MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 4853

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NT_187072	GCA	2	6	46991	46996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248506
1002	NT_187072	CCG	2	6	47051	47056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248506
1003	NT_187072	ATA	2	6	47063	47068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248506
1004	NT_187072	ATC	2	6	47083	47088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248506
1005	NT_187072	CAG	2	6	47127	47132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248506
1006	NT_187072	CG	3	6	47135	47140	0 %	0 %	50 %	50 %	409248506
1007	NT_187072	CGA	2	6	47149	47154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248506
1008	NT_187072	CAT	2	6	47159	47164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248506
1009	NT_187072	GCTC	2	8	47237	47244	0 %	25 %	25 %	50 %	409248506
1010	NT_187072	AGCGC	2	10	47264	47273	20 %	0 %	40 %	40 %	409248506
1011	NT_187072	TCGA	2	8	47286	47293	25 %	25 %	25 %	25 %	409248506
1012	NT_187072	TCT	2	6	47422	47427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248506
1013	NT_187072	CATC	2	8	47573	47580	25 %	25 %	0 %	50 %	409248506
1014	NT_187072	CAA	2	6	47582	47587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248506
1015	NT_187072	GGC	2	6	47805	47810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NT_187072	AGT	2	6	47850	47855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248507
1017	NT_187072	GAA	2	6	47881	47886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248507
1018	NT_187072	TTCC	2	8	47887	47894	0 %	50 %	0 %	50 %	409248507
1019	NT_187072	GCG	2	6	47938	47943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248507
1020	NT_187072	CTG	2	6	47945	47950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248507
1021	NT_187072	GAC	2	6	48022	48027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248507
1022	NT_187072	GCG	2	6	48060	48065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248507
1023	NT_187072	GCG	2	6	48073	48078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248507
1024	NT_187072	CGCC	2	8	48148	48155	0 %	0 %	25 %	75 %	409248507
1025	NT_187072	GCG	2	6	48247	48252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248507
1026	NT_187072	GCTG	2	8	48295	48302	0 %	25 %	50 %	25 %	409248507
1027	NT_187072	T	6	6	48332	48337	0 %	100 %	0 %	0 %	409248507
1028	NT_187072	CCGCG	2	10	48349	48358	0 %	0 %	40 %	60 %	409248507
1029	NT_187072	CTCCAG	2	12	48398	48409	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	409248507
1030	NT_187072	TGT	2	6	48429	48434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248507
1031	NT_187072	CCA	2	6	48446	48451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248507
1032	NT_187072	CCG	2	6	48487	48492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248507
1033	NT_187072	GC	4	8	48508	48515	0 %	0 %	50 %	50 %	409248507
1034	NT_187072	GAC	2	6	48624	48629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248507
1035	NT_187072	GTG	2	6	48660	48665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248507
1036	NT_187072	TTA	2	6	48720	48725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248507
1037	NT_187072	GGCA	2	8	48777	48784	25 %	0 %	50 %	25 %	409248507
1038	NT_187072	ATCA	2	8	48875	48882	50 %	25 %	0 %	25 %	409248507
1039	NT_187072	GCC	2	6	48971	48976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248507
1040	NT_187072	GCG	2	6	48988	48993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248507
1041	NT_187072	GCG	2	6	49062	49067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248507
1042	NT_187072	CCG	2	6	49074	49079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248507
1043	NT_187072	TCG	2	6	49105	49110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248507
1044	NT_187072	CG	3	6	49109	49114	0 %	0 %	50 %	50 %	409248507
1045	NT_187072	GCG	2	6	49217	49222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248507
1046	NT_187072	A	7	7	49380	49386	100 %	0 %	0 %	0 %	409248507
1047	NT_187072	GCA	2	6	49477	49482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248507
1048	NT_187072	CAC	2	6	49499	49504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248507
1049	NT_187072	GAT	2	6	49514	49519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248507
1050	NT_187072	GCGG	2	8	49570	49577	0 %	0 %	75 %	25 %	409248507
1051	NT_187072	GCG	2	6	49729	49734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248507
1052	NT_187072	GGGGT	2	10	49745	49754	0 %	20 %	80 %	0 %	409248507
1053	NT_187072	TAA	2	6	49816	49821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248507
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1055	NT_187072	GCA	2	6	49888	49893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248507
1056	NT_187072	GCG	2	6	49975	49980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248507
1057	NT_187072	AGC	2	6	50007	50012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248507
1058	NT_187072	GGC	2	6	50015	50020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248507
1059	NT_187072	CTGG	2	8	50030	50037	0 %	25 %	50 %	25 %	409248507
1060	NT_187072	TGTC	2	8	50092	50099	0 %	50 %	25 %	25 %	409248507
1061	NT_187072	GCCA	2	8	50100	50107	25 %	0 %	25 %	50 %	409248507
1062	NT_187072	GCG	2	6	50128	50133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248507
1063	NT_187072	CCTG	2	8	50163	50170	0 %	25 %	25 %	50 %	409248507
1064	NT_187072	GAT	2	6	50177	50182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248507
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1066	NT_187072	TAA	2	6	50278	50283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NT_187072	AAG	2	6	50299	50304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NT_187072	CCA	2	6	50316	50321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NT_187072	TGA	2	6	50349	50354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NT_187072	GCA	2	6	50396	50401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NT_187072	CCG	2	6	50460	50465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NT_187072	ATC	2	6	50512	50517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NT_187072	GCG	2	6	50557	50562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248508
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1081	NT_187072	AC	3	6	50964	50969	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1082	NT_187072	TGA	2	6	50974	50979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248509
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1084	NT_187072	GCA	2	6	51215	51220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248509
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1088	NT_187072	TGGG	2	8	51389	51396	0 %	25 %	75 %	0 %	409248509
1089	NT_187072	TCAG	2	8	51448	51455	25 %	25 %	25 %	25 %	409248509
1090	NT_187072	GTTGAA	2	12	51486	51497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248509
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1092	NT_187072	ACGGT	2	10	51574	51583	20 %	20 %	40 %	20 %	409248509
1093	NT_187072	ACCA	2	8	51586	51593	50 %	0 %	0 %	50 %	409248509
1094	NT_187072	CAG	2	6	51665	51670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248509
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1096	NT_187072	CAG	2	6	51835	51840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248509
1097	NT_187072	GCC	2	6	51916	51921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248509
1098	NT_187072	TGGCG	2	10	51942	51951	0 %	20 %	60 %	20 %	409248509
1099	NT_187072	GAAA	2	8	52016	52023	75 %	0 %	25 %	0 %	409248509
1100	NT_187072	TG	3	6	52046	52051	0 %	50 %	50 %	0 %	409248509
1101	NT_187072	GCG	2	6	52107	52112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248509
1102	NT_187072	GAT	2	6	52139	52144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248509
1103	NT_187072	GCC	2	6	52153	52158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248509
1104	NT_187072	GTC	2	6	52192	52197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NT_187072	GGA	2	6	52246	52251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1106	NT_187072	TGT	3	9	52258	52266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248510
1107	NT_187072	CG	3	6	52298	52303	0 %	0 %	50 %	50 %	409248510
1108	NT_187072	CGC	2	6	52377	52382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248510
1109	NT_187072	GCC	2	6	52410	52415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248510
1110	NT_187072	CG	3	6	52428	52433	0 %	0 %	50 %	50 %	409248510
1111	NT_187072	TGT	2	6	52441	52446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248510
1112	NT_187072	CG	3	6	52544	52549	0 %	0 %	50 %	50 %	409248510
1113	NT_187072	CTGA	2	8	52560	52567	25 %	25 %	25 %	25 %	409248510
1114	NT_187072	TGCC	2	8	52622	52629	0 %	25 %	25 %	50 %	409248511
1115	NT_187072	TGA	2	6	52637	52642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248511
1116	NT_187072	ATGA	2	8	52657	52664	50 %	25 %	25 %	0 %	409248511
1117	NT_187072	GTTC	2	8	52665	52672	0 %	50 %	25 %	25 %	409248511
1118	NT_187072	AT	3	6	52751	52756	50 %	50 %	0 %	0 %	409248511
1119	NT_187072	AAT	2	6	52763	52768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248511
1120	NT_187072	GGC	2	6	52783	52788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248511
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1122	NT_187072	ATGG	2	8	52898	52905	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1123	NT_187072	ATG	2	6	52957	52962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NT_187072	CAG	2	6	52973	52978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NT_187072	TTTA	2	8	53015	53022	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NT_187072	A	6	6	53130	53135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NT_187072	T	6	6	53142	53147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NT_187072	GTTT	2	8	53148	53155	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1129	NT_187072	ATA	2	6	53213	53218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NT_187072	TAAA	2	8	53239	53246	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NT_187072	TCG	2	6	53266	53271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NT_187072	CT	3	6	53276	53281	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1133	NT_187072	TAATT	2	10	53285	53294	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NT_187072	ATTTT	2	10	53311	53320	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NT_187072	CGGGTG	2	12	53327	53338	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
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1137	NT_187072	ATT	2	6	53518	53523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248512
1138	NT_187072	T	7	7	53538	53544	0 %	100 %	0 %	0 %	409248512
1139	NT_187072	A	6	6	53565	53570	100 %	0 %	0 %	0 %	409248512
1140	NT_187072	ATT	2	6	53587	53592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248512
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1144	NT_187072	ATA	2	6	53687	53692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248512
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1163	NT_187072	TCT	2	6	54487	54492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248513
1164	NT_187072	GCC	2	6	54613	54618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1165	NT_187072	CAGCG	2	10	54669	54678	20 %	0 %	40 %	40 %	409248514
1166	NT_187072	GC	3	6	54796	54801	0 %	0 %	50 %	50 %	409248514
1167	NT_187072	GCCA	2	8	54803	54810	25 %	0 %	25 %	50 %	409248514
1168	NT_187072	GCG	2	6	54892	54897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248514
1169	NT_187072	CAG	2	6	54923	54928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248514
1170	NT_187072	CGA	2	6	54961	54966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248514
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1172	NT_187072	GCC	2	6	55016	55021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248514
1173	NT_187072	AC	3	6	55076	55081	50 %	0 %	0 %	50 %	409248514
1174	NT_187072	CGAGC	2	10	55094	55103	20 %	0 %	40 %	40 %	409248514
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1189	NT_187072	CG	3	6	55725	55730	0 %	0 %	50 %	50 %	409248514
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1232	NT_187072	TCG	2	6	57784	57789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248515
1233	NT_187072	GC	3	6	57814	57819	0 %	0 %	50 %	50 %	409248515
1234	NT_187072	CAATTG	2	12	57845	57856	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	409248515
1235	NT_187072	TCCA	2	8	57869	57876	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1236	NT_187072	AG	3	6	57901	57906	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1237	NT_187072	CAGG	2	8	57923	57930	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1238	NT_187072	AATGCT	2	12	57953	57964	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1239	NT_187072	TCA	2	6	58105	58110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1240	NT_187072	GTC	2	6	58141	58146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1241	NT_187072	TCT	2	6	58170	58175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1242	NT_187072	G	6	6	58185	58190	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1243	NT_187072	T	7	7	58299	58305	0 %	100 %	0 %	0 %	409248516
1244	NT_187072	ATCG	2	8	58306	58313	25 %	25 %	25 %	25 %	409248516
1245	NT_187072	AT	3	6	58332	58337	50 %	50 %	0 %	0 %	409248516
1246	NT_187072	TAA	3	9	58371	58379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248516
1247	NT_187072	TGTC	2	8	58392	58399	0 %	50 %	25 %	25 %	409248516
1248	NT_187072	AT	3	6	58409	58414	50 %	50 %	0 %	0 %	409248516
1249	NT_187072	CCG	2	6	58423	58428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248516
1250	NT_187072	TCA	2	6	58437	58442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248516
1251	NT_187072	GC	3	6	58573	58578	0 %	0 %	50 %	50 %	409248516
1252	NT_187072	ATC	2	6	58609	58614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248516
1253	NT_187072	CTG	2	6	58663	58668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248516
1254	NT_187072	GTT	2	6	58674	58679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248516
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1256	NT_187072	CCG	2	6	58717	58722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248516
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