MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptomyces rapamycinicus NRRL 5491 genome

Total Repeats: 347051

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_022785	CGAA	2	8	101564	101571	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2502	NC_022785	CCT	2	6	101595	101600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2503	NC_022785	GGC	2	6	101616	101621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2504	NC_022785	GCG	2	6	101654	101659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2505	NC_022785	CG	3	6	101676	101681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2506	NC_022785	GTG	2	6	101710	101715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557683102
2507	NC_022785	CTC	2	6	101734	101739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557683102
2508	NC_022785	CTG	2	6	101746	101751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683102
2509	NC_022785	GC	3	6	101867	101872	0 %	0 %	50 %	50 %	557683102
2510	NC_022785	CCA	2	6	101909	101914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557683102
2511	NC_022785	CAA	2	6	101937	101942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557683102
2512	NC_022785	GCC	2	6	101959	101964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683102
2513	NC_022785	GAG	2	6	101968	101973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557683102
2514	NC_022785	GC	3	6	101989	101994	0 %	0 %	50 %	50 %	557683102
2515	NC_022785	CCTG	2	8	102005	102012	0 %	25 %	25 %	50 %	557683102
2516	NC_022785	CGA	2	6	102021	102026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683102
2517	NC_022785	TAC	2	6	102031	102036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557683102
2518	NC_022785	CG	4	8	102042	102049	0 %	0 %	50 %	50 %	557683102
2519	NC_022785	GTG	2	6	102100	102105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557683102
2520	NC_022785	AGC	2	6	102182	102187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683102
2521	NC_022785	GCCT	2	8	102196	102203	0 %	25 %	25 %	50 %	557683102
2522	NC_022785	GCA	2	6	102228	102233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683102
2523	NC_022785	GGC	2	6	102243	102248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683102
2524	NC_022785	TGC	2	6	102269	102274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683102
2525	NC_022785	CGC	2	6	102301	102306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683102
2526	NC_022785	TGG	2	6	102323	102328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557683102
2527	NC_022785	ACG	2	6	102488	102493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683102
2528	NC_022785	CGC	2	6	102501	102506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683102
2529	NC_022785	GCC	2	6	102521	102526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683102
2530	NC_022785	AAG	2	6	102559	102564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557683102
2531	NC_022785	GCTC	2	8	102582	102589	0 %	25 %	25 %	50 %	557683102
2532	NC_022785	ACG	2	6	102630	102635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2533	NC_022785	GAC	2	6	102654	102659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683103
2534	NC_022785	GTC	2	6	102681	102686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683103
2535	NC_022785	CTA	2	6	102824	102829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557683103
2536	NC_022785	CGG	2	6	102842	102847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683103
2537	NC_022785	GTC	2	6	102852	102857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683103
2538	NC_022785	CGA	2	6	102881	102886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683103
2539	NC_022785	CGG	2	6	102917	102922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683103
2540	NC_022785	GCC	2	6	103063	103068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683103
2541	NC_022785	CGC	2	6	103150	103155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683103
2542	NC_022785	TCG	2	6	103162	103167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683103
2543	NC_022785	CGG	2	6	103198	103203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683103
2544	NC_022785	CGC	2	6	103204	103209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683103
2545	NC_022785	TCG	2	6	103216	103221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683103
2546	NC_022785	GCT	2	6	103328	103333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683103
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2548	NC_022785	CGA	2	6	103361	103366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683103
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2551	NC_022785	GTC	2	6	103522	103527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683103
2552	NC_022785	TCGCCG	2	12	103531	103542	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	557683103
2553	NC_022785	CG	3	6	103632	103637	0 %	0 %	50 %	50 %	557683104
2554	NC_022785	GC	3	6	103647	103652	0 %	0 %	50 %	50 %	557683104
2555	NC_022785	AGG	2	6	103659	103664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557683104
2556	NC_022785	CGG	2	6	103684	103689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683104
2557	NC_022785	ATC	2	6	103710	103715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557683104
2558	NC_022785	TCA	2	6	103795	103800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557683104
2559	NC_022785	AGA	2	6	103980	103985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557683104
2560	NC_022785	CTG	2	6	103989	103994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683104
2561	NC_022785	TCCG	2	8	104031	104038	0 %	25 %	25 %	50 %	557683104
2562	NC_022785	TGCG	2	8	104040	104047	0 %	25 %	50 %	25 %	557683104
2563	NC_022785	CACCG	2	10	104054	104063	20 %	0 %	20 %	60 %	557683104
2564	NC_022785	CGG	2	6	104104	104109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683104
2565	NC_022785	CAG	2	6	104112	104117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683104
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2567	NC_022785	CAA	3	9	104246	104254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557683104
2568	NC_022785	AGC	2	6	104301	104306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683104
2569	NC_022785	GGTCC	2	10	104360	104369	0 %	20 %	40 %	40 %	557683104
2570	NC_022785	CGGT	2	8	104376	104383	0 %	25 %	50 %	25 %	557683104
2571	NC_022785	CGC	2	6	104423	104428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683104
2572	NC_022785	GCTG	2	8	104452	104459	0 %	25 %	50 %	25 %	557683104
2573	NC_022785	AGC	2	6	104493	104498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683104
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2575	NC_022785	TC	3	6	104726	104731	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2576	NC_022785	AGG	2	6	104752	104757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2577	NC_022785	CTG	2	6	104779	104784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2578	NC_022785	CGA	2	6	104798	104803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2579	NC_022785	AAC	2	6	104812	104817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2580	NC_022785	CAG	2	6	105007	105012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683105
2581	NC_022785	AGG	2	6	105036	105041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557683105
2582	NC_022785	CCT	2	6	105060	105065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557683105
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2584	NC_022785	CCA	2	6	105084	105089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557683105
2585	NC_022785	CCG	3	9	105105	105113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683105
2586	NC_022785	TCG	2	6	105257	105262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683105
2587	NC_022785	GTG	2	6	105278	105283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557683105
2588	NC_022785	GATC	2	8	105286	105293	25 %	25 %	25 %	25 %	557683105
2589	NC_022785	GCC	2	6	105296	105301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683105
2590	NC_022785	GGA	2	6	105334	105339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557683105
2591	NC_022785	GGC	2	6	105361	105366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683105
2592	NC_022785	GCC	2	6	105390	105395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683105
2593	NC_022785	GCGGAC	2	12	105427	105438	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	557683105
2594	NC_022785	TCG	2	6	105503	105508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683105
2595	NC_022785	C	6	6	105515	105520	0 %	0 %	0 %	100 %	557683105
2596	NC_022785	GTCC	2	8	105537	105544	0 %	25 %	25 %	50 %	557683105
2597	NC_022785	TCA	2	6	105596	105601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557683105
2598	NC_022785	AACC	2	8	105620	105627	50 %	0 %	0 %	50 %	557683105
2599	NC_022785	GGCA	2	8	105667	105674	25 %	0 %	50 %	25 %	557683105
2600	NC_022785	C	6	6	105683	105688	0 %	0 %	0 %	100 %	557683105
2601	NC_022785	CCG	2	6	105743	105748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683105
2602	NC_022785	CTC	3	9	105859	105867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557683105
2603	NC_022785	TGC	2	6	105912	105917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683105
2604	NC_022785	GAG	2	6	105928	105933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557683105
2605	NC_022785	AGG	2	6	105972	105977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557683105
2606	NC_022785	CCG	2	6	106052	106057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683105
2607	NC_022785	TGA	2	6	106065	106070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557683105
2608	NC_022785	GAG	2	6	106102	106107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557683105
2609	NC_022785	CTC	2	6	106168	106173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557683105
2610	NC_022785	CCA	2	6	106232	106237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2611	NC_022785	ACC	2	6	106240	106245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2612	NC_022785	CGA	2	6	106248	106253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2613	NC_022785	CAA	2	6	106254	106259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2614	NC_022785	CTGA	2	8	106269	106276	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2615	NC_022785	CAT	2	6	106348	106353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2616	NC_022785	CG	3	6	106356	106361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2617	NC_022785	GCA	2	6	106362	106367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2618	NC_022785	GTCG	2	8	106416	106423	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2619	NC_022785	G	6	6	106478	106483	0 %	0 %	100 %	0 %	557683106
2620	NC_022785	CGG	2	6	106549	106554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683106
2621	NC_022785	CGG	2	6	106635	106640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683106
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2623	NC_022785	GC	3	6	106692	106697	0 %	0 %	50 %	50 %	557683106
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2745	NC_022785	CGC	2	6	111019	111024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683106
2746	NC_022785	CGA	2	6	111046	111051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683106
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2988	NC_022785	G	7	7	120936	120942	0 %	0 %	100 %	0 %	557683107
2989	NC_022785	CCG	2	6	120946	120951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683107
2990	NC_022785	TCG	2	6	120982	120987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683107
2991	NC_022785	GCC	2	6	121006	121011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683107
2992	NC_022785	CGTT	2	8	121067	121074	0 %	50 %	25 %	25 %	557683107
2993	NC_022785	AGG	2	6	121088	121093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557683107
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2995	NC_022785	CAG	2	6	121146	121151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683107
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3000	NC_022785	CGT	2	6	121386	121391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683107

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