MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 797

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NT_187101	GCAGG	2	10	24440	24449	20 %	0 %	60 %	20 %	409250049
502	NT_187101	GGC	2	6	24509	24514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250049
503	NT_187101	TTA	2	6	24585	24590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250049
504	NT_187101	ATCC	2	8	24649	24656	25 %	25 %	0 %	50 %	409250049
505	NT_187101	GAAT	2	8	24732	24739	50 %	25 %	25 %	0 %	409250050
506	NT_187101	AG	3	6	24839	24844	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
507	NT_187101	CAT	2	6	24902	24907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250051
508	NT_187101	TCC	2	6	24929	24934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409250051
509	NT_187101	CTT	3	9	24950	24958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250051
510	NT_187101	GCG	2	6	25109	25114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250051
511	NT_187101	ATGAA	2	10	25134	25143	60 %	20 %	20 %	0 %	409250051
512	NT_187101	CCG	2	6	25227	25232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250051
513	NT_187101	AAC	2	6	25359	25364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250051
514	NT_187101	GCA	2	6	25370	25375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250051
515	NT_187101	ACT	2	6	25426	25431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250051
516	NT_187101	ATG	2	6	25466	25471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250051
517	NT_187101	CGCTGG	2	12	25491	25502	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409250051
518	NT_187101	GCA	2	6	25555	25560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250051
519	NT_187101	GCG	2	6	25586	25591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250051
520	NT_187101	TCA	2	6	25648	25653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250051
521	NT_187101	CAG	2	6	25658	25663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250051
522	NT_187101	GCA	2	6	25666	25671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250051
523	NT_187101	CAA	2	6	25679	25684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250051
524	NT_187101	GGA	2	6	25711	25716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409250051
525	NT_187101	CCG	2	6	25743	25748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250051
526	NT_187101	TCT	2	6	25763	25768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250051
527	NT_187101	CAG	2	6	25778	25783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250051
528	NT_187101	GCC	2	6	25787	25792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250051
529	NT_187101	AGCC	2	8	25897	25904	25 %	0 %	25 %	50 %	409250051
530	NT_187101	CCA	2	6	25953	25958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250051
531	NT_187101	A	7	7	25964	25970	100 %	0 %	0 %	0 %	409250051
532	NT_187101	CCG	2	6	25984	25989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250051
533	NT_187101	CGG	2	6	26035	26040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
534	NT_187101	GGC	2	6	26045	26050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
535	NT_187101	GGT	2	6	26081	26086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250052
536	NT_187101	GC	3	6	26119	26124	0 %	0 %	50 %	50 %	409250052
537	NT_187101	GGC	2	6	26126	26131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250052
538	NT_187101	ATGA	2	8	26214	26221	50 %	25 %	25 %	0 %	409250052
539	NT_187101	TGA	2	6	26279	26284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250052
540	NT_187101	GTCA	2	8	26307	26314	25 %	25 %	25 %	25 %	409250052
541	NT_187101	CAA	2	6	26343	26348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250052
542	NT_187101	CGG	3	9	26377	26385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250052
543	NT_187101	GAA	2	6	26394	26399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250052
544	NT_187101	GCC	2	6	26403	26408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250052
545	NT_187101	CGTTT	2	10	26431	26440	0 %	60 %	20 %	20 %	409250052
546	NT_187101	CGA	2	6	26455	26460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250052
547	NT_187101	ATC	2	6	26465	26470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250052
548	NT_187101	TAA	2	6	26478	26483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250052
549	NT_187101	TCT	2	6	26686	26691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250053
550	NT_187101	CGTAAT	2	12	26720	26731	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	409250053
551	NT_187101	GGCA	2	8	26781	26788	25 %	0 %	50 %	25 %	409250053
552	NT_187101	GAC	2	6	26853	26858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250053
553	NT_187101	CAG	2	6	26949	26954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250053
554	NT_187101	GATC	2	8	27008	27015	25 %	25 %	25 %	25 %	409250053
555	NT_187101	GCAA	2	8	27034	27041	50 %	0 %	25 %	25 %	409250053
556	NT_187101	GCC	2	6	27109	27114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250053
557	NT_187101	CAGCG	2	10	27126	27135	20 %	0 %	40 %	40 %	409250053
558	NT_187101	GC	3	6	27143	27148	0 %	0 %	50 %	50 %	409250053
559	NT_187101	CAC	2	6	27156	27161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250053
560	NT_187101	CGG	2	6	27200	27205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250053
561	NT_187101	GC	3	6	27269	27274	0 %	0 %	50 %	50 %	409250053
562	NT_187101	GTT	2	6	27311	27316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250053
563	NT_187101	GTTC	2	8	27320	27327	0 %	50 %	25 %	25 %	409250053
564	NT_187101	GCTG	2	8	27343	27350	0 %	25 %	50 %	25 %	409250053
565	NT_187101	CG	3	6	27372	27377	0 %	0 %	50 %	50 %	409250053
566	NT_187101	T	7	7	27454	27460	0 %	100 %	0 %	0 %	409250053
567	NT_187101	GTT	2	6	27505	27510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NT_187101	ATT	2	6	27537	27542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NT_187101	TTTTA	2	10	27571	27580	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NT_187101	TGA	2	6	27582	27587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NT_187101	TTC	2	6	27692	27697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NT_187101	CAG	2	6	27823	27828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250054
573	NT_187101	GTACG	2	10	27840	27849	20 %	20 %	40 %	20 %	409250054
574	NT_187101	AAT	2	6	27892	27897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250054
575	NT_187101	AGA	2	6	27984	27989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250054
576	NT_187101	CAT	2	6	28017	28022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250054
577	NT_187101	TTA	2	6	28041	28046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250054
578	NT_187101	TC	4	8	28050	28057	0 %	50 %	0 %	50 %	409250054
579	NT_187101	GGCG	2	8	28059	28066	0 %	0 %	75 %	25 %	409250054
580	NT_187101	GCG	2	6	28189	28194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250054
581	NT_187101	ACG	2	6	28253	28258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250054
582	NT_187101	TGC	2	6	28275	28280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250054
583	NT_187101	TGA	2	6	28344	28349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250054
584	NT_187101	CGC	2	6	28433	28438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250054
585	NT_187101	ATG	2	6	28468	28473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250054
586	NT_187101	CGC	2	6	28519	28524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250054
587	NT_187101	TGA	2	6	28587	28592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250054
588	NT_187101	GC	3	6	28612	28617	0 %	0 %	50 %	50 %	409250054
589	NT_187101	GTC	2	6	28661	28666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250054
590	NT_187101	CAG	2	6	28780	28785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250054
591	NT_187101	ATCC	2	8	28843	28850	25 %	25 %	0 %	50 %	409250054
592	NT_187101	CGA	2	6	28854	28859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250054
593	NT_187101	TTC	2	6	28919	28924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250054
594	NT_187101	GAA	2	6	29065	29070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250054
595	NT_187101	AAGG	2	8	29137	29144	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
596	NT_187101	TGG	2	6	29171	29176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250055
597	NT_187101	CGT	2	6	29202	29207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250055
598	NT_187101	GAA	2	6	29212	29217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250055
599	NT_187101	GCCGC	2	10	29245	29254	0 %	0 %	40 %	60 %	409250055
600	NT_187101	CGG	3	9	29370	29378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250055
601	NT_187101	CCG	2	6	29429	29434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250055
602	NT_187101	CGG	3	9	29472	29480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250055
603	NT_187101	GCC	2	6	29505	29510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250055
604	NT_187101	GCGCG	2	10	29535	29544	0 %	0 %	60 %	40 %	409250055
605	NT_187101	GTG	2	6	29548	29553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250055
606	NT_187101	CGCTG	2	10	29655	29664	0 %	20 %	40 %	40 %	409250055
607	NT_187101	GGC	2	6	29695	29700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250055
608	NT_187101	CCG	2	6	29732	29737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250055
609	NT_187101	ATT	2	6	29800	29805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250055
610	NT_187101	A	7	7	29850	29856	100 %	0 %	0 %	0 %	409250055
611	NT_187101	CGT	2	6	29985	29990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250055
612	NT_187101	CTT	2	6	30015	30020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250055
613	NT_187101	GCG	2	6	30022	30027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250055
614	NT_187101	TGA	2	6	30047	30052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250055
615	NT_187101	A	6	6	30119	30124	100 %	0 %	0 %	0 %	409250055
616	NT_187101	GCG	2	6	30135	30140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250055
617	NT_187101	GCT	2	6	30162	30167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250055
618	NT_187101	CGA	2	6	30186	30191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250055
619	NT_187101	GGC	2	6	30200	30205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250055
620	NT_187101	GTC	2	6	30244	30249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250055
621	NT_187101	GCA	2	6	30258	30263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250055
622	NT_187101	GTAT	2	8	30363	30370	25 %	50 %	25 %	0 %	409250055
623	NT_187101	GAATGA	2	12	30411	30422	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	409250055
624	NT_187101	CG	3	6	30485	30490	0 %	0 %	50 %	50 %	409250055
625	NT_187101	TGC	2	6	30494	30499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250055
626	NT_187101	TGCG	2	8	30599	30606	0 %	25 %	50 %	25 %	409250055
627	NT_187101	GAA	2	6	30672	30677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NT_187101	TGC	2	6	30678	30683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NT_187101	CAA	2	6	30758	30763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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633	NT_187101	TTA	2	6	30893	30898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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759	NT_187101	ATC	2	6	37166	37171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250061
760	NT_187101	GCC	2	6	37178	37183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250061
761	NT_187101	TCCAGC	2	12	37241	37252	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	409250061
762	NT_187101	CGT	2	6	37386	37391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250061
763	NT_187101	TGT	2	6	37563	37568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250061
764	NT_187101	TG	3	6	37587	37592	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
765	NT_187101	T	6	6	37603	37608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
766	NT_187101	CAA	2	6	37657	37662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
767	NT_187101	TAAT	2	8	37694	37701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
768	NT_187101	ATTG	2	8	37706	37713	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
769	NT_187101	TA	3	6	37723	37728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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771	NT_187101	AAG	2	6	37794	37799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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795	NT_187101	GCAT	2	8	39169	39176	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
796	NT_187101	C	9	9	39204	39212	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
797	NT_187101	G	7	7	39219	39225	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding

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