	0 %	50 %	0 %	409250967
2002	NT_187106	CCG	3	9	93636	93644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250967
2003	NT_187106	CATA	2	8	93750	93757	50 %	25 %	0 %	25 %	409250967
2004	NT_187106	TCG	2	6	93782	93787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250967
2005	NT_187106	CCG	2	6	93812	93817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250967
2006	NT_187106	ATCAA	2	10	93827	93836	60 %	20 %	0 %	20 %	409250967
2007	NT_187106	CCA	2	6	93876	93881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250967
2008	NT_187106	GCG	2	6	93979	93984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250967
2009	NT_187106	TTC	2	6	93991	93996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250967
2010	NT_187106	TTC	2	6	94103	94108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250967
2011	NT_187106	GA	3	6	94116	94121	50 %	0 %	50 %	0 %	409250967
2012	NT_187106	TAA	2	6	94161	94166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250967
2013	NT_187106	CAC	2	6	94213	94218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250967
2014	NT_187106	CGC	2	6	94239	94244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250967
2015	NT_187106	AAG	2	6	94358	94363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250967
2016	NT_187106	CTG	2	6	94393	94398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250967
2017	NT_187106	AAT	2	6	94417	94422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250967
2018	NT_187106	GC	3	6	94462	94467	0 %	0 %	50 %	50 %	409250967
2019	NT_187106	AGTC	2	8	94578	94585	25 %	25 %	25 %	25 %	409250967
2020	NT_187106	T	6	6	94660	94665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2021	NT_187106	AAT	2	6	94671	94676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2022	NT_187106	TCA	2	6	94729	94734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2023	NT_187106	ACG	2	6	94737	94742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2024	NT_187106	ACA	2	6	94765	94770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2025	NT_187106	AT	3	6	94794	94799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2026	NT_187106	CCA	2	6	94805	94810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250968
2027	NT_187106	TCA	2	6	94863	94868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250968
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2029	NT_187106	TAC	2	6	94906	94911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250968
2030	NT_187106	A	7	7	95025	95031	100 %	0 %	0 %	0 %	409250968
2031	NT_187106	TTA	2	6	95061	95066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250968
2032	NT_187106	AGGCC	2	10	95076	95085	20 %	0 %	40 %	40 %	409250968
2033	NT_187106	CAC	2	6	95100	95105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250968
2034	NT_187106	CGC	2	6	95108	95113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250968
2035	NT_187106	GGC	2	6	95128	95133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250968
2036	NT_187106	GGC	2	6	95177	95182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250968
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2039	NT_187106	ATT	2	6	95248	95253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250968
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2041	NT_187106	GCC	2	6	95302	95307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250968
2042	NT_187106	GCA	2	6	95381	95386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250968
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2044	NT_187106	GCG	2	6	95471	95476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250968
2045	NT_187106	TGA	2	6	95541	95546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250968
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2051	NT_187106	T	6	6	95717	95722	0 %	100 %	0 %	0 %	409250968
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2053	NT_187106	GC	3	6	95760	95765	0 %	0 %	50 %	50 %	409250968
2054	NT_187106	ATT	2	6	95795	95800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250968
2055	NT_187106	GCA	2	6	95924	95929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250968
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2057	NT_187106	CAT	2	6	95964	95969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250968
2058	NT_187106	GCC	2	6	96133	96138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250968
2059	NT_187106	CAC	2	6	96165	96170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250968
2060	NT_187106	GTG	2	6	96211	96216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250968
2061	NT_187106	CGC	2	6	96244	96249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2062	NT_187106	CGT	2	6	96320	96325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250969
2063	NT_187106	CTG	2	6	96411	96416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250969
2064	NT_187106	CG	3	6	96432	96437	0 %	0 %	50 %	50 %	409250969
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2068	NT_187106	GAT	2	6	96639	96644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250969
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2072	NT_187106	CG	3	6	96711	96716	0 %	0 %	50 %	50 %	409250969
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2093	NT_187106	CGA	2	6	98076	98081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250970
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2095	NT_187106	GTA	2	6	98170	98175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250970
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2097	NT_187106	AATC	2	8	98289	98296	50 %	25 %	0 %	25 %	409250970
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2099	NT_187106	AGAAAA	2	12	98356	98367	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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2101	NT_187106	TAAA	2	8	98397	98404	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2102	NT_187106	A	6	6	98415	98420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2103	NT_187106	AGA	2	6	98462	98467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2104	NT_187106	GGC	2	6	98521	98526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2105	NT_187106	GC	3	6	98593	98598	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2106	NT_187106	CAC	2	6	98636	98641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250971
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2108	NT_187106	CGA	2	6	98713	98718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250971
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2110	NT_187106	GC	3	6	98827	98832	0 %	0 %	50 %	50 %	409250971
2111	NT_187106	TCG	2	6	98874	98879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250971
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2113	NT_187106	GCG	2	6	98913	98918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250971
2114	NT_187106	CGGCTT	2	12	98945	98956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250971
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2122	NT_187106	TCT	2	6	99361	99366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250972
2123	NT_187106	GTT	2	6	99446	99451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250972
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2125	NT_187106	CGCGC	2	10	99459	99468	0 %	0 %	40 %	60 %	409250972
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2127	NT_187106	GCA	2	6	99548	99553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250972
2128	NT_187106	GAC	2	6	99599	99604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250972
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2245	NT_187106	CAG	2	6	105255	105260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250977
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.