MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 212

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187105	GCGAC	2	10	2093	2102	20 %	0 %	40 %	40 %	409250601
2	NT_187105	CGTCA	2	10	6505	6514	20 %	20 %	20 %	40 %	409250602
3	NT_187105	GGGAT	2	10	9082	9091	20 %	20 %	60 %	0 %	409250602
4	NT_187105	CTTTA	2	10	10553	10562	20 %	60 %	0 %	20 %	409250604
5	NT_187105	GCTGA	2	10	10931	10940	20 %	20 %	40 %	20 %	409250605
6	NT_187105	ACTGA	2	10	10969	10978	40 %	20 %	20 %	20 %	409250605
7	NT_187105	TTTTC	2	10	11078	11087	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NT_187105	ATAGA	2	10	12120	12129	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NT_187105	AATTG	2	10	14071	14080	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187105	AGCTA	2	10	15740	15749	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NT_187105	AAAAT	2	10	17323	17332	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187105	TCGCC	2	10	21947	21956	0 %	20 %	20 %	60 %	409250619
13	NT_187105	GCGCC	2	10	23975	23984	0 %	0 %	40 %	60 %	409250621
14	NT_187105	CGCCC	2	10	26227	26236	0 %	0 %	20 %	80 %	409250623
15	NT_187105	CGATT	2	10	27129	27138	20 %	40 %	20 %	20 %	409250624
16	NT_187105	TAAAC	2	10	28274	28283	60 %	20 %	0 %	20 %	409250625
17	NT_187105	TGCCC	2	10	29147	29156	0 %	20 %	20 %	60 %	409250626
18	NT_187105	AACGC	2	10	29697	29706	40 %	0 %	20 %	40 %	409250628
19	NT_187105	CGGCA	2	10	29788	29797	20 %	0 %	40 %	40 %	409250628
20	NT_187105	GGACA	2	10	30020	30029	40 %	0 %	40 %	20 %	409250628
21	NT_187105	GCATC	2	10	30678	30687	20 %	20 %	20 %	40 %	409250629
22	NT_187105	GATGC	2	10	32344	32353	20 %	20 %	40 %	20 %	409250631
23	NT_187105	GCCGG	2	10	33379	33388	0 %	0 %	60 %	40 %	409250633
24	NT_187105	CGGTA	2	10	34702	34711	20 %	20 %	40 %	20 %	409250634
25	NT_187105	GCCCG	2	10	35050	35059	0 %	0 %	40 %	60 %	409250634
26	NT_187105	TGGCG	2	10	36993	37002	0 %	20 %	60 %	20 %	409250637
27	NT_187105	AATCG	2	10	38109	38118	40 %	20 %	20 %	20 %	409250639
28	NT_187105	GCGCG	2	10	38680	38689	0 %	0 %	60 %	40 %	409250639
29	NT_187105	GGGTC	2	10	39936	39945	0 %	20 %	60 %	20 %	409250640
30	NT_187105	ACGCC	2	10	40194	40203	20 %	0 %	20 %	60 %	409250640
31	NT_187105	AAACA	2	10	41911	41920	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NT_187105	GTGAA	2	10	43621	43630	40 %	20 %	40 %	0 %	409250643
33	NT_187105	TGCCG	2	10	45449	45458	0 %	20 %	40 %	40 %	409250645
34	NT_187105	CGTGC	2	10	45468	45477	0 %	20 %	40 %	40 %	409250645
35	NT_187105	TTGGC	2	10	46415	46424	0 %	40 %	40 %	20 %	409250646
36	NT_187105	GTCAG	2	10	49232	49241	20 %	20 %	40 %	20 %	409250648
37	NT_187105	GTGAA	2	10	50013	50022	40 %	20 %	40 %	0 %	409250650
38	NT_187105	CCATC	2	10	50703	50712	20 %	20 %	0 %	60 %	409250652
39	NT_187105	GCCGC	2	10	50875	50884	0 %	0 %	40 %	60 %	409250652
40	NT_187105	GCACG	2	10	52673	52682	20 %	0 %	40 %	40 %	409250655
41	NT_187105	TGAGC	2	10	52781	52790	20 %	20 %	40 %	20 %	409250655
42	NT_187105	GGCGC	2	10	52806	52815	0 %	0 %	60 %	40 %	409250655
43	NT_187105	CCTGC	2	10	53791	53800	0 %	20 %	20 %	60 %	409250656
44	NT_187105	CGCCA	2	10	61618	61627	20 %	0 %	20 %	60 %	409250665
45	NT_187105	CACAC	2	10	61750	61759	40 %	0 %	0 %	60 %	409250665
46	NT_187105	TCTTT	2	10	63038	63047	0 %	80 %	0 %	20 %	409250667
47	NT_187105	TACCG	2	10	65476	65485	20 %	20 %	20 %	40 %	409250670
48	NT_187105	GAAGC	2	10	65917	65926	40 %	0 %	40 %	20 %	409250670
49	NT_187105	TTTTA	2	10	67833	67842	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NT_187105	ACCCG	2	10	68121	68130	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
51	NT_187105	AAACA	2	10	68568	68577	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NT_187105	TGCGC	2	10	71486	71495	0 %	20 %	40 %	40 %	409250672
53	NT_187105	CGGCC	2	10	76752	76761	0 %	0 %	40 %	60 %	409250677
54	NT_187105	CGCGC	2	10	76872	76881	0 %	0 %	40 %	60 %	409250677
55	NT_187105	GCGCT	2	10	77316	77325	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
56	NT_187105	GTCAG	2	10	78059	78068	20 %	20 %	40 %	20 %	409250678
57	NT_187105	CGCGG	2	10	78957	78966	0 %	0 %	60 %	40 %	409250679
58	NT_187105	CTGCG	2	10	79374	79383	0 %	20 %	40 %	40 %	409250679
59	NT_187105	GCGCG	2	10	82660	82669	0 %	0 %	60 %	40 %	409250683
60	NT_187105	ATATA	2	10	89073	89082	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NT_187105	CAAAT	2	10	90211	90220	60 %	20 %	0 %	20 %	409250690
62	NT_187105	AAAAT	2	10	90332	90341	80 %	20 %	0 %	0 %	409250690
63	NT_187105	AAAAT	2	10	90398	90407	80 %	20 %	0 %	0 %	409250690
64	NT_187105	TAAAG	2	10	94378	94387	60 %	20 %	20 %	0 %	409250693
65	NT_187105	AAATT	2	10	96127	96136	60 %	40 %	0 %	0 %	409250695
66	NT_187105	TTTTA	2	10	97690	97699	20 %	80 %	0 %	0 %	409250696
67	NT_187105	TTTTC	2	10	98153	98162	0 %	80 %	0 %	20 %	409250696
68	NT_187105	TTACT	2	10	98729	98738	20 %	60 %	0 %	20 %	409250698
69	NT_187105	ATCTT	2	10	98751	98760	20 %	60 %	0 %	20 %	409250698
70	NT_187105	GTTCT	2	10	101107	101116	0 %	60 %	20 %	20 %	409250701
71	NT_187105	TGCCT	2	10	101419	101428	0 %	40 %	20 %	40 %	409250701
72	NT_187105	CGGTT	2	10	102755	102764	0 %	40 %	40 %	20 %	409250702
73	NT_187105	TTTAA	2	10	104007	104016	40 %	60 %	0 %	0 %	409250703
74	NT_187105	CTTCA	2	10	105378	105387	20 %	40 %	0 %	40 %	409250704
75	NT_187105	ACGCC	2	10	105497	105506	20 %	0 %	20 %	60 %	409250704
76	NT_187105	TAAAA	2	10	107648	107657	80 %	20 %	0 %	0 %	409250706
77	NT_187105	ATCGC	2	10	108729	108738	20 %	20 %	20 %	40 %	409250706
78	NT_187105	CAAGC	2	10	114046	114055	40 %	0 %	20 %	40 %	409250710
79	NT_187105	CGTCA	2	10	114070	114079	20 %	20 %	20 %	40 %	409250710
80	NT_187105	ATCCG	2	10	114401	114410	20 %	20 %	20 %	40 %	409250710
81	NT_187105	TTTTC	2	10	116913	116922	0 %	80 %	0 %	20 %	409250713
82	NT_187105	CGGCG	2	10	117495	117504	0 %	0 %	60 %	40 %	409250714
83	NT_187105	TCGCC	2	10	118289	118298	0 %	20 %	20 %	60 %	409250715
84	NT_187105	ACGCG	2	10	119883	119892	20 %	0 %	40 %	40 %	409250716
85	NT_187105	CAGCC	2	10	120473	120482	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
86	NT_187105	GAAAC	2	10	120829	120838	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NT_187105	TGCCG	2	10	120856	120865	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
88	NT_187105	CGTGA	2	10	121131	121140	20 %	20 %	40 %	20 %	409250717
89	NT_187105	CCGCG	2	10	121223	121232	0 %	0 %	40 %	60 %	409250717
90	NT_187105	ATCGA	2	10	123689	123698	40 %	20 %	20 %	20 %	409250719
91	NT_187105	ACTCC	2	10	126692	126701	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
92	NT_187105	GCATT	2	10	126813	126822	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NT_187105	ATGGA	2	10	126889	126898	40 %	20 %	40 %	0 %	409250722
94	NT_187105	GGTTT	2	10	127499	127508	0 %	60 %	40 %	0 %	409250722
95	NT_187105	TTTCC	2	10	129060	129069	0 %	60 %	0 %	40 %	409250723
96	NT_187105	ACGCG	2	10	129431	129440	20 %	0 %	40 %	40 %	409250723
97	NT_187105	CTGGA	2	10	129546	129555	20 %	20 %	40 %	20 %	409250723
98	NT_187105	CAGCG	2	10	130248	130257	20 %	0 %	40 %	40 %	409250723
99	NT_187105	GCCGC	2	10	130524	130533	0 %	0 %	40 %	60 %	409250724
100	NT_187105	GTGCG	2	10	132770	132779	0 %	20 %	60 %	20 %	409250728
101	NT_187105	GGTTC	2	10	133735	133744	0 %	40 %	40 %	20 %	409250728
102	NT_187105	CAGCT	2	10	133786	133795	20 %	20 %	20 %	40 %	409250728
103	NT_187105	ATCGG	2	10	134156	134165	20 %	20 %	40 %	20 %	409250728
104	NT_187105	GCCGG	2	10	134950	134959	0 %	0 %	60 %	40 %	409250728
105	NT_187105	TACGG	2	10	136073	136082	20 %	20 %	40 %	20 %	409250730
106	NT_187105	TGCCG	2	10	137648	137657	0 %	20 %	40 %	40 %	409250731
107	NT_187105	TCCCT	2	10	137777	137786	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
108	NT_187105	ACGCT	2	10	138257	138266	20 %	20 %	20 %	40 %	409250732
109	NT_187105	GCGGA	2	10	140865	140874	20 %	0 %	60 %	20 %	409250733
110	NT_187105	CGCTC	2	10	141494	141503	0 %	20 %	20 %	60 %	409250733
111	NT_187105	AATGA	2	10	142443	142452	60 %	20 %	20 %	0 %	409250734
112	NT_187105	AATTT	2	10	142492	142501	40 %	60 %	0 %	0 %	409250734
113	NT_187105	CGGCG	2	10	142517	142526	0 %	0 %	60 %	40 %	409250734
114	NT_187105	AAACT	2	10	149447	149456	60 %	20 %	0 %	20 %	409250739
115	NT_187105	CGGCG	2	10	150587	150596	0 %	0 %	60 %	40 %	409250740
116	NT_187105	CAGAA	2	10	151979	151988	60 %	0 %	20 %	20 %	409250741
117	NT_187105	TGAAG	2	10	152820	152829	40 %	20 %	40 %	0 %	409250741
118	NT_187105	TTTCG	2	10	153061	153070	0 %	60 %	20 %	20 %	409250741
119	NT_187105	TCTTT	2	10	154022	154031	0 %	80 %	0 %	20 %	409250743
120	NT_187105	CATTA	2	10	154530	154539	40 %	40 %	0 %	20 %	409250743
121	NT_187105	TTTTA	2	10	155465	155474	20 %	80 %	0 %	0 %	409250744
122	NT_187105	TTATT	2	10	156451	156460	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NT_187105	ATCCC	2	10	158903	158912	20 %	20 %	0 %	60 %	409250746
124	NT_187105	GTCAG	2	10	164200	164209	20 %	20 %	40 %	20 %	409250752
125	NT_187105	CCGAA	2	10	164345	164354	40 %	0 %	20 %	40 %	409250752
126	NT_187105	TACCT	2	10	165087	165096	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NT_187105	GTTTA	2	10	172085	172094	20 %	60 %	20 %	0 %	409250760
128	NT_187105	TAATT	2	10	172340	172349	40 %	60 %	0 %	0 %	409250760
129	NT_187105	TATAA	2	10	172394	172403	60 %	40 %	0 %	0 %	409250760
130	NT_187105	ACTTT	2	10	172487	172496	20 %	60 %	0 %	20 %	409250761
131	NT_187105	CCAGC	2	10	174385	174394	20 %	0 %	20 %	60 %	409250761
132	NT_187105	GAATA	2	10	175158	175167	60 %	20 %	20 %	0 %	409250762
133	NT_187105	AACCG	2	10	176033	176042	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
134	NT_187105	TCCAT	2	10	176998	177007	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
135	NT_187105	GAACT	2	10	179864	179873	40 %	20 %	20 %	20 %	409250764
136	NT_187105	CGCGC	2	10	180247	180256	0 %	0 %	40 %	60 %	409250764
137	NT_187105	TCTTT	2	10	181131	181140	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NT_187105	GTAAT	2	10	183084	183093	40 %	40 %	20 %	0 %	409250769
139	NT_187105	AATAA	2	10	184265	184274	80 %	20 %	0 %	0 %	409250769
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150	NT_187105	TACTT	2	10	196155	196164	20 %	60 %	0 %	20 %	409250780
151	NT_187105	AGATT	2	10	199320	199329	40 %	40 %	20 %	0 %	409250785
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154	NT_187105	TAACG	2	10	203244	203253	40 %	20 %	20 %	20 %	409250789
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156	NT_187105	GAAAA	2	10	209525	209534	80 %	0 %	20 %	0 %	409250795
157	NT_187105	AAGCA	2	10	212513	212522	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
158	NT_187105	GTACC	2	10	215384	215393	20 %	20 %	20 %	40 %	409250802
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168	NT_187105	ATTTT	2	10	230076	230085	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NT_187105	ATCGC	2	10	234854	234863	20 %	20 %	20 %	40 %	409250819
170	NT_187105	TCTCC	2	10	235960	235969	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
171	NT_187105	GCCAG	2	10	237326	237335	20 %	0 %	40 %	40 %	409250821
172	NT_187105	TTATT	2	10	237954	237963	20 %	80 %	0 %	0 %	409250822
173	NT_187105	GGTCG	2	10	241719	241728	0 %	20 %	60 %	20 %	409250828
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175	NT_187105	CGCAG	2	10	246400	246409	20 %	0 %	40 %	40 %	409250831
176	NT_187105	TCCCC	2	10	248066	248075	0 %	20 %	0 %	80 %	409250833
177	NT_187105	CCGCG	2	10	248433	248442	0 %	0 %	40 %	60 %	409250833
178	NT_187105	ACCGC	2	10	250298	250307	20 %	0 %	20 %	60 %	409250834
179	NT_187105	ATAAA	2	10	250936	250945	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NT_187105	GCCCG	2	10	251419	251428	0 %	0 %	40 %	60 %	409250837
181	NT_187105	CCCCG	2	10	255341	255350	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
182	NT_187105	GCATC	2	10	256185	256194	20 %	20 %	20 %	40 %	409250843
183	NT_187105	ACAAT	2	10	256770	256779	60 %	20 %	0 %	20 %	409250843
184	NT_187105	GCATC	2	10	258067	258076	20 %	20 %	20 %	40 %	409250846
185	NT_187105	CATCA	2	10	259705	259714	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
186	NT_187105	GCGCC	2	10	259936	259945	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
187	NT_187105	CGCAC	2	10	260024	260033	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
188	NT_187105	CTGTG	2	10	262007	262016	0 %	40 %	40 %	20 %	409250848
189	NT_187105	GGTAA	2	10	265004	265013	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
190	NT_187105	ATTTA	2	10	266095	266104	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NT_187105	GCCAC	2	10	267195	267204	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
192	NT_187105	GCAGC	2	10	268099	268108	20 %	0 %	40 %	40 %	409250856
193	NT_187105	CCAGC	2	10	268196	268205	20 %	0 %	20 %	60 %	409250856
194	NT_187105	CCAGC	2	10	270009	270018	20 %	0 %	20 %	60 %	409250858
195	NT_187105	GCCGA	2	10	270034	270043	20 %	0 %	40 %	40 %	409250858
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206	NT_187105	ATGCC	2	10	284358	284367	20 %	20 %	20 %	40 %	409250875
207	NT_187105	TCCCG	2	10	286966	286975	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
208	NT_187105	CTACC	2	10	287564	287573	20 %	20 %	0 %	60 %	409250877
209	NT_187105	CTGGC	2	10	287701	287710	0 %	20 %	40 %	40 %	409250877
210	NT_187105	GCCGC	2	10	288470	288479	0 %	0 %	40 %	60 %	409250877
211	NT_187105	CGCTG	2	10	289587	289596	0 %	20 %	40 %	40 %	409250877
212	NT_187105	AACCA	2	10	292540	292549	60 %	0 %	0 %	40 %	409250879

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.