MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187078	TTGCT	2	10	729	738	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NT_187078	GCTGG	2	10	4857	4866	0 %	20 %	60 %	20 %	409249103
3	NT_187078	GCGTA	2	10	6597	6606	20 %	20 %	40 %	20 %	409249104
4	NT_187078	AAACG	2	10	7352	7361	60 %	0 %	20 %	20 %	409249105
5	NT_187078	AGTAA	2	10	7633	7642	60 %	20 %	20 %	0 %	409249105
6	NT_187078	CTGGC	2	10	7957	7966	0 %	20 %	40 %	40 %	409249105
7	NT_187078	GAAGC	2	10	9500	9509	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NT_187078	ACCAT	2	10	10246	10255	40 %	20 %	0 %	40 %	409249107
9	NT_187078	GTCCC	2	10	11833	11842	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
10	NT_187078	GCAAA	2	10	14107	14116	60 %	0 %	20 %	20 %	409249111
11	NT_187078	GCCGC	2	10	18029	18038	0 %	0 %	40 %	60 %	409249115
12	NT_187078	ACGCC	2	10	21230	21239	20 %	0 %	20 %	60 %	409249117
13	NT_187078	GTGAA	2	10	21672	21681	40 %	20 %	40 %	0 %	409249117
14	NT_187078	TCAGG	2	10	21730	21739	20 %	20 %	40 %	20 %	409249117
15	NT_187078	CGACG	2	10	21808	21817	20 %	0 %	40 %	40 %	409249117
16	NT_187078	CGGTG	2	10	25212	25221	0 %	20 %	60 %	20 %	409249120
17	NT_187078	CAGCG	2	10	25578	25587	20 %	0 %	40 %	40 %	409249120
18	NT_187078	GGCGG	2	10	26084	26093	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
19	NT_187078	CTGGT	2	10	27570	27579	0 %	40 %	40 %	20 %	409249122
20	NT_187078	ACGGC	2	10	27896	27905	20 %	0 %	40 %	40 %	409249122
21	NT_187078	ATGAA	2	10	28607	28616	60 %	20 %	20 %	0 %	409249122
22	NT_187078	GGCCT	2	10	29742	29751	0 %	20 %	40 %	40 %	409249123
23	NT_187078	CGCGC	2	10	30407	30416	0 %	0 %	40 %	60 %	409249123
24	NT_187078	CTCCA	2	10	32170	32179	20 %	20 %	0 %	60 %	409249125
25	NT_187078	GGGCT	2	10	32622	32631	0 %	20 %	60 %	20 %	409249125
26	NT_187078	ACGTG	2	10	32871	32880	20 %	20 %	40 %	20 %	409249125
27	NT_187078	ATAAA	2	10	33882	33891	80 %	20 %	0 %	0 %	409249127
28	NT_187078	GGCCG	2	10	35002	35011	0 %	0 %	60 %	40 %	409249128
29	NT_187078	GCATG	2	10	37922	37931	20 %	20 %	40 %	20 %	409249130
30	NT_187078	TGATT	2	10	41775	41784	20 %	60 %	20 %	0 %	409249136
31	NT_187078	GCGCT	2	10	43426	43435	0 %	20 %	40 %	40 %	409249137
32	NT_187078	AAAAT	2	10	43813	43822	80 %	20 %	0 %	0 %	409249138
33	NT_187078	TTCAA	2	10	44055	44064	40 %	40 %	0 %	20 %	409249139
34	NT_187078	CCAGC	2	10	44483	44492	20 %	0 %	20 %	60 %	409249139
35	NT_187078	GATCG	2	10	48609	48618	20 %	20 %	40 %	20 %	409249142
36	NT_187078	GCGCG	2	10	48932	48941	0 %	0 %	60 %	40 %	409249142
37	NT_187078	ATCGC	2	10	50916	50925	20 %	20 %	20 %	40 %	409249143
38	NT_187078	AGCGA	2	10	53287	53296	40 %	0 %	40 %	20 %	409249145
39	NT_187078	AACGG	2	10	55905	55914	40 %	0 %	40 %	20 %	409249146
40	NT_187078	CGCGT	2	10	57666	57675	0 %	20 %	40 %	40 %	409249149
41	NT_187078	CAGAA	2	10	59001	59010	60 %	0 %	20 %	20 %	409249150
42	NT_187078	CGCGG	2	10	59287	59296	0 %	0 %	60 %	40 %	409249150
43	NT_187078	GGCAC	2	10	61097	61106	20 %	0 %	40 %	40 %	409249152
44	NT_187078	GTTCT	2	10	63138	63147	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NT_187078	TTTGT	2	10	63595	63604	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NT_187078	GAAAA	2	10	63605	63614	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NT_187078	ATGCG	2	10	67573	67582	20 %	20 %	40 %	20 %	409249160
48	NT_187078	AAATT	2	10	67777	67786	60 %	40 %	0 %	0 %	409249160
49	NT_187078	GTTAT	2	10	68057	68066	20 %	60 %	20 %	0 %	409249161
50	NT_187078	TCATA	2	10	68144	68153	40 %	40 %	0 %	20 %	409249161
51	NT_187078	AAAAG	2	10	70646	70655	80 %	0 %	20 %	0 %	409249163
52	NT_187078	GGCGA	2	10	71456	71465	20 %	0 %	60 %	20 %	409249164
53	NT_187078	AAAAT	2	10	73578	73587	80 %	20 %	0 %	0 %	409249165
54	NT_187078	AATAA	2	10	77856	77865	80 %	20 %	0 %	0 %	409249170
55	NT_187078	GACCG	2	10	80967	80976	20 %	0 %	40 %	40 %	409249174
56	NT_187078	ACCAC	2	10	81164	81173	40 %	0 %	0 %	60 %	409249174
57	NT_187078	CGGTA	2	10	84865	84874	20 %	20 %	40 %	20 %	409249176
58	NT_187078	GAACT	2	10	88634	88643	40 %	20 %	20 %	20 %	409249179
59	NT_187078	TAAAA	2	10	89918	89927	80 %	20 %	0 %	0 %	409249180
60	NT_187078	TAAAA	2	10	90894	90903	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NT_187078	ACGCA	2	10	95157	95166	40 %	0 %	20 %	40 %	409249187
62	NT_187078	GGGCC	2	10	97903	97912	0 %	0 %	60 %	40 %	409249191
63	NT_187078	GGGAT	2	10	98958	98967	20 %	20 %	60 %	0 %	409249191
64	NT_187078	GCAGC	2	10	99949	99958	20 %	0 %	40 %	40 %	409249193
65	NT_187078	CCCCG	2	10	99999	100008	0 %	0 %	20 %	80 %	409249193

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.