MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 1492

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187100	CAC	2	6	22	27	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NT_187100	TGC	2	6	43	48	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NT_187100	ATT	2	6	70	75	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187100	CTC	2	6	87	92	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NT_187100	CAT	2	6	256	261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NT_187100	CGC	2	6	273	278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NT_187100	AAT	2	6	372	377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249915
8	NT_187100	CAT	2	6	468	473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249915
9	NT_187100	TCT	2	6	475	480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249915
10	NT_187100	GAT	2	6	570	575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249915
11	NT_187100	CGC	2	6	581	586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249915
12	NT_187100	TGA	2	6	598	603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249915
13	NT_187100	GTG	2	6	639	644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249915
14	NT_187100	CAC	2	6	714	719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249915
15	NT_187100	TCA	2	6	899	904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249915
16	NT_187100	CGG	2	6	962	967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249915
17	NT_187100	AGA	2	6	1018	1023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249915
18	NT_187100	GCA	2	6	1268	1273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249916
19	NT_187100	ATA	2	6	1346	1351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249916
20	NT_187100	GAT	2	6	1517	1522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249916
21	NT_187100	ATC	2	6	1523	1528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249916
22	NT_187100	TCA	2	6	1588	1593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249916
23	NT_187100	AAT	2	6	1718	1723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249916
24	NT_187100	TCA	2	6	1895	1900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249917
25	NT_187100	TAA	2	6	1983	1988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249917
26	NT_187100	AGG	2	6	2067	2072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249917
27	NT_187100	CGA	2	6	2165	2170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249917
28	NT_187100	ATG	2	6	2372	2377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249917
29	NT_187100	GCA	2	6	2388	2393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249917
30	NT_187100	GAT	2	6	2437	2442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249917
31	NT_187100	GCG	2	6	2665	2670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249917
32	NT_187100	TTG	2	6	2858	2863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249918
33	NT_187100	GAA	4	12	3223	3234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249918
34	NT_187100	CCG	2	6	3275	3280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249918
35	NT_187100	TTG	2	6	3289	3294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249918
36	NT_187100	CAG	2	6	3316	3321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249918
37	NT_187100	CCG	2	6	3362	3367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249918
38	NT_187100	TTG	2	6	3472	3477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249918
39	NT_187100	CAA	2	6	3520	3525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249918
40	NT_187100	ATC	2	6	3569	3574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249918
41	NT_187100	CTA	2	6	3621	3626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249918
42	NT_187100	CCG	2	6	3659	3664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249918
43	NT_187100	TCA	2	6	3693	3698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249918
44	NT_187100	AGC	2	6	3709	3714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249918
45	NT_187100	AGG	2	6	3801	3806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249918
46	NT_187100	TGT	2	6	3821	3826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249918
47	NT_187100	CGA	2	6	3880	3885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NT_187100	TGC	2	6	4104	4109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249919
49	NT_187100	TGC	2	6	4137	4142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249919
50	NT_187100	CGT	2	6	4171	4176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249919
51	NT_187100	GCT	2	6	4190	4195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249919
52	NT_187100	GGA	2	6	4312	4317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249919
53	NT_187100	TAT	2	6	4348	4353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249919
54	NT_187100	CCG	2	6	4507	4512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249919
55	NT_187100	CGA	2	6	4516	4521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249919
56	NT_187100	AGA	2	6	4555	4560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249919
57	NT_187100	TAA	2	6	4840	4845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249919
58	NT_187100	GAA	3	9	4922	4930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249919
59	NT_187100	AAG	2	6	4940	4945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249919
60	NT_187100	GTC	2	6	5011	5016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NT_187100	GCG	2	6	5049	5054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NT_187100	ATT	2	6	5079	5084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249920
63	NT_187100	TTC	2	6	5119	5124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249920
64	NT_187100	CAG	2	6	5266	5271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249920
65	NT_187100	TTC	2	6	5335	5340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249920
66	NT_187100	CAG	4	12	5346	5357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249920
67	NT_187100	TCT	2	6	5363	5368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249920
68	NT_187100	ACG	2	6	5371	5376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249920
69	NT_187100	TTC	2	6	5410	5415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249920
70	NT_187100	TGT	2	6	5463	5468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249920
71	NT_187100	GTA	2	6	5495	5500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NT_187100	GGT	2	6	5519	5524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NT_187100	TTG	2	6	5525	5530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NT_187100	TAA	2	6	5534	5539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NT_187100	TTA	2	6	5598	5603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NT_187100	ATG	2	6	5727	5732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NT_187100	TGA	2	6	5856	5861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NT_187100	TTG	2	6	5868	5873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NT_187100	GCC	2	6	6003	6008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NT_187100	ATT	2	6	6023	6028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NT_187100	CTA	2	6	6173	6178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249921
82	NT_187100	CGT	2	6	6254	6259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249921
83	NT_187100	CGG	2	6	6265	6270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249921
84	NT_187100	CGA	2	6	6275	6280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249921
85	NT_187100	GTC	2	6	6320	6325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249921
86	NT_187100	CGA	2	6	6413	6418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249921
87	NT_187100	CAG	2	6	6438	6443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249921
88	NT_187100	TGG	2	6	6568	6573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249921
89	NT_187100	TGC	2	6	6616	6621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249921
90	NT_187100	GGT	2	6	6662	6667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249921
91	NT_187100	GGA	2	6	6725	6730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249921
92	NT_187100	ATT	2	6	6825	6830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NT_187100	CCT	2	6	6835	6840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NT_187100	GAT	2	6	6872	6877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NT_187100	ACG	2	6	7013	7018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249922
96	NT_187100	GTA	2	6	7060	7065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249922
97	NT_187100	CAG	2	6	7072	7077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249922
98	NT_187100	CAG	2	6	7252	7257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249922
99	NT_187100	GCG	2	6	7271	7276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249922
100	NT_187100	GGT	2	6	7305	7310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249922
101	NT_187100	ACG	2	6	7327	7332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249922
102	NT_187100	CAG	2	6	7417	7422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249922
103	NT_187100	CAG	2	6	7603	7608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249922
104	NT_187100	ACC	2	6	7696	7701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249922
105	NT_187100	TCG	2	6	7808	7813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249922
106	NT_187100	GTG	3	9	7856	7864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249922
107	NT_187100	TTC	2	6	7945	7950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249922
108	NT_187100	CCG	2	6	8012	8017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249922
109	NT_187100	GAT	2	6	8026	8031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249922
110	NT_187100	GAA	2	6	8107	8112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249922
111	NT_187100	GTT	2	6	8170	8175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249922
112	NT_187100	CGG	2	6	8258	8263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249922
113	NT_187100	TTG	2	6	8327	8332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249922
114	NT_187100	ACC	2	6	8371	8376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249922
115	NT_187100	ACC	2	6	8437	8442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249922
116	NT_187100	TCA	2	6	8481	8486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249922
117	NT_187100	CTT	2	6	8595	8600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249922
118	NT_187100	TCA	2	6	8666	8671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249922
119	NT_187100	TGG	2	6	8700	8705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249922
120	NT_187100	CGA	2	6	8757	8762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249922
121	NT_187100	AGC	2	6	8764	8769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249922
122	NT_187100	GCA	2	6	8826	8831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249922
123	NT_187100	GCC	2	6	8836	8841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249922
124	NT_187100	CAT	2	6	8868	8873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249922
125	NT_187100	CAA	2	6	8883	8888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249922
126	NT_187100	ACA	2	6	8891	8896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249922
127	NT_187100	TCA	2	6	8981	8986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249922
128	NT_187100	GTG	2	6	9097	9102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249922
129	NT_187100	CTT	2	6	9216	9221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249922
130	NT_187100	GAT	2	6	9244	9249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249922
131	NT_187100	AAT	2	6	9328	9333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249922
132	NT_187100	GTC	2	6	9370	9375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249922
133	NT_187100	CGC	2	6	9387	9392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249922
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135	NT_187100	ATC	2	6	9684	9689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NT_187100	CGA	2	6	9716	9721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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138	NT_187100	CAG	2	6	9910	9915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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150	NT_187100	TTA	2	6	10920	10925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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153	NT_187100	ATT	2	6	11012	11017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NT_187100	TTA	2	6	11024	11029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NT_187100	GTT	2	6	11030	11035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NT_187100	AAT	2	6	11063	11068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NT_187100	GAG	2	6	11128	11133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
158	NT_187100	ATA	2	6	11160	11165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249924
159	NT_187100	AGA	2	6	11301	11306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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162	NT_187100	CGT	2	6	11374	11379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
163	NT_187100	CGA	2	6	11389	11394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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252	NT_187100	CTT	2	6	17192	17197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
253	NT_187100	GTC	2	6	17227	17232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249930
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259	NT_187100	ATT	2	6	17663	17668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249930
260	NT_187100	TCA	2	6	17677	17682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249930
261	NT_187100	TGA	2	6	17715	17720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249930
262	NT_187100	ACG	2	6	17771	17776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249930
263	NT_187100	CGC	2	6	17838	17843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249930
264	NT_187100	CGC	2	6	17847	17852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249930
265	NT_187100	AGC	2	6	17936	17941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249930
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267	NT_187100	ACC	2	6	18206	18211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249931
268	NT_187100	AAC	2	6	18275	18280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249931
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270	NT_187100	CTC	2	6	18295	18300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249931
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275	NT_187100	ATA	2	6	18821	18826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249932
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277	NT_187100	GCA	2	6	18867	18872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249932
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279	NT_187100	ATA	2	6	19028	19033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249932
280	NT_187100	CCA	2	6	19191	19196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249932
281	NT_187100	ATC	2	6	19232	19237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249932
282	NT_187100	CAT	2	6	19333	19338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249932
283	NT_187100	GCC	2	6	19340	19345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249932
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286	NT_187100	GCG	2	6	19415	19420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249932
287	NT_187100	GCC	2	6	19453	19458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249932
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290	NT_187100	GAT	2	6	19762	19767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249932
291	NT_187100	GAT	2	6	19789	19794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249932
292	NT_187100	AAC	2	6	19796	19801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249932
293	NT_187100	CAC	2	6	19897	19902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249932
294	NT_187100	GTT	2	6	19947	19952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
295	NT_187100	GTA	2	6	20070	20075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249933
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380	NT_187100	CTC	2	6	25659	25664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249943
381	NT_187100	CAT	3	9	25700	25708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249943
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