MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptomyces rapamycinicus NRRL 5491 genome

Total Repeats: 347051

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_022785	ACC	2	6	242149	242154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557683221
6002	NC_022785	CACGAC	2	12	242179	242190	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	557683221
6003	NC_022785	AC	3	6	242217	242222	50 %	0 %	0 %	50 %	557683221
6004	NC_022785	CGGC	2	8	242263	242270	0 %	0 %	50 %	50 %	557683221
6005	NC_022785	CGG	2	6	242346	242351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_022785	ACC	2	6	242355	242360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6007	NC_022785	CGA	2	6	242439	242444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_022785	GCC	2	6	242468	242473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6009	NC_022785	CAG	2	6	242487	242492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_022785	CTG	2	6	242502	242507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_022785	GTG	2	6	242523	242528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_022785	GCC	2	6	242560	242565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6013	NC_022785	GC	3	6	242578	242583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6014	NC_022785	GTA	2	6	242604	242609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_022785	ACGGC	2	10	242679	242688	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6016	NC_022785	CGC	2	6	242692	242697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6017	NC_022785	GCC	2	6	242733	242738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683222
6018	NC_022785	GCT	2	6	242864	242869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683222
6019	NC_022785	GGC	2	6	242922	242927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683222
6020	NC_022785	CAG	2	6	243000	243005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683222
6021	NC_022785	TCG	2	6	243040	243045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683222
6022	NC_022785	CCA	2	6	243092	243097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557683222
6023	NC_022785	GTG	2	6	243115	243120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557683222
6024	NC_022785	GCG	2	6	243138	243143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683222
6025	NC_022785	GGCGTG	2	12	243176	243187	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	557683222
6026	NC_022785	GCCTAT	2	12	243192	243203	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	557683222
6027	NC_022785	GGC	2	6	243213	243218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683222
6028	NC_022785	GCA	2	6	243254	243259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683222
6029	NC_022785	CGG	2	6	243272	243277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683222
6030	NC_022785	CAG	2	6	243321	243326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683222
6031	NC_022785	G	6	6	243366	243371	0 %	0 %	100 %	0 %	557683222
6032	NC_022785	CGT	2	6	243376	243381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683222
6033	NC_022785	TTC	2	6	243420	243425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557683222
6034	NC_022785	CG	3	6	243446	243451	0 %	0 %	50 %	50 %	557683222
6035	NC_022785	CCA	2	6	243452	243457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557683222
6036	NC_022785	CTC	2	6	243498	243503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557683222
6037	NC_022785	TCCG	2	8	243523	243530	0 %	25 %	25 %	50 %	557683222
6038	NC_022785	GGC	2	6	243624	243629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683222
6039	NC_022785	GCC	2	6	243637	243642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683222
6040	NC_022785	GCA	2	6	243647	243652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683222
6041	NC_022785	TCG	2	6	243718	243723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683222
6042	NC_022785	CGG	2	6	243774	243779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683222
6043	NC_022785	AC	3	6	243845	243850	50 %	0 %	0 %	50 %	557683222
6044	NC_022785	CGT	2	6	243878	243883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683222
6045	NC_022785	AGC	2	6	243913	243918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683222
6046	NC_022785	GTC	2	6	243930	243935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683222
6047	NC_022785	CGAC	2	8	243945	243952	25 %	0 %	25 %	50 %	557683222
6048	NC_022785	G	6	6	244016	244021	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_022785	GTC	2	6	244072	244077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6050	NC_022785	CGT	2	6	244105	244110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_022785	GCT	2	6	244234	244239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683223
6052	NC_022785	GCC	2	6	244242	244247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683223
6053	NC_022785	GCCCA	2	10	244250	244259	20 %	0 %	20 %	60 %	557683223
6054	NC_022785	GGC	2	6	244292	244297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683223
6055	NC_022785	CAG	2	6	244319	244324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683223
6056	NC_022785	CCA	2	6	244347	244352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557683223
6057	NC_022785	CGC	2	6	244394	244399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683223
6058	NC_022785	GC	3	6	244433	244438	0 %	0 %	50 %	50 %	557683223
6059	NC_022785	TGG	2	6	244490	244495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_022785	ATG	2	6	244529	244534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557683224
6061	NC_022785	CAGCC	2	10	244558	244567	20 %	0 %	20 %	60 %	557683224
6062	NC_022785	GC	3	6	244594	244599	0 %	0 %	50 %	50 %	557683224
6063	NC_022785	ACCG	2	8	244625	244632	25 %	0 %	25 %	50 %	557683224
6064	NC_022785	GACG	2	8	244735	244742	25 %	0 %	50 %	25 %	557683224
6065	NC_022785	ATC	2	6	244748	244753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557683224
6066	NC_022785	GCC	2	6	244766	244771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683224
6067	NC_022785	ACG	2	6	244796	244801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683224
6068	NC_022785	TCG	2	6	244868	244873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_022785	TTC	2	6	244888	244893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6070	NC_022785	AAC	2	6	244898	244903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6071	NC_022785	TCG	2	6	244939	244944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6072	NC_022785	GCTT	2	8	244948	244955	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6073	NC_022785	GGA	2	6	244967	244972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_022785	GTC	2	6	245004	245009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_022785	GTCAG	2	10	245120	245129	20 %	20 %	40 %	20 %	557683225
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6078	NC_022785	GCG	2	6	245262	245267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683225
6079	NC_022785	GCC	2	6	245333	245338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683225
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6081	NC_022785	CGG	2	6	245371	245376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683225
6082	NC_022785	CGGC	2	8	245442	245449	0 %	0 %	50 %	50 %	557683225
6083	NC_022785	CTG	2	6	245471	245476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683225
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6085	NC_022785	CTG	2	6	245498	245503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683225
6086	NC_022785	GCTGT	2	10	245555	245564	0 %	40 %	40 %	20 %	557683225
6087	NC_022785	GCCACC	2	12	245565	245576	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	557683225
6088	NC_022785	GGT	2	6	245585	245590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557683225
6089	NC_022785	CGG	2	6	245597	245602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683225
6090	NC_022785	CAG	2	6	245603	245608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683225
6091	NC_022785	CGTC	2	8	245632	245639	0 %	25 %	25 %	50 %	557683225
6092	NC_022785	CACCG	2	10	245711	245720	20 %	0 %	20 %	60 %	557683225
6093	NC_022785	CCG	3	9	245718	245726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683225
6094	NC_022785	CG	3	6	245750	245755	0 %	0 %	50 %	50 %	557683225
6095	NC_022785	CCA	2	6	245770	245775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557683225
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6099	NC_022785	CCGT	2	8	245883	245890	0 %	25 %	25 %	50 %	557683225
6100	NC_022785	GTA	2	6	245936	245941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557683225
6101	NC_022785	CAG	2	6	245993	245998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683225
6102	NC_022785	CG	3	6	246062	246067	0 %	0 %	50 %	50 %	557683225
6103	NC_022785	GCC	2	6	246089	246094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683225
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6105	NC_022785	CG	3	6	246165	246170	0 %	0 %	50 %	50 %	557683225
6106	NC_022785	GTT	2	6	246251	246256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557683225
6107	NC_022785	CCA	2	6	246284	246289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557683225
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6109	NC_022785	TCT	2	6	246361	246366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557683225
6110	NC_022785	GC	3	6	246372	246377	0 %	0 %	50 %	50 %	557683225
6111	NC_022785	CAG	2	6	246488	246493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683225
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6118	NC_022785	CGG	2	6	246850	246855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683225
6119	NC_022785	ACG	2	6	246879	246884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683225
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6121	NC_022785	GGT	2	6	246920	246925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6123	NC_022785	GTG	2	6	247024	247029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6493	NC_022785	CAC	2	6	261958	261963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557683238
6494	NC_022785	CCCA	2	8	262004	262011	25 %	0 %	0 %	75 %	557683238
6495	NC_022785	CGC	2	6	262030	262035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683238
6496	NC_022785	CTG	2	6	262046	262051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683238
6497	NC_022785	CCT	2	6	262063	262068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557683238
6498	NC_022785	CTC	2	6	262069	262074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557683238
6499	NC_022785	GAT	2	6	262108	262113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557683238
6500	NC_022785	GCC	2	6	262145	262150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683238

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