MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptomyces rapamycinicus NRRL 5491 genome

Total Repeats: 347051

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_022785	CGC	2	6	121452	121457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683107
3003	NC_022785	GCT	2	6	121469	121474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683107
3004	NC_022785	ACC	2	6	121540	121545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557683107
3005	NC_022785	CCA	3	9	121589	121597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557683107
3006	NC_022785	ACGCCC	2	12	121600	121611	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	557683107
3007	NC_022785	CGC	2	6	121638	121643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683107
3008	NC_022785	GAGC	2	8	121667	121674	25 %	0 %	50 %	25 %	557683107
3009	NC_022785	GC	3	6	121745	121750	0 %	0 %	50 %	50 %	557683107
3010	NC_022785	CCA	2	6	121790	121795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557683107
3011	NC_022785	CCGG	2	8	121860	121867	0 %	0 %	50 %	50 %	557683107
3012	NC_022785	CCT	2	6	121910	121915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557683107
3013	NC_022785	CGG	2	6	121970	121975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683107
3014	NC_022785	GCCC	2	8	122007	122014	0 %	0 %	25 %	75 %	557683107
3015	NC_022785	CAG	3	9	122040	122048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683107
3016	NC_022785	GCT	2	6	122051	122056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683107
3017	NC_022785	GAA	2	6	122094	122099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557683107
3018	NC_022785	CGT	2	6	122120	122125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683107
3019	NC_022785	GGA	2	6	122126	122131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557683107
3020	NC_022785	GTC	2	6	122214	122219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683107
3021	NC_022785	CTC	2	6	122268	122273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557683107
3022	NC_022785	CGA	2	6	122312	122317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683107
3023	NC_022785	TGGT	2	8	122332	122339	0 %	50 %	50 %	0 %	557683107
3024	NC_022785	CGG	2	6	122348	122353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683107
3025	NC_022785	AGGC	2	8	122363	122370	25 %	0 %	50 %	25 %	557683107
3026	NC_022785	GCC	2	6	122371	122376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683107
3027	NC_022785	GCA	2	6	122387	122392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683107
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3029	NC_022785	GGT	2	6	122483	122488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557683107
3030	NC_022785	CG	3	6	122535	122540	0 %	0 %	50 %	50 %	557683107
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3032	NC_022785	GGCC	2	8	122642	122649	0 %	0 %	50 %	50 %	557683107
3033	NC_022785	CGCC	2	8	122834	122841	0 %	0 %	25 %	75 %	557683107
3034	NC_022785	GCC	2	6	122885	122890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683107
3035	NC_022785	CTT	2	6	122924	122929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557683107
3036	NC_022785	AGGCCG	2	12	122965	122976	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	557683107
3037	NC_022785	GGA	2	6	123060	123065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557683107
3038	NC_022785	GCA	2	6	123140	123145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683107
3039	NC_022785	ACG	2	6	123178	123183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683107
3040	NC_022785	CGT	2	6	123185	123190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683107
3041	NC_022785	CCG	2	6	123197	123202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683107
3042	NC_022785	TCG	2	6	123232	123237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683107
3043	NC_022785	CGT	2	6	123242	123247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683107
3044	NC_022785	GAG	2	6	123249	123254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557683107
3045	NC_022785	CG	3	6	123267	123272	0 %	0 %	50 %	50 %	557683107
3046	NC_022785	CGG	2	6	123364	123369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683107
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3053	NC_022785	CCG	2	6	123578	123583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683107
3054	NC_022785	CGG	2	6	123589	123594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683107
3055	NC_022785	CG	4	8	123597	123604	0 %	0 %	50 %	50 %	557683107
3056	NC_022785	CCA	2	6	123626	123631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557683107
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3065	NC_022785	CCGCGG	2	12	123992	124003	0 %	0 %	50 %	50 %	557683107
3066	NC_022785	CAG	2	6	124044	124049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683107
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3074	NC_022785	CGGCG	2	10	124284	124293	0 %	0 %	60 %	40 %	557683107
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3103	NC_022785	GAACAC	2	12	125331	125342	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	557683107
3104	NC_022785	CCG	2	6	125359	125364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683107
3105	NC_022785	CG	3	6	125368	125373	0 %	0 %	50 %	50 %	557683107
3106	NC_022785	TCG	2	6	125381	125386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683107
3107	NC_022785	GAG	2	6	125418	125423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557683107
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3111	NC_022785	GC	3	6	125520	125525	0 %	0 %	50 %	50 %	557683107
3112	NC_022785	AGGA	2	8	125530	125537	50 %	0 %	50 %	0 %	557683107
3113	NC_022785	GCC	2	6	125543	125548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683107
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3119	NC_022785	GAC	2	6	125729	125734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683107
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3122	NC_022785	C	6	6	125776	125781	0 %	0 %	0 %	100 %	557683107
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3234	NC_022785	GA	3	6	130105	130110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3235	NC_022785	AGA	2	6	130152	130157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3236	NC_022785	CCG	2	6	130247	130252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3237	NC_022785	GCC	2	6	130260	130265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3238	NC_022785	CCG	2	6	130378	130383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3239	NC_022785	GCCCA	2	10	130396	130405	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3240	NC_022785	GAT	2	6	130424	130429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3241	NC_022785	CCG	2	6	130501	130506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3242	NC_022785	CA	3	6	130532	130537	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3243	NC_022785	GCC	2	6	130559	130564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3244	NC_022785	ATC	2	6	130592	130597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3245	NC_022785	GCTCA	2	10	130700	130709	20 %	20 %	20 %	40 %	557683108
3246	NC_022785	GAC	3	9	130739	130747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683108
3247	NC_022785	CAC	2	6	130759	130764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557683108
3248	NC_022785	CGACC	2	10	130786	130795	20 %	0 %	20 %	60 %	557683108
3249	NC_022785	GCG	2	6	130855	130860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683108
3250	NC_022785	GGA	2	6	130891	130896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557683108
3251	NC_022785	CGA	2	6	130936	130941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683108
3252	NC_022785	CACC	2	8	131023	131030	25 %	0 %	0 %	75 %	557683108
3253	NC_022785	GCT	2	6	131071	131076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683108
3254	NC_022785	GAC	2	6	131161	131166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683108
3255	NC_022785	GACG	2	8	131188	131195	25 %	0 %	50 %	25 %	557683108
3256	NC_022785	CACGA	2	10	131249	131258	40 %	0 %	20 %	40 %	557683108
3257	NC_022785	GCA	2	6	131284	131289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683108
3258	NC_022785	TCG	2	6	131316	131321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683108
3259	NC_022785	AGCA	2	8	131330	131337	50 %	0 %	25 %	25 %	557683108
3260	NC_022785	CGC	2	6	131356	131361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683108
3261	NC_022785	CTG	2	6	131390	131395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683108
3262	NC_022785	CAC	2	6	131429	131434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557683108
3263	NC_022785	CCT	2	6	131494	131499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557683108
3264	NC_022785	GCCGC	2	10	131524	131533	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3265	NC_022785	GAA	2	6	131542	131547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3266	NC_022785	CCAGC	2	10	131603	131612	20 %	0 %	20 %	60 %	557683109
3267	NC_022785	GC	3	6	131618	131623	0 %	0 %	50 %	50 %	557683109
3268	NC_022785	CGC	2	6	131650	131655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683109
3269	NC_022785	TGG	2	6	131746	131751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557683109
3270	NC_022785	CGC	2	6	131798	131803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683109
3271	NC_022785	CAC	2	6	131807	131812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557683109
3272	NC_022785	ACGT	2	8	131828	131835	25 %	25 %	25 %	25 %	557683109
3273	NC_022785	CGA	2	6	131836	131841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683109
3274	NC_022785	GTC	2	6	131852	131857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683109
3275	NC_022785	GAC	2	6	131858	131863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683109
3276	NC_022785	GCG	2	6	131875	131880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683109
3277	NC_022785	TGG	2	6	131890	131895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557683109
3278	NC_022785	GCG	2	6	131907	131912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683109
3279	NC_022785	GC	3	6	132038	132043	0 %	0 %	50 %	50 %	557683109
3280	NC_022785	TCC	2	6	132072	132077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557683109
3281	NC_022785	AGC	2	6	132132	132137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683109
3282	NC_022785	CGT	2	6	132144	132149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683109
3283	NC_022785	GC	3	6	132165	132170	0 %	0 %	50 %	50 %	557683109
3284	NC_022785	CGA	2	6	132181	132186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683109
3285	NC_022785	CGCC	2	8	132235	132242	0 %	0 %	25 %	75 %	557683109
3286	NC_022785	GAC	2	6	132248	132253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683109
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3288	NC_022785	GGAA	2	8	132315	132322	50 %	0 %	50 %	0 %	557683109
3289	NC_022785	TCT	2	6	132350	132355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557683109
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3292	NC_022785	GAC	2	6	132434	132439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683109
3293	NC_022785	CG	3	6	132508	132513	0 %	0 %	50 %	50 %	557683110
3294	NC_022785	ACG	2	6	132534	132539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683110
3295	NC_022785	GCA	2	6	132540	132545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683110
3296	NC_022785	GC	3	6	132551	132556	0 %	0 %	50 %	50 %	557683110
3297	NC_022785	CGG	2	6	132666	132671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683110
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3300	NC_022785	ACCC	2	8	132820	132827	25 %	0 %	0 %	75 %	557683110
3301	NC_022785	ACC	2	6	132836	132841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557683110
3302	NC_022785	AGC	2	6	132848	132853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683110
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3305	NC_022785	CGC	2	6	132912	132917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683110
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3310	NC_022785	AGG	2	6	133193	133198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557683111
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3313	NC_022785	GTGCC	2	10	133358	133367	0 %	20 %	40 %	40 %	557683111
3314	NC_022785	GCC	2	6	133380	133385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683111
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3319	NC_022785	GT	3	6	133529	133534	0 %	50 %	50 %	0 %	557683111
3320	NC_022785	AGG	2	6	133555	133560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557683111
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3322	NC_022785	GAC	2	6	133602	133607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683111
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3324	NC_022785	TCG	2	6	133759	133764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683111
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3329	NC_022785	CG	3	6	133925	133930	0 %	0 %	50 %	50 %	557683111
3330	NC_022785	GGTCG	2	10	133973	133982	0 %	20 %	60 %	20 %	557683111
3331	NC_022785	GCG	2	6	133986	133991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683111
3332	NC_022785	CCA	2	6	134222	134227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557683111
3333	NC_022785	GCT	2	6	134235	134240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683111
3334	NC_022785	CGT	2	6	134252	134257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683111
3335	NC_022785	AG	3	6	134316	134321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3336	NC_022785	TCG	2	6	134342	134347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3337	NC_022785	CCTC	2	8	134350	134357	0 %	25 %	0 %	75 %	557683112
3338	NC_022785	CCG	2	6	134372	134377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683112
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3343	NC_022785	CTC	2	6	134512	134517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557683112
3344	NC_022785	GTC	2	6	134530	134535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683112
3345	NC_022785	CGA	2	6	134553	134558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683112
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3347	NC_022785	GCA	2	6	134643	134648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683112
3348	NC_022785	TCG	2	6	134657	134662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683112
3349	NC_022785	CGA	2	6	134703	134708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683112
3350	NC_022785	CGT	2	6	134715	134720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683112
3351	NC_022785	AGC	2	6	134813	134818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683112
3352	NC_022785	CGG	2	6	134838	134843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683112
3353	NC_022785	GAC	2	6	134980	134985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683112
3354	NC_022785	GAG	2	6	135007	135012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557683112
3355	NC_022785	AC	3	6	135061	135066	50 %	0 %	0 %	50 %	557683112
3356	NC_022785	CGGA	2	8	135091	135098	25 %	0 %	50 %	25 %	557683112
3357	NC_022785	ACC	2	6	135108	135113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557683112
3358	NC_022785	GTT	2	6	135149	135154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3359	NC_022785	TTCCT	2	10	135168	135177	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3360	NC_022785	CACC	2	8	135225	135232	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3361	NC_022785	CCA	2	6	135259	135264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557683113
3362	NC_022785	CGC	2	6	135269	135274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683113
3363	NC_022785	CCA	2	6	135297	135302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557683113
3364	NC_022785	CTC	2	6	135307	135312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557683113
3365	NC_022785	CGG	2	6	135321	135326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683113
3366	NC_022785	CGC	2	6	135342	135347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683113
3367	NC_022785	AGC	2	6	135440	135445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683113
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3369	NC_022785	TGT	2	6	135489	135494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557683113
3370	NC_022785	GTC	2	6	135547	135552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683113
3371	NC_022785	TGA	2	6	135624	135629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557683113
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3471	NC_022785	GCCTC	2	10	140096	140105	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3472	NC_022785	GGA	2	6	140121	140126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3473	NC_022785	CGA	2	6	140142	140147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3475	NC_022785	CCGC	2	8	140161	140168	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3476	NC_022785	TCG	2	6	140183	140188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3477	NC_022785	GCG	2	6	140195	140200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3478	NC_022785	CCG	2	6	140232	140237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3485	NC_022785	GCC	2	6	140448	140453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3486	NC_022785	GAC	2	6	140534	140539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3488	NC_022785	GC	3	6	140765	140770	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3489	NC_022785	CTG	2	6	140799	140804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3490	NC_022785	GGT	2	6	140805	140810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3491	NC_022785	CAG	2	6	140840	140845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3492	NC_022785	ACT	2	6	140851	140856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3493	NC_022785	GGT	2	6	140891	140896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3494	NC_022785	GACC	2	8	140897	140904	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3495	NC_022785	GGC	2	6	140911	140916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3496	NC_022785	CACC	2	8	140973	140980	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3497	NC_022785	CG	3	6	140989	140994	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3498	NC_022785	CGG	2	6	140999	141004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3499	NC_022785	CGAAT	2	10	141077	141086	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3500	NC_022785	GTC	2	6	141087	141092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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