MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 123

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187074	TA	3	6	107	112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NT_187074	TA	3	6	271	276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187074	GC	3	6	1751	1756	0 %	0 %	50 %	50 %	409248758
4	NT_187074	GC	3	6	3055	3060	0 %	0 %	50 %	50 %	409248759
5	NT_187074	TC	3	6	3321	3326	0 %	50 %	0 %	50 %	409248760
6	NT_187074	GC	3	6	4226	4231	0 %	0 %	50 %	50 %	409248761
7	NT_187074	CG	3	6	4270	4275	0 %	0 %	50 %	50 %	409248761
8	NT_187074	GT	3	6	4877	4882	0 %	50 %	50 %	0 %	409248761
9	NT_187074	AC	3	6	4921	4926	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NT_187074	TA	3	6	4942	4947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187074	AT	3	6	5436	5441	50 %	50 %	0 %	0 %	409248763
12	NT_187074	AT	3	6	5998	6003	50 %	50 %	0 %	0 %	409248764
13	NT_187074	GC	3	6	7741	7746	0 %	0 %	50 %	50 %	409248766
14	NT_187074	TC	3	6	8047	8052	0 %	50 %	0 %	50 %	409248766
15	NT_187074	CT	3	6	8487	8492	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NT_187074	CG	3	6	8662	8667	0 %	0 %	50 %	50 %	409248767
17	NT_187074	CT	3	6	8944	8949	0 %	50 %	0 %	50 %	409248767
18	NT_187074	CG	3	6	8969	8974	0 %	0 %	50 %	50 %	409248767
19	NT_187074	TC	4	8	9647	9654	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NT_187074	TG	3	6	10366	10371	0 %	50 %	50 %	0 %	409248770
21	NT_187074	TA	3	6	10707	10712	50 %	50 %	0 %	0 %	409248770
22	NT_187074	CG	3	6	11385	11390	0 %	0 %	50 %	50 %	409248772
23	NT_187074	TC	3	6	11853	11858	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NT_187074	TA	3	6	12301	12306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NT_187074	TA	3	6	12320	12325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NT_187074	TC	3	6	12922	12927	0 %	50 %	0 %	50 %	409248774
27	NT_187074	GT	3	6	12994	12999	0 %	50 %	50 %	0 %	409248774
28	NT_187074	GT	3	6	13777	13782	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NT_187074	AT	4	8	13889	13896	50 %	50 %	0 %	0 %	409248775
30	NT_187074	GC	3	6	14316	14321	0 %	0 %	50 %	50 %	409248775
31	NT_187074	TC	3	6	14919	14924	0 %	50 %	0 %	50 %	409248775
32	NT_187074	GC	3	6	15696	15701	0 %	0 %	50 %	50 %	409248776
33	NT_187074	CG	3	6	15934	15939	0 %	0 %	50 %	50 %	409248776
34	NT_187074	TC	3	6	16030	16035	0 %	50 %	0 %	50 %	409248777
35	NT_187074	TA	3	6	16628	16633	50 %	50 %	0 %	0 %	409248777
36	NT_187074	TG	3	6	18029	18034	0 %	50 %	50 %	0 %	409248779
37	NT_187074	TG	3	6	18326	18331	0 %	50 %	50 %	0 %	409248779
38	NT_187074	TA	3	6	18641	18646	50 %	50 %	0 %	0 %	409248779
39	NT_187074	CA	3	6	19048	19053	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NT_187074	CA	3	6	19262	19267	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NT_187074	TA	3	6	19648	19653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NT_187074	AT	3	6	20136	20141	50 %	50 %	0 %	0 %	409248780
43	NT_187074	AG	3	6	22053	22058	50 %	0 %	50 %	0 %	409248781
44	NT_187074	CG	3	6	22442	22447	0 %	0 %	50 %	50 %	409248782
45	NT_187074	GC	3	6	22623	22628	0 %	0 %	50 %	50 %	409248782
46	NT_187074	GC	3	6	22812	22817	0 %	0 %	50 %	50 %	409248782
47	NT_187074	CG	3	6	23422	23427	0 %	0 %	50 %	50 %	409248782
48	NT_187074	GC	4	8	23456	23463	0 %	0 %	50 %	50 %	409248782
49	NT_187074	GC	3	6	23862	23867	0 %	0 %	50 %	50 %	409248782
50	NT_187074	CG	3	6	24279	24284	0 %	0 %	50 %	50 %	409248782
51	NT_187074	CG	3	6	25600	25605	0 %	0 %	50 %	50 %	409248784
52	NT_187074	TC	3	6	26332	26337	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NT_187074	TA	4	8	27191	27198	50 %	50 %	0 %	0 %	409248785
54	NT_187074	CT	3	6	27320	27325	0 %	50 %	0 %	50 %	409248785
55	NT_187074	TG	3	6	27901	27906	0 %	50 %	50 %	0 %	409248786
56	NT_187074	TC	3	6	28144	28149	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NT_187074	AT	3	6	28378	28383	50 %	50 %	0 %	0 %	409248787
58	NT_187074	AG	4	8	28748	28755	50 %	0 %	50 %	0 %	409248787
59	NT_187074	CT	4	8	29191	29198	0 %	50 %	0 %	50 %	409248788
60	NT_187074	AT	3	6	29272	29277	50 %	50 %	0 %	0 %	409248788
61	NT_187074	AT	3	6	29848	29853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NT_187074	AT	3	6	31380	31385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NT_187074	TG	3	6	31458	31463	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NT_187074	TA	3	6	31489	31494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NT_187074	TA	3	6	32631	32636	50 %	50 %	0 %	0 %	409248792
66	NT_187074	GA	3	6	32852	32857	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NT_187074	AG	3	6	32940	32945	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NT_187074	AT	3	6	33493	33498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NT_187074	GC	5	10	33508	33517	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NT_187074	CG	4	8	33529	33536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NT_187074	GC	3	6	33653	33658	0 %	0 %	50 %	50 %	409248794
72	NT_187074	CG	3	6	33759	33764	0 %	0 %	50 %	50 %	409248794
73	NT_187074	AG	3	6	33923	33928	50 %	0 %	50 %	0 %	409248794
74	NT_187074	GC	4	8	34045	34052	0 %	0 %	50 %	50 %	409248794
75	NT_187074	TG	3	6	34333	34338	0 %	50 %	50 %	0 %	409248794
76	NT_187074	CG	3	6	34695	34700	0 %	0 %	50 %	50 %	409248794
77	NT_187074	GC	3	6	34844	34849	0 %	0 %	50 %	50 %	409248794
78	NT_187074	GC	3	6	37178	37183	0 %	0 %	50 %	50 %	409248795
79	NT_187074	GC	3	6	37839	37844	0 %	0 %	50 %	50 %	409248795
80	NT_187074	GC	4	8	38563	38570	0 %	0 %	50 %	50 %	409248796
81	NT_187074	GC	3	6	38886	38891	0 %	0 %	50 %	50 %	409248796
82	NT_187074	CG	3	6	39176	39181	0 %	0 %	50 %	50 %	409248796
83	NT_187074	GC	3	6	39287	39292	0 %	0 %	50 %	50 %	409248796
84	NT_187074	GC	3	6	39827	39832	0 %	0 %	50 %	50 %	409248797
85	NT_187074	TG	3	6	40473	40478	0 %	50 %	50 %	0 %	409248797
86	NT_187074	GC	3	6	40627	40632	0 %	0 %	50 %	50 %	409248797
87	NT_187074	GC	3	6	41824	41829	0 %	0 %	50 %	50 %	409248797
88	NT_187074	GC	4	8	42141	42148	0 %	0 %	50 %	50 %	409248798
89	NT_187074	CA	3	6	42510	42515	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NT_187074	TA	3	6	42890	42895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NT_187074	GC	3	6	43205	43210	0 %	0 %	50 %	50 %	409248800
92	NT_187074	GC	4	8	44020	44027	0 %	0 %	50 %	50 %	409248800
93	NT_187074	GC	4	8	44615	44622	0 %	0 %	50 %	50 %	409248801
94	NT_187074	GC	3	6	46702	46707	0 %	0 %	50 %	50 %	409248802
95	NT_187074	AG	3	6	48954	48959	50 %	0 %	50 %	0 %	409248802
96	NT_187074	TC	3	6	49020	49025	0 %	50 %	0 %	50 %	409248802
97	NT_187074	GC	3	6	49342	49347	0 %	0 %	50 %	50 %	409248802
98	NT_187074	TA	4	8	49871	49878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NT_187074	CG	3	6	51241	51246	0 %	0 %	50 %	50 %	409248804
100	NT_187074	CG	3	6	51625	51630	0 %	0 %	50 %	50 %	409248805
101	NT_187074	TC	3	6	52459	52464	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NT_187074	GC	5	10	53477	53486	0 %	0 %	50 %	50 %	409248806
103	NT_187074	GC	3	6	55565	55570	0 %	0 %	50 %	50 %	409248807
104	NT_187074	CT	3	6	55836	55841	0 %	50 %	0 %	50 %	409248807
105	NT_187074	GC	3	6	57316	57321	0 %	0 %	50 %	50 %	409248810
106	NT_187074	CG	4	8	58404	58411	0 %	0 %	50 %	50 %	409248810
107	NT_187074	CG	3	6	58812	58817	0 %	0 %	50 %	50 %	409248810
108	NT_187074	CG	3	6	59395	59400	0 %	0 %	50 %	50 %	409248811
109	NT_187074	GC	3	6	59543	59548	0 %	0 %	50 %	50 %	409248811
110	NT_187074	CG	3	6	59621	59626	0 %	0 %	50 %	50 %	409248811
111	NT_187074	GC	4	8	60494	60501	0 %	0 %	50 %	50 %	409248812
112	NT_187074	GC	3	6	60785	60790	0 %	0 %	50 %	50 %	409248812
113	NT_187074	CG	3	6	61880	61885	0 %	0 %	50 %	50 %	409248813
114	NT_187074	CG	4	8	62000	62007	0 %	0 %	50 %	50 %	409248813
115	NT_187074	GT	3	6	62461	62466	0 %	50 %	50 %	0 %	409248813
116	NT_187074	GC	3	6	63186	63191	0 %	0 %	50 %	50 %	409248814
117	NT_187074	GC	3	6	63248	63253	0 %	0 %	50 %	50 %	409248814
118	NT_187074	TC	3	6	63859	63864	0 %	50 %	0 %	50 %	409248814
119	NT_187074	CG	3	6	64001	64006	0 %	0 %	50 %	50 %	409248814
120	NT_187074	GC	3	6	64773	64778	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NT_187074	TC	3	6	65576	65581	0 %	50 %	0 %	50 %	409248815
122	NT_187074	GC	3	6	65713	65718	0 %	0 %	50 %	50 %	409248815
123	NT_187074	TA	3	6	65893	65898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.