MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 8012

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NT_187102	GCT	2	6	25829	25834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250091
502	NT_187102	TCG	2	6	25875	25880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250091
503	NT_187102	CGT	2	6	25912	25917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250091
504	NT_187102	TTGC	2	8	25943	25950	0 %	50 %	25 %	25 %	409250091
505	NT_187102	GC	3	6	25955	25960	0 %	0 %	50 %	50 %	409250091
506	NT_187102	TAAA	2	8	25984	25991	75 %	25 %	0 %	0 %	409250091
507	NT_187102	CTG	2	6	26038	26043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250091
508	NT_187102	CGC	2	6	26089	26094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250091
509	NT_187102	TTG	2	6	26252	26257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250091
510	NT_187102	GAA	2	6	26299	26304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250091
511	NT_187102	CAGC	2	8	26315	26322	25 %	0 %	25 %	50 %	409250091
512	NT_187102	CTT	2	6	26356	26361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250091
513	NT_187102	CGC	2	6	26423	26428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250091
514	NT_187102	T	6	6	26436	26441	0 %	100 %	0 %	0 %	409250091
515	NT_187102	GT	4	8	26474	26481	0 %	50 %	50 %	0 %	409250091
516	NT_187102	GC	3	6	26522	26527	0 %	0 %	50 %	50 %	409250091
517	NT_187102	CGG	2	6	26558	26563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250091
518	NT_187102	GCC	2	6	26663	26668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250091
519	NT_187102	GCG	2	6	26776	26781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250091
520	NT_187102	CGC	2	6	26806	26811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250091
521	NT_187102	CA	3	6	26845	26850	50 %	0 %	0 %	50 %	409250091
522	NT_187102	GC	3	6	27000	27005	0 %	0 %	50 %	50 %	409250092
523	NT_187102	ATC	2	6	27022	27027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250092
524	NT_187102	TAC	2	6	27090	27095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250092
525	NT_187102	GC	3	6	27096	27101	0 %	0 %	50 %	50 %	409250092
526	NT_187102	AG	3	6	27133	27138	50 %	0 %	50 %	0 %	409250092
527	NT_187102	GGC	2	6	27139	27144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250092
528	NT_187102	GCG	2	6	27287	27292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250092
529	NT_187102	GGGC	2	8	27302	27309	0 %	0 %	75 %	25 %	409250092
530	NT_187102	GGCGC	2	10	27388	27397	0 %	0 %	60 %	40 %	409250092
531	NT_187102	A	6	6	27436	27441	100 %	0 %	0 %	0 %	409250092
532	NT_187102	CGG	2	6	27452	27457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250092
533	NT_187102	GCG	2	6	27566	27571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250092
534	NT_187102	TCC	2	6	27580	27585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409250092
535	NT_187102	CGG	2	6	27594	27599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250092
536	NT_187102	GCC	2	6	27643	27648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250092
537	NT_187102	TCCGGC	2	12	27673	27684	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	409250092
538	NT_187102	GCAG	2	8	27722	27729	25 %	0 %	50 %	25 %	409250092
539	NT_187102	CAT	2	6	27737	27742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250092
540	NT_187102	CTG	2	6	28071	28076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250092
541	NT_187102	CCG	3	9	28132	28140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250092
542	NT_187102	ATC	2	6	28155	28160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250092
543	NT_187102	AG	3	6	28178	28183	50 %	0 %	50 %	0 %	409250092
544	NT_187102	GTT	2	6	28194	28199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NT_187102	CTT	2	6	28210	28215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NT_187102	GCAA	2	8	28243	28250	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
547	NT_187102	CGG	2	6	28252	28257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
548	NT_187102	GGC	3	9	28332	28340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
549	NT_187102	GGA	2	6	28428	28433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409250093
550	NT_187102	GCC	2	6	28453	28458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250093
551	NT_187102	ATGA	2	8	28483	28490	50 %	25 %	25 %	0 %	409250093
552	NT_187102	GCA	3	9	28545	28553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250093
553	NT_187102	GGCA	2	8	28582	28589	25 %	0 %	50 %	25 %	409250093
554	NT_187102	AAG	2	6	28595	28600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250093
555	NT_187102	CG	3	6	28608	28613	0 %	0 %	50 %	50 %	409250093
556	NT_187102	AGC	2	6	28619	28624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250093
557	NT_187102	GGC	2	6	28633	28638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250093
558	NT_187102	GC	3	6	28702	28707	0 %	0 %	50 %	50 %	409250094
559	NT_187102	CG	3	6	28752	28757	0 %	0 %	50 %	50 %	409250094
560	NT_187102	CCG	2	6	28773	28778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250094
561	NT_187102	CTGG	2	8	28784	28791	0 %	25 %	50 %	25 %	409250094
562	NT_187102	GTC	2	6	28809	28814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250094
563	NT_187102	GCG	2	6	28815	28820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250094
564	NT_187102	A	6	6	28856	28861	100 %	0 %	0 %	0 %	409250094
565	NT_187102	CAG	2	6	28868	28873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250094
566	NT_187102	CCA	2	6	28889	28894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250094
567	NT_187102	TCG	2	6	29005	29010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250094
568	NT_187102	ATG	2	6	29011	29016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250094
569	NT_187102	ATA	2	6	29034	29039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250094
570	NT_187102	ACC	2	6	29049	29054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250094
571	NT_187102	CGG	2	6	29065	29070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250094
572	NT_187102	TCA	2	6	29101	29106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250094
573	NT_187102	TCA	2	6	29129	29134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250095
574	NT_187102	CGGTAA	2	12	29202	29213	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	409250095
575	NT_187102	ATG	2	6	29224	29229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250095
576	NT_187102	GGC	2	6	29242	29247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250095
577	NT_187102	CCA	2	6	29268	29273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250095
578	NT_187102	TCG	2	6	29300	29305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250095
579	NT_187102	CTG	2	6	29312	29317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250095
580	NT_187102	AGC	2	6	29318	29323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250095
581	NT_187102	ATG	2	6	29418	29423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250095
582	NT_187102	CAC	2	6	29434	29439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250095
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584	NT_187102	GGC	2	6	29667	29672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
585	NT_187102	GAAA	2	8	29717	29724	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
586	NT_187102	TAT	2	6	29793	29798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NT_187102	GAG	2	6	29819	29824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
588	NT_187102	TCG	2	6	29854	29859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250096
589	NT_187102	CGC	2	6	29889	29894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250096
590	NT_187102	GAA	2	6	29915	29920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250096
591	NT_187102	T	7	7	29967	29973	0 %	100 %	0 %	0 %	409250096
592	NT_187102	GCC	2	6	30025	30030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250096
593	NT_187102	TCCT	2	8	30196	30203	0 %	50 %	0 %	50 %	409250096
594	NT_187102	CGC	3	9	30295	30303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250096
595	NT_187102	CGG	2	6	30373	30378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250096
596	NT_187102	ATC	2	6	30432	30437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250096
597	NT_187102	TAT	2	6	30494	30499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250096
598	NT_187102	GGT	2	6	30509	30514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250096
599	NT_187102	CAGA	2	8	30615	30622	50 %	0 %	25 %	25 %	409250096
600	NT_187102	CTG	2	6	30629	30634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250096
601	NT_187102	ATC	2	6	30677	30682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250096
602	NT_187102	AAG	2	6	30741	30746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250096
603	NT_187102	GCT	2	6	30811	30816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250096
604	NT_187102	GAA	2	6	30823	30828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250096
605	NT_187102	A	6	6	30871	30876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NT_187102	GGC	2	6	30878	30883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
607	NT_187102	TCA	2	6	30936	30941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NT_187102	TTG	2	6	31051	31056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NT_187102	TATT	2	8	31095	31102	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NT_187102	T	6	6	31126	31131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NT_187102	CTT	2	6	31149	31154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NT_187102	TGT	2	6	31171	31176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NT_187102	GAAG	2	8	31190	31197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
614	NT_187102	A	6	6	31215	31220	100 %	0 %	0 %	0 %	409250097
615	NT_187102	CA	3	6	31240	31245	50 %	0 %	0 %	50 %	409250097
616	NT_187102	GGA	2	6	31477	31482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409250097
617	NT_187102	GGT	2	6	31489	31494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250097
618	NT_187102	CGC	2	6	31495	31500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250097
619	NT_187102	T	6	6	31702	31707	0 %	100 %	0 %	0 %	409250097
620	NT_187102	TGA	2	6	31726	31731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250097
621	NT_187102	AAG	2	6	31791	31796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250097
622	NT_187102	CAA	2	6	31826	31831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250097
623	NT_187102	CGA	2	6	31839	31844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250097
624	NT_187102	TGCCA	2	10	31944	31953	20 %	20 %	20 %	40 %	409250098
625	NT_187102	ATA	2	6	31994	31999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250098
626	NT_187102	ACCGA	2	10	32025	32034	40 %	0 %	20 %	40 %	409250098
627	NT_187102	CAA	2	6	32122	32127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250098
628	NT_187102	TCA	2	6	32157	32162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250098
629	NT_187102	ACC	2	6	32206	32211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250098
630	NT_187102	CCAG	2	8	32323	32330	25 %	0 %	25 %	50 %	409250098
631	NT_187102	ATG	2	6	32335	32340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250098
632	NT_187102	GGC	2	6	32395	32400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250098
633	NT_187102	GTAG	2	8	32420	32427	25 %	25 %	50 %	0 %	409250098
634	NT_187102	TCC	2	6	32432	32437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409250098
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652	NT_187102	GTTT	2	8	33201	33208	0 %	75 %	25 %	0 %	409250098
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656	NT_187102	GTGG	2	8	33413	33420	0 %	25 %	75 %	0 %	409250098
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672	NT_187102	ATAA	2	8	34212	34219	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
673	NT_187102	ATT	3	9	34222	34230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
674	NT_187102	TAA	2	6	34240	34245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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745	NT_187102	AGC	2	6	37554	37559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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750	NT_187102	TTGA	2	8	37734	37741	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
751	NT_187102	GA	3	6	37756	37761	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
752	NT_187102	TGC	2	6	37870	37875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250102
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769	NT_187102	T	7	7	38610	38616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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