MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 8012

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NT_187102	CCGC	2	8	50169	50176	0 %	0 %	25 %	75 %	409250111
1002	NT_187102	ATT	2	6	50240	50245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250111
1003	NT_187102	GC	3	6	50331	50336	0 %	0 %	50 %	50 %	409250111
1004	NT_187102	CA	3	6	50359	50364	50 %	0 %	0 %	50 %	409250111
1005	NT_187102	GAT	2	6	50383	50388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250111
1006	NT_187102	GCG	2	6	50424	50429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250111
1007	NT_187102	GAT	2	6	50449	50454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250111
1008	NT_187102	TGG	2	6	50460	50465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250111
1009	NT_187102	GCT	2	6	50473	50478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250111
1010	NT_187102	TGC	2	6	50538	50543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250111
1011	NT_187102	GC	3	6	50583	50588	0 %	0 %	50 %	50 %	409250111
1012	NT_187102	GGC	2	6	50624	50629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250111
1013	NT_187102	GC	3	6	50640	50645	0 %	0 %	50 %	50 %	409250111
1014	NT_187102	CAA	2	6	50684	50689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250111
1015	NT_187102	GCT	2	6	50713	50718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250111
1016	NT_187102	GCC	2	6	50729	50734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250111
1017	NT_187102	GCG	3	9	50789	50797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250111
1018	NT_187102	TGT	2	6	50862	50867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250111
1019	NT_187102	CTGC	2	8	50897	50904	0 %	25 %	25 %	50 %	409250111
1020	NT_187102	GGCA	2	8	50991	50998	25 %	0 %	50 %	25 %	409250111
1021	NT_187102	CGC	2	6	51007	51012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250111
1022	NT_187102	AGC	2	6	51050	51055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250111
1023	NT_187102	CTT	2	6	51068	51073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250111
1024	NT_187102	ATAAC	2	10	51121	51130	60 %	20 %	0 %	20 %	409250111
1025	NT_187102	GCGT	2	8	51203	51210	0 %	25 %	50 %	25 %	409250112
1026	NT_187102	AGGC	2	8	51232	51239	25 %	0 %	50 %	25 %	409250112
1027	NT_187102	ATCGGT	2	12	51329	51340	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	409250112
1028	NT_187102	CGC	2	6	51388	51393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250112
1029	NT_187102	G	6	6	51430	51435	0 %	0 %	100 %	0 %	409250112
1030	NT_187102	GGCA	2	8	51508	51515	25 %	0 %	50 %	25 %	409250112
1031	NT_187102	AGCC	2	8	51628	51635	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1032	NT_187102	ACA	2	6	51664	51669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NT_187102	TGT	2	6	51705	51710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250113
1034	NT_187102	GTC	2	6	51745	51750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250113
1035	NT_187102	CAG	2	6	51751	51756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250113
1036	NT_187102	AGT	2	6	51798	51803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250113
1037	NT_187102	GGAC	2	8	51889	51896	25 %	0 %	50 %	25 %	409250113
1038	NT_187102	GGT	2	6	51988	51993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250113
1039	NT_187102	GGT	2	6	52015	52020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250113
1040	NT_187102	TGT	2	6	52032	52037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250113
1041	NT_187102	CAT	2	6	52041	52046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250113
1042	NT_187102	CAG	2	6	52056	52061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250113
1043	NT_187102	GCA	2	6	52085	52090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250113
1044	NT_187102	GCT	2	6	52103	52108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250113
1045	NT_187102	GTT	2	6	52117	52122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250113
1046	NT_187102	AAG	2	6	52280	52285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250113
1047	NT_187102	AGT	2	6	52312	52317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250113
1048	NT_187102	CCA	2	6	52358	52363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250113
1049	NT_187102	TTTGTC	2	12	52477	52488	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	409250113
1050	NT_187102	CG	3	6	52589	52594	0 %	0 %	50 %	50 %	409250113
1051	NT_187102	ATC	2	6	52621	52626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250113
1052	NT_187102	AAT	2	6	52632	52637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250113
1053	NT_187102	TA	3	6	52686	52691	50 %	50 %	0 %	0 %	409250113
1054	NT_187102	CTG	2	6	52713	52718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250113
1055	NT_187102	CACTGC	2	12	52732	52743	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	409250113
1056	NT_187102	TAA	2	6	52764	52769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250113
1057	NT_187102	AAT	2	6	52865	52870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NT_187102	ATT	2	6	52890	52895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NT_187102	TG	3	6	52902	52907	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1060	NT_187102	TAA	2	6	52959	52964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NT_187102	AT	3	6	52966	52971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NT_187102	GTA	2	6	53013	53018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NT_187102	ATT	2	6	53026	53031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NT_187102	TA	3	6	53066	53071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NT_187102	AC	3	6	53191	53196	50 %	0 %	0 %	50 %	409250114
1066	NT_187102	GATA	2	8	53201	53208	50 %	25 %	25 %	0 %	409250114
1067	NT_187102	GTTGT	2	10	53217	53226	0 %	60 %	40 %	0 %	409250114
1068	NT_187102	AATATC	2	12	53257	53268	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1069	NT_187102	GCCC	2	8	53270	53277	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1070	NT_187102	GCC	2	6	53290	53295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1071	NT_187102	GCCA	2	8	53301	53308	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1072	NT_187102	AGT	2	6	53313	53318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250115
1073	NT_187102	GTG	2	6	53365	53370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250115
1074	NT_187102	CAGAG	2	10	53390	53399	40 %	0 %	40 %	20 %	409250115
1075	NT_187102	GCG	2	6	53472	53477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250115
1076	NT_187102	GCG	2	6	53551	53556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250115
1077	NT_187102	A	6	6	53675	53680	100 %	0 %	0 %	0 %	409250115
1078	NT_187102	TGG	2	6	53704	53709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250115
1079	NT_187102	C	6	6	53751	53756	0 %	0 %	0 %	100 %	409250115
1080	NT_187102	AGTT	2	8	53809	53816	25 %	50 %	25 %	0 %	409250115
1081	NT_187102	T	6	6	53815	53820	0 %	100 %	0 %	0 %	409250115
1082	NT_187102	GGC	2	6	53906	53911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250115
1083	NT_187102	GA	3	6	53918	53923	50 %	0 %	50 %	0 %	409250115
1084	NT_187102	CTGC	2	8	53961	53968	0 %	25 %	25 %	50 %	409250115
1085	NT_187102	CGG	2	6	53991	53996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250115
1086	NT_187102	CAG	3	9	54023	54031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250115
1087	NT_187102	GCC	2	6	54059	54064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250115
1088	NT_187102	CGC	2	6	54088	54093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250115
1089	NT_187102	CAA	2	6	54130	54135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250115
1090	NT_187102	T	6	6	54248	54253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NT_187102	A	6	6	54330	54335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NT_187102	TGC	2	6	54396	54401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NT_187102	AGG	2	6	54409	54414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1094	NT_187102	A	6	6	54428	54433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NT_187102	T	6	6	54465	54470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NT_187102	GCGG	2	8	54480	54487	0 %	0 %	75 %	25 %	409250116
1097	NT_187102	AAC	2	6	54497	54502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250116
1098	NT_187102	GC	3	6	54566	54571	0 %	0 %	50 %	50 %	409250116
1099	NT_187102	A	6	6	54647	54652	100 %	0 %	0 %	0 %	409250116
1100	NT_187102	AAG	2	6	54658	54663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250116
1101	NT_187102	ATC	2	6	54691	54696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250116
1102	NT_187102	GC	3	6	54709	54714	0 %	0 %	50 %	50 %	409250116
1103	NT_187102	CG	3	6	54783	54788	0 %	0 %	50 %	50 %	409250116
1104	NT_187102	CT	3	6	54918	54923	0 %	50 %	0 %	50 %	409250116
1105	NT_187102	CGG	2	6	54943	54948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250116
1106	NT_187102	TC	3	6	54990	54995	0 %	50 %	0 %	50 %	409250116
1107	NT_187102	GC	3	6	55020	55025	0 %	0 %	50 %	50 %	409250116
1108	NT_187102	ACCA	2	8	55083	55090	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1109	NT_187102	CGT	2	6	55115	55120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250117
1110	NT_187102	GGC	2	6	55131	55136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250117
1111	NT_187102	ATA	2	6	55189	55194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250117
1112	NT_187102	CTG	2	6	55371	55376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250117
1113	NT_187102	GAT	2	6	55383	55388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250117
1114	NT_187102	TGA	2	6	55397	55402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250117
1115	NT_187102	TCC	2	6	55449	55454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409250117
1116	NT_187102	TGA	2	6	55493	55498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250117
1117	NT_187102	TG	4	8	55518	55525	0 %	50 %	50 %	0 %	409250117
1118	NT_187102	CTG	2	6	55530	55535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250117
1119	NT_187102	AGC	2	6	55537	55542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250117
1120	NT_187102	CGT	2	6	55565	55570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250117
1121	NT_187102	GT	3	6	55611	55616	0 %	50 %	50 %	0 %	409250117
1122	NT_187102	ACC	2	6	55653	55658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250117
1123	NT_187102	GCTGG	2	10	55670	55679	0 %	20 %	60 %	20 %	409250117
1124	NT_187102	GAT	2	6	55721	55726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250117
1125	NT_187102	TGC	2	6	55732	55737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250117
1126	NT_187102	TGGC	2	8	55753	55760	0 %	25 %	50 %	25 %	409250117
1127	NT_187102	CCA	2	6	55825	55830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250117
1128	NT_187102	ACT	2	6	55930	55935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250117
1129	NT_187102	TTC	2	6	55953	55958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250117
1130	NT_187102	TGA	2	6	55966	55971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250117
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1188	NT_187102	ACG	2	6	59140	59145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1192	NT_187102	ACC	2	6	59447	59452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250120
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1202	NT_187102	ACG	2	6	59957	59962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250120
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1211	NT_187102	GT	3	6	60360	60365	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1245	NT_187102	ACTC	2	8	62130	62137	25 %	25 %	0 %	50 %	409250121
1246	NT_187102	CGT	2	6	62163	62168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1247	NT_187102	ATC	2	6	62171	62176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1248	NT_187102	AT	3	6	62177	62182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1249	NT_187102	CCA	2	6	62189	62194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1250	NT_187102	CGGCG	2	10	62317	62326	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1251	NT_187102	CAC	2	6	62348	62353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250122
1252	NT_187102	GCT	2	6	62354	62359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250122
1253	NT_187102	AAC	2	6	62375	62380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250122
1254	NT_187102	CTC	2	6	62452	62457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409250122
1255	NT_187102	GAAA	2	8	62496	62503	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1256	NT_187102	TGC	2	6	62554	62559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1257	NT_187102	CTG	2	6	62583	62588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250123
1258	NT_187102	ATC	2	6	62652	62657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250123
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1260	NT_187102	TGC	2	6	62721	62726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250123
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1262	NT_187102	AATT	2	8	62802	62809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1263	NT_187102	AAT	2	6	62826	62831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1264	NT_187102	AGA	2	6	62901	62906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1265	NT_187102	AT	3	6	62909	62914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1266	NT_187102	TAG	2	6	62943	62948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1268	NT_187102	CTC	2	6	63055	63060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1269	NT_187102	GAA	2	6	63063	63068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1271	NT_187102	AAAG	2	8	63101	63108	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1272	NT_187102	TCA	2	6	63130	63135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1274	NT_187102	AGC	2	6	63221	63226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1275	NT_187102	T	6	6	63242	63247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1279	NT_187102	AACC	2	8	63402	63409	50 %	0 %	0 %	50 %	409250124
1280	NT_187102	CAAAG	2	10	63568	63577	60 %	0 %	20 %	20 %	409250124
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1283	NT_187102	GCTC	2	8	63762	63769	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1284	NT_187102	TGCC	2	8	63784	63791	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1285	NT_187102	TCA	2	6	63887	63892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1286	NT_187102	AAT	2	6	63921	63926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1287	NT_187102	GA	3	6	63958	63963	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1288	NT_187102	TAT	2	6	63971	63976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1290	NT_187102	ATT	2	6	64031	64036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1291	NT_187102	CAA	3	9	64041	64049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1292	NT_187102	CAG	2	6	64071	64076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1293	NT_187102	TAT	2	6	64078	64083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250125
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1301	NT_187102	TCT	2	6	64457	64462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1362	NT_187102	GAAT	2	8	67147	67154	50 %	25 %	25 %	0 %	409250127
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1383	NT_187102	GC	3	6	68198	68203	0 %	0 %	50 %	50 %	409250128
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1385	NT_187102	GGC	2	6	68229	68234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250128
1386	NT_187102	GCT	2	6	68280	68285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250128
1387	NT_187102	AG	3	6	68331	68336	50 %	0 %	50 %	0 %	409250128
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1479	NT_187102	GCA	2	6	73096	73101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250131
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1482	NT_187102	GCG	2	6	73225	73230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1483	NT_187102	GAA	2	6	73292	73297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250132
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1489	NT_187102	AAT	2	6	73583	73588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250132
1490	NT_187102	CAG	2	6	73592	73597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250132
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1493	NT_187102	ATG	2	6	73818	73823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250132
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1497	NT_187102	GCG	2	6	73981	73986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250132
1498	NT_187102	GATAA	2	10	74021	74030	60 %	20 %	20 %	0 %	409250132
1499	NT_187102	CGG	2	6	74035	74040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250132
1500	NT_187102	GTC	2	6	74061	74066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250132

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