MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 202

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187100	TC	3	6	122	127	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NT_187100	GC	3	6	425	430	0 %	0 %	50 %	50 %	409249915
3	NT_187100	CG	3	6	610	615	0 %	0 %	50 %	50 %	409249915
4	NT_187100	GC	3	6	669	674	0 %	0 %	50 %	50 %	409249915
5	NT_187100	CG	3	6	1144	1149	0 %	0 %	50 %	50 %	409249915
6	NT_187100	CG	3	6	1422	1427	0 %	0 %	50 %	50 %	409249916
7	NT_187100	CG	3	6	2227	2232	0 %	0 %	50 %	50 %	409249917
8	NT_187100	CT	3	6	2401	2406	0 %	50 %	0 %	50 %	409249917
9	NT_187100	AG	3	6	2430	2435	50 %	0 %	50 %	0 %	409249917
10	NT_187100	GA	3	6	2816	2821	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187100	GC	3	6	4401	4406	0 %	0 %	50 %	50 %	409249919
12	NT_187100	AT	3	6	4852	4857	50 %	50 %	0 %	0 %	409249919
13	NT_187100	TA	3	6	5909	5914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NT_187100	GC	3	6	7290	7295	0 %	0 %	50 %	50 %	409249922
15	NT_187100	CA	3	6	7707	7712	50 %	0 %	0 %	50 %	409249922
16	NT_187100	AG	3	6	8249	8254	50 %	0 %	50 %	0 %	409249922
17	NT_187100	CG	3	6	8471	8476	0 %	0 %	50 %	50 %	409249922
18	NT_187100	GC	3	6	9162	9167	0 %	0 %	50 %	50 %	409249922
19	NT_187100	GC	3	6	9224	9229	0 %	0 %	50 %	50 %	409249922
20	NT_187100	AT	3	6	9422	9427	50 %	50 %	0 %	0 %	409249922
21	NT_187100	TG	3	6	9870	9875	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187100	TG	3	6	11085	11090	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187100	TC	3	6	11699	11704	0 %	50 %	0 %	50 %	409249925
24	NT_187100	CG	3	6	13087	13092	0 %	0 %	50 %	50 %	409249925
25	NT_187100	TA	3	6	13161	13166	50 %	50 %	0 %	0 %	409249925
26	NT_187100	GC	3	6	13415	13420	0 %	0 %	50 %	50 %	409249926
27	NT_187100	CG	3	6	13879	13884	0 %	0 %	50 %	50 %	409249926
28	NT_187100	CG	3	6	13925	13930	0 %	0 %	50 %	50 %	409249926
29	NT_187100	GC	3	6	14098	14103	0 %	0 %	50 %	50 %	409249926
30	NT_187100	GC	3	6	15453	15458	0 %	0 %	50 %	50 %	409249928
31	NT_187100	GC	3	6	15622	15627	0 %	0 %	50 %	50 %	409249928
32	NT_187100	GC	3	6	15907	15912	0 %	0 %	50 %	50 %	409249928
33	NT_187100	GC	3	6	16128	16133	0 %	0 %	50 %	50 %	409249928
34	NT_187100	GC	4	8	16359	16366	0 %	0 %	50 %	50 %	409249929
35	NT_187100	GA	3	6	16795	16800	50 %	0 %	50 %	0 %	409249929
36	NT_187100	GC	3	6	17092	17097	0 %	0 %	50 %	50 %	409249929
37	NT_187100	GC	3	6	17304	17309	0 %	0 %	50 %	50 %	409249930
38	NT_187100	GC	3	6	17670	17675	0 %	0 %	50 %	50 %	409249930
39	NT_187100	GC	3	6	18006	18011	0 %	0 %	50 %	50 %	409249930
40	NT_187100	CG	3	6	18918	18923	0 %	0 %	50 %	50 %	409249932
41	NT_187100	GC	3	6	19823	19828	0 %	0 %	50 %	50 %	409249932
42	NT_187100	GT	3	6	20229	20234	0 %	50 %	50 %	0 %	409249933
43	NT_187100	GC	3	6	20496	20501	0 %	0 %	50 %	50 %	409249934
44	NT_187100	TG	3	6	20676	20681	0 %	50 %	50 %	0 %	409249935
45	NT_187100	GC	3	6	21753	21758	0 %	0 %	50 %	50 %	409249937
46	NT_187100	TG	3	6	22041	22046	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NT_187100	GC	3	6	22425	22430	0 %	0 %	50 %	50 %	409249938
48	NT_187100	GC	3	6	23137	23142	0 %	0 %	50 %	50 %	409249939
49	NT_187100	GC	3	6	23144	23149	0 %	0 %	50 %	50 %	409249939
50	NT_187100	GC	3	6	23248	23253	0 %	0 %	50 %	50 %	409249939
51	NT_187100	CG	4	8	23612	23619	0 %	0 %	50 %	50 %	409249940
52	NT_187100	AC	3	6	24950	24955	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NT_187100	CG	3	6	25085	25090	0 %	0 %	50 %	50 %	409249943
54	NT_187100	AG	3	6	25293	25298	50 %	0 %	50 %	0 %	409249943
55	NT_187100	AG	3	6	25516	25521	50 %	0 %	50 %	0 %	409249943
56	NT_187100	TC	3	6	25685	25690	0 %	50 %	0 %	50 %	409249943
57	NT_187100	GT	3	6	28397	28402	0 %	50 %	50 %	0 %	409249947
58	NT_187100	AG	3	6	28577	28582	50 %	0 %	50 %	0 %	409249948
59	NT_187100	CG	3	6	28742	28747	0 %	0 %	50 %	50 %	409249948
60	NT_187100	TG	3	6	29449	29454	0 %	50 %	50 %	0 %	409249948
61	NT_187100	GC	3	6	29602	29607	0 %	0 %	50 %	50 %	409249948
62	NT_187100	GC	3	6	29724	29729	0 %	0 %	50 %	50 %	409249949
63	NT_187100	CG	4	8	30206	30213	0 %	0 %	50 %	50 %	409249949
64	NT_187100	AT	3	6	30242	30247	50 %	50 %	0 %	0 %	409249949
65	NT_187100	CG	3	6	30557	30562	0 %	0 %	50 %	50 %	409249949
66	NT_187100	CG	3	6	30936	30941	0 %	0 %	50 %	50 %	409249949
67	NT_187100	CG	3	6	31436	31441	0 %	0 %	50 %	50 %	409249950
68	NT_187100	CT	3	6	32022	32027	0 %	50 %	0 %	50 %	409249950
69	NT_187100	CG	3	6	32133	32138	0 %	0 %	50 %	50 %	409249950
70	NT_187100	CG	3	6	32283	32288	0 %	0 %	50 %	50 %	409249950
71	NT_187100	GC	4	8	32723	32730	0 %	0 %	50 %	50 %	409249951
72	NT_187100	GC	3	6	32949	32954	0 %	0 %	50 %	50 %	409249951
73	NT_187100	GC	3	6	33112	33117	0 %	0 %	50 %	50 %	409249951
74	NT_187100	GC	3	6	33127	33132	0 %	0 %	50 %	50 %	409249951
75	NT_187100	CG	3	6	33463	33468	0 %	0 %	50 %	50 %	409249951
76	NT_187100	AG	3	6	33875	33880	50 %	0 %	50 %	0 %	409249951
77	NT_187100	GC	3	6	34062	34067	0 %	0 %	50 %	50 %	409249951
78	NT_187100	CG	3	6	34927	34932	0 %	0 %	50 %	50 %	409249952
79	NT_187100	CG	3	6	35003	35008	0 %	0 %	50 %	50 %	409249952
80	NT_187100	GC	4	8	36134	36141	0 %	0 %	50 %	50 %	409249954
81	NT_187100	CG	3	6	36780	36785	0 %	0 %	50 %	50 %	409249954
82	NT_187100	GC	3	6	37210	37215	0 %	0 %	50 %	50 %	409249955
83	NT_187100	GC	3	6	37221	37226	0 %	0 %	50 %	50 %	409249955
84	NT_187100	GC	3	6	37807	37812	0 %	0 %	50 %	50 %	409249956
85	NT_187100	AG	3	6	38587	38592	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NT_187100	CG	3	6	38953	38958	0 %	0 %	50 %	50 %	409249957
87	NT_187100	GT	3	6	40220	40225	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NT_187100	AT	3	6	40315	40320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NT_187100	CG	3	6	40789	40794	0 %	0 %	50 %	50 %	409249959
90	NT_187100	GC	3	6	40895	40900	0 %	0 %	50 %	50 %	409249959
91	NT_187100	GC	3	6	41186	41191	0 %	0 %	50 %	50 %	409249959
92	NT_187100	GC	3	6	41238	41243	0 %	0 %	50 %	50 %	409249959
93	NT_187100	GC	3	6	42364	42369	0 %	0 %	50 %	50 %	409249959
94	NT_187100	TG	4	8	42439	42446	0 %	50 %	50 %	0 %	409249959
95	NT_187100	CG	4	8	42771	42778	0 %	0 %	50 %	50 %	409249959
96	NT_187100	CG	3	6	43763	43768	0 %	0 %	50 %	50 %	409249960
97	NT_187100	CG	3	6	46253	46258	0 %	0 %	50 %	50 %	409249963
98	NT_187100	AT	3	6	46330	46335	50 %	50 %	0 %	0 %	409249963
99	NT_187100	GC	3	6	47337	47342	0 %	0 %	50 %	50 %	409249963
100	NT_187100	GC	3	6	49088	49093	0 %	0 %	50 %	50 %	409249965
101	NT_187100	AC	3	6	49358	49363	50 %	0 %	0 %	50 %	409249965
102	NT_187100	GC	3	6	49848	49853	0 %	0 %	50 %	50 %	409249966
103	NT_187100	CG	3	6	50208	50213	0 %	0 %	50 %	50 %	409249967
104	NT_187100	CG	3	6	50474	50479	0 %	0 %	50 %	50 %	409249967
105	NT_187100	CG	3	6	50693	50698	0 %	0 %	50 %	50 %	409249967
106	NT_187100	GC	3	6	51789	51794	0 %	0 %	50 %	50 %	409249968
107	NT_187100	GC	3	6	51924	51929	0 %	0 %	50 %	50 %	409249968
108	NT_187100	CT	3	6	52868	52873	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NT_187100	AG	4	8	53078	53085	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NT_187100	GA	3	6	53223	53228	50 %	0 %	50 %	0 %	409249971
111	NT_187100	CA	3	6	53251	53256	50 %	0 %	0 %	50 %	409249971
112	NT_187100	AG	3	6	53915	53920	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NT_187100	AG	3	6	55921	55926	50 %	0 %	50 %	0 %	409249973
114	NT_187100	GA	3	6	56156	56161	50 %	0 %	50 %	0 %	409249973
115	NT_187100	CG	4	8	57234	57241	0 %	0 %	50 %	50 %	409249974
116	NT_187100	GC	3	6	57617	57622	0 %	0 %	50 %	50 %	409249974
117	NT_187100	GC	3	6	58376	58381	0 %	0 %	50 %	50 %	409249974
118	NT_187100	GT	3	6	58872	58877	0 %	50 %	50 %	0 %	409249975
119	NT_187100	CG	3	6	59052	59057	0 %	0 %	50 %	50 %	409249975
120	NT_187100	CT	4	8	59301	59308	0 %	50 %	0 %	50 %	409249975
121	NT_187100	CG	3	6	59340	59345	0 %	0 %	50 %	50 %	409249975
122	NT_187100	TA	3	6	59787	59792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NT_187100	GA	3	6	59941	59946	50 %	0 %	50 %	0 %	409249976
124	NT_187100	AG	3	6	60154	60159	50 %	0 %	50 %	0 %	409249976
125	NT_187100	GC	3	6	60196	60201	0 %	0 %	50 %	50 %	409249976
126	NT_187100	GT	3	6	60763	60768	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NT_187100	AT	3	6	61383	61388	50 %	50 %	0 %	0 %	409249977
128	NT_187100	AT	3	6	61424	61429	50 %	50 %	0 %	0 %	409249977
129	NT_187100	AT	3	6	61537	61542	50 %	50 %	0 %	0 %	409249977
130	NT_187100	AT	3	6	62194	62199	50 %	50 %	0 %	0 %	409249977
131	NT_187100	AT	3	6	62992	62997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NT_187100	AT	3	6	63019	63024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NT_187100	GC	3	6	64133	64138	0 %	0 %	50 %	50 %	409249979
134	NT_187100	CT	4	8	64630	64637	0 %	50 %	0 %	50 %	409249980
135	NT_187100	CG	3	6	64837	64842	0 %	0 %	50 %	50 %	409249980
136	NT_187100	GC	3	6	65786	65791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NT_187100	CG	3	6	66798	66803	0 %	0 %	50 %	50 %	409249981
138	NT_187100	GC	3	6	67122	67127	0 %	0 %	50 %	50 %	409249981
139	NT_187100	GC	3	6	67830	67835	0 %	0 %	50 %	50 %	409249982
140	NT_187100	CG	3	6	68006	68011	0 %	0 %	50 %	50 %	409249982
141	NT_187100	GT	3	6	68544	68549	0 %	50 %	50 %	0 %	409249982
142	NT_187100	AG	3	6	70035	70040	50 %	0 %	50 %	0 %	409249984
143	NT_187100	CG	3	6	70504	70509	0 %	0 %	50 %	50 %	409249985
144	NT_187100	GC	4	8	70622	70629	0 %	0 %	50 %	50 %	409249985
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202	NT_187100	CT	3	6	106105	106110	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.