MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 2219

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NT_187100	CCT	2	6	46653	46658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249963
1002	NT_187100	GGC	2	6	46690	46695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249963
1003	NT_187100	A	6	6	46709	46714	100 %	0 %	0 %	0 %	409249963
1004	NT_187100	A	6	6	46913	46918	100 %	0 %	0 %	0 %	409249963
1005	NT_187100	ATCC	2	8	46973	46980	25 %	25 %	0 %	50 %	409249963
1006	NT_187100	CTGG	2	8	46996	47003	0 %	25 %	50 %	25 %	409249963
1007	NT_187100	CGC	3	9	47007	47015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249963
1008	NT_187100	TGG	2	6	47016	47021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249963
1009	NT_187100	ATC	2	6	47158	47163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249963
1010	NT_187100	GAA	2	6	47207	47212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249963
1011	NT_187100	CTTT	2	8	47286	47293	0 %	75 %	0 %	25 %	409249963
1012	NT_187100	GC	3	6	47337	47342	0 %	0 %	50 %	50 %	409249963
1013	NT_187100	CGAC	2	8	47373	47380	25 %	0 %	25 %	50 %	409249963
1014	NT_187100	CCGG	2	8	47390	47397	0 %	0 %	50 %	50 %	409249963
1015	NT_187100	CCG	2	6	47418	47423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249963
1016	NT_187100	TGA	2	6	47499	47504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249963
1017	NT_187100	TGC	2	6	47544	47549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249963
1018	NT_187100	ATG	2	6	47607	47612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249963
1019	NT_187100	CAG	2	6	47627	47632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249963
1020	NT_187100	A	6	6	47634	47639	100 %	0 %	0 %	0 %	409249963
1021	NT_187100	CGC	2	6	47640	47645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249963
1022	NT_187100	GGC	2	6	47695	47700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249963
1023	NT_187100	GTG	2	6	47729	47734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249963
1024	NT_187100	TGAT	2	8	47850	47857	25 %	50 %	25 %	0 %	409249963
1025	NT_187100	GCA	2	6	47922	47927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249963
1026	NT_187100	TAC	2	6	47978	47983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249963
1027	NT_187100	CAGG	2	8	48057	48064	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1028	NT_187100	CTTA	3	12	48086	48097	25 %	50 %	0 %	25 %	409249964
1029	NT_187100	ATT	2	6	48141	48146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249964
1030	NT_187100	CGA	2	6	48179	48184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249964
1031	NT_187100	ATT	2	6	48225	48230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249964
1032	NT_187100	CAG	2	6	48234	48239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249964
1033	NT_187100	CGG	2	6	48302	48307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249964
1034	NT_187100	TGA	2	6	48319	48324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249964
1035	NT_187100	TTA	2	6	48376	48381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249964
1036	NT_187100	GGT	2	6	48410	48415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249964
1037	NT_187100	CTT	2	6	48434	48439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249964
1038	NT_187100	TTC	2	6	48603	48608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249964
1039	NT_187100	CCA	2	6	48614	48619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249964
1040	NT_187100	GTC	2	6	48710	48715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NT_187100	GGC	2	6	48750	48755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NT_187100	TTAT	2	8	48852	48859	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NT_187100	GCC	2	6	48906	48911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249965
1044	NT_187100	TGGCAG	2	12	48951	48962	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	409249965
1045	NT_187100	TGG	2	6	48978	48983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249965
1046	NT_187100	GC	3	6	49088	49093	0 %	0 %	50 %	50 %	409249965
1047	NT_187100	TCG	2	6	49132	49137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249965
1048	NT_187100	A	6	6	49204	49209	100 %	0 %	0 %	0 %	409249965
1049	NT_187100	AC	3	6	49358	49363	50 %	0 %	0 %	50 %	409249965
1050	NT_187100	CTGG	2	8	49553	49560	0 %	25 %	50 %	25 %	409249965
1051	NT_187100	GCC	2	6	49586	49591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249965
1052	NT_187100	GAA	2	6	49596	49601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249965
1053	NT_187100	ATC	2	6	49669	49674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NT_187100	GGCG	2	8	49679	49686	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1055	NT_187100	CATTTC	2	12	49687	49698	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NT_187100	GC	3	6	49848	49853	0 %	0 %	50 %	50 %	409249966
1057	NT_187100	CTG	2	6	49883	49888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249966
1058	NT_187100	GTATC	2	10	49900	49909	20 %	40 %	20 %	20 %	409249966
1059	NT_187100	TTGC	2	8	49916	49923	0 %	50 %	25 %	25 %	409249966
1060	NT_187100	TGGC	2	8	49951	49958	0 %	25 %	50 %	25 %	409249966
1061	NT_187100	TCG	2	6	50075	50080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249966
1062	NT_187100	AAT	2	6	50091	50096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249966
1063	NT_187100	GTT	2	6	50110	50115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249967
1064	NT_187100	CTG	2	6	50120	50125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249967
1065	NT_187100	GGT	2	6	50148	50153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249967
1066	NT_187100	CAA	2	6	50174	50179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249967
1067	NT_187100	CG	3	6	50208	50213	0 %	0 %	50 %	50 %	409249967
1068	NT_187100	CTG	2	6	50237	50242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249967
1069	NT_187100	CAA	2	6	50249	50254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249967
1070	NT_187100	TCA	2	6	50374	50379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249967
1071	NT_187100	GCC	2	6	50456	50461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249967
1072	NT_187100	CG	3	6	50474	50479	0 %	0 %	50 %	50 %	409249967
1073	NT_187100	CGA	2	6	50503	50508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249967
1074	NT_187100	CAG	2	6	50534	50539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249967
1075	NT_187100	CAG	2	6	50666	50671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249967
1076	NT_187100	ACG	2	6	50679	50684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249967
1077	NT_187100	CG	3	6	50693	50698	0 %	0 %	50 %	50 %	409249967
1078	NT_187100	A	6	6	50711	50716	100 %	0 %	0 %	0 %	409249967
1079	NT_187100	GCC	2	6	50720	50725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249967
1080	NT_187100	ATG	2	6	50756	50761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249967
1081	NT_187100	TGC	2	6	50862	50867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249967
1082	NT_187100	GAG	2	6	50930	50935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249967
1083	NT_187100	ACC	2	6	51072	51077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249967
1084	NT_187100	GAA	2	6	51089	51094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249967
1085	NT_187100	GCGA	2	8	51097	51104	25 %	0 %	50 %	25 %	409249967
1086	NT_187100	GTCC	2	8	51213	51220	0 %	25 %	25 %	50 %	409249967
1087	NT_187100	AGT	2	6	51267	51272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249967
1088	NT_187100	A	7	7	51277	51283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NT_187100	ACA	2	6	51298	51303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NT_187100	TGA	2	6	51308	51313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1091	NT_187100	ACG	2	6	51327	51332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NT_187100	CGG	2	6	51340	51345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NT_187100	CAT	2	6	51441	51446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NT_187100	AAG	2	6	51448	51453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1095	NT_187100	TCT	2	6	51480	51485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249968
1096	NT_187100	TCTT	2	8	51664	51671	0 %	75 %	0 %	25 %	409249968
1097	NT_187100	CGC	2	6	51716	51721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249968
1098	NT_187100	ATG	2	6	51777	51782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249968
1099	NT_187100	GC	3	6	51789	51794	0 %	0 %	50 %	50 %	409249968
1100	NT_187100	CGG	2	6	51901	51906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249968
1101	NT_187100	GC	3	6	51924	51929	0 %	0 %	50 %	50 %	409249968
1102	NT_187100	GCA	2	6	51935	51940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249968
1103	NT_187100	GCAG	2	8	52041	52048	25 %	0 %	50 %	25 %	409249968
1104	NT_187100	AGGC	2	8	52051	52058	25 %	0 %	50 %	25 %	409249968
1105	NT_187100	CCG	2	6	52096	52101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249968
1106	NT_187100	GCC	2	6	52123	52128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249968
1107	NT_187100	GAA	2	6	52250	52255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249969
1108	NT_187100	ATGA	2	8	52361	52368	50 %	25 %	25 %	0 %	409249969
1109	NT_187100	GGC	2	6	52387	52392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249969
1110	NT_187100	GAA	2	6	52399	52404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249969
1111	NT_187100	A	6	6	52403	52408	100 %	0 %	0 %	0 %	409249969
1112	NT_187100	ATT	2	6	52439	52444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249969
1113	NT_187100	GGC	2	6	52517	52522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249969
1114	NT_187100	TAT	2	6	52609	52614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NT_187100	ATT	2	6	52644	52649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249970
1116	NT_187100	CGC	2	6	52671	52676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249970
1117	NT_187100	CCG	2	6	52680	52685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249970
1118	NT_187100	CGC	2	6	52686	52691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249970
1119	NT_187100	CCGT	2	8	52712	52719	0 %	25 %	25 %	50 %	409249970
1120	NT_187100	GCC	2	6	52729	52734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249970
1121	NT_187100	CAGCA	2	10	52825	52834	40 %	0 %	20 %	40 %	409249970
1122	NT_187100	T	7	7	52842	52848	0 %	100 %	0 %	0 %	409249970
1123	NT_187100	ATA	2	6	52862	52867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249970
1124	NT_187100	CT	3	6	52868	52873	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1125	NT_187100	ACTATA	2	12	52904	52915	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1126	NT_187100	TAAAA	2	10	52918	52927	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NT_187100	ACA	2	6	53036	53041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NT_187100	AG	4	8	53078	53085	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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