MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 190

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187082	TGC	2	6	286	291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NT_187082	CTA	2	6	318	323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NT_187082	GTT	2	6	449	454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249358
4	NT_187082	CAC	2	6	458	463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249358
5	NT_187082	CAG	2	6	491	496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249358
6	NT_187082	CGG	2	6	538	543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249358
7	NT_187082	ACG	2	6	603	608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249358
8	NT_187082	CGC	2	6	959	964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249358
9	NT_187082	TGA	2	6	1023	1028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249358
10	NT_187082	GCT	2	6	1260	1265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249359
11	NT_187082	ACC	2	6	1303	1308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249359
12	NT_187082	CGT	2	6	1329	1334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249359
13	NT_187082	ACC	2	6	1363	1368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249359
14	NT_187082	GCG	2	6	1445	1450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249359
15	NT_187082	GGT	2	6	1572	1577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249359
16	NT_187082	CGC	2	6	1628	1633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249359
17	NT_187082	CGC	3	9	1721	1729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249359
18	NT_187082	CGC	2	6	1811	1816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249359
19	NT_187082	CAG	3	9	1860	1868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249359
20	NT_187082	CTG	2	6	1881	1886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249359
21	NT_187082	CGG	2	6	2158	2163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249360
22	NT_187082	TGA	2	6	2174	2179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249360
23	NT_187082	GGA	2	6	2216	2221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249360
24	NT_187082	ACC	2	6	2250	2255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249360
25	NT_187082	TGG	2	6	2314	2319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249360
26	NT_187082	GGC	2	6	2327	2332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249360
27	NT_187082	GCT	2	6	2399	2404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249360
28	NT_187082	TCG	2	6	2483	2488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249360
29	NT_187082	CGT	2	6	2495	2500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249360
30	NT_187082	TAC	2	6	2762	2767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249360
31	NT_187082	GGC	2	6	2789	2794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249360
32	NT_187082	AAC	2	6	2842	2847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249360
33	NT_187082	GCC	2	6	2850	2855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249360
34	NT_187082	CGG	2	6	2892	2897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249360
35	NT_187082	ATT	2	6	2933	2938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249360
36	NT_187082	AGA	2	6	2972	2977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249360
37	NT_187082	TGG	2	6	2989	2994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249360
38	NT_187082	GCC	2	6	3066	3071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NT_187082	GAG	2	6	3083	3088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NT_187082	TCT	2	6	3298	3303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249361
41	NT_187082	CTT	2	6	3365	3370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NT_187082	CGC	2	6	3444	3449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NT_187082	TAC	2	6	3470	3475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NT_187082	GCA	2	6	3581	3586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NT_187082	AAT	2	6	3639	3644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249362
46	NT_187082	ACG	2	6	3713	3718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249362
47	NT_187082	CCG	2	6	3783	3788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249362
48	NT_187082	CAG	2	6	3815	3820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249362
49	NT_187082	GGC	2	6	3844	3849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249362
50	NT_187082	CGC	2	6	3862	3867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249362
51	NT_187082	CCG	2	6	3900	3905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249362
52	NT_187082	TGC	2	6	4096	4101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249362
53	NT_187082	ACC	2	6	4150	4155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249362
54	NT_187082	AAC	2	6	4212	4217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249362
55	NT_187082	CGC	2	6	4234	4239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249362
56	NT_187082	AAT	2	6	4363	4368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NT_187082	GTT	2	6	4380	4385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249363
58	NT_187082	ATA	2	6	4393	4398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249363
59	NT_187082	ATG	2	6	4442	4447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249363
60	NT_187082	CGT	2	6	4452	4457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249363
61	NT_187082	GAT	2	6	4465	4470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249363
62	NT_187082	GGT	2	6	4567	4572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249363
63	NT_187082	CAT	2	6	4617	4622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249363
64	NT_187082	GAC	2	6	4647	4652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249363
65	NT_187082	CGC	2	6	4659	4664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249363
66	NT_187082	TCG	2	6	4763	4768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249363
67	NT_187082	GCC	2	6	4781	4786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249363
68	NT_187082	TAA	2	6	4789	4794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249363
69	NT_187082	CAC	2	6	4837	4842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249363
70	NT_187082	TTG	2	6	4912	4917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249363
71	NT_187082	GCC	2	6	5225	5230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249363
72	NT_187082	AGA	2	6	5238	5243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249363
73	NT_187082	GCC	2	6	5278	5283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249363
74	NT_187082	CGC	2	6	5286	5291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249363
75	NT_187082	CAG	2	6	5335	5340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249363
76	NT_187082	GCT	2	6	5487	5492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249363
77	NT_187082	CGG	2	6	5557	5562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249363
78	NT_187082	ATA	2	6	5564	5569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249363
79	NT_187082	GCC	2	6	5590	5595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249363
80	NT_187082	CAG	2	6	5734	5739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249363
81	NT_187082	GCA	2	6	5817	5822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249363
82	NT_187082	CGG	2	6	5868	5873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249363
83	NT_187082	CAG	2	6	5986	5991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249363
84	NT_187082	TCC	2	6	6101	6106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249364
85	NT_187082	GGC	2	6	6142	6147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249364
86	NT_187082	CGC	2	6	6268	6273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249364
87	NT_187082	GCC	2	6	6320	6325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249364
88	NT_187082	CAG	2	6	6334	6339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249364
89	NT_187082	CTG	2	6	6407	6412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249364
90	NT_187082	GCA	2	6	6447	6452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249364
91	NT_187082	GCG	2	6	6476	6481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249364
92	NT_187082	CGC	2	6	6550	6555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249364
93	NT_187082	ATA	2	6	6672	6677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249364
94	NT_187082	ATA	2	6	6791	6796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249364
95	NT_187082	CGC	2	6	6846	6851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249364
96	NT_187082	CCG	2	6	6897	6902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249364
97	NT_187082	CGG	2	6	6993	6998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249364
98	NT_187082	TGC	2	6	7168	7173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249364
99	NT_187082	GCG	2	6	7282	7287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249364
100	NT_187082	CCA	2	6	7311	7316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249364
101	NT_187082	CAG	2	6	7351	7356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249364
102	NT_187082	GCC	3	9	7364	7372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249364
103	NT_187082	CGC	2	6	7390	7395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249364
104	NT_187082	ATA	2	6	7450	7455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249364
105	NT_187082	CGG	2	6	7503	7508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249364
106	NT_187082	TGC	2	6	7538	7543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249364
107	NT_187082	CGG	2	6	7562	7567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249364
108	NT_187082	TGT	2	6	7583	7588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249364
109	NT_187082	GGA	2	6	7635	7640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249364
110	NT_187082	CAG	2	6	7654	7659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249364
111	NT_187082	ACC	2	6	7791	7796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249364
112	NT_187082	ACG	2	6	7911	7916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NT_187082	GCC	2	6	8023	8028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249365
114	NT_187082	CGC	2	6	8088	8093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249365
115	NT_187082	TGC	2	6	8260	8265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249365
116	NT_187082	CTT	2	6	8312	8317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249365
117	NT_187082	CTT	2	6	8459	8464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249365
118	NT_187082	GCC	3	9	8478	8486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249365
119	NT_187082	AGA	2	6	8513	8518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249365
120	NT_187082	CGC	2	6	8546	8551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249365
121	NT_187082	CTT	2	6	8564	8569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249365
122	NT_187082	TTG	2	6	8683	8688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249365
123	NT_187082	CAG	2	6	8748	8753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249365
124	NT_187082	CGT	2	6	8799	8804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249365
125	NT_187082	TAA	2	6	8837	8842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249365
126	NT_187082	CCG	2	6	8876	8881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249365
127	NT_187082	CCG	2	6	8891	8896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249365
128	NT_187082	AGC	2	6	8914	8919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249365
129	NT_187082	GTT	2	6	8955	8960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NT_187082	ATC	2	6	9075	9080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NT_187082	TGT	2	6	9158	9163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NT_187082	CTG	2	6	9196	9201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.