MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptomyces rapamycinicus NRRL 5491 genome

Total Repeats: 347051

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_022785	GAT	2	6	222914	222919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_022785	CGT	2	6	222947	222952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_022785	GGAC	2	8	222970	222977	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5504	NC_022785	CTG	2	6	223054	223059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683199
5505	NC_022785	GCT	2	6	223074	223079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683199
5506	NC_022785	GCG	2	6	223085	223090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683199
5507	NC_022785	CCA	2	6	223097	223102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557683199
5508	NC_022785	CTC	2	6	223111	223116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557683199
5509	NC_022785	CGGG	2	8	223162	223169	0 %	0 %	75 %	25 %	557683199
5510	NC_022785	CG	3	6	223176	223181	0 %	0 %	50 %	50 %	557683199
5511	NC_022785	GC	3	6	223249	223254	0 %	0 %	50 %	50 %	557683199
5512	NC_022785	CGA	2	6	223255	223260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683199
5513	NC_022785	TCG	2	6	223295	223300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683199
5514	NC_022785	CGT	2	6	223338	223343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683199
5515	NC_022785	GTCC	2	8	223345	223352	0 %	25 %	25 %	50 %	557683199
5516	NC_022785	GGC	2	6	223378	223383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683199
5517	NC_022785	CCG	2	6	223389	223394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683199
5518	NC_022785	CCGG	2	8	223456	223463	0 %	0 %	50 %	50 %	557683199
5519	NC_022785	GTC	2	6	223516	223521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683199
5520	NC_022785	CGC	2	6	223531	223536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683199
5521	NC_022785	GC	3	6	223593	223598	0 %	0 %	50 %	50 %	557683199
5522	NC_022785	CCG	2	6	223605	223610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683199
5523	NC_022785	GC	3	6	223629	223634	0 %	0 %	50 %	50 %	557683199
5524	NC_022785	GC	4	8	223676	223683	0 %	0 %	50 %	50 %	557683199
5525	NC_022785	GTC	2	6	223706	223711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683199
5526	NC_022785	ACG	2	6	223743	223748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683199
5527	NC_022785	CCG	2	6	223770	223775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683199
5528	NC_022785	CCG	2	6	223781	223786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683199
5529	NC_022785	GC	4	8	223788	223795	0 %	0 %	50 %	50 %	557683199
5530	NC_022785	CGTG	2	8	223851	223858	0 %	25 %	50 %	25 %	557683199
5531	NC_022785	TCCGGC	2	12	223877	223888	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	557683199
5532	NC_022785	GTC	2	6	224041	224046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683199
5533	NC_022785	CGG	2	6	224136	224141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683199
5534	NC_022785	GCG	2	6	224234	224239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683200
5535	NC_022785	CGG	2	6	224242	224247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683200
5536	NC_022785	CACCGG	2	12	224312	224323	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	557683200
5537	NC_022785	GTC	2	6	224414	224419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683200
5538	NC_022785	CGA	2	6	224497	224502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683200
5539	NC_022785	CGA	2	6	224545	224550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683200
5540	NC_022785	CGGT	2	8	224595	224602	0 %	25 %	50 %	25 %	557683200
5541	NC_022785	GCC	2	6	224617	224622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683200
5542	NC_022785	GGC	3	9	224639	224647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683200
5543	NC_022785	GTA	2	6	224729	224734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557683200
5544	NC_022785	CCG	2	6	224751	224756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683200
5545	NC_022785	GCC	2	6	224766	224771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683200
5546	NC_022785	CCG	2	6	224795	224800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683200
5547	NC_022785	CCA	2	6	224834	224839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557683200
5548	NC_022785	CGG	2	6	224848	224853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683200
5549	NC_022785	CGG	2	6	224863	224868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683200
5550	NC_022785	ACG	2	6	224874	224879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683200
5551	NC_022785	CCGA	2	8	224901	224908	25 %	0 %	25 %	50 %	557683200
5552	NC_022785	GCA	2	6	224917	224922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683200
5553	NC_022785	CGA	2	6	224965	224970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683200
5554	NC_022785	TCGC	2	8	224996	225003	0 %	25 %	25 %	50 %	557683200
5555	NC_022785	GC	4	8	225022	225029	0 %	0 %	50 %	50 %	557683200
5556	NC_022785	CAG	2	6	225047	225052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683200
5557	NC_022785	GCACG	2	10	225082	225091	20 %	0 %	40 %	40 %	557683200
5558	NC_022785	CCGCC	2	10	225112	225121	0 %	0 %	20 %	80 %	557683200
5559	NC_022785	GGC	2	6	225155	225160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683200
5560	NC_022785	GAT	2	6	225164	225169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557683200
5561	NC_022785	GCC	2	6	225190	225195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683200
5562	NC_022785	CGCC	2	8	225238	225245	0 %	0 %	25 %	75 %	557683200
5563	NC_022785	CCG	2	6	225252	225257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683200
5564	NC_022785	CGA	2	6	225268	225273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683200
5565	NC_022785	ACG	2	6	225276	225281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683200
5566	NC_022785	CGGCC	2	10	225290	225299	0 %	0 %	40 %	60 %	557683200
5567	NC_022785	CGA	2	6	225340	225345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683200
5568	NC_022785	CAG	2	6	225371	225376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683200
5569	NC_022785	TGGC	2	8	225472	225479	0 %	25 %	50 %	25 %	557683200
5570	NC_022785	GCA	2	6	225517	225522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683200
5571	NC_022785	CTC	2	6	225589	225594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5572	NC_022785	GCG	2	6	225610	225615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5573	NC_022785	TGT	2	6	225633	225638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_022785	GAG	2	6	225680	225685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_022785	TGG	2	6	225720	225725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557683201
5576	NC_022785	AGC	2	6	225795	225800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683201
5577	NC_022785	GAC	2	6	225815	225820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683201
5578	NC_022785	CG	3	6	225905	225910	0 %	0 %	50 %	50 %	557683201
5579	NC_022785	ACGCGG	2	12	225948	225959	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	557683201
5580	NC_022785	ACG	2	6	225981	225986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683201
5581	NC_022785	GAC	2	6	226028	226033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683201
5582	NC_022785	TGG	2	6	226037	226042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557683201
5583	NC_022785	ACCG	2	8	226061	226068	25 %	0 %	25 %	50 %	557683201
5584	NC_022785	CGC	2	6	226084	226089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683201
5585	NC_022785	CGA	2	6	226335	226340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5586	NC_022785	CGC	2	6	226386	226391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5587	NC_022785	CG	3	6	226489	226494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5588	NC_022785	CTCGAC	2	12	226515	226526	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5589	NC_022785	CGG	2	6	226537	226542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5590	NC_022785	CAAG	2	8	226547	226554	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5591	NC_022785	GAGCC	2	10	226558	226567	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5592	NC_022785	G	6	6	226570	226575	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_022785	CAG	2	6	226613	226618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5594	NC_022785	GCC	2	6	226792	226797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5595	NC_022785	GAC	2	6	226848	226853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5596	NC_022785	CG	3	6	226974	226979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5597	NC_022785	AC	3	6	226985	226990	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5598	NC_022785	GGC	2	6	227001	227006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5599	NC_022785	GCA	2	6	227091	227096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683202
5600	NC_022785	TCT	2	6	227145	227150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557683202
5601	NC_022785	ACG	2	6	227157	227162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683202
5602	NC_022785	GGC	2	6	227173	227178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683202
5603	NC_022785	CT	3	6	227203	227208	0 %	50 %	0 %	50 %	557683202
5604	NC_022785	TTC	2	6	227234	227239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557683202
5605	NC_022785	GCG	2	6	227395	227400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683202
5606	NC_022785	CGG	2	6	227452	227457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683202
5607	NC_022785	GCG	2	6	227491	227496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683202
5608	NC_022785	TCG	2	6	227499	227504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683202
5609	NC_022785	GGC	2	6	227557	227562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683202
5610	NC_022785	AGG	2	6	227574	227579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557683202
5611	NC_022785	GGCCG	2	10	227660	227669	0 %	0 %	60 %	40 %	557683202
5612	NC_022785	CTC	2	6	227725	227730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557683202
5613	NC_022785	GCCC	2	8	227773	227780	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5614	NC_022785	GAC	2	6	227813	227818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5615	NC_022785	TCA	2	6	227826	227831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5616	NC_022785	GGA	2	6	227833	227838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_022785	CGA	2	6	227919	227924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683203
5618	NC_022785	GCG	2	6	227935	227940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683203
5619	NC_022785	CTG	2	6	227974	227979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683203
5620	NC_022785	CGT	2	6	228078	228083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683203
5621	NC_022785	CTC	2	6	228084	228089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557683203
5622	NC_022785	GGA	2	6	228105	228110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557683203
5623	NC_022785	TCA	2	6	228128	228133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557683203
5624	NC_022785	GGC	2	6	228144	228149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683203
5625	NC_022785	GGCG	2	8	228168	228175	0 %	0 %	75 %	25 %	557683203
5626	NC_022785	CTG	2	6	228238	228243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683203
5627	NC_022785	CTG	2	6	228256	228261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683203
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5637	NC_022785	CGC	2	6	228552	228557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5648	NC_022785	GTC	2	6	229077	229082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5745	NC_022785	GC	3	6	232965	232970	0 %	0 %	50 %	50 %	557683212
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5747	NC_022785	CTGCG	2	10	233066	233075	0 %	20 %	40 %	40 %	557683213
5748	NC_022785	CGCC	2	8	233092	233099	0 %	0 %	25 %	75 %	557683213
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5751	NC_022785	GTC	2	6	233178	233183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683213
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5753	NC_022785	GCG	3	9	233239	233247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683213
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5855	NC_022785	CGA	2	6	236536	236541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683216
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5857	NC_022785	CGG	2	6	236566	236571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683216
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5859	NC_022785	CGG	2	6	236626	236631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683216
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5861	NC_022785	GAC	2	6	236678	236683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683216
5862	NC_022785	CACC	2	8	236701	236708	25 %	0 %	0 %	75 %	557683216
5863	NC_022785	ACC	2	6	236766	236771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557683216
5864	NC_022785	GCA	2	6	236834	236839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683216
5865	NC_022785	TCG	2	6	236854	236859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683216
5866	NC_022785	TCC	2	6	236867	236872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557683216
5867	NC_022785	GC	3	6	236937	236942	0 %	0 %	50 %	50 %	557683216
5868	NC_022785	GTC	2	6	236945	236950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683216
5869	NC_022785	ACG	2	6	236970	236975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683216
5870	NC_022785	CGC	2	6	237037	237042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683216
5871	NC_022785	C	6	6	237060	237065	0 %	0 %	0 %	100 %	557683216
5872	NC_022785	GCAC	2	8	237116	237123	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5873	NC_022785	TCG	2	6	237141	237146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5875	NC_022785	ACG	2	6	237162	237167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5879	NC_022785	CGT	2	6	237299	237304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5881	NC_022785	TCCGT	2	10	237452	237461	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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5883	NC_022785	TGG	2	6	237471	237476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5997	NC_022785	ACG	2	6	242030	242035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683221
5998	NC_022785	CGA	2	6	242040	242045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683221
5999	NC_022785	ACCGA	2	10	242063	242072	40 %	0 %	20 %	40 %	557683221
6000	NC_022785	GCC	2	6	242138	242143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683221

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