MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptomyces rapamycinicus NRRL 5491 genome

Total Repeats: 347051

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_022785	CGC	2	6	141096	141101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3502	NC_022785	CAGG	2	8	141175	141182	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3503	NC_022785	GAT	2	6	141217	141222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_022785	CA	3	6	141278	141283	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3505	NC_022785	CGGT	2	8	141324	141331	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3506	NC_022785	GAG	2	6	141350	141355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_022785	CG	3	6	141481	141486	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3508	NC_022785	CGC	2	6	141531	141536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3509	NC_022785	GC	3	6	141554	141559	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3510	NC_022785	GCG	2	6	141585	141590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_022785	CCGG	2	8	141593	141600	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3512	NC_022785	GAG	2	6	141679	141684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_022785	CCA	2	6	141758	141763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3514	NC_022785	CAA	2	6	141764	141769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_022785	GCC	2	6	141819	141824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3516	NC_022785	GAT	3	9	141997	142005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557683119
3517	NC_022785	GAC	2	6	142058	142063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683119
3518	NC_022785	TCG	2	6	142086	142091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683119
3519	NC_022785	CCG	2	6	142100	142105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683119
3520	NC_022785	ACG	2	6	142115	142120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683119
3521	NC_022785	GAT	2	6	142129	142134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557683119
3522	NC_022785	ACCA	2	8	142203	142210	50 %	0 %	0 %	50 %	557683119
3523	NC_022785	AGG	2	6	142239	142244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557683119
3524	NC_022785	CG	3	6	142249	142254	0 %	0 %	50 %	50 %	557683119
3525	NC_022785	CCG	2	6	142273	142278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683119
3526	NC_022785	TCA	2	6	142281	142286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557683119
3527	NC_022785	CG	3	6	142323	142328	0 %	0 %	50 %	50 %	557683119
3528	NC_022785	TGTC	2	8	142371	142378	0 %	50 %	25 %	25 %	557683119
3529	NC_022785	CGAG	2	8	142405	142412	25 %	0 %	50 %	25 %	557683119
3530	NC_022785	CGC	2	6	142417	142422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683119
3531	NC_022785	GCA	2	6	142489	142494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683119
3532	NC_022785	CCGA	2	8	142511	142518	25 %	0 %	25 %	50 %	557683119
3533	NC_022785	CGA	2	6	142729	142734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683119
3534	NC_022785	CG	3	6	142745	142750	0 %	0 %	50 %	50 %	557683119
3535	NC_022785	TTC	2	6	142796	142801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557683119
3536	NC_022785	CAG	2	6	143003	143008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_022785	AGC	2	6	143016	143021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_022785	CGTC	2	8	143033	143040	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3539	NC_022785	CGT	2	6	143081	143086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_022785	CGG	2	6	143095	143100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_022785	CACG	2	8	143103	143110	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3542	NC_022785	AGC	2	6	143111	143116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_022785	GCG	2	6	143140	143145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_022785	CAGA	2	8	143166	143173	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3545	NC_022785	CTG	2	6	143345	143350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3546	NC_022785	GCG	2	6	143384	143389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_022785	GGC	2	6	143422	143427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_022785	CAG	2	6	143428	143433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_022785	GAACG	2	10	143445	143454	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3550	NC_022785	GTC	2	6	143472	143477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_022785	CCA	3	9	143486	143494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3552	NC_022785	CCA	2	6	143496	143501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3553	NC_022785	CTG	2	6	143502	143507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_022785	CGGT	2	8	143510	143517	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3555	NC_022785	CG	3	6	143532	143537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3556	NC_022785	CGA	2	6	143554	143559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_022785	GAC	2	6	143560	143565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_022785	TGC	2	6	143639	143644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683120
3559	NC_022785	CGGC	2	8	143714	143721	0 %	0 %	50 %	50 %	557683120
3560	NC_022785	CTT	2	6	143841	143846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557683120
3561	NC_022785	GAG	2	6	143874	143879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_022785	GCCGCG	2	12	144027	144038	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3563	NC_022785	CGG	2	6	144056	144061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_022785	GTCTG	2	10	144128	144137	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3565	NC_022785	AGC	2	6	144140	144145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_022785	GCC	2	6	144202	144207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3567	NC_022785	CCGTG	2	10	144211	144220	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3568	NC_022785	CCT	2	6	144243	144248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3569	NC_022785	ACGG	2	8	144308	144315	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3570	NC_022785	GTG	2	6	144324	144329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_022785	GCT	2	6	144341	144346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_022785	GGT	2	6	144359	144364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_022785	GC	3	6	144409	144414	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3574	NC_022785	ACC	2	6	144450	144455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557683121
3575	NC_022785	ACG	2	6	144456	144461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683121
3576	NC_022785	GAC	2	6	144512	144517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683121
3577	NC_022785	GCG	2	6	144518	144523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683121
3578	NC_022785	CTG	2	6	144536	144541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683121
3579	NC_022785	GCT	2	6	144544	144549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683121
3580	NC_022785	CGATC	2	10	144574	144583	20 %	20 %	20 %	40 %	557683121
3581	NC_022785	TGG	2	6	144615	144620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557683121
3582	NC_022785	AAG	2	6	144707	144712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557683121
3583	NC_022785	GTC	2	6	144731	144736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683121
3584	NC_022785	ACCG	2	8	144771	144778	25 %	0 %	25 %	50 %	557683121
3585	NC_022785	CG	3	6	144820	144825	0 %	0 %	50 %	50 %	557683121
3586	NC_022785	CAG	2	6	144830	144835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683121
3587	NC_022785	TAC	2	6	144893	144898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557683121
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3589	NC_022785	CG	3	6	144956	144961	0 %	0 %	50 %	50 %	557683121
3590	NC_022785	GCC	2	6	144992	144997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683121
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3592	NC_022785	GCCG	2	8	145037	145044	0 %	0 %	50 %	50 %	557683121
3593	NC_022785	CCG	2	6	145090	145095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683121
3594	NC_022785	CTC	2	6	145154	145159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557683121
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3597	NC_022785	ATC	2	6	145244	145249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557683121
3598	NC_022785	CGA	2	6	145306	145311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683121
3599	NC_022785	GCC	2	6	145389	145394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683121
3600	NC_022785	TCAC	2	8	145398	145405	25 %	25 %	0 %	50 %	557683121
3601	NC_022785	CCG	2	6	145498	145503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683121
3602	NC_022785	CAA	2	6	145507	145512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557683121
3603	NC_022785	CCA	2	6	145570	145575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557683121
3604	NC_022785	CCA	2	6	145588	145593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557683121
3605	NC_022785	CGA	2	6	145600	145605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683121
3606	NC_022785	CTCG	2	8	145636	145643	0 %	25 %	25 %	50 %	557683121
3607	NC_022785	GCT	2	6	145649	145654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683121
3608	NC_022785	GCG	2	6	145703	145708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683122
3609	NC_022785	CGG	2	6	145722	145727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683122
3610	NC_022785	GCC	2	6	145847	145852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3611	NC_022785	CTT	2	6	145853	145858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_022785	T	6	6	145897	145902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_022785	GTCCA	2	10	145937	145946	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3614	NC_022785	CAGCC	2	10	145999	146008	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3615	NC_022785	GCC	2	6	146073	146078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3616	NC_022785	AGC	2	6	146082	146087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_022785	CGA	2	6	146114	146119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3618	NC_022785	CGA	2	6	146135	146140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_022785	GCC	2	6	146187	146192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3620	NC_022785	GCC	2	6	146202	146207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3621	NC_022785	GGCC	2	8	146261	146268	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3622	NC_022785	ATC	2	6	146282	146287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3623	NC_022785	GCC	2	6	146539	146544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3624	NC_022785	CGA	2	6	146548	146553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3625	NC_022785	CTC	2	6	146564	146569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3626	NC_022785	CGCT	2	8	146579	146586	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3627	NC_022785	GTC	2	6	146633	146638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3628	NC_022785	CAT	2	6	146740	146745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3630	NC_022785	CCG	2	6	146914	146919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3631	NC_022785	CACAC	5	25	147100	147124	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
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3749	NC_022785	GC	3	6	151480	151485	0 %	0 %	50 %	50 %	557683128
3750	NC_022785	CAGA	2	8	151492	151499	50 %	0 %	25 %	25 %	557683128
3751	NC_022785	CGA	2	6	151556	151561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683128
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3753	NC_022785	GGC	2	6	151664	151669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683128
3754	NC_022785	GTC	2	6	151672	151677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683128
3755	NC_022785	GGT	2	6	151699	151704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557683128
3756	NC_022785	CCG	2	6	151757	151762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683128
3757	NC_022785	TGC	2	6	151820	151825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683128
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3759	NC_022785	TGCGC	2	10	151935	151944	0 %	20 %	40 %	40 %	557683128
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3794	NC_022785	GCCG	2	8	153237	153244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3795	NC_022785	CCT	2	6	153259	153264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3796	NC_022785	CCG	2	6	153287	153292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3830	NC_022785	ATCC	2	8	154415	154422	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3831	NC_022785	GGA	2	6	154484	154489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3834	NC_022785	GCA	2	6	154593	154598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3872	NC_022785	CCA	2	6	155937	155942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557683133
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3997	NC_022785	TCG	2	6	160677	160682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683139
3998	NC_022785	CGGTG	2	10	160690	160699	0 %	20 %	60 %	20 %	557683139
3999	NC_022785	GTC	2	6	160714	160719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683139
4000	NC_022785	ACC	2	6	160724	160729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557683139

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