MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 1671

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NT_187088	TCATC	2	10	70564	70573	20 %	40 %	0 %	40 %	409249541
1502	NT_187088	CGT	2	6	70585	70590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249541
1503	NT_187088	ATG	2	6	70597	70602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249541
1504	NT_187088	TGAAT	2	10	70646	70655	40 %	40 %	20 %	0 %	409249541
1505	NT_187088	TCA	2	6	70686	70691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249541
1506	NT_187088	CCGT	2	8	70770	70777	0 %	25 %	25 %	50 %	409249541
1507	NT_187088	ATC	2	6	70848	70853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249541
1508	NT_187088	T	7	7	70871	70877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NT_187088	TAA	2	6	70908	70913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NT_187088	T	6	6	70945	70950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NT_187088	TTC	2	6	70985	70990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NT_187088	GTT	2	6	71014	71019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1513	NT_187088	AATG	2	8	71049	71056	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1514	NT_187088	GTTTT	2	10	71059	71068	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1515	NT_187088	T	6	6	71065	71070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NT_187088	TTGA	2	8	71073	71080	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1517	NT_187088	TA	3	6	71081	71086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NT_187088	T	6	6	71091	71096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NT_187088	CTAT	2	8	71121	71128	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1520	NT_187088	ATTT	2	8	71129	71136	25 %	75 %	0 %	0 %	409249542
1521	NT_187088	TCA	2	6	71150	71155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249542
1522	NT_187088	TAA	2	6	71157	71162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249542
1523	NT_187088	GATGGT	2	12	71190	71201	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	409249542
1524	NT_187088	A	7	7	71203	71209	100 %	0 %	0 %	0 %	409249542
1525	NT_187088	ATA	2	6	71218	71223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249542
1526	NT_187088	AGTA	2	8	71234	71241	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1527	NT_187088	AAAT	2	8	71259	71266	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NT_187088	AT	3	6	71271	71276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NT_187088	TCA	2	6	71308	71313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NT_187088	AG	3	6	71362	71367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1531	NT_187088	ATGT	2	8	71430	71437	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1532	NT_187088	CA	3	6	71661	71666	50 %	0 %	0 %	50 %	409249543
1533	NT_187088	GCT	2	6	71707	71712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249543
1534	NT_187088	TGC	2	6	71739	71744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249543
1535	NT_187088	TGG	2	6	71762	71767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249543
1536	NT_187088	CAC	2	6	71803	71808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249543
1537	NT_187088	GC	4	8	71968	71975	0 %	0 %	50 %	50 %	409249543
1538	NT_187088	A	7	7	72051	72057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NT_187088	TTA	2	6	72083	72088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NT_187088	CGG	2	6	72115	72120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NT_187088	AGGC	2	8	72133	72140	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1542	NT_187088	ACTGT	2	10	72146	72155	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1543	NT_187088	CGC	2	6	72160	72165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1544	NT_187088	CAGC	2	8	72334	72341	25 %	0 %	25 %	50 %	409249544
1545	NT_187088	ACG	2	6	72462	72467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249544
1546	NT_187088	CGCC	2	8	72497	72504	0 %	0 %	25 %	75 %	409249544
1547	NT_187088	GC	3	6	72511	72516	0 %	0 %	50 %	50 %	409249544
1548	NT_187088	GGC	2	6	72691	72696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249544
1549	NT_187088	GGA	2	6	72697	72702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249544
1550	NT_187088	CGA	2	6	72739	72744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249544
1551	NT_187088	CTC	2	6	72877	72882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249544
1552	NT_187088	TAA	2	6	73054	73059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249544
1553	NT_187088	GGT	2	6	73162	73167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249544
1554	NT_187088	CAGC	2	8	73186	73193	25 %	0 %	25 %	50 %	409249544
1555	NT_187088	GGC	3	9	73198	73206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249544
1556	NT_187088	GCTCAG	2	12	73212	73223	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409249544
1557	NT_187088	CAGA	2	8	73260	73267	50 %	0 %	25 %	25 %	409249544
1558	NT_187088	GGC	2	6	73272	73277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249544
1559	NT_187088	GAA	2	6	73343	73348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249544
1560	NT_187088	TCT	2	6	73350	73355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249544
1561	NT_187088	CGA	2	6	73357	73362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249544
1562	NT_187088	CGGGTG	2	12	73370	73381	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	409249544
1563	NT_187088	GGT	2	6	73438	73443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249544
1564	NT_187088	CG	3	6	73485	73490	0 %	0 %	50 %	50 %	409249544
1565	NT_187088	ATT	2	6	73541	73546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249544
1566	NT_187088	ACC	2	6	73560	73565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249544
1567	NT_187088	TGA	2	6	73663	73668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249544
1568	NT_187088	AGA	2	6	73704	73709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249544
1569	NT_187088	TGC	2	6	73725	73730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249544
1570	NT_187088	CAC	2	6	73738	73743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249544
1571	NT_187088	TAA	2	6	73777	73782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249544
1572	NT_187088	GCA	2	6	73872	73877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249544
1573	NT_187088	CTC	2	6	73922	73927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249544
1574	NT_187088	GTG	2	6	73946	73951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249544
1575	NT_187088	ATG	2	6	73994	73999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249544
1576	NT_187088	TGG	2	6	74034	74039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249544
1577	NT_187088	GCG	2	6	74274	74279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249544
1578	NT_187088	A	6	6	74391	74396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NT_187088	GAA	2	6	74397	74402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1580	NT_187088	CGG	2	6	74435	74440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NT_187088	GC	3	6	74507	74512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1582	NT_187088	GCGTG	2	10	74519	74528	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1583	NT_187088	GT	3	6	74533	74538	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1584	NT_187088	AGA	2	6	74553	74558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1585	NT_187088	GCT	2	6	74583	74588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NT_187088	TAC	2	6	74600	74605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NT_187088	GCCCG	2	10	74628	74637	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1588	NT_187088	CAG	2	6	74664	74669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NT_187088	CTGG	2	8	74711	74718	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1590	NT_187088	GTC	2	6	74820	74825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NT_187088	CTGG	2	8	74847	74854	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1592	NT_187088	GGCA	2	8	74906	74913	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1593	NT_187088	GTG	2	6	74976	74981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1594	NT_187088	CGC	2	6	75032	75037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1595	NT_187088	GCC	2	6	75039	75044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1596	NT_187088	ACGG	2	8	75077	75084	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1597	NT_187088	CGC	2	6	75102	75107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1598	NT_187088	GACG	2	8	75141	75148	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1599	NT_187088	CA	3	6	75180	75185	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1600	NT_187088	GGC	2	6	75201	75206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NT_187088	GGC	2	6	75210	75215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NT_187088	CAG	2	6	75224	75229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NT_187088	TGCC	2	8	75269	75276	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1604	NT_187088	AC	3	6	75383	75388	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1605	NT_187088	GCC	2	6	75403	75408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1606	NT_187088	ATG	2	6	75518	75523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1607	NT_187088	AGC	2	6	75542	75547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NT_187088	A	7	7	75584	75590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NT_187088	TGC	2	6	75629	75634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NT_187088	GGGC	2	8	75648	75655	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1611	NT_187088	GTG	2	6	75664	75669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1612	NT_187088	CGT	2	6	75677	75682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NT_187088	CGG	2	6	75716	75721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NT_187088	GACG	2	8	75738	75745	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1615	NT_187088	CGG	2	6	75746	75751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NT_187088	CGG	2	6	75797	75802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NT_187088	CGGA	2	8	75812	75819	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1618	NT_187088	CAGC	2	8	75843	75850	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1619	NT_187088	ACG	2	6	75865	75870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NT_187088	ATG	2	6	75902	75907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1621	NT_187088	CGG	2	6	75923	75928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NT_187088	GAC	2	6	75948	75953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NT_187088	GCA	2	6	76013	76018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NT_187088	TGG	2	6	76052	76057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1625	NT_187088	GTATGA	2	12	76089	76100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1626	NT_187088	CGG	2	6	76118	76123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NT_187088	ACC	2	6	76163	76168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1628	NT_187088	ACG	2	6	76226	76231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NT_187088	ACC	2	6	76243	76248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1630	NT_187088	ACG	2	6	76286	76291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NT_187088	CA	3	6	76314	76319	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1632	NT_187088	GGGC	2	8	76320	76327	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1633	NT_187088	CGG	2	6	76333	76338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NT_187088	ATG	2	6	76346	76351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1635	NT_187088	ACA	2	6	76431	76436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1636	NT_187088	GACG	2	8	76447	76454	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1637	NT_187088	CA	3	6	76491	76496	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1638	NT_187088	CA	3	6	76518	76523	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1639	NT_187088	CGCAC	2	10	76553	76562	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1640	NT_187088	ATA	2	6	76670	76675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1641	NT_187088	GCA	2	6	76737	76742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1642	NT_187088	GCC	2	6	76803	76808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1643	NT_187088	TGG	2	6	76871	76876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1644	NT_187088	GCG	2	6	76911	76916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1645	NT_187088	CAC	2	6	76950	76955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1646	NT_187088	CGCAGC	2	12	76994	77005	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1647	NT_187088	G	6	6	77031	77036	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1648	NT_187088	GCA	2	6	77061	77066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1649	NT_187088	AGCGGG	2	12	77086	77097	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
1650	NT_187088	CGG	2	6	77162	77167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1651	NT_187088	AGC	3	9	77203	77211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1652	NT_187088	GTG	2	6	77314	77319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1653	NT_187088	ACG	2	6	77330	77335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1654	NT_187088	AC	3	6	77341	77346	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1655	NT_187088	CA	3	6	77391	77396	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1656	NT_187088	GGAGG	2	10	77415	77424	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1657	NT_187088	GCC	2	6	77444	77449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1658	NT_187088	GGGA	2	8	77543	77550	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1659	NT_187088	GA	3	6	77549	77554	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1660	NT_187088	GAC	2	6	77559	77564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1661	NT_187088	CGC	2	6	77618	77623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1662	NT_187088	CGG	2	6	77732	77737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1663	NT_187088	GTGA	2	8	77788	77795	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1664	NT_187088	TGGC	2	8	77809	77816	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1665	NT_187088	AC	3	6	77867	77872	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1666	NT_187088	GTGGC	2	10	77947	77956	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1667	NT_187088	ATG	2	6	77966	77971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1668	NT_187088	CGG	2	6	78002	78007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1669	NT_187088	CAG	2	6	78037	78042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1670	NT_187088	GAG	2	6	78049	78054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1671	NT_187088	TAT	2	6	78064	78069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.