MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 1359

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NT_187094	GCC	2	6	48749	48754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1002	NT_187094	TGG	2	6	48789	48794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1003	NT_187094	CAG	2	6	48796	48801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NT_187094	GGC	2	6	48856	48861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NT_187094	CA	3	6	48913	48918	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1006	NT_187094	GCAG	2	8	49009	49016	25 %	0 %	50 %	25 %	409249753
1007	NT_187094	GGT	2	6	49018	49023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249753
1008	NT_187094	GGT	2	6	49091	49096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249753
1009	NT_187094	GCT	2	6	49190	49195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249753
1010	NT_187094	A	6	6	49241	49246	100 %	0 %	0 %	0 %	409249753
1011	NT_187094	CGG	2	6	49278	49283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249753
1012	NT_187094	TGC	2	6	49308	49313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249753
1013	NT_187094	GGC	2	6	49321	49326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249753
1014	NT_187094	GCC	2	6	49346	49351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249753
1015	NT_187094	CAA	2	6	49380	49385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249753
1016	NT_187094	GC	3	6	49421	49426	0 %	0 %	50 %	50 %	409249753
1017	NT_187094	CCGGG	2	10	49507	49516	0 %	0 %	60 %	40 %	409249753
1018	NT_187094	ATG	2	6	49547	49552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249753
1019	NT_187094	CGG	2	6	49555	49560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249753
1020	NT_187094	GCG	2	6	49580	49585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249753
1021	NT_187094	GAAA	2	8	49621	49628	75 %	0 %	25 %	0 %	409249753
1022	NT_187094	GAG	2	6	49631	49636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249753
1023	NT_187094	TCGC	2	8	49709	49716	0 %	25 %	25 %	50 %	409249753
1024	NT_187094	GCA	2	6	49732	49737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249753
1025	NT_187094	GGT	2	6	49762	49767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249753
1026	NT_187094	GCAG	2	8	49789	49796	25 %	0 %	50 %	25 %	409249753
1027	NT_187094	CAGT	2	8	49844	49851	25 %	25 %	25 %	25 %	409249753
1028	NT_187094	GAT	2	6	49886	49891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249753
1029	NT_187094	GAA	2	6	49980	49985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249753
1030	NT_187094	TGC	2	6	49993	49998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249753
1031	NT_187094	CGGG	2	8	50039	50046	0 %	0 %	75 %	25 %	409249753
1032	NT_187094	GCG	2	6	50102	50107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249753
1033	NT_187094	CGGG	2	8	50137	50144	0 %	0 %	75 %	25 %	409249753
1034	NT_187094	A	6	6	50160	50165	100 %	0 %	0 %	0 %	409249753
1035	NT_187094	A	6	6	50181	50186	100 %	0 %	0 %	0 %	409249753
1036	NT_187094	CG	4	8	50188	50195	0 %	0 %	50 %	50 %	409249753
1037	NT_187094	TCC	2	6	50222	50227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249753
1038	NT_187094	CAG	2	6	50243	50248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249753
1039	NT_187094	GAAC	2	8	50254	50261	50 %	0 %	25 %	25 %	409249753
1040	NT_187094	CTG	2	6	50288	50293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249753
1041	NT_187094	GCAG	2	8	50305	50312	25 %	0 %	50 %	25 %	409249753
1042	NT_187094	AGA	2	6	50325	50330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249753
1043	NT_187094	CGC	2	6	50356	50361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249753
1044	NT_187094	GC	3	6	50411	50416	0 %	0 %	50 %	50 %	409249753
1045	NT_187094	AACG	2	8	50474	50481	50 %	0 %	25 %	25 %	409249753
1046	NT_187094	A	6	6	50486	50491	100 %	0 %	0 %	0 %	409249753
1047	NT_187094	TAC	2	6	50525	50530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249753
1048	NT_187094	ACG	2	6	50532	50537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249753
1049	NT_187094	CAGC	2	8	50563	50570	25 %	0 %	25 %	50 %	409249753
1050	NT_187094	GCC	2	6	50597	50602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249753
1051	NT_187094	A	6	6	50622	50627	100 %	0 %	0 %	0 %	409249753
1052	NT_187094	AGC	2	6	50643	50648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249753
1053	NT_187094	CAG	2	6	50660	50665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249753
1054	NT_187094	A	6	6	50687	50692	100 %	0 %	0 %	0 %	409249753
1055	NT_187094	CGG	2	6	50697	50702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249753
1056	NT_187094	GAA	2	6	50806	50811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249753
1057	NT_187094	CCAG	2	8	50829	50836	25 %	0 %	25 %	50 %	409249753
1058	NT_187094	GAA	2	6	50846	50851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249753
1059	NT_187094	GCA	3	9	50863	50871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249753
1060	NT_187094	AAC	2	6	50958	50963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249753
1061	NT_187094	AGC	2	6	50967	50972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249753
1062	NT_187094	TGC	2	6	51097	51102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249753
1063	NT_187094	G	6	6	51157	51162	0 %	0 %	100 %	0 %	409249753
1064	NT_187094	GGCA	2	8	51169	51176	25 %	0 %	50 %	25 %	409249753
1065	NT_187094	CAG	2	6	51366	51371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249753
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1067	NT_187094	CGG	2	6	51433	51438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249753
1068	NT_187094	CAG	2	6	51450	51455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249753
1069	NT_187094	TCAG	2	8	51459	51466	25 %	25 %	25 %	25 %	409249753
1070	NT_187094	GGC	2	6	51517	51522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249753
1071	NT_187094	TCG	2	6	51562	51567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249753
1072	NT_187094	GCA	2	6	51596	51601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249753
1073	NT_187094	CGC	2	6	51672	51677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249753
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1075	NT_187094	GCA	3	9	51730	51738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249753
1076	NT_187094	CGG	2	6	51748	51753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249753
1077	NT_187094	GAT	2	6	51774	51779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249753
1078	NT_187094	GGT	2	6	51840	51845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249754
1079	NT_187094	AGC	2	6	51866	51871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249754
1080	NT_187094	AAT	2	6	51889	51894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249754
1081	NT_187094	A	6	6	51901	51906	100 %	0 %	0 %	0 %	409249754
1082	NT_187094	GGA	2	6	51933	51938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249754
1083	NT_187094	ACA	2	6	52069	52074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249754
1084	NT_187094	CGAT	2	8	52123	52130	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1085	NT_187094	CTG	3	9	52153	52161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NT_187094	AAT	2	6	52183	52188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NT_187094	A	7	7	52190	52196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NT_187094	GCA	2	6	52269	52274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249755
1089	NT_187094	GGCT	2	8	52323	52330	0 %	25 %	50 %	25 %	409249755
1090	NT_187094	TACA	2	8	52409	52416	50 %	25 %	0 %	25 %	409249755
1091	NT_187094	TAA	2	6	52430	52435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249755
1092	NT_187094	AGGT	2	8	52447	52454	25 %	25 %	50 %	0 %	409249755
1093	NT_187094	CTT	2	6	52473	52478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249755
1094	NT_187094	TGA	2	6	52522	52527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249755
1095	NT_187094	GCA	2	6	52533	52538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249755
1096	NT_187094	T	6	6	52774	52779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NT_187094	CCA	2	6	52857	52862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249756
1098	NT_187094	ATC	2	6	52908	52913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249756
1099	NT_187094	GTG	2	6	52951	52956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249756
1100	NT_187094	T	6	6	53056	53061	0 %	100 %	0 %	0 %	409249756
1101	NT_187094	TCC	2	6	53075	53080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249756
1102	NT_187094	TG	3	6	53138	53143	0 %	50 %	50 %	0 %	409249756
1103	NT_187094	GAG	2	6	53185	53190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249756
1104	NT_187094	AAC	2	6	53305	53310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249756
1105	NT_187094	TGA	2	6	53311	53316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249756
1106	NT_187094	T	6	6	53365	53370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NT_187094	TAA	2	6	53391	53396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NT_187094	ATAA	2	8	53418	53425	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NT_187094	TC	3	6	53433	53438	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1110	NT_187094	AT	3	6	53439	53444	50 %	50 %	0 %	0 %	409249757
1111	NT_187094	ACC	2	6	53476	53481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249757
1112	NT_187094	TCT	2	6	53552	53557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249757
1113	NT_187094	CGAAC	2	10	53562	53571	40 %	0 %	20 %	40 %	409249757
1114	NT_187094	TACAGG	2	12	53624	53635	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	409249757
1115	NT_187094	CCCG	2	8	53666	53673	0 %	0 %	25 %	75 %	409249757
1116	NT_187094	GTT	2	6	53680	53685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249757
1117	NT_187094	TGGTC	2	10	53697	53706	0 %	40 %	40 %	20 %	409249757
1118	NT_187094	GGA	2	6	53718	53723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249757
1119	NT_187094	TCG	2	6	53735	53740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249757
1120	NT_187094	AGG	2	6	53828	53833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249757
1121	NT_187094	GC	3	6	53839	53844	0 %	0 %	50 %	50 %	409249757
1122	NT_187094	TCA	2	6	53875	53880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249757
1123	NT_187094	ATT	2	6	53890	53895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249757
1124	NT_187094	ACG	2	6	53993	53998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249757
1125	NT_187094	GCCC	2	8	53999	54006	0 %	0 %	25 %	75 %	409249757
1126	NT_187094	CAA	2	6	54123	54128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249757
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1128	NT_187094	GGA	2	6	54294	54299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249758
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1359	NT_187094	T	6	6	64668	64673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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