MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187074	CTGAC	2	10	414	423	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NT_187074	CGCGG	2	10	998	1007	0 %	0 %	60 %	40 %	409248757
3	NT_187074	TGGCG	2	10	1722	1731	0 %	20 %	60 %	20 %	409248758
4	NT_187074	TTGTT	2	10	5115	5124	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187074	GAAAG	2	10	8305	8314	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187074	CATGA	2	10	11328	11337	40 %	20 %	20 %	20 %	409248772
7	NT_187074	GCGCC	2	10	11578	11587	0 %	0 %	40 %	60 %	409248772
8	NT_187074	AAAAT	2	10	12416	12425	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NT_187074	ATTTT	2	10	12955	12964	20 %	80 %	0 %	0 %	409248774
10	NT_187074	TGAGC	2	10	13277	13286	20 %	20 %	40 %	20 %	409248774
11	NT_187074	TTTCA	2	10	13454	13463	20 %	60 %	0 %	20 %	409248774
12	NT_187074	CAACG	2	10	15651	15660	40 %	0 %	20 %	40 %	409248776
13	NT_187074	GCGTT	2	10	18840	18849	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NT_187074	AATGT	2	10	19336	19345	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NT_187074	TGAAA	2	10	19620	19629	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187074	GACTG	2	10	22929	22938	20 %	20 %	40 %	20 %	409248782
17	NT_187074	ATTTT	2	10	25056	25065	20 %	80 %	0 %	0 %	409248783
18	NT_187074	TCCTG	2	10	29564	29573	0 %	40 %	20 %	40 %	409248788
19	NT_187074	GATGC	2	10	31286	31295	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NT_187074	AAGCC	2	10	36494	36503	40 %	0 %	20 %	40 %	409248795
21	NT_187074	ACCAA	2	10	36986	36995	60 %	0 %	0 %	40 %	409248795
22	NT_187074	CACGA	2	10	39708	39717	40 %	0 %	20 %	40 %	409248797
23	NT_187074	TGTCG	2	10	41141	41150	0 %	40 %	40 %	20 %	409248797
24	NT_187074	CCGAT	2	10	41386	41395	20 %	20 %	20 %	40 %	409248797
25	NT_187074	CGCTT	2	10	42774	42783	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NT_187074	GCGTC	2	10	43373	43382	0 %	20 %	40 %	40 %	409248800
27	NT_187074	ATGTG	2	10	45154	45163	20 %	40 %	40 %	0 %	409248801
28	NT_187074	ACGGT	2	10	45406	45415	20 %	20 %	40 %	20 %	409248801
29	NT_187074	TAAAG	2	10	46802	46811	60 %	20 %	20 %	0 %	409248802
30	NT_187074	AAGCC	2	10	48594	48603	40 %	0 %	20 %	40 %	409248802
31	NT_187074	CACGG	2	10	48938	48947	20 %	0 %	40 %	40 %	409248802
32	NT_187074	CCCGT	2	10	49494	49503	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
33	NT_187074	CGTTT	2	10	49821	49830	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NT_187074	CGGGC	2	10	50257	50266	0 %	0 %	60 %	40 %	409248804
35	NT_187074	GCTAC	2	10	50923	50932	20 %	20 %	20 %	40 %	409248804
36	NT_187074	CGCAA	2	10	53272	53281	40 %	0 %	20 %	40 %	409248806
37	NT_187074	ATTAC	2	10	55003	55012	40 %	40 %	0 %	20 %	409248807
38	NT_187074	CTCTT	2	10	56578	56587	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NT_187074	GCCAG	2	10	57504	57513	20 %	0 %	40 %	40 %	409248810
40	NT_187074	TTTTC	2	10	58944	58953	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NT_187074	CTTTG	2	10	59051	59060	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NT_187074	CGCGC	2	10	59135	59144	0 %	0 %	40 %	60 %	409248811
43	NT_187074	GTGGC	2	10	63479	63488	0 %	20 %	60 %	20 %	409248814
44	NT_187074	GGCAT	2	10	65617	65626	20 %	20 %	40 %	20 %	409248815

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.