MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 70

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187075	ATATT	2	10	2749	2758	40 %	60 %	0 %	0 %	409248819
2	NT_187075	CCCAG	2	10	2849	2858	20 %	0 %	20 %	60 %	409248819
3	NT_187075	GCGCC	2	10	3332	3341	0 %	0 %	40 %	60 %	409248819
4	NT_187075	AGCGA	2	10	3523	3532	40 %	0 %	40 %	20 %	409248819
5	NT_187075	CAGCG	2	10	4272	4281	20 %	0 %	40 %	40 %	409248820
6	NT_187075	TGATT	2	10	4479	4488	20 %	60 %	20 %	0 %	409248820
7	NT_187075	GTACG	2	10	5956	5965	20 %	20 %	40 %	20 %	409248821
8	NT_187075	GGCAG	2	10	6212	6221	20 %	0 %	60 %	20 %	409248821
9	NT_187075	GCCCA	2	10	6595	6604	20 %	0 %	20 %	60 %	409248822
10	NT_187075	GGTCA	2	10	8791	8800	20 %	20 %	40 %	20 %	409248825
11	NT_187075	GCGCT	2	10	8836	8845	0 %	20 %	40 %	40 %	409248825
12	NT_187075	GCTAA	2	10	9326	9335	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NT_187075	GTTTG	2	10	9400	9409	0 %	60 %	40 %	0 %	409248826
14	NT_187075	ATCAA	2	10	10084	10093	60 %	20 %	0 %	20 %	409248826
15	NT_187075	CCGCG	2	10	10169	10178	0 %	0 %	40 %	60 %	409248826
16	NT_187075	ACTTT	2	10	11512	11521	20 %	60 %	0 %	20 %	409248829
17	NT_187075	CAAAG	2	10	12970	12979	60 %	0 %	20 %	20 %	409248830
18	NT_187075	CATTA	2	10	15060	15069	40 %	40 %	0 %	20 %	409248833
19	NT_187075	TTAAT	2	10	16352	16361	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187075	GCGCT	2	10	16706	16715	0 %	20 %	40 %	40 %	409248837
21	NT_187075	GTAAT	2	10	17560	17569	40 %	40 %	20 %	0 %	409248837
22	NT_187075	GCGCG	2	10	18615	18624	0 %	0 %	60 %	40 %	409248838
23	NT_187075	CGTGT	2	10	20626	20635	0 %	40 %	40 %	20 %	409248840
24	NT_187075	GCTGA	2	10	21306	21315	20 %	20 %	40 %	20 %	409248840
25	NT_187075	GCGCC	2	10	21509	21518	0 %	0 %	40 %	60 %	409248840
26	NT_187075	CGCGG	2	10	24287	24296	0 %	0 %	60 %	40 %	409248841
27	NT_187075	ATTAC	2	10	24868	24877	40 %	40 %	0 %	20 %	409248843
28	NT_187075	CGTAT	2	10	26074	26083	20 %	40 %	20 %	20 %	409248844
29	NT_187075	CCTTG	2	10	27758	27767	0 %	40 %	20 %	40 %	409248846
30	NT_187075	AACGC	2	10	32479	32488	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NT_187075	GCCAT	2	10	32790	32799	20 %	20 %	20 %	40 %	409248850
32	NT_187075	TACGG	2	10	34695	34704	20 %	20 %	40 %	20 %	409248853
33	NT_187075	CGTTG	2	10	35077	35086	0 %	40 %	40 %	20 %	409248853
34	NT_187075	CCGAT	2	10	36455	36464	20 %	20 %	20 %	40 %	409248855
35	NT_187075	TGACC	2	10	38545	38554	20 %	20 %	20 %	40 %	409248856
36	NT_187075	GGCGA	2	10	40622	40631	20 %	0 %	60 %	20 %	409248859
37	NT_187075	CAGTT	2	10	41380	41389	20 %	40 %	20 %	20 %	409248860
38	NT_187075	GCGCT	2	10	42140	42149	0 %	20 %	40 %	40 %	409248860
39	NT_187075	CTTTT	2	10	45768	45777	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NT_187075	GCGCC	2	10	47349	47358	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
41	NT_187075	CGGCG	2	10	47504	47513	0 %	0 %	60 %	40 %	409248869
42	NT_187075	AGTAG	2	10	49087	49096	40 %	20 %	40 %	0 %	409248870
43	NT_187075	AGGGT	2	10	50237	50246	20 %	20 %	60 %	0 %	409248870
44	NT_187075	AAGGC	2	10	50536	50545	40 %	0 %	40 %	20 %	409248871
45	NT_187075	CGGAT	2	10	53570	53579	20 %	20 %	40 %	20 %	409248874
46	NT_187075	CTGCA	2	10	54180	54189	20 %	20 %	20 %	40 %	409248875
47	NT_187075	CACAC	2	10	57941	57950	40 %	0 %	0 %	60 %	409248878
48	NT_187075	ATCTT	2	10	57977	57986	20 %	60 %	0 %	20 %	409248878
49	NT_187075	CAGTA	2	10	59234	59243	40 %	20 %	20 %	20 %	409248879
50	NT_187075	GCAAC	2	10	59345	59354	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NT_187075	TGAAC	2	10	59493	59502	40 %	20 %	20 %	20 %	409248880
52	NT_187075	GAAGC	2	10	59659	59668	40 %	0 %	40 %	20 %	409248880
53	NT_187075	TTTGC	2	10	61629	61638	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NT_187075	TATTT	2	10	61854	61863	20 %	80 %	0 %	0 %	409248882
55	NT_187075	AGGCC	2	10	62468	62477	20 %	0 %	40 %	40 %	409248882
56	NT_187075	GATAC	2	10	63552	63561	40 %	20 %	20 %	20 %	409248883
57	NT_187075	AACTT	2	10	63931	63940	40 %	40 %	0 %	20 %	409248883
58	NT_187075	ATCTT	2	10	68681	68690	20 %	60 %	0 %	20 %	409248887
59	NT_187075	TTGAC	2	10	71566	71575	20 %	40 %	20 %	20 %	409248890
60	NT_187075	CGCGG	2	10	72797	72806	0 %	0 %	60 %	40 %	409248892
61	NT_187075	GTTTT	2	10	72894	72903	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NT_187075	TGATG	2	10	73577	73586	20 %	40 %	40 %	0 %	409248893
63	NT_187075	ACTAA	2	10	77023	77032	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NT_187075	GATGT	2	10	78436	78445	20 %	40 %	40 %	0 %	409248896
65	NT_187075	GAAGA	2	10	79597	79606	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NT_187075	ATGCG	2	10	80030	80039	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NT_187075	TGGCG	2	10	81840	81849	0 %	20 %	60 %	20 %	409248898
68	NT_187075	GCGCG	2	10	84094	84103	0 %	0 %	60 %	40 %	409248902
69	NT_187075	CTTAT	2	10	85912	85921	20 %	60 %	0 %	20 %	409248903
70	NT_187075	ATGCC	2	10	86425	86434	20 %	20 %	20 %	40 %	409248903

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.