MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 70

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187088	GGAGT	2	10	564	573	20 %	20 %	60 %	0 %	409249476
2	NT_187088	TATCT	2	10	634	643	20 %	60 %	0 %	20 %	409249476
3	NT_187088	CACAA	2	10	801	810	60 %	0 %	0 %	40 %	409249476
4	NT_187088	AGTCA	2	10	1440	1449	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NT_187088	CCCGC	2	10	2419	2428	0 %	0 %	20 %	80 %	409249479
6	NT_187088	CGCTA	2	10	5291	5300	20 %	20 %	20 %	40 %	409249482
7	NT_187088	CCCAT	2	10	8942	8951	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
8	NT_187088	CATCG	2	10	9738	9747	20 %	20 %	20 %	40 %	409249486
9	NT_187088	ACGTT	2	10	10170	10179	20 %	40 %	20 %	20 %	409249487
10	NT_187088	ATCAC	2	10	12179	12188	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
11	NT_187088	TACTT	2	10	12192	12201	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NT_187088	GCGAT	2	10	12798	12807	20 %	20 %	40 %	20 %	409249489
13	NT_187088	GATCT	2	10	13391	13400	20 %	40 %	20 %	20 %	409249489
14	NT_187088	GCGCT	2	10	16309	16318	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NT_187088	GGCGT	2	10	17073	17082	0 %	20 %	60 %	20 %	409249494
16	NT_187088	ACCAT	2	10	20750	20759	40 %	20 %	0 %	40 %	409249498
17	NT_187088	CAGGG	2	10	21350	21359	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NT_187088	TTCCA	2	10	22105	22114	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NT_187088	TCCGC	2	10	25141	25150	0 %	20 %	20 %	60 %	409249503
20	NT_187088	TTAAT	2	10	25512	25521	40 %	60 %	0 %	0 %	409249503
21	NT_187088	GCCGT	2	10	26408	26417	0 %	20 %	40 %	40 %	409249503
22	NT_187088	GCTCC	2	10	27421	27430	0 %	20 %	20 %	60 %	409249505
23	NT_187088	TCTGC	2	10	33217	33226	0 %	40 %	20 %	40 %	409249512
24	NT_187088	CAAAC	2	10	33538	33547	60 %	0 %	0 %	40 %	409249512
25	NT_187088	GCGAG	2	10	33739	33748	20 %	0 %	60 %	20 %	409249512
26	NT_187088	ACGCG	2	10	35564	35573	20 %	0 %	40 %	40 %	409249512
27	NT_187088	TAACA	2	10	35973	35982	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NT_187088	GTCAC	2	10	38553	38562	20 %	20 %	20 %	40 %	409249515
29	NT_187088	CAGAG	2	10	40284	40293	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NT_187088	GCCGA	2	10	41134	41143	20 %	0 %	40 %	40 %	409249517
31	NT_187088	ACGAT	2	10	42088	42097	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NT_187088	TTTTC	2	10	42329	42338	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NT_187088	TATGT	2	10	43063	43072	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187088	AAACG	2	10	43972	43981	60 %	0 %	20 %	20 %	409249519
35	NT_187088	CAAAA	2	10	44439	44448	80 %	0 %	0 %	20 %	409249519
36	NT_187088	TGGTT	2	10	44512	44521	0 %	60 %	40 %	0 %	409249519
37	NT_187088	TTTTG	2	10	45016	45025	0 %	80 %	20 %	0 %	409249520
38	NT_187088	AAATT	2	10	45261	45270	60 %	40 %	0 %	0 %	409249520
39	NT_187088	GTTCT	2	10	46424	46433	0 %	60 %	20 %	20 %	409249521
40	NT_187088	ATTCA	2	10	46822	46831	40 %	40 %	0 %	20 %	409249521
41	NT_187088	GCGCT	2	10	46869	46878	0 %	20 %	40 %	40 %	409249521
42	NT_187088	GCGCT	2	10	48143	48152	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
43	NT_187088	CTTTC	2	10	49882	49891	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NT_187088	TATAT	2	10	50215	50224	40 %	60 %	0 %	0 %	409249525
45	NT_187088	TCCAG	2	10	50715	50724	20 %	20 %	20 %	40 %	409249525
46	NT_187088	CGCAG	2	10	52128	52137	20 %	0 %	40 %	40 %	409249527
47	NT_187088	CCAGA	2	10	53161	53170	40 %	0 %	20 %	40 %	409249528
48	NT_187088	CATGG	2	10	58094	58103	20 %	20 %	40 %	20 %	409249530
49	NT_187088	AACGA	2	10	61813	61822	60 %	0 %	20 %	20 %	409249533
50	NT_187088	GGCAT	2	10	61911	61920	20 %	20 %	40 %	20 %	409249533
51	NT_187088	TCCGC	2	10	62938	62947	0 %	20 %	20 %	60 %	409249534
52	NT_187088	TGTCC	2	10	63477	63486	0 %	40 %	20 %	40 %	409249535
53	NT_187088	TGGTC	2	10	63517	63526	0 %	40 %	40 %	20 %	409249535
54	NT_187088	CGCGG	2	10	64195	64204	0 %	0 %	60 %	40 %	409249536
55	NT_187088	CGGAT	2	10	64630	64639	20 %	20 %	40 %	20 %	409249536
56	NT_187088	CCGGG	2	10	64654	64663	0 %	0 %	60 %	40 %	409249536
57	NT_187088	CCAGC	2	10	65314	65323	20 %	0 %	20 %	60 %	409249537
58	NT_187088	CCAGG	2	10	65977	65986	20 %	0 %	40 %	40 %	409249537
59	NT_187088	TGGCG	2	10	66608	66617	0 %	20 %	60 %	20 %	409249538
60	NT_187088	CGCGG	2	10	69316	69325	0 %	0 %	60 %	40 %	409249540
61	NT_187088	GATTT	2	10	70542	70551	20 %	60 %	20 %	0 %	409249541
62	NT_187088	TCATC	2	10	70564	70573	20 %	40 %	0 %	40 %	409249541
63	NT_187088	TGAAT	2	10	70646	70655	40 %	40 %	20 %	0 %	409249541
64	NT_187088	GTTTT	2	10	71059	71068	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NT_187088	ACTGT	2	10	72146	72155	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NT_187088	GCGTG	2	10	74519	74528	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
67	NT_187088	GCCCG	2	10	74628	74637	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
68	NT_187088	CGCAC	2	10	76553	76562	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
69	NT_187088	GGAGG	2	10	77415	77424	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
70	NT_187088	GTGGC	2	10	77947	77956	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.