MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptomyces rapamycinicus NRRL 5491 genome

Total Repeats: 347051

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_022785	CCG	2	6	203596	203601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683179
5003	NC_022785	GCCC	2	8	203607	203614	0 %	0 %	25 %	75 %	557683179
5004	NC_022785	GGCCAA	2	12	203681	203692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683179
5005	NC_022785	CG	3	6	203740	203745	0 %	0 %	50 %	50 %	557683179
5006	NC_022785	ATC	2	6	203814	203819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557683179
5007	NC_022785	CCG	2	6	203836	203841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683179
5008	NC_022785	CGG	2	6	203890	203895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683180
5009	NC_022785	CGG	2	6	203902	203907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683180
5010	NC_022785	TGA	2	6	203925	203930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557683180
5011	NC_022785	CGA	2	6	203980	203985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683180
5012	NC_022785	CTTCGG	2	12	203989	204000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683180
5013	NC_022785	CGT	2	6	204001	204006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683180
5014	NC_022785	CGA	2	6	204013	204018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683180
5015	NC_022785	CGG	2	6	204025	204030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683180
5016	NC_022785	ACC	2	6	204047	204052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557683180
5017	NC_022785	CGACAT	2	12	204091	204102	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	557683180
5018	NC_022785	CGG	2	6	204130	204135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683180
5019	NC_022785	CGC	2	6	204145	204150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683180
5020	NC_022785	CCCCG	2	10	204226	204235	0 %	0 %	20 %	80 %	557683180
5021	NC_022785	GTG	2	6	204269	204274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557683180
5022	NC_022785	ACGG	2	8	204301	204308	25 %	0 %	50 %	25 %	557683180
5023	NC_022785	CCCT	2	8	204329	204336	0 %	25 %	0 %	75 %	557683180
5024	NC_022785	ACCG	2	8	204371	204378	25 %	0 %	25 %	50 %	557683180
5025	NC_022785	TTC	2	6	204398	204403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557683180
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5027	NC_022785	TCG	2	6	204474	204479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683180
5028	NC_022785	GGC	2	6	204498	204503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683180
5029	NC_022785	C	6	6	204538	204543	0 %	0 %	0 %	100 %	557683180
5030	NC_022785	CGA	2	6	204553	204558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683180
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5032	NC_022785	CCA	2	6	204607	204612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557683180
5033	NC_022785	CAA	2	6	204622	204627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557683180
5034	NC_022785	CAC	2	6	204671	204676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557683180
5035	NC_022785	CGC	2	6	204700	204705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683180
5036	NC_022785	GGA	2	6	204751	204756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557683180
5037	NC_022785	CTCGCC	2	12	204761	204772	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	557683180
5038	NC_022785	GCG	2	6	204829	204834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683180
5039	NC_022785	CCT	2	6	204937	204942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557683180
5040	NC_022785	CGC	2	6	204953	204958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683180
5041	NC_022785	GCC	2	6	205013	205018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683180
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5043	NC_022785	CCG	2	6	205131	205136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683180
5044	NC_022785	GCG	2	6	205191	205196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683180
5045	NC_022785	TGA	2	6	205206	205211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557683180
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5049	NC_022785	CGC	2	6	205510	205515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683180
5050	NC_022785	GCC	3	9	205526	205534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683180
5051	NC_022785	N	705	705	205611	206315	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_022785	CCT	2	6	206319	206324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5053	NC_022785	GAG	2	6	206325	206330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_022785	GGT	2	6	206402	206407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557683181
5055	NC_022785	GGC	2	6	206420	206425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683181
5056	NC_022785	GGC	2	6	206429	206434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557683181
5057	NC_022785	TCG	2	6	206455	206460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683181
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5059	NC_022785	GAC	2	6	206534	206539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683181
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5062	NC_022785	CCGG	2	8	206638	206645	0 %	0 %	50 %	50 %	557683181
5063	NC_022785	GGT	2	6	206651	206656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557683181
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5070	NC_022785	GC	3	6	206945	206950	0 %	0 %	50 %	50 %	557683182
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5115	NC_022785	GCT	2	6	208326	208331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5119	NC_022785	C	6	6	208602	208607	0 %	0 %	0 %	100 %	557683183
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5245	NC_022785	GGCT	2	8	212810	212817	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5246	NC_022785	GCCG	2	8	212834	212841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5247	NC_022785	CAG	2	6	212845	212850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5248	NC_022785	GCCCAG	2	12	212895	212906	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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5253	NC_022785	ACA	2	6	213095	213100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5254	NC_022785	CCGGC	2	10	213125	213134	0 %	0 %	40 %	60 %	557683190
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5262	NC_022785	CGG	2	6	213487	213492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5357	NC_022785	CG	3	6	217045	217050	0 %	0 %	50 %	50 %	557683194
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5365	NC_022785	GTC	2	6	217305	217310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683194
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5368	NC_022785	CAC	2	6	217433	217438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557683194
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5372	NC_022785	GTC	2	6	217689	217694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683194
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5379	NC_022785	CCGAAG	2	12	217962	217973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683194
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5386	NC_022785	CGA	2	6	218322	218327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5388	NC_022785	CGG	2	6	218392	218397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5389	NC_022785	CCGG	2	8	218458	218465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5403	NC_022785	GACC	2	8	219012	219019	25 %	0 %	25 %	50 %	557683195
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5480	NC_022785	CTG	2	6	222030	222035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5481	NC_022785	TCG	2	6	222075	222080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5482	NC_022785	CA	3	6	222123	222128	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5483	NC_022785	TCA	2	6	222173	222178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5484	NC_022785	TCA	2	6	222191	222196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5485	NC_022785	GCG	2	6	222236	222241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5486	NC_022785	CAC	2	6	222274	222279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5487	NC_022785	TGC	2	6	222364	222369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683198
5488	NC_022785	TGGC	2	8	222420	222427	0 %	25 %	50 %	25 %	557683198
5489	NC_022785	GCT	2	6	222437	222442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557683198
5490	NC_022785	CGA	2	6	222454	222459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557683198
5491	NC_022785	GCC	3	9	222477	222485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557683198
5492	NC_022785	CGGCA	2	10	222512	222521	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5493	NC_022785	TGC	2	6	222540	222545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5494	NC_022785	GTC	2	6	222546	222551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5495	NC_022785	CTGG	2	8	222592	222599	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5496	NC_022785	CGC	2	6	222655	222660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5497	NC_022785	CAT	2	6	222705	222710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5498	NC_022785	GCC	2	6	222818	222823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5499	NC_022785	ATG	2	6	222833	222838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5500	NC_022785	CTC	2	6	222898	222903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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