MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 8012

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NT_187102	T	6	6	193586	193591	0 %	100 %	0 %	0 %	409250262
4002	NT_187102	GTG	2	6	193597	193602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250262
4003	NT_187102	ACT	2	6	193624	193629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250262
4004	NT_187102	TCA	2	6	193687	193692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NT_187102	TTA	2	6	193697	193702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NT_187102	T	7	7	193804	193810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NT_187102	TGCC	2	8	193915	193922	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4008	NT_187102	TAC	2	6	193989	193994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250263
4009	NT_187102	CTG	2	6	194045	194050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250263
4010	NT_187102	AAAAG	2	10	194078	194087	80 %	0 %	20 %	0 %	409250263
4011	NT_187102	A	8	8	194116	194123	100 %	0 %	0 %	0 %	409250263
4012	NT_187102	A	8	8	194127	194134	100 %	0 %	0 %	0 %	409250263
4013	NT_187102	TTC	3	9	194151	194159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250263
4014	NT_187102	ACC	2	6	194179	194184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250263
4015	NT_187102	ACG	2	6	194206	194211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250263
4016	NT_187102	TCG	2	6	194214	194219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250263
4017	NT_187102	CGC	2	6	194244	194249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250263
4018	NT_187102	ACG	2	6	194272	194277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250263
4019	NT_187102	CGA	2	6	194366	194371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250263
4020	NT_187102	CGC	2	6	194432	194437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250263
4021	NT_187102	TAT	2	6	194467	194472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250263
4022	NT_187102	TTC	2	6	194584	194589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250263
4023	NT_187102	CCG	2	6	194609	194614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250263
4024	NT_187102	GAA	2	6	194698	194703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250263
4025	NT_187102	TCG	2	6	194730	194735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250263
4026	NT_187102	TGA	2	6	194738	194743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250263
4027	NT_187102	CTT	3	9	194795	194803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NT_187102	TGCG	2	8	194856	194863	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4029	NT_187102	TAA	3	9	194870	194878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NT_187102	GA	3	6	194880	194885	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4031	NT_187102	CTG	2	6	194948	194953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250264
4032	NT_187102	CAT	2	6	194980	194985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250264
4033	NT_187102	GC	3	6	195060	195065	0 %	0 %	50 %	50 %	409250264
4034	NT_187102	TAA	2	6	195084	195089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250264
4035	NT_187102	CGC	2	6	195090	195095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250264
4036	NT_187102	GGC	2	6	195145	195150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250264
4037	NT_187102	ACCG	2	8	195153	195160	25 %	0 %	25 %	50 %	409250264
4038	NT_187102	CGC	2	6	195320	195325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250264
4039	NT_187102	TG	3	6	195360	195365	0 %	50 %	50 %	0 %	409250264
4040	NT_187102	TTG	2	6	195446	195451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250264
4041	NT_187102	CGC	2	6	195462	195467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250264
4042	NT_187102	AG	3	6	195507	195512	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4043	NT_187102	ATAGA	2	10	195515	195524	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4044	NT_187102	C	7	7	195532	195538	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4045	NT_187102	AGA	2	6	195541	195546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4046	NT_187102	GTA	2	6	195609	195614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250265
4047	NT_187102	TCA	2	6	195640	195645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250265
4048	NT_187102	CA	3	6	195666	195671	50 %	0 %	0 %	50 %	409250265
4049	NT_187102	TC	3	6	195713	195718	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4050	NT_187102	GT	4	8	195873	195880	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4051	NT_187102	CAA	2	6	195943	195948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NT_187102	CAA	2	6	196004	196009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250266
4053	NT_187102	GAA	2	6	196026	196031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250266
4054	NT_187102	GGC	2	6	196049	196054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250266
4055	NT_187102	ACT	2	6	196069	196074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250266
4056	NT_187102	CG	3	6	196088	196093	0 %	0 %	50 %	50 %	409250266
4057	NT_187102	CAG	2	6	196139	196144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250266
4058	NT_187102	A	7	7	196183	196189	100 %	0 %	0 %	0 %	409250266
4059	NT_187102	GC	3	6	196250	196255	0 %	0 %	50 %	50 %	409250266
4060	NT_187102	ATG	2	6	196266	196271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250266
4061	NT_187102	CTG	2	6	196293	196298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250266
4062	NT_187102	TGG	2	6	196363	196368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250266
4063	NT_187102	TGAT	2	8	196411	196418	25 %	50 %	25 %	0 %	409250266
4064	NT_187102	GGC	2	6	196431	196436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250266
4065	NT_187102	GGA	2	6	196550	196555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409250266
4066	NT_187102	GCA	2	6	196628	196633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250266
4067	NT_187102	CCG	2	6	196660	196665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250266
4068	NT_187102	GCG	3	9	196672	196680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250266
4069	NT_187102	GC	3	6	196696	196701	0 %	0 %	50 %	50 %	409250266
4070	NT_187102	GAC	2	6	196799	196804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250266
4071	NT_187102	CAG	2	6	197039	197044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250267
4072	NT_187102	TGC	2	6	197073	197078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250267
4073	NT_187102	CAGG	2	8	197201	197208	25 %	0 %	50 %	25 %	409250267
4074	NT_187102	ACG	2	6	197232	197237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250267
4075	NT_187102	T	6	6	197242	197247	0 %	100 %	0 %	0 %	409250267
4076	NT_187102	CAG	2	6	197255	197260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250267
4077	NT_187102	ATC	2	6	197330	197335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250267
4078	NT_187102	CAGCTC	2	12	197385	197396	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	409250267
4079	NT_187102	C	6	6	197426	197431	0 %	0 %	0 %	100 %	409250267
4080	NT_187102	CCT	2	6	197509	197514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409250267
4081	NT_187102	CAG	2	6	197522	197527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250267
4082	NT_187102	CGA	2	6	197557	197562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250267
4083	NT_187102	GCCA	2	8	197623	197630	25 %	0 %	25 %	50 %	409250267
4084	NT_187102	CTG	2	6	197648	197653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250267
4085	NT_187102	T	7	7	197668	197674	0 %	100 %	0 %	0 %	409250267
4086	NT_187102	CTT	2	6	197689	197694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250267
4087	NT_187102	CAG	2	6	197710	197715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250267
4088	NT_187102	CGT	2	6	197739	197744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250267
4089	NT_187102	GCCA	2	8	197760	197767	25 %	0 %	25 %	50 %	409250267
4090	NT_187102	CTC	2	6	197768	197773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409250267
4091	NT_187102	ACTG	2	8	197792	197799	25 %	25 %	25 %	25 %	409250267
4092	NT_187102	GCC	2	6	197826	197831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250267
4093	NT_187102	GC	3	6	197849	197854	0 %	0 %	50 %	50 %	409250267
4094	NT_187102	TGTC	2	8	197977	197984	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4095	NT_187102	AAGA	2	8	197989	197996	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4096	NT_187102	T	6	6	198023	198028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NT_187102	GCC	2	6	198093	198098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250268
4098	NT_187102	CGCC	2	8	198118	198125	0 %	0 %	25 %	75 %	409250268
4099	NT_187102	CAGCCT	2	12	198140	198151	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	409250268
4100	NT_187102	CTC	2	6	198180	198185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409250268
4101	NT_187102	CTG	2	6	198228	198233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250268
4102	NT_187102	TATC	2	8	198238	198245	25 %	50 %	0 %	25 %	409250268
4103	NT_187102	GCA	2	6	198288	198293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250268
4104	NT_187102	CTG	2	6	198294	198299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250268
4105	NT_187102	ATT	2	6	198367	198372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250268
4106	NT_187102	A	6	6	198382	198387	100 %	0 %	0 %	0 %	409250268
4107	NT_187102	TGG	2	6	198418	198423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250268
4108	NT_187102	GTT	2	6	198515	198520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250268
4109	NT_187102	GCGCT	2	10	198534	198543	0 %	20 %	40 %	40 %	409250268
4110	NT_187102	GCC	2	6	198642	198647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250268
4111	NT_187102	T	6	6	198660	198665	0 %	100 %	0 %	0 %	409250268
4112	NT_187102	CG	3	6	198780	198785	0 %	0 %	50 %	50 %	409250268
4113	NT_187102	AAT	2	6	198879	198884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250268
4114	NT_187102	TGG	2	6	198892	198897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250268
4115	NT_187102	TCG	3	9	198952	198960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250268
4116	NT_187102	GCG	2	6	199002	199007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250268
4117	NT_187102	TGG	2	6	199051	199056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250268
4118	NT_187102	TCA	2	6	199066	199071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250268
4119	NT_187102	CGC	2	6	199075	199080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250268
4120	NT_187102	ACC	3	9	199086	199094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250268
4121	NT_187102	GTT	2	6	199113	199118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250268
4122	NT_187102	GGC	2	6	199121	199126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250268
4123	NT_187102	ATC	2	6	199259	199264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NT_187102	GTT	2	6	199292	199297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4125	NT_187102	ATT	2	6	199310	199315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NT_187102	ATGG	2	8	199352	199359	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4127	NT_187102	TCC	2	6	199376	199381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4128	NT_187102	A	6	6	199445	199450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NT_187102	AGA	2	6	199518	199523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4130	NT_187102	GAT	2	6	199537	199542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250269
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4132	NT_187102	T	7	7	199635	199641	0 %	100 %	0 %	0 %	409250269
4133	NT_187102	AGGA	2	8	199655	199662	50 %	0 %	50 %	0 %	409250269
4134	NT_187102	ATGG	2	8	199687	199694	25 %	25 %	50 %	0 %	409250269
4135	NT_187102	TGG	2	6	199696	199701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250269
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4139	NT_187102	A	6	6	199825	199830	100 %	0 %	0 %	0 %	409250269
4140	NT_187102	T	6	6	199877	199882	0 %	100 %	0 %	0 %	409250269
4141	NT_187102	CAAGC	2	10	199957	199966	40 %	0 %	20 %	40 %	409250269
4142	NT_187102	AATT	2	8	199970	199977	50 %	50 %	0 %	0 %	409250269
4143	NT_187102	AGCTAC	2	12	199985	199996	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	409250269
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4146	NT_187102	GTG	2	6	200077	200082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250269
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4149	NT_187102	A	6	6	200229	200234	100 %	0 %	0 %	0 %	409250269
4150	NT_187102	ACA	2	6	200237	200242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250269
4151	NT_187102	A	7	7	200311	200317	100 %	0 %	0 %	0 %	409250269
4152	NT_187102	GTT	2	6	200366	200371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250269
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4155	NT_187102	GGT	2	6	200601	200606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250269
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4157	NT_187102	ATC	2	6	200649	200654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250269
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4159	NT_187102	T	7	7	200808	200814	0 %	100 %	0 %	0 %	409250270
4160	NT_187102	GTA	2	6	200824	200829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250270
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4171	NT_187102	AAC	2	6	201416	201421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4172	NT_187102	T	6	6	201424	201429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4173	NT_187102	CGG	2	6	201501	201506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4174	NT_187102	AAC	2	6	201525	201530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4175	NT_187102	TTA	2	6	201579	201584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250271
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4182	NT_187102	TGA	2	6	201853	201858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250271
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4186	NT_187102	AAACC	2	10	202015	202024	60 %	0 %	0 %	40 %	409250271
4187	NT_187102	CTG	2	6	202050	202055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250271
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4199	NT_187102	CGG	2	6	202426	202431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250271
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4219	NT_187102	ATT	2	6	203298	203303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4223	NT_187102	ATCT	2	8	203423	203430	25 %	50 %	0 %	25 %	409250272
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4236	NT_187102	TTTA	2	8	204260	204267	25 %	75 %	0 %	0 %	409250272
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4240	NT_187102	TTTCT	2	10	204419	204428	0 %	80 %	0 %	20 %	409250272
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4246	NT_187102	CATA	2	8	204646	204653	50 %	25 %	0 %	25 %	409250273
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4248	NT_187102	AT	3	6	204713	204718	50 %	50 %	0 %	0 %	409250273
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4375	NT_187102	AAC	2	6	210591	210596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250278
4376	NT_187102	AAT	2	6	210597	210602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250278
4377	NT_187102	CTG	2	6	210669	210674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250278
4378	NT_187102	TTTG	2	8	210746	210753	0 %	75 %	25 %	0 %	409250278
4379	NT_187102	ATG	2	6	210841	210846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250278
4380	NT_187102	CCAAC	2	10	210857	210866	40 %	0 %	0 %	60 %	409250278
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4383	NT_187102	GTA	2	6	210979	210984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250278
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4387	NT_187102	GAT	2	6	211255	211260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250278
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4439	NT_187102	CAG	2	6	214047	214052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250283
4440	NT_187102	TCA	2	6	214202	214207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250283
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4442	NT_187102	TCT	2	6	214299	214304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250283
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4449	NT_187102	AAGA	2	8	214561	214568	75 %	0 %	25 %	0 %	409250283
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4453	NT_187102	TGG	2	6	214745	214750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250284
4454	NT_187102	A	7	7	214776	214782	100 %	0 %	0 %	0 %	409250284
4455	NT_187102	CAA	2	6	214979	214984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250285
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4457	NT_187102	CAG	2	6	215099	215104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250285
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4460	NT_187102	TAAT	2	8	215194	215201	50 %	50 %	0 %	0 %	409250286
4461	NT_187102	CTG	2	6	215214	215219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250286
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4463	NT_187102	CATT	2	8	215270	215277	25 %	50 %	0 %	25 %	409250286
4464	NT_187102	TGGCC	2	10	215288	215297	0 %	20 %	40 %	40 %	409250286
4465	NT_187102	TAAAA	2	10	215361	215370	80 %	20 %	0 %	0 %	409250286
4466	NT_187102	TA	3	6	215425	215430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4467	NT_187102	GTT	2	6	215456	215461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4468	NT_187102	GCT	2	6	215496	215501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250287
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4471	NT_187102	A	6	6	215729	215734	100 %	0 %	0 %	0 %	409250287
4472	NT_187102	ATG	2	6	215769	215774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250287
4473	NT_187102	ATG	2	6	215778	215783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250287
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4475	NT_187102	TTG	2	6	216000	216005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250287
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4477	NT_187102	TCA	2	6	216243	216248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250288
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4484	NT_187102	AGCA	2	8	216586	216593	50 %	0 %	25 %	25 %	409250288
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4488	NT_187102	AGC	2	6	216774	216779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250288
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4490	NT_187102	CCT	2	6	216832	216837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409250288
4491	NT_187102	AGG	2	6	216854	216859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409250288
4492	NT_187102	ATT	2	6	216948	216953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4493	NT_187102	CT	3	6	217022	217027	0 %	50 %	0 %	50 %	409250289
4494	NT_187102	CAT	2	6	217046	217051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250289
4495	NT_187102	TGGC	2	8	217089	217096	0 %	25 %	50 %	25 %	409250289
4496	NT_187102	CGT	2	6	217133	217138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250289
4497	NT_187102	CAT	2	6	217151	217156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250289
4498	NT_187102	GC	3	6	217233	217238	0 %	0 %	50 %	50 %	409250289
4499	NT_187102	AAT	2	6	217240	217245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250289
4500	NT_187102	CCT	2	6	217249	217254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409250289

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