MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 2304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NT_187106	CAG	2	6	47110	47115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250922
1002	NT_187106	GCA	2	6	47127	47132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250922
1003	NT_187106	CAG	2	6	47209	47214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250922
1004	NT_187106	GGC	3	9	47224	47232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250922
1005	NT_187106	AGCG	2	8	47264	47271	25 %	0 %	50 %	25 %	409250922
1006	NT_187106	GCC	2	6	47342	47347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250922
1007	NT_187106	CAG	2	6	47365	47370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250922
1008	NT_187106	CAG	2	6	47398	47403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250922
1009	NT_187106	CAG	2	6	47476	47481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250922
1010	NT_187106	GCG	2	6	47526	47531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250922
1011	NT_187106	AGC	2	6	47578	47583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250922
1012	NT_187106	ACC	3	9	47654	47662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250922
1013	NT_187106	CGA	2	6	47670	47675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250922
1014	NT_187106	CAG	2	6	47677	47682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250922
1015	NT_187106	AGC	2	6	47687	47692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250922
1016	NT_187106	GTA	3	9	47738	47746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250923
1017	NT_187106	CTG	2	6	47764	47769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250923
1018	NT_187106	CAC	2	6	47839	47844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250923
1019	NT_187106	CTGG	2	8	47893	47900	0 %	25 %	50 %	25 %	409250923
1020	NT_187106	GCA	2	6	47937	47942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250923
1021	NT_187106	ATC	2	6	47996	48001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250923
1022	NT_187106	CAC	2	6	48004	48009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250923
1023	NT_187106	CAT	2	6	48136	48141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250923
1024	NT_187106	CA	3	6	48180	48185	50 %	0 %	0 %	50 %	409250923
1025	NT_187106	GA	3	6	48206	48211	50 %	0 %	50 %	0 %	409250923
1026	NT_187106	ATC	2	6	48221	48226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250923
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1030	NT_187106	CGG	2	6	48495	48500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250923
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1041	NT_187106	TCAGGT	2	12	48897	48908	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	409250923
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1054	NT_187106	CAA	2	6	49600	49605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250924
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1056	NT_187106	CAG	2	6	49733	49738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250924
1057	NT_187106	AAT	2	6	49767	49772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250924
1058	NT_187106	ACC	2	6	49807	49812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250924
1059	NT_187106	CAG	2	6	49820	49825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250924
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1076	NT_187106	TGTTC	2	10	50329	50338	0 %	60 %	20 %	20 %	409250924
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1083	NT_187106	TCA	2	6	50587	50592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250924
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1093	NT_187106	CAG	2	6	51002	51007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250924
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1095	NT_187106	GAA	2	6	51062	51067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250924
1096	NT_187106	AG	3	6	51143	51148	50 %	0 %	50 %	0 %	409250924
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1098	NT_187106	GGCT	2	8	51225	51232	0 %	25 %	50 %	25 %	409250924
1099	NT_187106	GAA	2	6	51254	51259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250924
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1101	NT_187106	CGC	2	6	51287	51292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250924
1102	NT_187106	GA	3	6	51324	51329	50 %	0 %	50 %	0 %	409250924
1103	NT_187106	GA	3	6	51349	51354	50 %	0 %	50 %	0 %	409250924
1104	NT_187106	CAG	2	6	51359	51364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250924
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1106	NT_187106	AAT	2	6	51386	51391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250924
1107	NT_187106	GCA	2	6	51468	51473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250925
1108	NT_187106	CAG	2	6	51625	51630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250925
1109	NT_187106	GCG	2	6	51634	51639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250925
1110	NT_187106	GT	3	6	51694	51699	0 %	50 %	50 %	0 %	409250925
1111	NT_187106	GC	3	6	51712	51717	0 %	0 %	50 %	50 %	409250925
1112	NT_187106	TCC	2	6	51718	51723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409250926
1113	NT_187106	CG	3	6	51735	51740	0 %	0 %	50 %	50 %	409250926
1114	NT_187106	CGAC	2	8	51784	51791	25 %	0 %	25 %	50 %	409250926
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1119	NT_187106	CAT	2	6	52044	52049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250926
1120	NT_187106	CAC	2	6	52050	52055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250926
1121	NT_187106	ATG	2	6	52072	52077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250926
1122	NT_187106	ACA	2	6	52172	52177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250926
1123	NT_187106	GGCTT	2	10	52301	52310	0 %	40 %	40 %	20 %	409250927
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1125	NT_187106	CTT	2	6	52494	52499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250927
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1251	NT_187106	GTC	2	6	58034	58039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250931
1252	NT_187106	T	7	7	58061	58067	0 %	100 %	0 %	0 %	409250931
1253	NT_187106	CAC	2	6	58108	58113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250931
1254	NT_187106	CGAC	2	8	58139	58146	25 %	0 %	25 %	50 %	409250931
1255	NT_187106	TCGC	2	8	58193	58200	0 %	25 %	25 %	50 %	409250931
1256	NT_187106	GCT	2	6	58257	58262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250931
1257	NT_187106	CGC	2	6	58291	58296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250931
1258	NT_187106	GTG	2	6	58312	58317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250931
1259	NT_187106	GTT	2	6	58377	58382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250931
1260	NT_187106	TAC	2	6	58430	58435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250932
1261	NT_187106	CTG	2	6	58488	58493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250932
1262	NT_187106	TGC	2	6	58541	58546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250932
1263	NT_187106	GTA	2	6	58560	58565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250932
1264	NT_187106	TCG	2	6	58580	58585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250932
1265	NT_187106	CCA	2	6	58589	58594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250932
1266	NT_187106	CGG	3	9	58689	58697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250932
1267	NT_187106	CTG	2	6	58752	58757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250932
1268	NT_187106	CGC	3	9	58823	58831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250932
1269	NT_187106	TCAAAG	2	12	58843	58854	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	409250932
1270	NT_187106	TACG	2	8	58883	58890	25 %	25 %	25 %	25 %	409250932
1271	NT_187106	CG	3	6	58908	58913	0 %	0 %	50 %	50 %	409250932
1272	NT_187106	GGT	2	6	58926	58931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250932
1273	NT_187106	GCA	2	6	59060	59065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250932
1274	NT_187106	CG	3	6	59078	59083	0 %	0 %	50 %	50 %	409250932
1275	NT_187106	CGC	2	6	59099	59104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250932
1276	NT_187106	CCA	2	6	59150	59155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250932
1277	NT_187106	CGGT	2	8	59173	59180	0 %	25 %	50 %	25 %	409250932
1278	NT_187106	AGA	2	6	59189	59194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250932
1279	NT_187106	CAG	2	6	59238	59243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250932
1280	NT_187106	ACC	2	6	59361	59366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250932
1281	NT_187106	CGGT	2	8	59380	59387	0 %	25 %	50 %	25 %	409250932
1282	NT_187106	T	6	6	59426	59431	0 %	100 %	0 %	0 %	409250932
1283	NT_187106	GGT	2	6	59441	59446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250932
1284	NT_187106	CGA	2	6	59471	59476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250932
1285	NT_187106	TTC	2	6	59478	59483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250932
1286	NT_187106	ATA	2	6	59500	59505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250932
1287	NT_187106	GGT	2	6	59528	59533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250932
1288	NT_187106	CG	4	8	59670	59677	0 %	0 %	50 %	50 %	409250932
1289	NT_187106	CAT	2	6	59721	59726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250932
1290	NT_187106	GGT	2	6	59897	59902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250932
1291	NT_187106	CGG	2	6	59921	59926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250932
1292	NT_187106	AGT	2	6	60028	60033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250932
1293	NT_187106	AAC	2	6	60051	60056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250932
1294	NT_187106	ATC	2	6	60132	60137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250932
1295	NT_187106	GAT	2	6	60140	60145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250932
1296	NT_187106	GTG	2	6	60213	60218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1297	NT_187106	GAAGT	2	10	60256	60265	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1298	NT_187106	GCT	2	6	60266	60271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1299	NT_187106	CGC	2	6	60331	60336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250933
1300	NT_187106	CAC	2	6	60389	60394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250933
1301	NT_187106	GCA	3	9	60433	60441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250933
1302	NT_187106	CGG	2	6	60470	60475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250933
1303	NT_187106	AATA	2	8	60532	60539	75 %	25 %	0 %	0 %	409250933
1304	NT_187106	GCC	2	6	60548	60553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250933
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1306	NT_187106	ACGC	2	8	60685	60692	25 %	0 %	25 %	50 %	409250933
1307	NT_187106	AGC	2	6	60757	60762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250933
1308	NT_187106	CG	3	6	61023	61028	0 %	0 %	50 %	50 %	409250934
1309	NT_187106	GTCCA	2	10	61032	61041	20 %	20 %	20 %	40 %	409250934
1310	NT_187106	ACCAG	2	10	61065	61074	40 %	0 %	20 %	40 %	409250934
1311	NT_187106	AAAAAT	2	12	61085	61096	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	409250934
1312	NT_187106	GAA	2	6	61184	61189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250934
1313	NT_187106	GCGG	2	8	61226	61233	0 %	0 %	75 %	25 %	409250934
1314	NT_187106	CCGA	2	8	61236	61243	25 %	0 %	25 %	50 %	409250934
1315	NT_187106	CG	3	6	61280	61285	0 %	0 %	50 %	50 %	409250934
1316	NT_187106	AACC	2	8	61302	61309	50 %	0 %	0 %	50 %	409250934
1317	NT_187106	GCA	2	6	61325	61330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250934
1318	NT_187106	AAGA	2	8	61349	61356	75 %	0 %	25 %	0 %	409250934
1319	NT_187106	TGA	2	6	61371	61376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250934
1320	NT_187106	TCA	2	6	61416	61421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1321	NT_187106	A	8	8	61487	61494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1322	NT_187106	T	6	6	61541	61546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1323	NT_187106	TCA	2	6	61609	61614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1324	NT_187106	CATTAA	2	12	61616	61627	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1325	NT_187106	G	7	7	61660	61666	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1326	NT_187106	TGT	2	6	61672	61677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1327	NT_187106	AC	4	8	61710	61717	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1328	NT_187106	CAA	2	6	61812	61817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250935
1329	NT_187106	T	6	6	61827	61832	0 %	100 %	0 %	0 %	409250935
1330	NT_187106	T	6	6	61867	61872	0 %	100 %	0 %	0 %	409250935
1331	NT_187106	A	8	8	61956	61963	100 %	0 %	0 %	0 %	409250935
1332	NT_187106	T	6	6	61977	61982	0 %	100 %	0 %	0 %	409250935
1333	NT_187106	T	6	6	61998	62003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1334	NT_187106	CCA	2	6	62053	62058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250936
1335	NT_187106	ATC	2	6	62066	62071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250936
1336	NT_187106	GCG	2	6	62217	62222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250936
1337	NT_187106	TCA	2	6	62245	62250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250936
1338	NT_187106	CG	3	6	62294	62299	0 %	0 %	50 %	50 %	409250936
1339	NT_187106	CCG	2	6	62302	62307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250936
1340	NT_187106	GCC	2	6	62332	62337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250936
1341	NT_187106	CAG	2	6	62399	62404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250936
1342	NT_187106	TGGG	2	8	62460	62467	0 %	25 %	75 %	0 %	409250936
1343	NT_187106	GGTT	2	8	62502	62509	0 %	50 %	50 %	0 %	409250936
1344	NT_187106	GTC	2	6	62511	62516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250936
1345	NT_187106	ACC	2	6	62517	62522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250936
1346	NT_187106	CCA	2	6	62551	62556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250936
1347	NT_187106	GCGTT	2	10	62562	62571	0 %	40 %	40 %	20 %	409250936
1348	NT_187106	A	6	6	62625	62630	100 %	0 %	0 %	0 %	409250936
1349	NT_187106	TCA	2	6	62652	62657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250936
1350	NT_187106	ATG	2	6	62701	62706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250936
1351	NT_187106	TCA	2	6	62715	62720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250936
1352	NT_187106	GGCG	2	8	62794	62801	0 %	0 %	75 %	25 %	409250936
1353	NT_187106	CTGA	2	8	62843	62850	25 %	25 %	25 %	25 %	409250936
1354	NT_187106	CCG	5	15	62872	62886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250936
1355	NT_187106	CAG	2	6	62927	62932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250936
1356	NT_187106	ATCGAG	2	12	62933	62944	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	409250936
1357	NT_187106	CTTA	2	8	63132	63139	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1358	NT_187106	ATA	2	6	63145	63150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1359	NT_187106	AT	3	6	63170	63175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1360	NT_187106	ATG	2	6	63221	63226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1361	NT_187106	AT	3	6	63286	63291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1362	NT_187106	TAT	2	6	63399	63404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1363	NT_187106	AAT	2	6	63409	63414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1364	NT_187106	ATT	2	6	63455	63460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1365	NT_187106	ATA	2	6	63492	63497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1366	NT_187106	ATTA	2	8	63498	63505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1367	NT_187106	CATT	2	8	63516	63523	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1368	NT_187106	C	6	6	63549	63554	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1369	NT_187106	GCC	2	6	63555	63560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1370	NT_187106	ATG	2	6	63628	63633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1371	NT_187106	TC	3	6	63642	63647	0 %	50 %	0 %	50 %	409250937
1372	NT_187106	ACA	2	6	63667	63672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250937
1373	NT_187106	A	6	6	63674	63679	100 %	0 %	0 %	0 %	409250937
1374	NT_187106	TACA	2	8	63715	63722	50 %	25 %	0 %	25 %	409250937
1375	NT_187106	TCT	3	9	63803	63811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250937
1376	NT_187106	CGT	2	6	63832	63837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1377	NT_187106	AAG	2	6	63973	63978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250938
1378	NT_187106	GAA	2	6	63993	63998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250938
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1494	NT_187106	A	6	6	69554	69559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1498	NT_187106	A	7	7	69756	69762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1499	NT_187106	ATG	2	6	69772	69777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1500	NT_187106	T	7	7	69830	69836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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