MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 2304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NT_187106	CTT	2	6	23681	23686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250898
502	NT_187106	AAT	3	9	23723	23731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250898
503	NT_187106	CCG	2	6	23779	23784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250898
504	NT_187106	GCC	2	6	23788	23793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250898
505	NT_187106	CCG	2	6	23839	23844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250898
506	NT_187106	CAG	2	6	23853	23858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250898
507	NT_187106	CAT	3	9	23906	23914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250898
508	NT_187106	CGCC	2	8	23993	24000	0 %	0 %	25 %	75 %	409250898
509	NT_187106	TAA	2	6	24060	24065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250898
510	NT_187106	T	7	7	24071	24077	0 %	100 %	0 %	0 %	409250898
511	NT_187106	AGCA	2	8	24094	24101	50 %	0 %	25 %	25 %	409250898
512	NT_187106	A	6	6	24165	24170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NT_187106	TAC	2	6	24198	24203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NT_187106	CAT	2	6	24217	24222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NT_187106	A	6	6	24263	24268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NT_187106	TGG	2	6	24337	24342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
517	NT_187106	ATG	2	6	24396	24401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250899
518	NT_187106	CTG	2	6	24410	24415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250899
519	NT_187106	GCG	2	6	24468	24473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250899
520	NT_187106	GGA	2	6	24523	24528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409250899
521	NT_187106	AAC	2	6	24537	24542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250899
522	NT_187106	CGA	2	6	24577	24582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250899
523	NT_187106	AAG	2	6	24615	24620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250899
524	NT_187106	AT	3	6	24669	24674	50 %	50 %	0 %	0 %	409250899
525	NT_187106	ACG	2	6	24681	24686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250899
526	NT_187106	AGA	2	6	24715	24720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250899
527	NT_187106	CA	3	6	24755	24760	50 %	0 %	0 %	50 %	409250899
528	NT_187106	TTA	2	6	24776	24781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250899
529	NT_187106	GAC	2	6	24786	24791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250899
530	NT_187106	GCAT	2	8	24875	24882	25 %	25 %	25 %	25 %	409250900
531	NT_187106	CGC	2	6	24918	24923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250900
532	NT_187106	T	6	6	24929	24934	0 %	100 %	0 %	0 %	409250900
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535	NT_187106	T	7	7	25044	25050	0 %	100 %	0 %	0 %	409250900
536	NT_187106	CAGG	2	8	25213	25220	25 %	0 %	50 %	25 %	409250900
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539	NT_187106	GCC	2	6	25289	25294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250900
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541	NT_187106	ATA	2	6	25361	25366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250900
542	NT_187106	GTTT	2	8	25398	25405	0 %	75 %	25 %	0 %	409250900
543	NT_187106	TAA	2	6	25407	25412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250900
544	NT_187106	GCAT	2	8	25537	25544	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
545	NT_187106	AAAGC	2	10	25567	25576	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
546	NT_187106	TTAAT	2	10	25625	25634	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NT_187106	A	6	6	25666	25671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NT_187106	ATG	2	6	25730	25735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250901
549	NT_187106	AAC	2	6	25819	25824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250901
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551	NT_187106	CAAT	2	8	25873	25880	50 %	25 %	0 %	25 %	409250901
552	NT_187106	TGCCGT	2	12	25882	25893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250901
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558	NT_187106	GGA	2	6	26393	26398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409250901
559	NT_187106	CG	3	6	26399	26404	0 %	0 %	50 %	50 %	409250901
560	NT_187106	CGC	2	6	26458	26463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250901
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562	NT_187106	GCC	2	6	26513	26518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250901
563	NT_187106	CGCAG	2	10	26521	26530	20 %	0 %	40 %	40 %	409250901
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580	NT_187106	TCA	2	6	27158	27163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250902
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583	NT_187106	GACAG	2	10	27266	27275	40 %	0 %	40 %	20 %	409250902
584	NT_187106	CTG	2	6	27310	27315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250902
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588	NT_187106	TCG	2	6	27450	27455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250902
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590	NT_187106	ACG	3	9	27559	27567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250902
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592	NT_187106	CGG	2	6	27609	27614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250902
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594	NT_187106	GC	3	6	27719	27724	0 %	0 %	50 %	50 %	409250902
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598	NT_187106	T	6	6	27975	27980	0 %	100 %	0 %	0 %	409250903
599	NT_187106	GGC	2	6	27998	28003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250903
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602	NT_187106	GAA	2	6	28122	28127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250903
603	NT_187106	TGCC	2	8	28177	28184	0 %	25 %	25 %	50 %	409250903
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605	NT_187106	GA	3	6	28279	28284	50 %	0 %	50 %	0 %	409250903
606	NT_187106	CAT	2	6	28338	28343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250903
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609	NT_187106	GCG	2	6	28399	28404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250903
610	NT_187106	CGC	2	6	28452	28457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250903
611	NT_187106	GCGG	2	8	28517	28524	0 %	0 %	75 %	25 %	409250903
612	NT_187106	GCC	2	6	28527	28532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250903
613	NT_187106	GC	3	6	28612	28617	0 %	0 %	50 %	50 %	409250903
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615	NT_187106	GC	3	6	28669	28674	0 %	0 %	50 %	50 %	409250903
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623	NT_187106	A	6	6	28995	29000	100 %	0 %	0 %	0 %	409250903
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757	NT_187106	ACG	2	6	36005	36010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250911
758	NT_187106	GGC	2	6	36054	36059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250911
759	NT_187106	TCT	2	6	36084	36089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250911
760	NT_187106	AT	3	6	36107	36112	50 %	50 %	0 %	0 %	409250911
761	NT_187106	GCC	2	6	36124	36129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250911
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763	NT_187106	CAT	2	6	36199	36204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250911
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766	NT_187106	CCG	2	6	36332	36337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250911
767	NT_187106	CGC	2	6	36342	36347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250911
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769	NT_187106	AAT	2	6	36400	36405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250911
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839	NT_187106	ATT	2	6	39112	39117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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868	NT_187106	CTGG	2	8	40299	40306	0 %	25 %	50 %	25 %	409250914
869	NT_187106	CCAG	2	8	40307	40314	25 %	0 %	25 %	50 %	409250914
870	NT_187106	AGT	2	6	40422	40427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250914
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872	NT_187106	A	6	6	40487	40492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
873	NT_187106	AGGG	2	8	40507	40514	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
874	NT_187106	G	6	6	40532	40537	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
875	NT_187106	GCGCC	2	10	40543	40552	0 %	0 %	40 %	60 %	409250915
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880	NT_187106	CGG	2	6	40749	40754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250915
881	NT_187106	ATC	3	9	40807	40815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250915
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883	NT_187106	CGGTTT	2	12	40890	40901	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
884	NT_187106	TGA	2	6	40907	40912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250916
885	NT_187106	AAACC	2	10	40976	40985	60 %	0 %	0 %	40 %	409250916
886	NT_187106	TGCGCC	2	12	41006	41017	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	409250916
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998	NT_187106	GC	3	6	47019	47024	0 %	0 %	50 %	50 %	409250922
999	NT_187106	AG	4	8	47063	47070	50 %	0 %	50 %	0 %	409250922
1000	NT_187106	ATC	2	6	47090	47095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250922

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