MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptomyces rapamycinicus NRRL 5491 genome

Total Repeats: 347051

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022785	CG	3	6	43224	43229	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1002	NC_022785	GTC	2	6	43245	43250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_022785	ACC	2	6	43276	43281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1004	NC_022785	AG	3	6	43311	43316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_022785	TC	3	6	43393	43398	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1006	NC_022785	AGA	2	6	43400	43405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_022785	CCG	2	6	43415	43420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1008	NC_022785	CAT	2	6	43534	43539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_022785	T	6	6	43602	43607	0 %	100 %	0 %	0 %	557683072
1010	NC_022785	CAG	2	6	43717	43722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683072
1011	NC_022785	CTT	2	6	43810	43815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557683072
1012	NC_022785	TCT	2	6	43830	43835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557683072
1013	NC_022785	ACG	2	6	43838	43843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683072
1014	NC_022785	AGA	2	6	43851	43856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557683072
1015	NC_022785	GAT	2	6	43882	43887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557683072
1016	NC_022785	CCAT	2	8	43963	43970	25 %	25 %	0 %	50 %	557683072
1017	NC_022785	GTA	2	6	44032	44037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557683072
1018	NC_022785	TCA	2	6	44051	44056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557683072
1019	NC_022785	GGC	2	6	44057	44062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683072
1020	NC_022785	GGAT	2	8	44069	44076	25 %	25 %	50 %	0 %	557683072
1021	NC_022785	AT	4	8	44075	44082	50 %	50 %	0 %	0 %	557683072
1022	NC_022785	GC	4	8	44102	44109	0 %	0 %	50 %	50 %	557683072
1023	NC_022785	CAG	2	6	44110	44115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683072
1024	NC_022785	GAT	2	6	44152	44157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557683072
1025	NC_022785	CGA	2	6	44292	44297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683072
1026	NC_022785	TTG	2	6	44303	44308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557683072
1027	NC_022785	GCG	2	6	44416	44421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683072
1028	NC_022785	AGG	2	6	44550	44555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557683072
1029	NC_022785	GCG	2	6	44617	44622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683072
1030	NC_022785	TC	3	6	44670	44675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_022785	TG	3	6	44686	44691	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_022785	TCG	2	6	44741	44746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683073
1033	NC_022785	GC	3	6	44754	44759	0 %	0 %	50 %	50 %	557683073
1034	NC_022785	CCAC	2	8	44768	44775	25 %	0 %	0 %	75 %	557683073
1035	NC_022785	CCG	2	6	44818	44823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683073
1036	NC_022785	GCC	2	6	44880	44885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683073
1037	NC_022785	CGG	2	6	44886	44891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683073
1038	NC_022785	ACG	2	6	44902	44907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683073
1039	NC_022785	GTG	2	6	44910	44915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557683073
1040	NC_022785	GATC	2	8	44981	44988	25 %	25 %	25 %	25 %	557683073
1041	NC_022785	GCC	3	9	45012	45020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683073
1042	NC_022785	CGG	2	6	45024	45029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683073
1043	NC_022785	TGG	2	6	45093	45098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557683073
1044	NC_022785	GAC	2	6	45103	45108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683073
1045	NC_022785	CCGC	2	8	45109	45116	0 %	0 %	25 %	75 %	557683073
1046	NC_022785	GC	3	6	45119	45124	0 %	0 %	50 %	50 %	557683073
1047	NC_022785	GCCG	2	8	45132	45139	0 %	0 %	50 %	50 %	557683073
1048	NC_022785	CGG	2	6	45140	45145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683073
1049	NC_022785	TGT	2	6	45155	45160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557683073
1050	NC_022785	GGC	2	6	45177	45182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683073
1051	NC_022785	TGG	2	6	45209	45214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557683073
1052	NC_022785	GCG	2	6	45239	45244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_022785	CCT	2	6	45283	45288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_022785	GCAC	2	8	45394	45401	25 %	0 %	25 %	50 %	557683074
1055	NC_022785	GTG	3	9	45406	45414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557683074
1056	NC_022785	CGCGGC	2	12	45531	45542	0 %	0 %	50 %	50 %	557683074
1057	NC_022785	CG	3	6	45555	45560	0 %	0 %	50 %	50 %	557683074
1058	NC_022785	CGA	2	6	45563	45568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683074
1059	NC_022785	CAG	2	6	45573	45578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683074
1060	NC_022785	GCA	2	6	45596	45601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683074
1061	NC_022785	CCG	2	6	45605	45610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683074
1062	NC_022785	TCT	2	6	45631	45636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_022785	GT	3	6	45668	45673	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_022785	CCG	2	6	45815	45820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683075
1065	NC_022785	ACC	2	6	45845	45850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557683075
1066	NC_022785	TCG	2	6	45926	45931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683075
1067	NC_022785	CG	3	6	46057	46062	0 %	0 %	50 %	50 %	557683075
1068	NC_022785	GCG	3	9	46060	46068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683075
1069	NC_022785	TGG	2	6	46153	46158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557683075
1070	NC_022785	ACC	2	6	46261	46266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557683075
1071	NC_022785	GCGCCC	2	12	46268	46279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683075
1072	NC_022785	CGC	2	6	46308	46313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683075
1073	NC_022785	GACC	2	8	46335	46342	25 %	0 %	25 %	50 %	557683075
1074	NC_022785	GCG	2	6	46397	46402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683075
1075	NC_022785	CGA	2	6	46416	46421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683075
1076	NC_022785	GCATG	2	10	46449	46458	20 %	20 %	40 %	20 %	557683075
1077	NC_022785	GCC	2	6	46525	46530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683075
1078	NC_022785	GCC	2	6	46549	46554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683075
1079	NC_022785	CTC	2	6	46555	46560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557683075
1080	NC_022785	CAC	2	6	46584	46589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557683075
1081	NC_022785	TGGTG	2	10	46887	46896	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_022785	CGG	2	6	46941	46946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_022785	GACGC	2	10	47088	47097	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1084	NC_022785	GCT	2	6	47116	47121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_022785	CGC	2	6	47187	47192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1086	NC_022785	CAT	2	6	47232	47237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_022785	TGAGG	2	10	47334	47343	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_022785	TGA	2	6	47417	47422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_022785	CCT	2	6	47442	47447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1090	NC_022785	GAA	2	6	47449	47454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_022785	GAG	2	6	47490	47495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_022785	GCA	2	6	47535	47540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_022785	GCC	2	6	47541	47546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1094	NC_022785	AACGGA	2	12	47562	47573	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1095	NC_022785	GTC	2	6	47583	47588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_022785	TGGGCA	2	12	47599	47610	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	557683076
1097	NC_022785	TCG	2	6	47613	47618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683076
1098	NC_022785	AGG	2	6	47647	47652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557683076
1099	NC_022785	CTC	2	6	47664	47669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557683076
1100	NC_022785	GAA	2	6	47691	47696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557683076
1101	NC_022785	GTG	2	6	47712	47717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557683076
1102	NC_022785	CGG	2	6	47752	47757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683076
1103	NC_022785	CCA	2	6	47776	47781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557683076
1104	NC_022785	TGG	2	6	47788	47793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557683076
1105	NC_022785	TGG	2	6	47801	47806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557683076
1106	NC_022785	CGCC	2	8	47815	47822	0 %	0 %	25 %	75 %	557683076
1107	NC_022785	TC	3	6	47871	47876	0 %	50 %	0 %	50 %	557683076
1108	NC_022785	CGG	2	6	47890	47895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683076
1109	NC_022785	TGCTCG	2	12	47905	47916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683076
1110	NC_022785	CGG	2	6	47976	47981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683076
1111	NC_022785	GCT	2	6	47993	47998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683076
1112	NC_022785	TCT	2	6	48004	48009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557683076
1113	NC_022785	CG	4	8	48026	48033	0 %	0 %	50 %	50 %	557683076
1114	NC_022785	CGGAC	2	10	48070	48079	20 %	0 %	40 %	40 %	557683076
1115	NC_022785	CA	3	6	48110	48115	50 %	0 %	0 %	50 %	557683076
1116	NC_022785	GAC	2	6	48140	48145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683076
1117	NC_022785	AGA	2	6	48149	48154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557683076
1118	NC_022785	CCG	2	6	48250	48255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683076
1119	NC_022785	ACC	2	6	48289	48294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557683076
1120	NC_022785	TCC	2	6	48316	48321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557683076
1121	NC_022785	CGG	2	6	48371	48376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683076
1122	NC_022785	CGA	2	6	48470	48475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683076
1123	NC_022785	GCGG	2	8	48492	48499	0 %	0 %	75 %	25 %	557683076
1124	NC_022785	CTT	2	6	48504	48509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557683076
1125	NC_022785	GTG	2	6	48519	48524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557683076
1126	NC_022785	GCT	2	6	48575	48580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683076
1127	NC_022785	CGC	2	6	48608	48613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683076
1128	NC_022785	AGC	2	6	48616	48621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683076
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1130	NC_022785	TCC	2	6	48664	48669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557683076
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1132	NC_022785	CGTC	2	8	48751	48758	0 %	25 %	25 %	50 %	557683076
1133	NC_022785	TCCG	2	8	48762	48769	0 %	25 %	25 %	50 %	557683076
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1141	NC_022785	CA	3	6	49026	49031	50 %	0 %	0 %	50 %	557683076
1142	NC_022785	CCT	2	6	49054	49059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557683076
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1497	NC_022785	CGC	2	6	62744	62749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1498	NC_022785	TCG	2	6	62792	62797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1499	NC_022785	CCA	2	6	62813	62818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1500	NC_022785	CCAC	2	8	62864	62871	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding

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