MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptomyces rapamycinicus NRRL 5491 genome

Total Repeats: 347051

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35118	NC_022785	TGAA	2	8	1318755	1318762	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35119	NC_022785	TG	3	6	1318764	1318769	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35120	NC_022785	TCA	2	6	1318796	1318801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35121	NC_022785	CCCT	2	8	1318805	1318812	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
35122	NC_022785	GA	3	6	1318827	1318832	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35123	NC_022785	AGA	2	6	1318845	1318850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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35141	NC_022785	GC	3	6	1319567	1319572	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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35145	NC_022785	GGC	2	6	1319764	1319769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35146	NC_022785	CGG	2	6	1319778	1319783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35147	NC_022785	GTG	2	6	1319795	1319800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35148	NC_022785	AAG	2	6	1319840	1319845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35149	NC_022785	GTG	2	6	1319879	1319884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35150	NC_022785	CTG	2	6	1319885	1319890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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35221	NC_022785	CGA	2	6	1322341	1322346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557684059
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35238	NC_022785	CGG	2	6	1322847	1322852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557684059
35239	NC_022785	GAG	2	6	1322867	1322872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557684059
35240	NC_022785	CTC	2	6	1322896	1322901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557684059
35241	NC_022785	CCCA	2	8	1322927	1322934	25 %	0 %	0 %	75 %	557684059
35242	NC_022785	ACG	2	6	1323028	1323033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557684060
35243	NC_022785	TCG	2	6	1323074	1323079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557684060
35244	NC_022785	TCG	2	6	1323092	1323097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557684060
35245	NC_022785	GC	3	6	1323111	1323116	0 %	0 %	50 %	50 %	557684060
35246	NC_022785	CGA	2	6	1323150	1323155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557684060
35247	NC_022785	CGA	2	6	1323180	1323185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557684060
35248	NC_022785	CGA	2	6	1323237	1323242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557684060
35249	NC_022785	GGCCGA	2	12	1323261	1323272	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	557684060
35250	NC_022785	GC	4	8	1323274	1323281	0 %	0 %	50 %	50 %	557684060
35251	NC_022785	CGC	2	6	1323285	1323290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557684060
35252	NC_022785	GGGT	2	8	1323296	1323303	0 %	25 %	75 %	0 %	557684060
35253	NC_022785	ACCCG	2	10	1323305	1323314	20 %	0 %	20 %	60 %	557684060
35254	NC_022785	CTG	2	6	1323367	1323372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557684060
35255	NC_022785	ACG	2	6	1323428	1323433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557684060
35256	NC_022785	CGC	2	6	1323442	1323447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557684060
35257	NC_022785	CCG	3	9	1323488	1323496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557684060
35258	NC_022785	GCC	2	6	1323502	1323507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557684060
35259	NC_022785	CG	3	6	1323538	1323543	0 %	0 %	50 %	50 %	557684060
35260	NC_022785	GGT	2	6	1323544	1323549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557684060
35261	NC_022785	CTG	3	9	1323550	1323558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557684060
35262	NC_022785	GAG	2	6	1323562	1323567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557684060
35263	NC_022785	CG	3	6	1323589	1323594	0 %	0 %	50 %	50 %	557684060
35264	NC_022785	AC	3	6	1323638	1323643	50 %	0 %	0 %	50 %	557684060
35265	NC_022785	TCG	2	6	1323656	1323661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557684060
35266	NC_022785	CGC	2	6	1323726	1323731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557684060
35267	NC_022785	GAG	2	6	1323733	1323738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557684060
35268	NC_022785	GGA	2	6	1323756	1323761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557684060
35269	NC_022785	GCG	2	6	1323767	1323772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557684060
35270	NC_022785	CCT	2	6	1323905	1323910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557684060
35271	NC_022785	CGT	2	6	1323993	1323998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557684060
35272	NC_022785	CGC	2	6	1324023	1324028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557684060
35273	NC_022785	TCC	2	6	1324033	1324038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557684060
35274	NC_022785	CCG	2	6	1324042	1324047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557684060
35275	NC_022785	TGC	3	9	1324049	1324057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557684060
35276	NC_022785	CG	3	6	1324064	1324069	0 %	0 %	50 %	50 %	557684060
35277	NC_022785	GGC	2	6	1324086	1324091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557684060
35278	NC_022785	CCT	2	6	1324146	1324151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557684060
35279	NC_022785	TCC	2	6	1324160	1324165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557684060
35280	NC_022785	GCC	2	6	1324189	1324194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557684060
35281	NC_022785	GCC	2	6	1324201	1324206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557684060
35282	NC_022785	CGC	2	6	1324212	1324217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557684060
35283	NC_022785	CGG	2	6	1324224	1324229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557684060
35284	NC_022785	CGG	2	6	1324277	1324282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557684060
35285	NC_022785	CGCC	2	8	1324296	1324303	0 %	0 %	25 %	75 %	557684060
35286	NC_022785	TCC	2	6	1324341	1324346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557684060
35287	NC_022785	CCGC	2	8	1324376	1324383	0 %	0 %	25 %	75 %	557684060
35288	NC_022785	ACCGGG	2	12	1324391	1324402	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	557684060
35289	NC_022785	GCG	2	6	1324430	1324435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557684060
35290	NC_022785	GCG	2	6	1324445	1324450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557684060
35291	NC_022785	CGC	2	6	1324509	1324514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557684060
35292	NC_022785	GAA	2	6	1324584	1324589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557684060
35293	NC_022785	GCC	2	6	1324612	1324617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557684060
35294	NC_022785	CGA	2	6	1324641	1324646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557684060
35295	NC_022785	AG	3	6	1324710	1324715	50 %	0 %	50 %	0 %	557684060
35296	NC_022785	TCC	2	6	1324724	1324729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557684060
35297	NC_022785	CCA	2	6	1324766	1324771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557684060
35298	NC_022785	GAC	2	6	1324789	1324794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557684060
35299	NC_022785	CCG	2	6	1324803	1324808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557684060
35300	NC_022785	TCG	2	6	1324817	1324822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557684060
35301	NC_022785	ACC	2	6	1324847	1324852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557684060
35302	NC_022785	CTG	2	6	1324858	1324863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557684060
35303	NC_022785	CTGGAC	2	12	1324906	1324917	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	557684060
35304	NC_022785	CGG	2	6	1324944	1324949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557684060
35305	NC_022785	CGGT	2	8	1324957	1324964	0 %	25 %	50 %	25 %	557684060
35306	NC_022785	CCG	2	6	1324973	1324978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557684060
35307	NC_022785	CGG	2	6	1324998	1325003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557684060
35308	NC_022785	GCT	2	6	1325100	1325105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557684060
35309	NC_022785	CGA	2	6	1325121	1325126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35310	NC_022785	AGCCGA	2	12	1325139	1325150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557684061
35311	NC_022785	GAC	2	6	1325173	1325178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557684061
35312	NC_022785	C	6	6	1325205	1325210	0 %	0 %	0 %	100 %	557684061
35313	NC_022785	CGT	2	6	1325297	1325302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557684061
35314	NC_022785	CGA	2	6	1325348	1325353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557684061
35315	NC_022785	CGC	2	6	1325384	1325389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557684061
35316	NC_022785	TGG	2	6	1325407	1325412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557684061
35317	NC_022785	TTG	2	6	1325440	1325445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557684061
35318	NC_022785	TGGA	2	8	1325488	1325495	25 %	25 %	50 %	0 %	557684061
35319	NC_022785	CTT	2	6	1325547	1325552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557684061
35320	NC_022785	TGG	2	6	1325635	1325640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557684061
35321	NC_022785	GAT	2	6	1325652	1325657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557684061
35322	NC_022785	CTT	2	6	1325682	1325687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557684061
35323	NC_022785	ATG	2	6	1325842	1325847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557684061
35324	NC_022785	CAGC	2	8	1325973	1325980	25 %	0 %	25 %	50 %	557684061
35325	NC_022785	TGC	2	6	1325981	1325986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557684061
35326	NC_022785	AGCC	2	8	1326007	1326014	25 %	0 %	25 %	50 %	557684061
35327	NC_022785	TGG	2	6	1326050	1326055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557684061
35328	NC_022785	CAG	2	6	1326165	1326170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557684061
35329	NC_022785	GT	3	6	1326182	1326187	0 %	50 %	50 %	0 %	557684061
35330	NC_022785	CGG	2	6	1326203	1326208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557684061
35331	NC_022785	GGT	2	6	1326279	1326284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557684061
35332	NC_022785	CGG	2	6	1326380	1326385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557684061
35333	NC_022785	TGG	2	6	1326479	1326484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557684061
35334	NC_022785	CCGA	2	8	1326496	1326503	25 %	0 %	25 %	50 %	557684061
35335	NC_022785	CGT	2	6	1326524	1326529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557684061
35336	NC_022785	CAG	2	6	1326531	1326536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557684061
35337	NC_022785	CAC	2	6	1326549	1326554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557684061
35338	NC_022785	AGG	2	6	1326595	1326600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557684061
35339	NC_022785	GCC	2	6	1326625	1326630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557684061
35340	NC_022785	CCA	2	6	1326644	1326649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557684061
35341	NC_022785	CGC	2	6	1326652	1326657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557684061
35342	NC_022785	TCG	2	6	1326662	1326667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557684061
35343	NC_022785	GCA	2	6	1326668	1326673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557684061
35344	NC_022785	AGC	3	9	1326676	1326684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557684061
35345	NC_022785	CGA	2	6	1326734	1326739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557684061
35346	NC_022785	AGG	3	9	1326757	1326765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557684061
35347	NC_022785	GCGA	2	8	1326781	1326788	25 %	0 %	50 %	25 %	557684061
35348	NC_022785	CCGT	2	8	1326812	1326819	0 %	25 %	25 %	50 %	557684061
35349	NC_022785	GCGG	2	8	1326852	1326859	0 %	0 %	75 %	25 %	557684061
35350	NC_022785	GGT	2	6	1326888	1326893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557684061
35351	NC_022785	CTC	2	6	1326894	1326899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557684061
35352	NC_022785	CCT	2	6	1326908	1326913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557684061
35353	NC_022785	CCT	2	6	1326917	1326922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557684061
35354	NC_022785	G	6	6	1326942	1326947	0 %	0 %	100 %	0 %	557684061
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35365	NC_022785	GC	3	6	1327414	1327419	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35366	NC_022785	GGA	2	6	1327472	1327477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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35460	NC_022785	CA	3	6	1330782	1330787	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35461	NC_022785	CCT	2	6	1330789	1330794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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35466	NC_022785	CGC	2	6	1331038	1331043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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35470	NC_022785	CGA	2	6	1331158	1331163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557684067
35471	NC_022785	TCG	2	6	1331169	1331174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557684067
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35473	NC_022785	CGG	2	6	1331368	1331373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557684067
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35485	NC_022785	GCC	2	6	1331957	1331962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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