MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 2219

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NT_187100	A	6	6	95982	95987	100 %	0 %	0 %	0 %	409250014
2002	NT_187100	ATT	2	6	95998	96003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250014
2003	NT_187100	TCCT	2	8	96013	96020	0 %	50 %	0 %	50 %	409250014
2004	NT_187100	ATC	2	6	96079	96084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2005	NT_187100	AGA	2	6	96096	96101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2006	NT_187100	AGA	2	6	96168	96173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2007	NT_187100	CG	3	6	96177	96182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2008	NT_187100	TTG	2	6	96195	96200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2009	NT_187100	ATG	2	6	96243	96248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2010	NT_187100	A	6	6	96270	96275	100 %	0 %	0 %	0 %	409250015
2011	NT_187100	CTG	2	6	96288	96293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250015
2012	NT_187100	GGT	2	6	96317	96322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250015
2013	NT_187100	CG	4	8	96325	96332	0 %	0 %	50 %	50 %	409250015
2014	NT_187100	CGG	2	6	96338	96343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250015
2015	NT_187100	TATG	2	8	96389	96396	25 %	50 %	25 %	0 %	409250015
2016	NT_187100	CTG	2	6	96444	96449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250015
2017	NT_187100	CGG	2	6	96476	96481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250015
2018	NT_187100	TCG	2	6	96556	96561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2019	NT_187100	TCA	2	6	96586	96591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250016
2020	NT_187100	CGCAG	2	10	96611	96620	20 %	0 %	40 %	40 %	409250016
2021	NT_187100	CTT	2	6	96737	96742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250016
2022	NT_187100	CGT	2	6	96836	96841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250016
2023	NT_187100	ATTG	2	8	96882	96889	25 %	50 %	25 %	0 %	409250016
2024	NT_187100	GCC	2	6	97032	97037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250016
2025	NT_187100	GCA	2	6	97088	97093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250016
2026	NT_187100	CCT	2	6	97184	97189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409250016
2027	NT_187100	GAT	2	6	97191	97196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250016
2028	NT_187100	ATA	2	6	97257	97262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250016
2029	NT_187100	TTA	2	6	97298	97303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250016
2030	NT_187100	GGT	2	6	97344	97349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250016
2031	NT_187100	GCC	2	6	97395	97400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250016
2032	NT_187100	GTC	2	6	97443	97448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250016
2033	NT_187100	ACC	2	6	97465	97470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250016
2034	NT_187100	TGAA	2	8	97552	97559	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2035	NT_187100	AGA	2	6	97614	97619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2036	NT_187100	GCC	2	6	97675	97680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250017
2037	NT_187100	CAG	2	6	97752	97757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250017
2038	NT_187100	GCG	2	6	97857	97862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250017
2039	NT_187100	TAAA	2	8	97873	97880	75 %	25 %	0 %	0 %	409250017
2040	NT_187100	TTC	2	6	97893	97898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250017
2041	NT_187100	TTC	2	6	97906	97911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250017
2042	NT_187100	TCA	2	6	97955	97960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250017
2043	NT_187100	CAT	2	6	97965	97970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250017
2044	NT_187100	GAT	2	6	98069	98074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250017
2045	NT_187100	CCA	2	6	98099	98104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250017
2046	NT_187100	TCA	2	6	98206	98211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250017
2047	NT_187100	GAT	2	6	98259	98264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250017
2048	NT_187100	GCTG	2	8	98315	98322	0 %	25 %	50 %	25 %	409250017
2049	NT_187100	AAT	2	6	98480	98485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2050	NT_187100	TGA	2	6	98499	98504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2051	NT_187100	ATTT	2	8	98532	98539	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2052	NT_187100	ATA	2	6	98594	98599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2053	NT_187100	CGC	2	6	98642	98647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250018
2054	NT_187100	AAC	2	6	98697	98702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250018
2055	NT_187100	GCA	2	6	98728	98733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250018
2056	NT_187100	GCG	2	6	98746	98751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250018
2057	NT_187100	GTC	2	6	98756	98761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250018
2058	NT_187100	GCC	2	6	98770	98775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250018
2059	NT_187100	C	6	6	98851	98856	0 %	0 %	0 %	100 %	409250018
2060	NT_187100	AAT	2	6	98900	98905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250018
2061	NT_187100	ACC	2	6	99052	99057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250018
2062	NT_187100	TC	3	6	99112	99117	0 %	50 %	0 %	50 %	409250018
2063	NT_187100	GGA	2	6	99353	99358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2064	NT_187100	GGA	2	6	99403	99408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409250019
2065	NT_187100	GAC	2	6	99508	99513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250019
2066	NT_187100	TGAA	2	8	99537	99544	50 %	25 %	25 %	0 %	409250019
2067	NT_187100	TCG	2	6	99556	99561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250019
2068	NT_187100	GCA	2	6	99571	99576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250019
2069	NT_187100	CAG	2	6	99614	99619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250019
2070	NT_187100	TCAT	2	8	99720	99727	25 %	50 %	0 %	25 %	409250019
2071	NT_187100	GGC	3	9	99839	99847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250019
2072	NT_187100	TAA	2	6	99975	99980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2073	NT_187100	ATGG	2	8	100084	100091	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2074	NT_187100	ATT	2	6	100290	100295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250020
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2076	NT_187100	TGG	2	6	100410	100415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250020
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2078	NT_187100	GCA	2	6	100476	100481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250020
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2081	NT_187100	GGC	2	6	100631	100636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250020
2082	NT_187100	GC	3	6	100635	100640	0 %	0 %	50 %	50 %	409250020
2083	NT_187100	CAG	2	6	100668	100673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250020
2084	NT_187100	GCC	2	6	100695	100700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250020
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2089	NT_187100	CGG	2	6	100924	100929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250020
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2091	NT_187100	GTG	2	6	100971	100976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250020
2092	NT_187100	GGC	2	6	101015	101020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250020
2093	NT_187100	A	6	6	101021	101026	100 %	0 %	0 %	0 %	409250020
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2096	NT_187100	A	7	7	101095	101101	100 %	0 %	0 %	0 %	409250020
2097	NT_187100	TTG	2	6	101113	101118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250020
2098	NT_187100	TGA	2	6	101143	101148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250020
2099	NT_187100	CCA	3	9	101158	101166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250020
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2101	NT_187100	AGCC	2	8	101331	101338	25 %	0 %	25 %	50 %	409250020
2102	NT_187100	AT	3	6	101371	101376	50 %	50 %	0 %	0 %	409250020
2103	NT_187100	ATA	2	6	101414	101419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250020
2104	NT_187100	T	6	6	101451	101456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2105	NT_187100	GA	3	6	101495	101500	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2106	NT_187100	GTG	2	6	101627	101632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250021
2107	NT_187100	GTGAT	2	10	101654	101663	20 %	40 %	40 %	0 %	409250021
2108	NT_187100	ACCC	2	8	101701	101708	25 %	0 %	0 %	75 %	409250021
2109	NT_187100	GCGT	2	8	101753	101760	0 %	25 %	50 %	25 %	409250021
2110	NT_187100	GCTG	2	8	101766	101773	0 %	25 %	50 %	25 %	409250021
2111	NT_187100	CG	3	6	101789	101794	0 %	0 %	50 %	50 %	409250021
2112	NT_187100	CGCTG	2	10	101825	101834	0 %	20 %	40 %	40 %	409250021
2113	NT_187100	TA	3	6	101885	101890	50 %	50 %	0 %	0 %	409250021
2114	NT_187100	AGG	2	6	101963	101968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409250021
2115	NT_187100	GCG	2	6	101987	101992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250021
2116	NT_187100	TG	3	6	102006	102011	0 %	50 %	50 %	0 %	409250021
2117	NT_187100	TCT	2	6	102084	102089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250021
2118	NT_187100	CG	3	6	102107	102112	0 %	0 %	50 %	50 %	409250021
2119	NT_187100	CGA	2	6	102219	102224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250021
2120	NT_187100	CG	3	6	102294	102299	0 %	0 %	50 %	50 %	409250021
2121	NT_187100	CAT	2	6	102306	102311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250021
2122	NT_187100	GC	3	6	102349	102354	0 %	0 %	50 %	50 %	409250021
2123	NT_187100	GGC	2	6	102433	102438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250021
2124	NT_187100	GGC	2	6	102445	102450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250021
2125	NT_187100	GGT	2	6	102502	102507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250021
2126	NT_187100	A	6	6	102573	102578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2127	NT_187100	TC	4	8	102631	102638	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2128	NT_187100	T	6	6	102694	102699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2129	NT_187100	ACG	2	6	102728	102733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2130	NT_187100	T	8	8	102753	102760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2131	NT_187100	TTA	2	6	102837	102842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250022
2132	NT_187100	CGC	2	6	102931	102936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250022
2133	NT_187100	GAA	2	6	102942	102947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250022
2134	NT_187100	CTG	2	6	102995	103000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250022
2135	NT_187100	CGC	2	6	103062	103067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250023
2136	NT_187100	ATG	2	6	103151	103156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250023
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2139	NT_187100	TGA	2	6	103530	103535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250023
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2155	NT_187100	GC	3	6	104063	104068	0 %	0 %	50 %	50 %	409250023
2156	NT_187100	TGC	2	6	104105	104110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250023
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2159	NT_187100	CGG	2	6	104193	104198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250023
2160	NT_187100	A	6	6	104200	104205	100 %	0 %	0 %	0 %	409250023
2161	NT_187100	GC	3	6	104234	104239	0 %	0 %	50 %	50 %	409250023
2162	NT_187100	ATT	2	6	104446	104451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2168	NT_187100	GCGG	2	8	104821	104828	0 %	0 %	75 %	25 %	409250024
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2188	NT_187100	CAGC	2	8	105574	105581	25 %	0 %	25 %	50 %	409250025
2189	NT_187100	CGA	2	6	105617	105622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250025
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2192	NT_187100	ATC	2	6	105851	105856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250025
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2198	NT_187100	GTCA	2	8	106064	106071	25 %	25 %	25 %	25 %	409250025
2199	NT_187100	GAT	4	12	106078	106089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250025
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2201	NT_187100	CAC	2	6	106134	106139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2202	NT_187100	GCG	2	6	106174	106179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250026
2203	NT_187100	GTA	2	6	106198	106203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250026
2204	NT_187100	T	7	7	106248	106254	0 %	100 %	0 %	0 %	409250026
2205	NT_187100	ATCTT	2	10	106267	106276	20 %	60 %	0 %	20 %	409250026
2206	NT_187100	CTG	2	6	106394	106399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250026
2207	NT_187100	CGT	2	6	106466	106471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250026
2208	NT_187100	TCTGAA	2	12	106519	106530	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	409250026
2209	NT_187100	CCT	2	6	106567	106572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409250026
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2211	NT_187100	GGA	2	6	106680	106685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2212	NT_187100	AAT	2	6	106714	106719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2213	NT_187100	AAT	2	6	106793	106798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2214	NT_187100	AAT	2	6	106805	106810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2215	NT_187100	TAT	2	6	106853	106858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2216	NT_187100	CGAA	2	8	106992	106999	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2217	NT_187100	T	7	7	107009	107015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2218	NT_187100	C	9	9	107028	107036	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2219	NT_187100	G	6	6	107040	107045	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.